MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 1029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549691988
2	NC_022529	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549691988
3	NC_022529	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549691989
4	NC_022529	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549691989
5	NC_022529	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549691989
6	NC_022529	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549691993
7	NC_022529	ATTTAA	2	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	549691993
8	NC_022529	ATGGGT	2	12	17170	17181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549691998
9	NC_022529	TTCATT	2	12	18322	18333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692000
10	NC_022529	AAGAAA	2	12	19535	19546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692001
11	NC_022529	AAGATA	2	12	20454	20465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692002
12	NC_022529	AGCAAA	2	12	21237	21248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549692002
13	NC_022529	TTTTCT	2	12	21744	21755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549692003
14	NC_022529	TTATGC	2	12	27600	27611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692008
15	NC_022529	CTTTAA	2	12	29847	29858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549692009
16	NC_022529	CTATTT	2	12	29967	29978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692009
17	NC_022529	ATGTGT	2	12	30661	30672	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549692010
18	NC_022529	ATGGAT	2	12	34528	34539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692013
19	NC_022529	GAAATT	2	12	34737	34748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549692013
20	NC_022529	AACAAA	2	12	44016	44027	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	549692015
21	NC_022529	GAAAAG	2	12	47973	47984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549692016
22	NC_022529	AAGATA	2	12	50346	50357	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692018
23	NC_022529	GAAAGA	2	12	50800	50811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549692018
24	NC_022529	GCAAAA	2	12	54083	54094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549692021
25	NC_022529	ATGAAA	2	12	54133	54144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692021
26	NC_022529	TAAGCT	2	12	54665	54676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549692021
27	NC_022529	AGTTTT	2	12	56847	56858	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692023
28	NC_022529	TTCTTT	2	12	57063	57074	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549692024
29	NC_022529	CGCCTT	2	12	57468	57479	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549692024
30	NC_022529	CCAATG	2	12	60918	60929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549692026
31	NC_022529	CAAAAT	2	12	61034	61045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549692026
32	NC_022529	TTCATC	2	12	61968	61979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692027
33	NC_022529	TAATTT	2	12	63762	63773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692029
34	NC_022529	ATTTTA	2	12	64014	64025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692029
35	NC_022529	AAATAT	2	12	64371	64382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692029
36	NC_022529	GTTGGA	2	12	65311	65322	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549692029
37	NC_022529	GTTTTT	2	12	65456	65467	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549692029
38	NC_022529	TACAGC	2	12	67496	67507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549692032
39	NC_022529	CTTTTA	2	12	67650	67661	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692033
40	NC_022529	ACGCAC	2	12	70100	70111	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549692037
41	NC_022529	TAGCTT	2	12	70770	70781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692038
42	NC_022529	TTCATT	2	12	73129	73140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692041
43	NC_022529	CATCTT	2	12	74875	74886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692042
44	NC_022529	TTTAAA	2	12	77295	77306	50 %	50 %	0 %	0 %	549692045
45	NC_022529	CTAGCT	2	12	77727	77738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549692046
46	NC_022529	GAATGA	2	12	77981	77992	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549692046
47	NC_022529	GATGCT	2	12	79143	79154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549692047
48	NC_022529	TCTAAA	2	12	81459	81470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549692052
49	NC_022529	TTTAGC	2	12	83016	83027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692053
50	NC_022529	TTTTTG	2	12	88321	88332	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549692059
51	NC_022529	GAATTT	2	12	88641	88652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549692060
52	NC_022529	AACTCA	2	12	89156	89167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549692060
53	NC_022529	CTTTAA	2	12	90936	90947	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549692061
54	NC_022529	ATATTT	2	12	91696	91707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692062
55	NC_022529	TGTAAC	2	12	94108	94119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549692064
56	NC_022529	CAGGAA	2	12	94816	94827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549692065
57	NC_022529	TTGTGT	2	12	95402	95413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549692065
58	NC_022529	ATAAAA	2	12	97227	97238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549692066
59	NC_022529	TTAATG	2	12	99443	99454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549692069
60	NC_022529	GCAAGC	2	12	99523	99534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549692069
61	NC_022529	AACTTA	2	12	102263	102274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549692073
62	NC_022529	TTAGAA	2	12	104563	104574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549692075
63	NC_022529	AAAAAT	2	12	106866	106877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549692078
64	NC_022529	GGTTTG	2	12	112571	112582	0 %	50 %	50 %	0 %	549692085
65	NC_022529	AAAGAA	2	12	112850	112861	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692086
66	NC_022529	AAAATA	2	12	114382	114393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549692088
67	NC_022529	AATAGT	2	12	115335	115346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549692089
