MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022521	TGAGTT	2	12	15339	15350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022521	GTTATA	2	12	22874	22885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022521	TACACC	2	12	152637	152648	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022521	CTCTAC	2	12	176024	176035	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022521	CTACAG	2	12	188712	188723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022521	CCGGAG	2	12	203141	203152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022521	CCGGAG	2	12	205532	205543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022521	CCGCCC	2	12	220736	220747	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_022521	TAGGCT	2	12	306401	306412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022521	CGCCAC	2	12	336302	336313	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_022521	TATCTC	2	12	412478	412489	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022521	ACCCCC	2	12	477134	477145	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_022521	GGTATT	2	12	503850	503861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022521	TAGATC	2	12	520923	520934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022521	GGGCTA	2	12	539814	539825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022521	TAACCT	2	12	541891	541902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022521	GGCCCA	2	12	542859	542870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022521	CCTAAT	2	12	543057	543068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022521	TGACCT	2	12	543944	543955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022521	GCCCCC	2	12	604715	604726	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_022521	TAAATA	2	12	621688	621699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022521	CCATTA	2	12	634579	634590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022521	CAAGAT	2	12	679829	679840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022521	GCAACA	2	12	691349	691360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022521	GCGGGG	2	12	696510	696521	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022521	ATACCT	2	12	698347	698358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022521	TGAAAT	2	12	699760	699771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022521	GAAGTG	2	12	747030	747041	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022521	TCTTAT	2	12	754815	754826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022521	ATGTAA	2	12	769468	769479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022521	TAGCTG	2	12	827744	827755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022521	CAAACC	2	12	873302	873313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022521	GCTTGG	2	12	873386	873397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022521	TGGTGA	2	12	933809	933820	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022521	ACGCCC	2	12	935030	935041	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_022521	AACAAG	2	12	1024231	1024242	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022521	GTATAG	2	12	1035787	1035798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022521	AACACC	2	12	1061185	1061196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022521	ACCCCC	2	12	1172193	1172204	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
40	NC_022521	GTCTTG	2	12	1178621	1178632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022521	ATGAAG	2	12	1183017	1183028	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022521	AGGCAT	2	12	1190781	1190792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022521	GTAACA	2	12	1195006	1195017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022521	CCTAAA	2	12	1204425	1204436	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022521	CCTGGG	2	12	1206328	1206339	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022521	GCTATC	2	12	1295719	1295730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022521	TCAGCC	2	12	1309813	1309824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022521	GATAAG	2	12	1325332	1325343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022521	GCCGGG	2	12	1331082	1331093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022521	ATTCAT	2	12	1357117	1357128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022521	ACTATG	2	12	1357683	1357694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022521	TGACTG	2	12	1379313	1379324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022521	ACCCCT	2	12	1395313	1395324	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_022521	GTAAAG	2	12	1396264	1396275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022521	CGGGGG	2	12	1396424	1396435	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022521	GATATC	2	12	1467458	1467469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022521	TTTGTT	2	12	1592697	1592708	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022521	GCTAGA	2	12	1595720	1595731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.