MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 9262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	ACCA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	549478130
2	NC_022525	ATGA	2	8	3129	3136	50 %	25 %	25 %	0 %	549481666
3	NC_022525	GATG	2	8	4634	4641	25 %	25 %	50 %	0 %	549478131
4	NC_022525	CAGC	2	8	4643	4650	25 %	0 %	25 %	50 %	549478131
5	NC_022525	CTGA	2	8	4701	4708	25 %	25 %	25 %	25 %	549478131
6	NC_022525	AAAG	2	8	4881	4888	75 %	0 %	25 %	0 %	549478131
7	NC_022525	CTGC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	549478131
8	NC_022525	GCCA	2	8	6665	6672	25 %	0 %	25 %	50 %	549478133
9	NC_022525	GGCG	2	8	6791	6798	0 %	0 %	75 %	25 %	549478133
10	NC_022525	TGAA	2	8	7291	7298	50 %	25 %	25 %	0 %	549478133
11	NC_022525	GCGT	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	549478134
12	NC_022525	AAGA	2	8	8239	8246	75 %	0 %	25 %	0 %	549478134
13	NC_022525	TGGC	2	8	8820	8827	0 %	25 %	50 %	25 %	549478135
14	NC_022525	TCCG	2	8	9280	9287	0 %	25 %	25 %	50 %	549478135
15	NC_022525	GAAC	2	8	9719	9726	50 %	0 %	25 %	25 %	549478136
16	NC_022525	CAGG	2	8	10123	10130	25 %	0 %	50 %	25 %	549478137
17	NC_022525	TTGA	2	8	10978	10985	25 %	50 %	25 %	0 %	549478138
18	NC_022525	TGGC	2	8	11005	11012	0 %	25 %	50 %	25 %	549478138
19	NC_022525	TCGT	2	8	11125	11132	0 %	50 %	25 %	25 %	549478138
20	NC_022525	ATTT	2	8	11371	11378	25 %	75 %	0 %	0 %	549481667
21	NC_022525	TCTG	2	8	11391	11398	0 %	50 %	25 %	25 %	549481667
22	NC_022525	ATGG	2	8	11649	11656	25 %	25 %	50 %	0 %	549478139
23	NC_022525	TGGT	2	8	11740	11747	0 %	50 %	50 %	0 %	549478139
24	NC_022525	CAAC	2	8	12253	12260	50 %	0 %	0 %	50 %	549478139
25	NC_022525	AAGA	2	8	12327	12334	75 %	0 %	25 %	0 %	549478139
26	NC_022525	CCAT	2	8	12904	12911	25 %	25 %	0 %	50 %	549478139
27	NC_022525	GGCT	2	8	13424	13431	0 %	25 %	50 %	25 %	549478139
28	NC_022525	CGGT	2	8	14594	14601	0 %	25 %	50 %	25 %	549478140
29	NC_022525	TCAG	2	8	15246	15253	25 %	25 %	25 %	25 %	549478141
30	NC_022525	TTTG	2	8	15536	15543	0 %	75 %	25 %	0 %	549478141
31	NC_022525	CGAA	2	8	15751	15758	50 %	0 %	25 %	25 %	549478141
32	NC_022525	ATTG	2	8	15763	15770	25 %	50 %	25 %	0 %	549478141
33	NC_022525	ATTA	2	8	16431	16438	50 %	50 %	0 %	0 %	549478142
34	NC_022525	ATAA	2	8	16523	16530	75 %	25 %	0 %	0 %	549478143
35	NC_022525	AATA	2	8	17999	18006	75 %	25 %	0 %	0 %	549478145
36	NC_022525	GGGC	2	8	18585	18592	0 %	0 %	75 %	25 %	549478145
37	NC_022525	CGTG	2	8	19285	19292	0 %	25 %	50 %	25 %	549478145
38	NC_022525	CCAA	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	549478146
39	NC_022525	GACG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	549478146
40	NC_022525	TGGC	2	8	22285	22292	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
41	NC_022525	TGGC	2	8	22391	22398	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
42	NC_022525	CGCC	2	8	22657	22664	0 %	0 %	25 %	75 %	549478146
43	NC_022525	CTGG	2	8	23003	23010	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
44	NC_022525	TTTA	2	8	23501	23508	25 %	75 %	0 %	0 %	549478147
45	NC_022525	CTGA	2	8	23854	23861	25 %	25 %	25 %	25 %	549478147
46	NC_022525	TCTG	2	8	23958	23965	0 %	50 %	25 %	25 %	549478147
47	NC_022525	TGAA	2	8	24469	24476	50 %	25 %	25 %	0 %	549478148
48	NC_022525	CCAG	2	8	24740	24747	25 %	0 %	25 %	50 %	549478148
49	NC_022525	ACCG	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	549478149
50	NC_022525	AAAT	2	8	25477	25484	75 %	25 %	0 %	0 %	549478149
51	NC_022525	TCTG	2	8	25934	25941	0 %	50 %	25 %	25 %	549478150
52	NC_022525	GCCT	2	8	26115	26122	0 %	25 %	25 %	50 %	549478150
53	NC_022525	CCTT	2	8	26621	26628	0 %	50 %	0 %	50 %	549478150
54	NC_022525	TCAG	2	8	26980	26987	25 %	25 %	25 %	25 %	549478150
55	NC_022525	ATCA	2	8	27393	27400	50 %	25 %	0 %	25 %	549478150
56	NC_022525	CAGC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
57	NC_022525	AGCC	2	8	27927	27934	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
58	NC_022525	CCGA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
59	NC_022525	ATTA	2	8	28527	28534	50 %	50 %	0 %	0 %	549478151
60	NC_022525	GGCG	2	8	28769	28776	0 %	0 %	75 %	25 %	549478151
61	NC_022525	ATGA	2	8	29974	29981	50 %	25 %	25 %	0 %	549478152
62	NC_022525	TGCT	2	8	30544	30551	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
63	NC_022525	TATC	2	8	30600	30607	25 %	50 %	0 %	25 %	549478154
64	NC_022525	GTAA	2	8	30637	30644	50 %	25 %	25 %	0 %	549478154
65	NC_022525	TTCG	2	8	30899	30906	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
66	NC_022525	GTCA	2	8	31408	31415	25 %	25 %	25 %	25 %	549478155
67	NC_022525	ACCG	2	8	32228	32235	25 %	0 %	25 %	50 %	549481668
68	NC_022525	AGGC	2	8	32266	32273	25 %	0 %	50 %	25 %	549481668
69	NC_022525	CCTG	2	8	32702	32709	0 %	25 %	25 %	50 %	549478156
70	NC_022525	AACA	2	8	32718	32725	75 %	0 %	0 %	25 %	549478156
71	NC_022525	CGCA	2	8	32892	32899	25 %	0 %	25 %	50 %	549478156
