MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022528	TCTTTT	2	12	6294	6305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022528	GGCAAA	2	12	14297	14308	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022528	CTTGAT	2	12	14661	14672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022528	TGAAAT	2	12	41444	41455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022528	AGAACT	2	12	42389	42400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022528	CAAATT	2	12	77680	77691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022528	ATAAAA	2	12	96539	96550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022528	GATGCA	2	12	308195	308206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022528	CTGCCT	2	12	317790	317801	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022528	ATCAAT	2	12	318681	318692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022528	CAGATA	2	12	336843	336854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022528	TAAAGA	2	12	338996	339007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022528	CTTTAT	2	12	347717	347728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022528	AAAGCC	2	12	389708	389719	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022528	TGAAAT	2	12	426493	426504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022528	AATTGT	2	12	564655	564666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022528	TTATTG	2	12	575226	575237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022528	TTTTTA	2	12	580771	580782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022528	ATAAAA	2	12	581130	581141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022528	TAGGGT	2	12	587882	587893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022528	CTTTTT	2	12	594756	594767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022528	ATTCTT	2	12	640774	640785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022528	ATGAAT	2	12	654058	654069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022528	AAAATG	2	12	692400	692411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022528	CTTTTT	2	12	717358	717369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022528	GTTAAA	2	12	722306	722317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022528	ATTTTT	2	12	742408	742419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022528	AAACAA	2	12	820618	820629	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022528	GTTTTT	2	12	869556	869567	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022528	AATGAT	2	12	888356	888367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022528	TTCAAT	2	12	982050	982061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022528	CTTCAT	2	12	1023805	1023816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022528	ATGTAA	2	12	1035099	1035110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022528	GCTTTG	2	12	1142975	1142986	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022528	CTTCAC	2	12	1161703	1161714	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022528	GAAACG	2	12	1207978	1207989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022528	AAAAAT	2	12	1229663	1229674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022528	TACAAA	2	12	1254667	1254678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022528	GAAAAA	2	12	1305654	1305665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022528	AAATAA	2	12	1312797	1312808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022528	TTCATT	2	12	1327219	1327230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022528	TTTGTA	2	12	1423341	1423352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022528	TAATTA	2	12	1545286	1545297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022528	TTCATT	2	12	1589082	1589093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022528	AAAATG	2	12	1589110	1589121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022528	GTATTT	2	12	1600863	1600874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022528	GTTTTT	2	12	1633531	1633542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022528	TAGGGT	2	12	1642179	1642190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022528	ATCATT	2	12	1644098	1644109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022528	GAAATA	2	12	1674915	1674926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022528	CTGCGG	2	12	1688462	1688473	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022528	TATAAA	2	12	1698213	1698224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022528	CAGATT	2	12	1739468	1739479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022528	ATAAAT	2	12	1739991	1740002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022528	TTTTTG	2	12	1758937	1758948	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022528	TGATAG	2	12	1770598	1770609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022528	AGCCGA	2	12	1774029	1774040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022528	AAGTTG	2	12	1831267	1831278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022528	AAGGGA	2	12	1831397	1831408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022528	ATCAAA	2	12	1854514	1854525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022528	ATAAAA	2	12	1888223	1888234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022528	AACATA	2	12	1940862	1940873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022528	AATTTG	2	12	1945525	1945536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022528	TCAGGT	2	12	1978585	1978596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022528	CAAAAC	2	12	2033272	2033283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022528	GTTCTG	2	12	2070478	2070489	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022528	TAATGA	2	12	2096350	2096361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022528	TAAAAT	2	12	2105174	2105185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022528	TGATCC	2	12	2117453	2117464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022528	TACACC	2	12	2165595	2165606	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022528	ATACAA	2	12	2280380	2280391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022528	ATTATA	2	12	2283885	2283896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022528	ACCATC	2	12	2316848	2316859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022528	ATCATT	2	12	2320141	2320152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022528	GCTGTG	2	12	2340838	2340849	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022528	ATTTTT	2	12	2403525	2403536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022528	TAAAAA	2	12	2451911	2451922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022528	ACATAT	2	12	2463076	2463087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022528	AATTAA	2	12	2467355	2467366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022528	GGTTTT	2	12	2477038	2477049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022528	AAGTGT	2	12	2494463	2494474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022528	AACCAG	2	12	2524841	2524852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022528	TGTTTC	2	12	2534675	2534686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022528	TGATAG	2	12	2555954	2555965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022528	CATTTT	2	12	2578180	2578191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022528	TCAACT	2	12	2615223	2615234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022528	AACAAA	2	12	2682158	2682169	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022528	AAAAAC	2	12	2694348	2694359	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022528	TTTTCA	2	12	2727886	2727897	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022528	TAAATG	2	12	2737630	2737641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022528	TCTTTT	2	12	2737650	2737661	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022528	AAATAT	2	12	2764402	2764413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022528	TCACAC	2	12	2774148	2774159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022528	GTTCAG	5	30	2796356	2796385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022528	CATCTC	2	12	2810994	2811005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022528	CGCTTT	2	12	2812766	2812777	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022528	ACTTTT	2	12	2812785	2812796	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022528	CAATTG	2	12	2819017	2819028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022528	TAAAAA	2	12	2823570	2823581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022528	TTTATT	2	12	2876366	2876377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022528	ACACAA	2	12	2933993	2934004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022528	GATTTG	2	12	2939768	2939779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022528	AGTTAA	2	12	2964394	2964405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022528	TAGAAA	2	12	2973955	2973966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022528	TATTGA	2	12	2981897	2981908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022528	GCGTTT	2	12	2985118	2985129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022528	CTAATT	2	12	3019235	3019246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022528	TTAAAA	2	12	3024141	3024152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022528	TATAAA	2	12	3064130	3064141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022528	CATATG	2	12	3094800	3094811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022528	AAAAAG	2	12	3117753	3117764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022528	TTTCGC	2	12	3167112	3167123	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022528	TAATTT	2	12	3203376	3203387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022528	ATTTCA	2	12	3239537	3239548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022528	AAATCA	2	12	3255462	3255473	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022528	TCCCCT	2	12	3260855	3260866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022528	ATCTCT	2	12	3291602	3291613	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022528	ATCAAC	2	12	3306959	3306970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022528	TCAAAA	2	12	3323712	3323723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_022528	AAAAAT	2	12	3361739	3361750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022528	AATTTT	2	12	3374475	3374486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022528	TAGTTT	2	12	3392755	3392766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022528	TTATTT	2	12	3400136	3400147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022528	TATCGC	2	12	3400711	3400722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022528	TTTTGT	2	12	3407380	3407391	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022528	ATTTCA	2	12	3516356	3516367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022528	ATTTCA	2	12	3522099	3522110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022528	TTAACT	2	12	3542236	3542247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022528	AATTAA	2	12	3574951	3574962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022528	CTTTTT	2	12	3664563	3664574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022528	CAGAAA	2	12	3682256	3682267	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022528	ATTTCA	2	12	3694003	3694014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022528	TTATAC	2	12	3740380	3740391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_022528	ATTTTG	2	12	3758353	3758364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022528	AGAAAA	2	12	3782010	3782021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022528	AATTAA	2	12	3866476	3866487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022528	GAACTT	2	12	3868445	3868456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_022528	AATAAA	2	12	3933275	3933286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022528	ATTTCA	2	12	3990190	3990201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_022528	ATTTCA	2	12	4037150	4037161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022528	AAATAG	2	12	4043437	4043448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.