MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis 167 DNA

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022532	TAACTA	2	12	136	147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022532	CATTAA	2	12	10304	10315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022532	GAAGTG	2	12	24219	24230	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022532	ACTAAT	2	12	24249	24260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022532	GAAGTG	2	12	84711	84722	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022532	ACTAAT	2	12	84741	84752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022532	TTCGGG	2	12	85673	85684	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022532	GGCTAT	2	12	124408	124419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022532	GTAGGT	2	12	177892	177903	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022532	AGAGAA	2	12	183877	183888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022532	CATAAA	2	12	209661	209672	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022532	TCTAGC	2	12	217744	217755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022532	TGAAAA	2	12	234206	234217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022532	GAAGTG	2	12	297818	297829	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022532	ACTAAT	2	12	297848	297859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022532	CTCAGT	2	12	328009	328020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022532	AAAAGA	2	12	337787	337798	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022532	GAAGTG	2	12	351995	352006	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022532	ACTAAT	2	12	352025	352036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022532	AAAAAG	2	12	394990	395001	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022532	CAAAAT	2	12	477983	477994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022532	ATTCAG	2	12	501673	501684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022532	AAAGGA	2	12	511487	511498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022532	AGAAGG	2	12	513483	513494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022532	AGAAAT	2	12	519320	519331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022532	AGGACT	2	12	564798	564809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022532	GCCAAA	2	12	571136	571147	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022532	CTATTT	2	12	571793	571804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022532	AATTAA	2	12	578886	578897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022532	AAAAGA	2	12	586272	586283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022532	GAAAAA	2	12	631804	631815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022532	CTTATC	2	12	689573	689584	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022532	AGGAAA	2	12	754010	754021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022532	ATACAA	2	12	786456	786467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022532	ATGTCA	2	12	817478	817489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022532	AGGTAA	2	12	828200	828211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022532	AAATAA	2	12	852699	852710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022532	TTAGCA	2	12	932933	932944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022532	TATTAA	2	12	971787	971798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022532	TCATGT	2	12	972907	972918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022532	AAAATG	2	12	976616	976627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022532	AAAGAA	2	12	995425	995436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022532	TAAATT	2	12	1006814	1006825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022532	CATTAT	2	12	1013335	1013346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022532	TTCCTT	2	12	1032050	1032061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022532	ACCTTT	2	12	1050276	1050287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022532	TTTAAA	2	12	1071011	1071022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022532	AGAGAA	2	12	1093812	1093823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022532	CCCGAA	2	12	1095558	1095569	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022532	CTCCTT	2	12	1145345	1145356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022532	GTTTTC	2	12	1202252	1202263	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022532	TCTAAT	2	12	1286735	1286746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022532	TCTTTT	2	12	1381366	1381377	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022532	AAGATG	2	12	1408197	1408208	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022532	TTTCAT	2	12	1421956	1421967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022532	TGACTT	2	12	1430601	1430612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022532	TTTCTT	2	12	1444454	1444465	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022532	TAGGAT	2	12	1460076	1460087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022532	ATAATT	2	12	1461519	1461530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022532	GAGATA	2	12	1479531	1479542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022532	CAAGTA	2	12	1507109	1507120	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022532	ATTAGT	2	12	1507541	1507552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022532	TGGTAT	2	12	1539521	1539532	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022532	TATTAG	2	12	1551716	1551727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022532	CAATTC	2	12	1576897	1576908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022532	TATTTT	2	12	1577969	1577980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022532	TTTTCT	2	12	1621042	1621053	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022532	TGGCTA	2	12	1621663	1621674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022532	AACTTC	2	12	1633601	1633612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022532	CTTTTT	2	12	1650866	1650877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022532	ATTCCA	2	12	1700556	1700567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022532	TTCCTT	2	12	1709418	1709429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022532	ATCATG	2	12	1734577	1734588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022532	ACAATA	2	12	1753865	1753876	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022532	ACTAGT	2	12	1756496	1756507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022532	TCTTTC	2	12	1772372	1772383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022532	TATTTT	2	12	1889286	1889297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022532	GGTCAA	2	12	1895788	1895799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022532	CTGATA	2	12	1898268	1898279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022532	AGTATA	2	12	1926301	1926312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022532	ACTGTC	2	12	1931857	1931868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022532	TATCCT	2	12	1940925	1940936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022532	CTTTTT	2	12	1940940	1940951	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022532	CTTTCT	2	12	1981138	1981149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022532	TTTTCA	2	12	2014853	2014864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022532	GAAAAA	2	12	2072054	2072065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.