MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022529	AATTTA	2	12	19355	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022529	TTTTAT	2	12	26538	26549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022529	TATTTA	2	12	39434	39445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022529	ATTTTT	2	12	162492	162503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022529	ATATTA	2	12	168779	168790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022529	AAATTT	2	12	198338	198349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022529	TATTTT	2	12	200333	200344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022529	TTAATT	2	12	215215	215226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022529	TATATT	2	12	215788	215799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022529	TGGTTT	2	12	218856	218867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022529	TAAAAT	2	12	260212	260223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022529	TAAATT	2	12	330588	330599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022529	TATTTT	2	12	354479	354490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022529	TGTGTT	2	12	361909	361920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022529	TTTTGT	2	12	377929	377940	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022529	TTAAAA	2	12	378986	378997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022529	TATTTA	2	12	386540	386551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022529	TTTATT	2	12	390246	390257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022529	ATTTTA	2	12	483313	483324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022529	TATAAA	2	12	485984	485995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022529	ATCTTA	2	12	486010	486021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022529	AATTTA	2	12	500846	500857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022529	AAAATA	2	12	517210	517221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022529	TTTTAA	2	12	545791	545802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022529	TAATAG	2	12	638131	638142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022529	ATTTAA	2	12	647074	647085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022529	TTTATT	2	12	657226	657237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022529	TAAATT	2	12	657295	657306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022529	CTTAAA	2	12	665529	665540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022529	TTAAAA	2	12	667212	667223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022529	TATGTT	2	12	669421	669432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022529	AAAAAT	2	12	670065	670076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022529	ATTTTT	2	12	674447	674458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022529	ATAATT	2	12	698061	698072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022529	TTAAAT	2	12	717633	717644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022529	TATTTA	2	12	727795	727806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022529	TTTATT	2	12	731501	731512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022529	TTATTT	2	12	732916	732927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022529	AAATTT	2	12	793686	793697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022529	AATTTT	2	12	806984	806995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022529	AAATTA	2	12	835690	835701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022529	ACAAAG	2	12	849306	849317	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022529	TTTTTA	2	12	851780	851791	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022529	AATAAA	2	12	898176	898187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022529	AATTTC	2	12	900726	900737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022529	TCAAAT	2	12	904507	904518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022529	TAAAAA	2	12	904589	904600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022529	ATCTTA	2	12	933313	933324	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022529	ATTATA	2	12	936265	936276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022529	TATAAA	2	12	938996	939007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022529	ATCTTA	2	12	939022	939033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022529	TTATAA	2	12	1015453	1015464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022529	ATTTTA	2	12	1067499	1067510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022529	TTAATT	2	12	1170095	1170106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022529	AAATTT	2	12	1171093	1171104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022529	ATTTAA	2	12	1181749	1181760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022529	AAAAGA	2	12	1181864	1181875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022529	TTAATT	2	12	1198080	1198091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022529	AATTTT	2	12	1233315	1233326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022529	CTTTAT	2	12	1278832	1278843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022529	CAAAAA	2	12	1349007	1349018	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022529	TTAATT	2	12	1358280	1358291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022529	ACTAAA	2	12	1478671	1478682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022529	TATAAT	2	12	1486991	1487002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022529	CAAAAA	2	12	1512000	1512011	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022529	ATAAAA	2	12	1519437	1519448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022529	ATTTTT	2	12	1542178	1542189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022529	TTAATT	2	12	1542250	1542261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022529	TAAAAA	2	12	1554579	1554590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022529	TAAATT	2	12	1609457	1609468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022529	ATTTTT	2	12	1612758	1612769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022529	TAAAAA	2	12	1656820	1656831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022529	AGGAAT	2	12	1657188	1657199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022529	TTAAAT	2	12	1665714	1665725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.