MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	TCTTAA	2	12	23206	23217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022525	TGTGGT	2	12	74850	74861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022525	AAAGAA	2	12	75344	75355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022525	CGGGTG	2	12	116555	116566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022525	AATGCT	2	12	121181	121192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022525	AAGAGG	2	12	128371	128382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022525	GGATAA	2	12	134331	134342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022525	TAAAAT	2	12	224420	224431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022525	ATAAAT	2	12	225110	225121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022525	CAATAT	2	12	244114	244125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022525	CCTGCT	2	12	331584	331595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022525	AGATGA	2	12	373915	373926	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022525	TTCTCA	2	12	381903	381914	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022525	CTCATT	2	12	401525	401536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022525	GTGATA	2	12	501154	501165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022525	AAATTT	2	12	521766	521777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022525	CAGGCG	2	12	563612	563623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022525	AGCGCC	2	12	569515	569526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022525	ATTTTT	2	12	581471	581482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022525	TGCAAT	2	12	614935	614946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022525	TAACGT	2	12	652218	652229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022525	TGCAAA	2	12	664447	664458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022525	TTTTTA	2	12	769152	769163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022525	CAAAAA	2	12	816103	816114	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022525	TGAAAA	2	12	906932	906943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022525	ATTTTT	2	12	913554	913565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022525	CATCGT	2	12	954412	954423	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022525	GATGAC	2	12	976032	976043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022525	ATCTCG	2	12	1110346	1110357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022525	AAAAAT	2	12	1129396	1129407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022525	AAGAGA	2	12	1135439	1135450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022525	TGAGTA	2	12	1143839	1143850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022525	TAATTA	2	12	1208558	1208569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022525	AAAAAC	2	12	1291688	1291699	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022525	GGTTTA	2	12	1304815	1304826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022525	GATTTT	2	12	1326219	1326230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022525	AAGCGC	2	12	1327846	1327857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022525	TAGCCT	2	12	1365599	1365610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022525	CGCTCG	2	12	1409925	1409936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022525	AGTCTT	2	12	1424825	1424836	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022525	CAGGCG	2	12	1495897	1495908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022525	GATATT	2	12	1619843	1619854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022525	CATTAA	2	12	1634395	1634406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022525	TTCCCC	2	12	1637302	1637313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022525	AGTATA	2	12	1658437	1658448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022525	TTTATG	2	12	1684311	1684322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022525	TATTTA	2	12	1688441	1688452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022525	TTATTT	2	12	1691959	1691970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022525	TTTTAT	2	12	1717637	1717648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022525	TATAGT	2	12	1765025	1765036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022525	TCTGCG	2	12	1777631	1777642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022525	TTGGCT	2	12	1859677	1859688	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022525	TGTTAA	2	12	1864400	1864411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022525	TCAACG	2	12	1900507	1900518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022525	AAAAAC	2	12	1957367	1957378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022525	CTTTCA	2	12	1957542	1957553	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022525	CAGGTA	2	12	1969589	1969600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022525	TAAAGC	2	12	1987891	1987902	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022525	GATTCG	2	12	2103396	2103407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022525	AATCAG	2	12	2113437	2113448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022525	CATATA	2	12	2113643	2113654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022525	GTTATT	2	12	2149028	2149039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022525	ATAACA	2	12	2185856	2185867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022525	ACATAA	2	12	2186074	2186085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022525	TCAACC	2	12	2199460	2199471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022525	ACGTTT	2	12	2202375	2202386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022525	TGTTTA	2	12	2203576	2203587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022525	TTTATC	2	12	2233398	2233409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022525	CCTTCA	2	12	2327594	2327605	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022525	ATTTTT	2	12	2464930	2464941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022525	GTAAGT	2	12	2476044	2476055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022525	TTTTCA	2	12	2485352	2485363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022525	CAAGTG	2	12	2502356	2502367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022525	GCTACA	2	12	2620335	