MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 1683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	549691987
2	NC_022529	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	549691987
3	NC_022529	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	549691987
4	NC_022529	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	549691989
5	NC_022529	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	549691990
6	NC_022529	TTGTT	2	10	6483	6492	0 %	80 %	20 %	0 %	549691991
7	NC_022529	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022529	GTTTT	2	10	7484	7493	0 %	80 %	20 %	0 %	549691992
9	NC_022529	ATTTT	2	10	8702	8711	20 %	80 %	0 %	0 %	549691993
10	NC_022529	AAGAG	2	10	9734	9743	60 %	0 %	40 %	0 %	549691993
11	NC_022529	TGCTT	2	10	10043	10052	0 %	60 %	20 %	20 %	549691993
12	NC_022529	ACTTC	2	10	10396	10405	20 %	40 %	0 %	40 %	549691993
13	NC_022529	TCAAA	2	10	10958	10967	60 %	20 %	0 %	20 %	549691993
14	NC_022529	GACAA	2	10	13566	13575	60 %	0 %	20 %	20 %	549691994
15	NC_022529	CTTAA	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	549691997
16	NC_022529	CATTT	2	10	15545	15554	20 %	60 %	0 %	20 %	549691997
17	NC_022529	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022529	GCGAT	2	10	15815	15824	20 %	20 %	40 %	20 %	549691998
19	NC_022529	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022529	TTTCA	2	10	18511	18520	20 %	60 %	0 %	20 %	549692000
21	NC_022529	AAGAT	2	10	20063	20072	60 %	20 %	20 %	0 %	549692001
22	NC_022529	ACCAA	2	10	21726	21735	60 %	0 %	0 %	40 %	549692003
23	NC_022529	GTTAA	2	10	21893	21902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022529	AGATA	2	10	23650	23659	60 %	20 %	20 %	0 %	549692004
25	NC_022529	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	549692007
26	NC_022529	ATGGT	2	10	25864	25873	20 %	40 %	40 %	0 %	549692007
27	NC_022529	TTCTT	2	10	26410	26419	0 %	80 %	0 %	20 %	549692007
28	NC_022529	AGATA	2	10	28168	28177	60 %	20 %	20 %	0 %	549692009
29	NC_022529	GCTTT	2	10	28682	28691	0 %	60 %	20 %	20 %	549692009
30	NC_022529	ATCAA	2	10	29289	29298	60 %	20 %	0 %	20 %	549692009
31	NC_022529	ATACT	2	10	30091	30100	40 %	40 %	0 %	20 %	549692009
32	NC_022529	AATCC	2	10	30542	30551	40 %	20 %	0 %	40 %	549692010
33	NC_022529	TGTTT	2	10	31529	31538	0 %	80 %	20 %	0 %	549692010
34	NC_022529	GCAAA	2	10	31596	31605	60 %	0 %	20 %	20 %	549692010
35	NC_022529	GAAAT	2	10	32014	32023	60 %	20 %	20 %	0 %	549692011
36	NC_022529	AAAGT	2	10	32498	32507	60 %	20 %	20 %	0 %	549692011
37	NC_022529	AAAAT	2	10	33750	33759	80 %	20 %	0 %	0 %	549692012
38	NC_022529	ATTAT	2	10	34495	34504	40 %	60 %	0 %	0 %	549692013
39	NC_022529	AAATC	2	10	35165	35174	60 %	20 %	0 %	20 %	549692013
40	NC_022529	TATAT	2	10	36987	36996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022529	CTTTT	2	10	37276	37285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022529	CTTTT	2	10	37447	37456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022529	GGTAA	2	10	37759	37768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022529	TCGTG	2	10	38555	38564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022529	TCTTT	2	10	39583	39592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022529	CCGTA	2	10	41441	41450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022529	AAGAA	2	10	42885	42894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022529	AAAAT	2	10	43546	43555	80 %	20 %	0 %	0 %	549692015
49	NC_022529	TTGAC	2	10	45271	45280	20 %	40 %	20 %	20 %	549692016
50	NC_022529	AAGAA	2	10	46175	46184	80 %	0 %	20 %	0 %	549692016
