MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 9418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022525	GC	3	6	576	581	0 %	0 %	50 %	50 %	549478130
3	NC_022525	CT	3	6	1106	1111	0 %	50 %	0 %	50 %	549478130
4	NC_022525	TG	3	6	1418	1423	0 %	50 %	50 %	0 %	549478130
5	NC_022525	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	549478130
6	NC_022525	CT	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	549478130
7	NC_022525	TC	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	549478130
8	NC_022525	GC	3	6	2315	2320	0 %	0 %	50 %	50 %	549478130
9	NC_022525	CG	3	6	2346	2351	0 %	0 %	50 %	50 %	549478130
10	NC_022525	CG	4	8	3504	3511	0 %	0 %	50 %	50 %	549481666
11	NC_022525	GC	3	6	3559	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	549481666
12	NC_022525	CG	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	549478131
13	NC_022525	CG	3	6	4207	4212	0 %	0 %	50 %	50 %	549478131
14	NC_022525	TG	3	6	5149	5154	0 %	50 %	50 %	0 %	549478132
15	NC_022525	CG	3	6	5252	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	549478132
16	NC_022525	CG	3	6	5471	5476	0 %	0 %	50 %	50 %	549478132
17	NC_022525	AG	3	6	5553	5558	50 %	0 %	50 %	0 %	549478132
18	NC_022525	CG	3	6	5972	5977	0 %	0 %	50 %	50 %	549478133
19	NC_022525	GC	3	6	6890	6895	0 %	0 %	50 %	50 %	549478133
20	NC_022525	CG	3	6	6992	6997	0 %	0 %	50 %	50 %	549478133
21	NC_022525	CT	3	6	7683	7688	0 %	50 %	0 %	50 %	549478134
22	NC_022525	TC	3	6	7774	7779	0 %	50 %	0 %	50 %	549478134
23	NC_022525	CG	3	6	7861	7866	0 %	0 %	50 %	50 %	549478134
24	NC_022525	CG	3	6	7959	7964	0 %	0 %	50 %	50 %	549478134
25	NC_022525	CT	3	6	8452	8457	0 %	50 %	0 %	50 %	549478134
26	NC_022525	GC	3	6	9574	9579	0 %	0 %	50 %	50 %	549478136
27	NC_022525	CG	3	6	10534	10539	0 %	0 %	50 %	50 %	549478137
28	NC_022525	CG	3	6	12991	12996	0 %	0 %	50 %	50 %	549478139
29	NC_022525	GC	3	6	13303	13308	0 %	0 %	50 %	50 %	549478139
30	NC_022525	GC	3	6	14552	14557	0 %	0 %	50 %	50 %	549478140
31	NC_022525	GA	3	6	14663	14668	50 %	0 %	50 %	0 %	549478140
32	NC_022525	AT	3	6	15375	15380	50 %	50 %	0 %	0 %	549478141
33	NC_022525	AT	3	6	15650	15655	50 %	50 %	0 %	0 %	549478141
34	NC_022525	AT	3	6	15903	15908	50 %	50 %	0 %	0 %	549478141
35	NC_022525	GA	3	6	17067	17072	50 %	0 %	50 %	0 %	549478144
36	NC_022525	GC	3	6	18369	18374	0 %	0 %	50 %	50 %	549478145
37	NC_022525	CT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	0 %	50 %	549478146
38	NC_022525	GC	3	6	20659	20664	0 %	0 %	50 %	50 %	549478146
39	NC_022525	GC	3	6	20779	20784	0 %	0 %	50 %	50 %	549478146
40	NC_022525	GC	3	6	21184	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	549478146
41	NC_022525	GC	3	6	22042	22047	0 %	0 %	50 %	50 %	549478146
42	NC_022525	CT	3	6	22797	22802	0 %	50 %	0 %	50 %	549478146
43	NC_022525	AT	3	6	23585	23590	50 %	50 %	0 %	0 %	549478147
44	NC_022525	CG	3	6	23655	23660	0 %	0 %	50 %	50 %	549478147
45	NC_022525	GC	4	8	23798	23805	0 %	0 %	50 %	50 %	549478147
46	NC_022525	AT	3	6	24059	24064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022525	CG	3	6	25067	25072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022525	CT	3	6	25353	25358	0 %	50 %	0 %	50 %	549478149
49	NC_022525	AT	3	6	25383	25388	50 %	50 %	0 %	0 %	549478149
50	NC_022525	GC	3	6	26086	26091	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
51	NC_022525	CG	3	6	28016	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
52	NC_022525	GC	3	6	28144	28149	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
53	NC_022525	GC	3	6	28180	28185	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
54	NC_022525	GT	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	549478150
55	NC_022525	TC	3	6	28376	28381	0 %	50 %	0 %	50 %	549478150
56	NC_022525	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
57	NC_022525	GT	3	6	28623	28628	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
58	NC_022525	CT	3	6	30108	30113	0 %	50 %	0 %	50 %	549478153
59	NC_022525	AG	3	6	30377	30382	50 %	0 %	50 %	0 %	549478153
60	NC_022525	CG	3	6	30434	30439	0 %	0 %	50 %	50 %	549478153
61	NC_022525	AT	3	6	30535	30540	50 %	50 %	0 %	0 %	549478154
62	NC_022525	GC	3	6	30766	30771	0 %	0 %	50 %	50 %	549478154
63	NC_022525	GC	3	6	31056	31061	0 %	0 %	50 %	50 %	549478154
64	NC_022525	GT	3	6	33043	33048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022525	TC	3	6	33487	33492	0 %	50 %	0 %	50 %	549481669
66	NC_022525	AT	3	6	33737	33742	50 %	50 %	0 %	0 %	549481669
67	NC_022525	TA	3	6	33940	33945	50 %	50 %	0 %	0 %	549481669
68	NC_022525	TA	3	6	34435	34440	50 %	50 %	0 %	0 %	549478157
69	NC_022525	AT	3	6	34697	34702	50 %	50 %	0 %	0 %	549478157
70	NC_022525	AT	3	6	35443	35448	50 %	50 %	0 %	0 %	549481670
71	NC_022525	TG	4	8	35658	35665	0 %	50 %	50 %	0 %	549481670
72	NC_022525	GC	3	6	36251	36256	0 %	0 %	50 %	50 %	549481670
73	NC_022525	TA	3	6	37201	37206	50 %	50 %	0 %	0 %	549478158
74	NC_022525	TG	3	6	37715	37720	0 %	50 %	50 %	0 %	549478158
75	NC_022525	AT	3	6	39517	39522	50 %	50 %	0 %	0 %	549478159
