MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 plasmid pBamNAU-B3a

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022531	GTA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
2	NC_022531	TGC	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
3	NC_022531	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
4	NC_022531	CAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
5	NC_022531	TTG	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
6	NC_022531	CTT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
7	NC_022531	TTG	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
8	NC_022531	TGT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
9	NC_022531	GTC	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
10	NC_022531	CGT	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
11	NC_022531	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
12	NC_022531	ACA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
13	NC_022531	TTC	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
14	NC_022531	CTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
15	NC_022531	CTT	3	9	1598	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
16	NC_022531	TGT	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
17	NC_022531	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700064
18	NC_022531	TGT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
19	NC_022531	TCT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
20	NC_022531	AGC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
21	NC_022531	ATC	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700065
22	NC_022531	TGT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700065
23	NC_022531	GAT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700065
24	NC_022531	AAG	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
25	NC_022531	CAG	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
26	NC_022531	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
27	NC_022531	GGC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
28	NC_022531	GAA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
29	NC_022531	GAG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549700065
30	NC_022531	GCG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
31	NC_022531	GAA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
32	NC_022531	AGA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
33	NC_022531	GCT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700065
34	NC_022531	TTC	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
35	NC_022531	CCA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549700066
36	NC_022531	TTC	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
37	NC_022531	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700066
38	NC_022531	TTC	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
39	NC_022531	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
40	NC_022531	AGA	3	9	5180	5188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
41	NC_022531	TTA	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
42	NC_022531	TAT	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
43	NC_022531	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
44	NC_022531	TTC	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700068
45	NC_022531	TGA	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
46	NC_022531	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
47	NC_022531	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
48	NC_022531	GAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
49	NC_022531	GAA	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
50	NC_022531	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
51	NC_022531	TTG	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700068
52	NC_022531	ATT	2	6	6714	6719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
53	NC_022531	AAG	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.