MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 41603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022535	CTT	2	6	219	224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704411
2	NC_022535	GAT	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704411
3	NC_022535	AGC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704411
4	NC_022535	TCG	2	6	407	412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704411
5	NC_022535	CGG	2	6	529	534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704411
6	NC_022535	ATT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704411
7	NC_022535	ATC	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704411
8	NC_022535	GCC	2	6	769	774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704411
9	NC_022535	TCG	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704411
10	NC_022535	CGG	2	6	855	860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704411
11	NC_022535	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704411
12	NC_022535	CAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704411
13	NC_022535	GCT	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704411
14	NC_022535	TGA	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704412
15	NC_022535	GGA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704412
16	NC_022535	AAC	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704412
17	NC_022535	CTG	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704412
18	NC_022535	GGT	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704412
19	NC_022535	AGC	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704412
20	NC_022535	ATT	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704412
21	NC_022535	GTT	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704413
22	NC_022535	GGC	2	6	1847	1852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704413
23	NC_022535	AGG	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704413
24	NC_022535	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704413
25	NC_022535	GCC	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704413
26	NC_022535	CCA	2	6	1968	1973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704413
27	NC_022535	CGG	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704413
28	NC_022535	GGT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704413
29	NC_022535	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704413
30	NC_022535	ATC	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704413
31	NC_022535	TGA	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704413
32	NC_022535	GAA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704414
33	NC_022535	GAA	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704414
34	NC_022535	GCT	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704414
35	NC_022535	GTG	3	9	2881	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704414
36	NC_022535	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704414
37	NC_022535	ATC	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704414
38	NC_022535	ATC	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704415
39	NC_022535	CGG	2	6	3175	3180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704415
40	NC_022535	CGA	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704416
41	NC_022535	TTC	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704416
42	NC_022535	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704416
43	NC_022535	CGC	2	6	3436	3441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704416
44	NC_022535	GCC	2	6	3516	3521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704416
45	NC_022535	CGG	2	6	3607	3612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704416
46	NC_022535	GCC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704416
47	NC_022535	GCC	2	6	3740	3745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704416
48	NC_022535	GCT	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704417
49	NC_022535	GCG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704417
50	NC_022535	CCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704417
51	NC_022535	GCA	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704417
52	NC_022535	GAG	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704417
53	NC_022535	ATC	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704418
54	NC_022535	CTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704418
55	NC_022535	AAT	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704418
56	NC_022535	ACG	3	9	4666	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704418
57	NC_022535	AGG	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704418
58	NC_022535	TGA	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704418
59	NC_022535	AAC	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704418
60	NC_022535	ACG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704418
61	NC_022535	GCC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704418
62	NC_022535	AAT	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704418
63	NC_022535	CAT	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704418
64	NC_022535	GAT	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704418
65	NC_022535	TCT	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704418
66	NC_022535	TCT	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704419
67	NC_022535	GTC	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704419
68	NC_022535	GCC	2	6	5263	5268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704419
69	NC_022535	GAT	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704419
70	NC_022535	TGA	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704419
71	NC_022535	GAT	2	6	5497	5502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704419
72	NC_022535	CTG	2	6	5546	5551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704419
73	NC_022535	TTG	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704419
74	NC_022535	CGG	3	9	6008	6016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704420
75	NC_022535	GCT	2	6	6027	6032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704420
76	NC_022535	GAC	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704420
77	NC_022535	CCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704420
78	NC_022535	ACC	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704420
79	NC_022535	TGG	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704420
80	NC_022535	CGA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704420
81	NC_022535	CGC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704420
82	NC_022535	CGA	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704420
83	NC_022535	CGC	3	9	6672	6680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704420
84	NC_022535	TCG	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704420
85	NC_022535	CTT	2	6	6747	6752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704420
86	NC_022535	GAT	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704420
87	NC_022535	CAT	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704420
88	NC_022535	TGC	2	6	6945	6950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704420