76	NC_022525	AT	3	6	39833	39838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022525	AT	3	6	39948	39953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022525	AT	4	8	40035	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022525	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022525	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	549478160
81	NC_022525	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	549478160
82	NC_022525	GT	3	6	41771	41776	0 %	50 %	50 %	0 %	549478161
83	NC_022525	TG	3	6	42801	42806	0 %	50 %	50 %	0 %	549478161
84	NC_022525	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	549478162
85	NC_022525	TA	3	6	43689	43694	50 %	50 %	0 %	0 %	549478162
86	NC_022525	CA	3	6	45002	45007	50 %	0 %	0 %	50 %	549481672
87	NC_022525	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	549481672
88	NC_022525	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022525	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022525	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	549478163
91	NC_022525	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	549478163
92	NC_022525	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	549478163
93	NC_022525	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	549478164
94	NC_022525	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	549478165
95	NC_022525	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	549478165
96	NC_022525	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	549478165
97	NC_022525	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	549481673
98	NC_022525	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	549481673
99	NC_022525	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022525	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	549478166
101	NC_022525	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
102	NC_022525	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
103	NC_022525	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
104	NC_022525	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
105	NC_022525	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	549478167
106	NC_022525	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	549478168
107	NC_022525	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	549478170
108	NC_022525	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	549478170
109	NC_022525	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	549478171
110	NC_022525	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	549478172
111	NC_022525	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	549478173
112	NC_022525	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	549478174
113	NC_022525	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	549478174
114	NC_022525	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	549478175
115	NC_022525	GC	3	6	66223	66228	0 %	0 %	50 %	50 %	549478176
116	NC_022525	GC	3	6	66726	66731	0 %	0 %	50 %	50 %	549478177
117	NC_022525	AT	3	6	68150	68155	50 %	50 %	0 %	0 %	549478178
118	NC_022525	GC	3	6	69029	69034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022525	GC	3	6	69602	69607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022525	AC	3	6	69654	69659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022525	AG	3	6	69800	69805	50 %	0 %	50 %	0 %	549478179
122	NC_022525	CG	3	6	69879	69884	0 %	0 %	50 %	50 %	549478179
123	NC_022525	GC	3	6	69907	69912	0 %	0 %	50 %	50 %	549478179
124	NC_022525	CG	3	6	70536	70541	0 %	0 %	50 %	50 %	549478180
125	NC_022525	CG	3	6	70816	70821	0 %	0 %	50 %	50 %	549478180
126	NC_022525	TG	3	6	71457	71462	0 %	50 %	50 %	0 %	549478181
127	NC_022525	GC	3	6	71968	71973	0 %	0 %	50 %	50 %	549478181
128	NC_022525	GC	3	6	72275	72280	0 %	0 %	50 %	50 %	549478181
129	NC_022525	GC	3	6	72452	72457	0 %	0 %	50 %	50 %	549478182
130	NC_022525	CG	3	6	73313	73318	0 %	0 %	50 %	50 %	549478183
131	NC_022525	GC	3	6	73459	73464	0 %	0 %	50 %	50 %	549478183
132	NC_022525	GC	3	6	73955	73960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022525	AT	3	6	74890	74895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022525	CT	3	6	76163	76168	0 %	50 %	0 %	50 %	549478185
135	NC_022525	CG	3	6	77467	77472	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
136	NC_022525	CG	3	6	77943	77948	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
137	NC_022525	GC	5	10	78989	78998	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
138	NC_022525	GC	3	6	79634	79639	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
139	NC_022525	GC	3	6	80133	80138	0 %	0 %	50 %	50 %	549478186
140	NC_022525	TG	3	6	80541	80546	0 %	50 %	50 %	0 %	549478187
141	NC_022525	CG	3	6	81192	81197	0 %	0 %	50 %	50 %	549478188
142	NC_022525	CT	3	6	81272	81277	0 %	50 %	0 %	50 %	549478188
143	NC_022525	CG	3	6	81865	81870	0 %	0 %	50 %	50 %	549478189
144	NC_022525	CG	3	6	81933	81938	0 %	0 %	50 %	50 %	549478189
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