68	NC_022529	ATTTTG	2	12	115919	115930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692090
69	NC_022529	GAAAAA	2	12	116826	116837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692091
70	NC_022529	GTTGTG	2	12	117673	117684	0 %	50 %	50 %	0 %	549692092
71	NC_022529	TTTGAT	2	12	119293	119304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692094
72	NC_022529	TTCTTT	2	12	128948	128959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549692106
73	NC_022529	GGGCTT	2	12	129627	129638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549692107
74	NC_022529	AAAGAT	2	12	132699	132710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692109
75	NC_022529	TTCAGG	2	12	133962	133973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549692111
76	NC_022529	GCTTTA	2	12	134008	134019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692111
77	NC_022529	TTGTTA	2	12	134784	134795	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692113
78	NC_022529	AAAGAA	2	12	134923	134934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692113
79	NC_022529	GAAAAA	2	12	137618	137629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692115
80	NC_022529	AGATGA	2	12	137885	137896	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549692116
81	NC_022529	ATTTTA	2	12	138457	138468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549692116
82	NC_022529	ACCTTT	2	12	140704	140715	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692117
83	NC_022529	TAAGGA	2	12	145695	145706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549692123
84	NC_022529	TTTTAC	2	12	147710	147721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692124
85	NC_022529	ACATTT	2	12	148363	148374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549692124
86	NC_022529	CTGCTC	2	12	149586	149597	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549692127
87	NC_022529	ATTTTC	2	12	150508	150519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692128
88	NC_022529	TTAGAT	2	12	151811	151822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549692129
89	NC_022529	AAAACT	2	12	153547	153558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549692131
90	NC_022529	ATAAAA	2	12	153615	153626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549692131
91	NC_022529	TTTTGC	2	12	154171	154182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549692132
92	NC_022529	AGCTAT	2	12	155226	155237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549692134
93	NC_022529	GGCTAA	2	12	155625	155636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549692134
94	NC_022529	ATTTTT	2	12	156352	156363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549692136
95	NC_022529	TCAAAT	2	12	157251	157262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549692137
96	NC_022529	AAATAA	2	12	160020	160031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549692142
97	NC_022529	ATTTTC	2	12	162092	162103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692144
98	NC_022529	AGCTTT	2	12	162788	162799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692145
99	NC_022529	GGCTGT	2	12	163431	163442	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549692146
100	NC_022529	TATAAA	2	12	164096	164107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692147
101	NC_022529	AAAAGC	2	12	165594	165605	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549692148
102	NC_022529	AACAAG	2	12	166386	166397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549692149
103	NC_022529	TCCTTA	2	12	168291	168302	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692150
104	NC_022529	ATTCTA	2	12	169108	169119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549692152
105	NC_022529	GCTATT	2	12	169335	169346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692152
106	NC_022529	TTGCAG	2	12	170682	170693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549692153
107	NC_022529	AACATA	2	12	171030	171041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549692153
108	NC_022529	TGACTT	2	12	173371	173382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549692156
109	NC_022529	AAAACC	2	12	174475	174486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549692158
110	NC_022529	CAAGGA	2	12	176845	176856	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549692160
111	NC_022529	TAGGAT	2	12	178405	178416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549692161
112	NC_022529	AATGAA	2	12	181249	181260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692165
113	NC_022529	AAGTGC	2	12	182454	182465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549692165
114	NC_022529	CCTAAT	2	12	182473	182484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549692165
115	NC_022529	CTTACT	2	12	184073	184084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549692167
116	NC_022529	ATTAAA	2	12	185452	185463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549692168
117	NC_022529	ATCAAT	2	12	186197	186208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549692169
118	NC_022529	TTTTAG	2	12	194864	194875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692176
119	NC_022529	AAAGAA	2	12	195003	195014	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692177
120	NC_022529	AAAGGC	2	12	197267	197278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549692179
121	NC_022529	GTTTAT	2	12	197531	197542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692179
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125	NC_022529	TTTGAT	2	12	201372	201383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549692185
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231	NC_022529	ATTTTC	2	12	376136	376147	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549692379
232	NC_022529	AAAAGA	2	12	379348	379359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549692384
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234	NC_022529	ACTAAA	2	12	382457	382468	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549692388
235	NC_022529	TGCAAG	2	12	391610	391621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549692391
236	NC_022529	AACAAA	2	12	391781	391792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	549692391
237	NC_022529	AGTAAA	2	12	391800	391811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692391
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348	NC_022529	GTAAAA	2	12	578511	578522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549692593
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