72	NC_022525	TAAA	2	8	32962	32969	75 %	25 %	0 %	0 %	549478156
73	NC_022525	TTAT	2	8	33531	33538	25 %	75 %	0 %	0 %	549481669
74	NC_022525	TTGG	2	8	33915	33922	0 %	50 %	50 %	0 %	549481669
75	NC_022525	CTTT	2	8	34295	34302	0 %	75 %	0 %	25 %	549481669
76	NC_022525	GAAG	2	8	34335	34342	50 %	0 %	50 %	0 %	549481669
77	NC_022525	TAAA	2	8	34387	34394	75 %	25 %	0 %	0 %	549478157
78	NC_022525	ATAA	2	8	34666	34673	75 %	25 %	0 %	0 %	549478157
79	NC_022525	GTGC	2	8	34789	34796	0 %	25 %	50 %	25 %	549478157
80	NC_022525	TTAA	2	8	34799	34806	50 %	50 %	0 %	0 %	549478157
81	NC_022525	TGGA	2	8	35551	35558	25 %	25 %	50 %	0 %	549481670
82	NC_022525	GGGA	2	8	36495	36502	25 %	0 %	75 %	0 %	549481670
83	NC_022525	ATAC	2	8	37480	37487	50 %	25 %	0 %	25 %	549478158
84	NC_022525	GAAG	2	8	37552	37559	50 %	0 %	50 %	0 %	549478158
85	NC_022525	CACG	2	8	38115	38122	25 %	0 %	25 %	50 %	549478158
86	NC_022525	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	549478158
87	NC_022525	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	549478160
88	NC_022525	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	549478160
89	NC_022525	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	549478160
90	NC_022525	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	549478160
91	NC_022525	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	549478160
92	NC_022525	AACC	2	8	41757	41764	50 %	0 %	0 %	50 %	549478161
93	NC_022525	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	549478161
94	NC_022525	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	549478161
95	NC_022525	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	549478161
96	NC_022525	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	549478162
97	NC_022525	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	549478162
98	NC_022525	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	549481672
99	NC_022525	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	549481672
100	NC_022525	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	549478163
101	NC_022525	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	549478163
102	NC_022525	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	549478163
103	NC_022525	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	549478164
104	NC_022525	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	549478164
105	NC_022525	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	549478165
106	NC_022525	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	549478165
107	NC_022525	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	549478165
108	NC_022525	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	549478165
109	NC_022525	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	549481673
110	NC_022525	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	549481673
111	NC_022525	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	549481673
112	NC_022525	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549478166
113	NC_022525	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549478166
114	NC_022525	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	549478166
115	NC_022525	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	549478167
116	NC_022525	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549478169
117	NC_022525	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549478169
118	NC_022525	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	549478169
119	NC_022525	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	549478170
120	NC_022525	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	549478171
121	NC_022525	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	549478171
122	NC_022525	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	549478171
123	NC_022525	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	549478171
124	NC_022525	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	549478172
125	NC_022525	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	549478172
126	NC_022525	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	549478173
127	NC_022525	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	549478174
128	NC_022525	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	549478174
129	NC_022525	TCAA	2	8	63163	63170	50 %	25 %	0 %	25 %	549478174
130	NC_022525	CGCC	2	8	63577	63584	0 %	0 %	25 %	75 %	549478175
131	NC_022525	GCCA	2	8	64749	64756	25 %	0 %	25 %	50 %	549478175
132	NC_022525	GCTG	2	8	65131	65138	0 %	25 %	50 %	25 %	549478176
133	NC_022525	CCAG	2	8	66163	66170	25 %	0 %	25 %	50 %	549478176
134	NC_022525	CCGC	2	8	66319	66326	0 %	0 %	25 %	75 %	549478176
135	NC_022525	TTCA	2	8	66878	66885	25 %	50 %	0 %	25 %	549478177
136	NC_022525	GAAG	2	8	67630	67637	50 %	0 %	50 %	0 %	549478178
137	NC_022525	CAGA	2	8	67803	67810	50 %	0 %	25 %	25 %	549478178
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