89	NC_022535	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704420
90	NC_022535	GAA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704421
91	NC_022535	GGA	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704421
92	NC_022535	GCC	2	6	7157	7162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704421
93	NC_022535	CCA	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704421
94	NC_022535	GCC	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704421
95	NC_022535	TCC	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704421
96	NC_022535	CGG	2	6	7478	7483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704421
97	NC_022535	GCC	3	9	7598	7606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704422
98	NC_022535	TCC	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704422
99	NC_022535	CAT	2	6	7702	7707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704422
100	NC_022535	TTC	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704422
101	NC_022535	GGT	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704422
102	NC_022535	GCC	2	6	7783	7788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704422
103	NC_022535	TGC	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704422
104	NC_022535	GTC	2	6	8210	8215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
105	NC_022535	TCC	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704423
106	NC_022535	GCC	2	6	8351	8356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
107	NC_022535	TCA	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704423
108	NC_022535	GGT	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704423
109	NC_022535	CCG	2	6	8485	8490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
110	NC_022535	CGC	2	6	8538	8543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
111	NC_022535	GAA	2	6	8729	8734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704423
112	NC_022535	CTG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
113	NC_022535	ATG	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704423
114	NC_022535	AAG	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704423
115	NC_022535	TGG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704423
116	NC_022535	CAA	2	6	8899	8904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704423
117	NC_022535	TGG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704423
118	NC_022535	CCT	2	6	8970	8975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704423
119	NC_022535	TCG	2	6	9086	9091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
120	NC_022535	GTC	2	6	9112	9117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
121	NC_022535	GAA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704423
122	NC_022535	GGT	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704423
123	NC_022535	GCC	2	6	9239	9244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
124	NC_022535	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
125	NC_022535	TCG	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
126	NC_022535	CCG	2	6	9369	9374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
127	NC_022535	TGT	2	6	9471	9476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704423
128	NC_022535	ATC	3	9	9566	9574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704423
129	NC_022535	CTG	2	6	9614	9619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
130	NC_022535	CTT	3	9	9625	9633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704423
131	NC_022535	GCC	2	6	9682	9687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
132	NC_022535	GGC	2	6	9910	9915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704423
133	NC_022535	CCG	2	6	9945	9950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704423
134	NC_022535	GGA	2	6	9964	9969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704423
135	NC_022535	TGC	2	6	10041	10046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
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139	NC_022535	TGC	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704423
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143	NC_022535	CGA	2	6	10764	10769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704424
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145	NC_022535	TCT	2	6	10884	10889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704424
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152	NC_022535	CGG	2	6	11423	11428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704425
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155	NC_022535	CCG	2	6	11595	11600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704425
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163	NC_022535	GTC	2	6	12528	12533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704426
164	NC_022535	TCT	2	6	12554	12559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704426
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253	NC_022535	GCC	2	6	19411	19416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704432
254	NC_022535	CGC	2	6	19480	19485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704432
255	NC_022535	CGG	2	6	19521	19526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704432
256	NC_022535	GCG	2	6	19633	19638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704433
257	NC_022535	AGC	2	6	19671	19676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704433
258	NC_022535	TCG	2	6	19768	19773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704433
259	NC_022535	GGA	2	6	19812	19817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704433
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261	NC_022535	CCA	2	6	19877	19882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704433
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269	NC_022535	ATC	2	6	20597	20602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704434
270	NC_022535	GAT	2	6	20615	20620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704434
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273	NC_022535	CCG	2	6	20800	20805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704434
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282	NC_022535	CGA	2	6	21118	21123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704434
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284	NC_022535	CGC	2	6	21181	21186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704434
285	NC_022535	GAA	2	6	21380	21385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704434
286	NC_022535	TAT	2	6	21457	21462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704434
287	NC_022535	GGC	2	6	21518	21523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704434
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372	NC_022535	GAA	2	6	27104	27109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704436
373	NC_022535	GCT	2	6	27145	27150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704436
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375	NC_022535	CCG	3	9	27225	27233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704436
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