MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022529	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022529	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022529	GTTAA	2	10	21893	21902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022529	TATAT	2	10	36987	36996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022529	CTTTT	2	10	37276	37285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022529	CTTTT	2	10	37447	37456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022529	GGTAA	2	10	37759	37768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022529	TCGTG	2	10	38555	38564	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022529	TCTTT	2	10	39583	39592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022529	CCGTA	2	10	41441	41450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022529	AAGAA	2	10	42885	42894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022529	AGCTT	2	10	51777	51786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022529	AATAA	2	10	66368	66377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022529	GCTTT	2	10	67717	67726	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022529	TCTCT	2	10	72840	72849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022529	TTAAT	2	10	80941	80950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022529	TATTT	2	10	81009	81018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022529	GTATA	2	10	81025	81034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022529	TTAAA	2	10	85765	85774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022529	ATTGT	2	10	85805	85814	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022529	TTGGC	2	10	91133	91142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022529	AAGAT	2	10	91220	91229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022529	TTATT	2	10	92019	92028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022529	TTAAA	2	10	93045	93054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022529	TAAAA	2	10	137779	137788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022529	TATTT	2	10	148847	148856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022529	TTATT	2	10	163059	163068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022529	TATTT	2	10	170216	170225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022529	TAAAA	2	10	180407	180416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022529	AAAAT	2	10	184575	184584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022529	AAGTG	2	10	187461	187470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022529	AGGAT	2	10	188646	188655	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022529	TAAAA	2	10	190004	190013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022529	TAGAT	2	10	199849	199858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022529	AAAAT	2	10	215300	215309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022529	GATTT	2	10	218790	218799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022529	CATAA	2	10	225641	225650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022529	ATATT	2	10	236609	236618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022529	ATTAA	2	10	239887	239896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022529	TTAAT	2	10	241804	241813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022529	ATAAA	2	10	260167	260176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022529	AATTT	2	10	268119	268128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022529	TTAAA	2	10	293066	293075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022529	TTTTA	2	10	311984	311993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022529	ATTAA	2	10	328055	328064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022529	ATTAA	2	10	330548	330557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022529	CTTTT	2	10	384382	384391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022529	CTTTT	2	10	384553	384562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022529	GGTAA	2	10	384865	384874	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022529	TCGTG	2	10	385661	385670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022529	TCTTT	2	10	386689	386698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022529	CCGTA	2	10	388547	388556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022529	AAGAA	2	10	389991	390000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022529	CTTAT	2	10	395624	395633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022529	ATTTT	2	10	400150	400159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022529	TAAAT	2	10	421435	421444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022529	TTGCT	2	10	424797	424806	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022529	GATTT	2	10	438632	438641	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022529	TGTTT	2	10	449156	449165	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022529	AATTT	2	10	449197	449206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022529	TTTAT	2	10	453214	453223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022529	TTTAA	2	10	453989	453998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022529	ACTAA	2	10	467428	467437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022529	AAATT	2	10	478113	478122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022529	ATATT	2	10	483206	483215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022529	AATAA	2	10	483224	483233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022529	TAATT	2	10	483241	483250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022529	AAAAT	2	10	533253	533262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022529	GTTTT	2	10	536346	536355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022529	AAATA	2	10	536655	536664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022529	CATTC	2	10	537371	537380	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022529	TTTAA	2	10	537406	537415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022529	TTTTA	2	10	545661	545670	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022529	AAAAT	2	10	545695	545704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022529	AATTA	2	10	548155	548164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022529	ATTTG	2	10	564022	564031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022529	TAAAA	2	10	577884	577893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022529	GAAAA	2	10	618579	618588	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022529	TTTGC	2	10	622100	622109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_022529	AATTA	2	10	638149	638158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022529	TTTAA	2	10	647133	647142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022529	AAAAT	2	10	665463	665472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022529	ATTTT	2	10	665510	665519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022529	TAAAA	2	10	665553	665562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022529	GCTTA	2	10	668458	668467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022529	TAAAA	3	15	684780	684794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022529	ATAAA	2	10	685603	685612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022529	ATTTA	2	10	687188	687197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022529	TTTAA	2	10	694517	694526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022529	TAAAA	2	10	717580	717589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022529	AAAAT	2	10	717650	717659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022529	ATTTT	2	10	717671	717680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022529	ATTTT	2	10	717743	717752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022529	CTTTT	2	10	725637	725646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022529	CTTTT	2	10	725808	725817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022529	GGTAA	2	10	726120	726129	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022529	TCGTG	2	10	726916	726925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022529	TCTTT	2	10	727944	727953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022529	CCGTA	2	10	729802	729811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_022529	AAGAA	2	10	731246	731255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022529	ATTTA	2	10	739379	739388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022529	TTTTC	2	10	769794	769803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022529	ATTTT	2	10	835678	835687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022529	TTTTA	2	10	835869	835878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022529	AGGTT	2	10	841316	841325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022529	AAAAT	2	10	849378	849387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022529	AAAAT	2	10	880262	880271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022529	TAAAT	2	10	880295	880304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022529	ATTTT	2	10	885925	885934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022529	CTTAA	2	10	898072	898081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022529	TAAAT	2	10	898839	898848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022529	GGAAA	2	10	899088	899097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022529	AAAAT	2	10	924166	924175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022529	TTAAT	2	10	936143	936152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022529	AATTA	2	10	962393	962402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022529	TAAAA	2	10	991024	991033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022529	TTTAT	2	10	996849	996858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022529	TTAAT	2	10	1001947	1001956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022529	CTTTT	2	10	1024575	1024584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022529	AAAAT	2	10	1056971	1056980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022529	TATAT	2	10	1083730	1083739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022529	TTTTA	2	10	1089164	1089173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022529	AGAAA	2	10	1122703	1122712	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022529	AAATT	2	10	1133635	1133644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022529	TTTAA	2	10	1137238	1137247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022529	AGTTT	2	10	1151581	1151590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022529	ATTTT	2	10	1155771	1155780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022529	TATCA	2	10	1161748	1161757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022529	TAAAA	2	10	1164155	1164164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022529	TTTTA	2	10	1169223	1169232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022529	TTTAT	2	10	1190921	1190930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022529	AAACT	2	10	1190950	1190959	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022529	TTTAA	2	10	1190971	1190980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022529	ATTTA	2	10	1194965	1194974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022529	TATTT	2	10	1210946	1210955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022529	TTTAT	2	10	1210994	1211003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022529	AATTT	2	10	1212743	1212752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022529	ATGTG	2	10	1256862	1256871	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022529	TTTAA	2	10	1257009	1257018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022529	AAAAT	2	10	1257030	1257039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022529	TTTAA	2	10	1266464	1266473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022529	ATATT	2	10	1275948	1275957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022529	TAAAA	2	10	1280108	1280117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022529	ATTTT	2	10	1284610	1284619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022529	TATAT	2	10	1284635	1284644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022529	TAAAA	2	10	1305488	1305497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022529	TATTT	2	10	1324646	1324655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_022529	TATAT	2	10	1665233	1665242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.