MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 60839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	CGG	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
2	NC_022525	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478130
3	NC_022525	GAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478130
4	NC_022525	CGG	2	6	502	507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
5	NC_022525	CTG	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
6	NC_022525	CGC	2	6	694	699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
7	NC_022525	CGC	2	6	859	864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
8	NC_022525	CCG	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
9	NC_022525	TGG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478130
10	NC_022525	CCG	3	9	966	974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
11	NC_022525	GCC	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
12	NC_022525	CTG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
13	NC_022525	CTG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
14	NC_022525	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478130
15	NC_022525	AAC	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478130
16	NC_022525	GAT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478130
17	NC_022525	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
18	NC_022525	CGC	2	6	1345	1350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
19	NC_022525	GGT	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478130
20	NC_022525	TCC	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478130
21	NC_022525	CCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
22	NC_022525	GCT	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
23	NC_022525	TGT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478130
24	NC_022525	TTC	2	6	1583	1588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478130
25	NC_022525	TCT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478130
26	NC_022525	TGG	2	6	1659	1664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478130
27	NC_022525	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478130
28	NC_022525	CCA	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478130
29	NC_022525	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
30	NC_022525	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
31	NC_022525	GAA	2	6	1810	1815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478130
32	NC_022525	GCG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
33	NC_022525	ATC	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478130
34	NC_022525	TTG	2	6	1989	1994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478130
35	NC_022525	TCG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
36	NC_022525	ACT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478130
37	NC_022525	CGC	3	9	2119	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
38	NC_022525	CTG	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
39	NC_022525	TGA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478130
40	NC_022525	GAC	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478130
41	NC_022525	GCC	2	6	2525	2530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478130
42	NC_022525	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478130
43	NC_022525	TAT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478130
44	NC_022525	TGC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478130
45	NC_022525	ATG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478130
46	NC_022525	CGG	3	9	2742	2750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478130
47	NC_022525	AGC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481666
48	NC_022525	GCC	2	6	2969	2974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481666
49	NC_022525	CGT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481666
50	NC_022525	GCA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481666
51	NC_022525	TGA	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481666
52	NC_022525	GAA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481666
53	NC_022525	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481666
54	NC_022525	CAG	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481666
55	NC_022525	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481666
56	NC_022525	GCC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481666
57	NC_022525	TGA	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481666
58	NC_022525	GTT	2	6	3596	3601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481666
59	NC_022525	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481666
60	NC_022525	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481666
61	NC_022525	CAG	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478131
62	NC_022525	TGA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478131
63	NC_022525	GCA	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478131
64	NC_022525	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
65	NC_022525	GCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
66	NC_022525	GCG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
67	NC_022525	GTC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478131
68	NC_022525	GGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
69	NC_022525	TGA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478131
70	NC_022525	GCC	2	6	4384	4389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478131
71	NC_022525	CTA	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478131
72	NC_022525	GCT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478131
73	NC_022525	CGC	2	6	4544	4549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478131
74	NC_022525	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478131
75	NC_022525	CCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478131
76	NC_022525	GCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
77	NC_022525	GAT	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478131
78	NC_022525	ACA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478131
79	NC_022525	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478131
80	NC_022525	GCT	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478131
81	NC_022525	CAT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478131
82	NC_022525	GCC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478131
83	NC_022525	ATG	2	6	5004	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478131
84	NC_022525	TCA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478132
85	NC_022525	AAT	2	6	5229	5234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478132
86	NC_022525	TCA	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478132
87	NC_022525	ACC	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478132
88	NC_022525	TCA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478132
89	NC_022525	TTC	2	6	5341	5346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478132
90	NC_022525	ACC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478132
91	NC_022525	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478132
92	NC_022525	CGT	2	6	5594	5599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478132
93	NC_022525	GCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478132
94	NC_022525	GCT	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478132
95	NC_022525	ACC	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478133
96	NC_022525	CAA	2	6	6111	6116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478133
97	NC_022525	TGA	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478133
98	NC_022525	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478133
99	NC_022525	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478133
100	NC_022525	ATC	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478133
101	NC_022525	GAT	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478133
102	NC_022525	ACG	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478133
103	NC_022525	GAT	2	6	6816	6821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478133
104	NC_022525	GCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478133