51	NC_022529	GAAAT	2	10	47677	47686	60 %	20 %	20 %	0 %	549692016
52	NC_022529	ATTTT	2	10	48040	48049	20 %	80 %	0 %	0 %	549692016
53	NC_022529	CAAAA	2	10	48288	48297	80 %	0 %	0 %	20 %	549692016
54	NC_022529	AAAAT	2	10	48319	48328	80 %	20 %	0 %	0 %	549692016
55	NC_022529	ATAAA	2	10	48846	48855	80 %	20 %	0 %	0 %	549692017
56	NC_022529	AATTT	2	10	48971	48980	40 %	60 %	0 %	0 %	549692017
57	NC_022529	ACAAA	2	10	49304	49313	80 %	0 %	0 %	20 %	549692017
58	NC_022529	AAATT	2	10	50366	50375	60 %	40 %	0 %	0 %	549692018
59	NC_022529	TTTTA	2	10	51101	51110	20 %	80 %	0 %	0 %	549692018
60	NC_022529	CAAGA	2	10	51650	51659	60 %	0 %	20 %	20 %	549692018
61	NC_022529	AGCTT	2	10	51777	51786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022529	CAAGG	2	10	53637	53646	40 %	0 %	40 %	20 %	549692020
63	NC_022529	CAAAT	2	10	53826	53835	60 %	20 %	0 %	20 %	549692021
64	NC_022529	TACTC	2	10	56106	56115	20 %	40 %	0 %	40 %	549692022
65	NC_022529	GATAA	2	10	56504	56513	60 %	20 %	20 %	0 %	549692023
66	NC_022529	CTTTT	2	10	57588	57597	0 %	80 %	0 %	20 %	549692024
67	NC_022529	TTTCA	2	10	57835	57844	20 %	60 %	0 %	20 %	549692024
68	NC_022529	AAGAT	2	10	59227	59236	60 %	20 %	20 %	0 %	549692025
69	NC_022529	TAATG	2	10	59279	59288	40 %	40 %	20 %	0 %	549692025
70	NC_022529	GATAA	2	10	59606	59615	60 %	20 %	20 %	0 %	549692026
71	NC_022529	AAATT	2	10	60542	60551	60 %	40 %	0 %	0 %	549692026
72	NC_022529	TACTA	2	10	62398	62407	40 %	40 %	0 %	20 %	549692028
73	NC_022529	TGCTT	2	10	63192	63201	0 %	60 %	20 %	20 %	549692028
74	NC_022529	AATAT	2	10	63377	63386	60 %	40 %	0 %	0 %	549692028
75	NC_022529	CATTT	2	10	63976	63985	20 %	60 %	0 %	20 %	549692029
76	NC_022529	AATTT	2	10	63990	63999	40 %	60 %	0 %	0 %	549692029
77	NC_022529	ATTTC	2	10	64092	64101	20 %	60 %	0 %	20 %	549692029
78	NC_022529	TGATT	2	10	64143	64152	20 %	60 %	20 %	0 %	549692029
79	NC_022529	TTTTA	2	10	64210	64219	20 %	80 %	0 %	0 %	549692029
80	NC_022529	GATAA	2	10	65144	65153	60 %	20 %	20 %	0 %	549692029
81	NC_022529	TCAAA	2	10	65694	65703	60 %	20 %	0 %	20 %	549692030
82	NC_022529	TGTGT	2	10	66189	66198	0 %	60 %	40 %	0 %	549692030
83	NC_022529	AATAA	2	10	66368	66377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022529	AAAAT	2	10	67424	67433	80 %	20 %	0 %	0 %	549692032
85	NC_022529	GCTTT	2	10	67717	67726	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022529	ATATT	2	10	69514	69523	40 %	60 %	0 %	0 %	549692036
87	NC_022529	CTCTT	2	10	72535	72544	0 %	60 %	0 %	40 %	549692040
88	NC_022529	TTTTC	2	10	72576	72585	0 %	80 %	0 %	20 %	549692040
89	NC_022529	TCTCT	2	10	72840	72849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022529	ATCTC	2	10	73391	73400	20 %	40 %	0 %	40 %	549692041
91	NC_022529	GCCAA	2	10	73529	73538	40 %	0 %	20 %	40 %	549692041
92	NC_022529	TTTTG	2	10	74773	74782	0 %	80 %	20 %	0 %	549692042
93	NC_022529	TAAGG	2	10	79247	79256	40 %	20 %	40 %	0 %	549692047
94	NC_022529	ATTTT	2	10	79300	79309	20 %	80 %	0 %	0 %	549692047
95	NC_022529	TAGGA	2	10	79576	79585	40 %	20 %	40 %	0 %	549692048
96	NC_022529	AAAAT	2	10	79602	79611	80 %	20 %	0 %	0 %	549692048
97	NC_022529	ATTTT	2	10	79612	79621	20 %	80 %	0 %	0 %	549692048
98	NC_022529	TGGAT	2	10	80041	80050	20 %	40 %	40 %	0 %	549692049
99	NC_022529	TAAAA	2	10	80322	80331	80 %	20 %	0 %	0 %	549692051
100	NC_022529	TTGTT	2	10	80479	80488	0 %	80 %	20 %	0 %	549692051
101	NC_022529	TAAGA	2	10	80631	80640	60 %	20 %	20 %	0 %	549692051
102	NC_022529	TTAAT	2	10	80941	80950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022529	TATTT	2	10	81009	81018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022529	GTATA	2	10	81025	81034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022529	TAAAA	2	10	84799	84808	80 %	20 %	0 %	0 %	549692055