2620346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022525	TTTGTT	2	12	2693366	2693377	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022525	TATTTT	2	12	2693561	2693572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022525	ACAGGC	2	12	2762179	2762190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022525	CTTTGC	2	12	2769375	2769386	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022525	CTTAGG	2	12	2779736	2779747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022525	CAATAA	2	12	2796194	2796205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022525	ATTAAA	2	12	2899308	2899319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022525	GTTTCT	2	12	2931745	2931756	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022525	GATTAT	2	12	2949470	2949481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022525	GGCGTC	2	12	2977910	2977921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022525	GCGATC	2	12	3003972	3003983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022525	CCACCG	2	12	3048231	3048242	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022525	TAATAT	2	12	3050575	3050586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022525	TTCAGT	2	12	3115333	3115344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022525	AGTTGT	2	12	3236631	3236642	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022525	AATGAT	2	12	3242299	3242310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022525	ACAAAA	2	12	3275884	3275895	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022525	TAACCA	2	12	3280491	3280502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022525	ATTCAA	2	12	3282238	3282249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022525	TTATTT	2	12	3284437	3284448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022525	AACCCT	2	12	3313347	3313358	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022525	TAAGCG	2	12	3330783	3330794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022525	TGTTAT	2	12	3375250	3375261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022525	CTGCGC	2	12	3418797	3418808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022525	GGCTCC	2	12	3437046	3437057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022525	TGTCGC	2	12	3457446	3457457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022525	CCTTGC	2	12	3482514	3482525	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022525	ATATTG	2	12	3539556	3539567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022525	CTTAAT	2	12	3638636	3638647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022525	GCGATA	2	12	3670542	3670553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022525	TAAAAA	2	12	3692477	3692488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022525	GCGATC	2	12	3707981	3707992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022525	ATTATA	2	12	3742001	3742012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022525	CAATGG	2	12	3743384	3743395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022525	GGTATT	2	12	3745620	3745631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022525	TGGCTC	2	12	3746093	3746104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022525	GCGATG	2	12	3746523	3746534	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022525	ATCAAC	2	12	3752487	3752498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022525	TGGCGC	2	12	3804585	3804596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022525	TAAATA	2	12	3815782	3815793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022525	ACATGA	2	12	3821591	3821602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022525	GCCATC	2	12	3872020	3872031	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022525	GGCGAA	2	12	3872823	3872834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022525	ACCGCC	2	12	3873061	3873072	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_022525	CCTGCG	2	12	4003682	4003693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022525	TATCAA	2	12	4103781	4103792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022525	TTTTAA	2	12	4116060	4116071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022525	TTTTAC	2	12	4160417	4160428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022525	AGCGTT	2	12	4186834	4186845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022525	TTTTGA	2	12	4253911	4253922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022525	TAACCA	2	12	4294523	4294534	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022525	GTCTTT	2	12	4356924	4356935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022525	TGTAAG	2	12	4357027	4357038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022525	CGCGTT	2	12	4365692	4365703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022525	TTATGA	2	12	4418254	4418265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022525	CCCCAT	2	12	4426728	4426739	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_022525	TTGATT	2	12	4437998	4438009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022525	ATTCTG	2	12	4448257	4448268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022525	TTTTTA	2	12	4449013	4449024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022525	GAGATA	2	12	4466254	4466265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022525	TGGCGC	2	12	4488097	4488108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022525	TCAGAT	2	12	4510219	4510230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022525	TTTTCC	2	12	4551468	4551479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022525	GCCGGA	2	12	4565027	4565038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022525	CTGGCG	2	12	4565412	4565423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022525	ATAAAT	2	12	4590665	4590676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022525	TATAAA	2	12	4591153	4591164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022525	TGATAT	2	12	4612685	4612696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022525	CTATTC	2	12	4629332	4629343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022525	AATGAT	2	12	4659167	4659178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022525	TTTAAT	2	12	4679824	4679835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022525	AAGCGC	2	12	4687344	4687355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022525	GTAAAA	2	12	4702283	4702294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.