MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 7363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022525	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022525	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_022525	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022525	AAC	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022525	CGC	2	6	5932	5937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022525	TTG	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022525	TGA	2	6	7429	7434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022525	ATG	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022525	CGG	2	6	7506	7511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022525	CGT	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022525	ATC	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022525	AAT	2	6	8723	8728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022525	TAG	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022525	TCC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_022525	GGA	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022525	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022525	ATA	2	6	10018	10023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022525	TAA	2	6	10052	10057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022525	GTG	2	6	11488	11493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022525	TTA	2	6	11542	11547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022525	ATG	2	6	11563	11568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022525	TTC	2	6	14756	14761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022525	TTG	2	6	14837	14842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022525	TAT	2	6	14973	14978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022525	ATG	2	6	16004	16009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022525	CCT	2	6	16025	16030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022525	ATT	2	6	16058	16063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022525	ATT	2	6	17615	17620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022525	GTT	2	6	17707	17712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022525	GTT	2	6	17731	17736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022525	ATC	2	6	17760	17765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022525	GAT	2	6	17772	17777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022525	CCA	2	6	20034	20039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022525	TTA	2	6	23169	23174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022525	GTT	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022525	GAT	2	6	24235	24240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022525	TAA	2	6	24262	24267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022525	TAA	2	6	24269	24274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022525	ACG	2	6	24309	24314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022525	AAG	2	6	24356	24361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022525	GAA	2	6	24402	24407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022525	CAG	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022525	GGT	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022525	ATA	2	6	33136	33141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022525	CAT	2	6	33203	33208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022525	TAA	2	6	33257	33262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022525	GTG	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022525	ATG	2	6	33329	33334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022525	ATA	3	9	34851	34859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022525	ATG	2	6	34939	34944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022525	TAG	2	6	34997	35002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022525	TTG	2	6	35045	35050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022525	AAT	2	6	35057	35062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022525	TAG	2	6	35154	35159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022525	ATT	2	6	35236	35241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022525	TTG	2	6	35255	35260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022525	TGT	2	6	35294	35299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022525	TCA	2	6	38756	38761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022525	TGT	2	6	39569	39574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022525	AAG	2	6	39578	39583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022525	TGT	2	6	39674	39679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022525	TTA	2	6	39680	39685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022525	TGT	2	6	39719	39724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022525	AAT	2	6	39770	39775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022525	AAT	2	6	39982	39987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022525	GAA	2	6	40013	40018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022525	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022525	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022525	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022525	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022525	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022525	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022525	AAC	2	6	51862	51867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022525	ATT	2	6	51894	51899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022525	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022525	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022525	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022525	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022525	TAT	2	6	52117	52122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022525	GCT	2	6	52154	52159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022525	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022525	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022525	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022525	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022525	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022525	TCG	2	6	52807	52812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022525	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022525	TGA	2	6	58771	58776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022525	GAA	2	6	58829	58834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022525	GTC	2	6	58844	58849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022525	ACG	2	6	66911	66916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022525	GAC	2	6	66925	66930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022525	CCG	2	6	67030	67035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022525	TAA	2	6	68430	68435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022525	ATT	2	6	68496	68501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022525	TTA	2	6	68503	68508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022525	GAT	2	6	68738	68743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022525	CTG	2	6	68867	68872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022525	GCT	2	6	68878	68883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022525	CAG	2	6	69013	69018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022525	TGG	2	6	69129	69134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022525	AGA	2	6	69181	69186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022525	GAC	2	6	69334	69339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022525	GTC	2	6	69508	69513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022525	CTG	2	6	69614	69619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022525	GCC	2	6	69646	69651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022525	TCT	2	6	73835	73840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022525	GGC	2	6	73943	73948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022525	TTA	2	6	75385	75390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022525	AAC	2	6	75455	75460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022525	ATT	2	6	75472	75477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022525	ATT	2	6	75531	75536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022525	GTT	2	6	75552	75557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022525	GTT	2	6	75562	75567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022525	GCC	2	6	75766	75771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022525	TAA	2	6	77028	77033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022525	CGG	2	6	80277	80282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022525	TAA	2	6	80402	80407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022525	TTA	2	6	80486	80491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022525	GGC	2	6	81636	81641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022525	CGG	2	6	82530	82535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022525	TAA	2	6	86670	86675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022525	TAT	2	6	88260	88265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022525	TTG	2	6	88273	88278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022525	ATT	2	6	88374	88379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022525	TTG	2	6	88464	88469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022525	CCG	2	6	88634	88639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022525	AAC	2	6	93574	93579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022525	AAT	2	6	93856	93861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022525	ATG	2	6	94086	94091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022525	TAT	2	6	94719	94724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022525	TGA	2	6	95072	95077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022525	ATT	2	6	95112	95117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022525	GCC	2	6	95286	95291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022525	ATT	2	6	95306	95311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022525	TAA	2	6	95317	95322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022525	TGT	3	9	95394	95402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022525	AAT	2	6	95411	95416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022525	ATA	2	6	95453	95458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022525	TAT	2	6	95466	95471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022525	TAA	2	6	95710	95715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022525	AAT	2	6	95783	95788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022525	TAA	2	6	95904	95909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022525	TAA	2	6	95943	95948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022525	TCA	2	6	97937	97942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022525	AAG	2	6	97999	98004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_022525	ATC	2	6	98040	98045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022525	AAT	2	6	98171	98176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022525	TAA	2	6	98215	98220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022525	ATC	2	6	98228	98233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022525	ACT	2	6	100682	100687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_022525	ATG	2	6	122282	122287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_022525	CAT	2	6	128524	128529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_022525	ATA	2	6	128580	128585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_022525	CAT	2	6	216327	216332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_022525	GGA	2	6	216351	216356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_022525	GAC	2	6	216815	216820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_022525	TTG	2	6	225144	225149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_022525	TAT	2	6	225252	225257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_022525	ATA	2	6	225281	225286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_022525	TAT	2	6	225352	225357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_022525	CTT	2	6	225747	225752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_022525	ATA	2	6	244485	244490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_022525	GAC	3	9	308567	308575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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