MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni 4031 genome sequence

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022529	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022529	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022529	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022529	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022529	AAAT	2	8	21868	21875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022529	TGAT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022529	AAGG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022529	TTAT	2	8	35888	35895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022529	TTTA	2	8	37095	37102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022529	CTAT	2	8	37495	37502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022529	ATTT	2	8	39369	39376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022529	CAAG	2	8	39525	39532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022529	TAGC	2	8	40190	40197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022529	CTTA	2	8	40852	40859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022529	AAAG	2	8	40923	40930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022529	AGTA	2	8	40983	40990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022529	TAAT	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022529	GGAT	2	8	41376	41383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022529	GGTG	2	8	41461	41468	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022529	TCCC	2	8	41603	41610	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_022529	TCGT	2	8	42151	42158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022529	ATTT	2	8	43160	43167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022529	AGGA	2	8	49655	49662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022529	TAAA	2	8	56298	56305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022529	TAAA	2	8	61181	61188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022529	TAAA	2	8	66387	66394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022529	TATT	2	8	66625	66632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022529	ATTT	2	8	66666	66673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022529	AGAA	2	8	66753	66760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022529	AATT	2	8	68184	68191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022529	ATTT	2	8	76151	76158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022529	AAAT	2	8	76184	76191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022529	TTTA	2	8	78353	78360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022529	TTTA	2	8	79659	79666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022529	ATTA	2	8	85816	85823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022529	TAAA	2	8	85854	85861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022529	ATCA	2	8	91184	91191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022529	AATT	2	8	92005	92012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022529	ATTT	2	8	92052	92059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022529	TAAA	3	12	92061	92072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022529	TAAA	2	8	92886	92893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022529	AGGA	2	8	97694	97701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022529	ATTA	2	8	115683	115690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022529	AAGG	2	8	121776	121783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022529	AAGG	2	8	130506	130513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022529	TAAA	2	8	143337	143344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022529	AATT	2	8	143358	143365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022529	CTTT	2	8	148823	148830	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022529	ATTT	2	8	158983	158990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022529	CAAA	2	8	162416	162423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022529	TTAA	2	8	162451	162458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022529	AAAT	2	8	162467	162474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022529	TAAA	2	8	163074	163081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022529	TAAA	2	8	168900	168907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022529	TTGC	2	8	180448	180455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022529	ATTT	2	8	184597	184604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022529	TTTA	2	8	187000	187007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022529	AAGA	2	8	188434	188441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022529	TTTA	2	8	198662	198669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022529	CAAG	2	8	200138	200145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022529	TAAA	2	8	204582	204589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022529	TAAA	2	8	204635	204642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022529	TAAA	2	8	209575	209582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022529	TAAA	2	8	210396	210403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022529	GGTT	2	8	210482	210489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022529	ATTA	3	12	215840	215851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022529	GTTA	2	8	219930	219937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022529	TAAA	2	8	222884	222891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022529	TTTG	2	8	222917	222924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022529	GTTT	2	8	236445	236452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022529	TCCC	2	8	236529	236536	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_022529	TTGA	2	8	236578	236585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022529	AAAT	2	8	246140	246147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022529	ATTT	2	8	246185	246192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022529	CTTT	2	8	256055	256062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022529	CTTT	2	8	256089	256096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022529	TTAA	2	8	257794	257801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022529	ATTG	2	8	258625	258632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022529	GCAA	2	8	258720	258727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022529	ATGA	2	8	264398	264405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022529	AAGT	2	8	264408	264415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022529	AATA	2	8	285145	285152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022529	AAAG	2	8	293058	293065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022529	TTTA	2	8	294304	294311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022529	TAAA	2	8	305364	305371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022529	ATTT	2	8	306591	306598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022529	TAAA	2	8	315323	315330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022529	ATAA	2	8	317106	317113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022529	ATTA	2	8	317144	317151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022529	ATTT	2	8	317174	317181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022529	TAAA	2	8	322019	322026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022529	TATT	2	8	330562	330569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022529	TTTA	2	8	361900	361907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022529	TAAA	2	8	371111	371118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022529	TTTA	2	8	374172	374179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022529	ATTA	2	8	377380	377387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022529	TTTA	2	8	384201	384208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022529	CTAT	2	8	384601	384608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022529	ATTT	2	8	386475	386482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022529	CAAG	2	8	386631	386638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022529	TAGC	2	8	387296	387303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022529	CTTA	2	8	387958	387965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022529	AAAG	2	8	388029	388036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022529	AGTA	2	8	388089	388096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022529	TAAT	2	8	388212	388219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022529	GGAT	2	8	388482	388489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022529	GGTG	2	8	388567	388574	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022529	TCCC	2	8	388709	388716	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_022529	TCGT	2	8	389257	389264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022529	TTAC	2	8	390219	390226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022529	GATA	2	8	394275	394282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022529	TTAA	2	8	395471	395478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022529	TTAA	2	8	395492	395499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022529	ATTT	2	8	395588	395595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022529	ATCT	2	8	395606	395613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022529	GTTT	2	8	395694	395701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022529	TTAA	2	8	402711	402718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022529	ATAA	2	8	404923	404930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022529	ATTT	2	8	424369	424376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022529	ATTT	2	8	424809	424816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022529	AAAG	2	8	438205	438212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022529	TCAT	2	8	438608	438615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022529	TTAA	2	8	449189	449196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022529	ATTA	2	8	449212	449219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022529	TTTA	2	8	449339	449346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022529	ATGT	2	8	449371	449378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022529	GTTT	2	8	460781	460788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022529	ATTG	2	8	460830	460837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022529	AGAA	2	8	461005	461012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022529	ATTA	2	8	466665	466672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022529	TTTA	2	8	467364	467371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022529	AAAG	2	8	474865	474872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022529	TTTA	2	8	483128	483135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022529	TATT	2	8	483180	483187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022529	TACT	2	8	483664	483671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022529	AACA	2	8	487792	487799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022529	TAAA	2	8	492693	492700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022529	TTTA	2	8	500402	500409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022529	CTTT	2	8	500803	500810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022529	ATTT	2	8	514424	514431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022529	AATA	2	8	514473	514480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022529	AAAT	2	8	514529	514536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022529	GTTT	2	8	517137	517144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022529	AAAC	2	8	517153	517160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022529	ATTT	2	8	533202	533209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022529	CAAA	2	8	536358	536365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022529	TTTC	2	8	536501	536508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022529	ATCA	2	8	536678	536685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022529	ATTT	2	8	537348	537355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022529	TTTA	2	8	544643	544650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022529	TTTA	2	8	545734	545741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.