106	NC_022529	CAAAA	2	10	85332	85341	80 %	0 %	0 %	20 %	549692055
107	NC_022529	TTAAA	2	10	85765	85774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022529	ATTGT	2	10	85805	85814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022529	TAAAA	2	10	88042	88051	80 %	20 %	0 %	0 %	549692058
110	NC_022529	GAAAT	2	10	88915	88924	60 %	20 %	20 %	0 %	549692060
111	NC_022529	TGGTT	2	10	89099	89108	0 %	60 %	40 %	0 %	549692060
112	NC_022529	TCCAT	2	10	89712	89721	20 %	40 %	0 %	40 %	549692060
113	NC_022529	TATTT	2	10	90259	90268	20 %	80 %	0 %	0 %	549692061
114	NC_022529	TTTTA	2	10	90271	90280	20 %	80 %	0 %	0 %	549692061
115	NC_022529	TATTT	2	10	90619	90628	20 %	80 %	0 %	0 %	549692061
116	NC_022529	TTGGC	2	10	91133	91142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022529	AAGAT	2	10	91220	91229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022529	GTAAA	2	10	91869	91878	60 %	20 %	20 %	0 %	549692062
119	NC_022529	TTATT	2	10	92019	92028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022529	AGAAT	2	10	92403	92412	60 %	20 %	20 %	0 %	549692063
121	NC_022529	TTAAA	2	10	93045	93054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022529	AAGAA	2	10	93085	93094	80 %	0 %	20 %	0 %	549692064
123	NC_022529	CCTTG	2	10	93526	93535	0 %	40 %	20 %	40 %	549692064
124	NC_022529	AGGTA	2	10	94042	94051	40 %	20 %	40 %	0 %	549692064
125	NC_022529	ACCTT	2	10	96812	96821	20 %	40 %	0 %	40 %	549692066
126	NC_022529	TATTT	2	10	97327	97336	20 %	80 %	0 %	0 %	549692067
127	NC_022529	TCAAA	2	10	97385	97394	60 %	20 %	0 %	20 %	549692067
128	NC_022529	ATTTA	2	10	97512	97521	40 %	60 %	0 %	0 %	549692067
129	NC_022529	TTAGA	2	10	97656	97665	40 %	40 %	20 %	0 %	549692067
130	NC_022529	GCTTT	2	10	97747	97756	0 %	60 %	20 %	20 %	549692068
131	NC_022529	CAAGT	2	10	97796	97805	40 %	20 %	20 %	20 %	549692068
132	NC_022529	GTTTA	2	10	98264	98273	20 %	60 %	20 %	0 %	549692068
133	NC_022529	TAAAA	2	10	98329	98338	80 %	20 %	0 %	0 %	549692068
134	NC_022529	ATGAA	2	10	98408	98417	60 %	20 %	20 %	0 %	549692069
135	NC_022529	AAATG	2	10	98514	98523	60 %	20 %	20 %	0 %	549692069
136	NC_022529	AGGCA	2	10	99150	99159	40 %	0 %	40 %	20 %	549692069
137	NC_022529	TAAAA	2	10	99513	99522	80 %	20 %	0 %	0 %	549692069
138	NC_022529	AAATT	2	10	100508	100517	60 %	40 %	0 %	0 %	549692070
139	NC_022529	AAAAC	2	10	100769	100778	80 %	0 %	0 %	20 %	549692070
140	NC_022529	AAAGC	2	10	101203	101212	60 %	0 %	20 %	20 %	549692071
141	NC_022529	CTTTG	2	10	101616	101625	0 %	60 %	20 %	20 %	549692072
142	NC_022529	AAGAA	2	10	102579	102588	80 %	0 %	20 %	0 %	549692073
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248	NC_022529	GATTT	2	10	218790	218799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_022529	CATAA	2	10	225641	225650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_022529	TGATA	2	10	225993	226002	40 %	40 %	20 %	0 %	549692217
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264	NC_022529	TTGAT	2	10	230299	230308	20 %	60 %	20 %	0 %	549692223
265	NC_022529	CACTG	2	10	232427	232436	20 %	20 %	20 %	40 %	549692224
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267	NC_022529	ATATT	2	10	236609	236618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022529	GCAAA	2	10	237181	237190	60 %	0 %	20 %	20 %	549692230
269	NC_022529	ATTTT	2	10	238353	238362	20 %	80 %	0 %	0 %	549692232
270	NC_022529	AAATT	2	10	238761	238770	60 %	40 %	0 %	0 %	549692232
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