105	NC_022525	CGA	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478133
106	NC_022525	GCC	2	6	7014	7019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478133
107	NC_022525	AGG	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478133
108	NC_022525	ATG	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478133
109	NC_022525	GCG	2	6	7141	7146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478133
110	NC_022525	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478133
111	NC_022525	AGC	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478133
112	NC_022525	TAA	2	6	7373	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478133
113	NC_022525	CAC	2	6	7698	7703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478134
114	NC_022525	AGC	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478134
115	NC_022525	AGC	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478134
116	NC_022525	CAG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478134
117	NC_022525	GTT	2	6	7873	7878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478134
118	NC_022525	ATG	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478134
119	NC_022525	AAG	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478134
120	NC_022525	GCT	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478134
121	NC_022525	TAC	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478134
122	NC_022525	CGT	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478134
123	NC_022525	GCA	2	6	8514	8519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478134
124	NC_022525	CTG	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478134
125	NC_022525	GCG	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478135
126	NC_022525	ACC	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478135
127	NC_022525	ATC	2	6	8886	8891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478135
128	NC_022525	TGA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478135
129	NC_022525	GCT	2	6	9230	9235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478135
130	NC_022525	GTC	2	6	9311	9316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478135
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134	NC_022525	CAG	2	6	9692	9697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478136
135	NC_022525	CAG	2	6	9776	9781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478136
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139	NC_022525	CAT	2	6	10111	10116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478137
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150	NC_022525	CAG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478137
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153	NC_022525	CGG	2	6	10625	10630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478137
154	NC_022525	GTT	2	6	10743	10748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478137
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161	NC_022525	CCG	2	6	11069	11074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478138
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251	NC_022525	ACT	2	6	17912	17917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478145
252	NC_022525	CAA	2	6	17943	17948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478145
253	NC_022525	GAT	2	6	17951	17956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478145
254	NC_022525	TTA	2	6	18040	18045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478145
255	NC_022525	TTG	2	6	18159	18164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478145
256	NC_022525	AGA	2	6	18193	18198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478145
257	NC_022525	CTG	2	6	18362	18367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
258	NC_022525	CGG	2	6	18436	18441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478145
259	NC_022525	CCG	2	6	18471	18476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478145
260	NC_022525	GTG	2	6	18512	18517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478145
261	NC_022525	GCT	2	6	18628	18633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
262	NC_022525	CTG	2	6	18702	18707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
263	NC_022525	ACT	2	6	18710	18715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478145
264	NC_022525	GCT	2	6	18749	18754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
265	NC_022525	TGA	2	6	18774	18779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478145
266	NC_022525	CTT	2	6	18787	18792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478145
267	NC_022525	CCA	2	6	18820	18825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478145
268	NC_022525	CTG	2	6	18884	18889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
269	NC_022525	CGC	2	6	18975	18980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478145
270	NC_022525	CTA	2	6	19011	19016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478145
271	NC_022525	CGC	2	6	19182	19187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478145
272	NC_022525	CGA	2	6	19390	19395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478145
273	NC_022525	GCG	2	6	19424	19429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478145
274	NC_022525	CTG	2	6	19436	19441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478145
275	NC_022525	TTC	2	6	19480	19485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478145
276	NC_022525	TGA	2	6	19486	19491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478145
277	NC_022525	GAA	2	6	19715	19720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478145
278	NC_022525	GAA	2	6	19748	19753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478145
279	NC_022525	GAT	2	6	19772	19777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478145
280	NC_022525	CAG	2	6	19782	19787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478145
281	NC_022525	TGG	2	6	19895	19900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478145
282	NC_022525	CGG	2	6	19936	19941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478145
283	NC_022525	TCA	2	6	20128	20133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478146
284	NC_022525	GCG	2	6	20215	20220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478146
285	NC_022525	AAC	2	6	20283	20288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478146
286	NC_022525	ATC	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478146
287	NC_022525	TAA	2	6	20297	20302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478146
288	NC_022525	CTT	2	6	20316	20321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478146
289	NC_022525	CGC	2	6	20471	20476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478146
290	NC_022525	AAC	2	6	20482	20487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478146
291	NC_022525	GAA	2	6	20750	20755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478146
292	NC_022525	GGC	2	6	20792	20797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478146
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294	NC_022525	GCC	2	6	20829	20834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478146
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329	NC_022525	ATA	2	6	23372	23377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478147
330	NC_022525	CAG	2	6	23410	23415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478147
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334	NC_022525	ATG	2	6	23567	23572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478147
335	NC_022525	ACG	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478147
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371	NC_022525	CCG	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
372	NC_022525	GCG	2	6	26818	26823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
373	NC_022525	CCG	2	6	26884	26889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
374	NC_022525	GGC	2	6	26911	26916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
375	NC_022525	GCG	2	6	26925	26930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
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