MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022521	AAAAT	2	10	3768	3777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022521	CATGT	2	10	15272	15281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022521	AAATA	2	10	21804	21813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022521	CATTA	2	10	22267	22276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022521	TCCTC	2	10	32562	32571	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_022521	TTATA	2	10	70994	71003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022521	ATATT	2	10	76874	76883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022521	AATCG	2	10	117386	117395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022521	CCTCG	2	10	122035	122044	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_022521	GGGGA	2	10	123162	123171	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022521	GCCTG	2	10	127872	127881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022521	GGAGG	2	10	138696	138705	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022521	GTGGC	2	10	167462	167471	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022521	CCCCG	2	10	181033	181042	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_022521	TGAGG	2	10	184822	184831	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022521	TGCGT	2	10	184939	184948	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022521	CACAC	2	10	185635	185644	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_022521	GCTTA	2	10	186030	186039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022521	TACTC	2	10	200327	200336	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022521	CCGGC	2	10	200640	200649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_022521	CCGCT	2	10	204964	204973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_022521	CTAAT	2	10	205380	205389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022521	TAGTT	2	10	214025	214034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022521	TAGTA	2	10	229904	229913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022521	CTAGG	2	10	256463	256472	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022521	TAATA	2	10	267139	267148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022521	GCTGG	2	10	275289	275298	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022521	ATTAA	2	10	282268	282277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022521	TGAGG	2	10	290411	290420	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022521	CCACA	2	10	312184	312193	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_022521	GAATC	2	10	314242	314251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022521	CAGGA	2	10	314336	314345	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022521	TGTTT	2	10	318129	318138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022521	ATAGA	2	10	320025	320034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022521	TTGTT	2	10	336633	336642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022521	GAGTG	2	10	346097	346106	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022521	GCGAG	2	10	351606	351615	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022521	TGGGG	2	10	356056	356065	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022521	GGCCC	2	10	369215	369224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_022521	GCATA	2	10	372691	372700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022521	GACTA	2	10	375924	375933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022521	TACAG	2	10	400101	400110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022521	CTACA	2	10	405307	405316	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022521	TAATA	2	10	406411	406420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022521	CTTTA	2	10	406421	406430	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022521	ACAAT	2	10	406454	406463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022521	GGGGA	2	10	412400	412409	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022521	CAGCC	2	10	436008	436017	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_022521	GAGTG	2	10	439056	439065	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022521	CCCGC	2	10	441736	441745	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
51	NC_022521	AGCCC	2	10	466000	466009	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_022521	TATAG	2	10	469514	469523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022521	CCAGC	2	10	477346	477355	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_022521	ATCTA	2	10	504303	504312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022521	AGTCC	2	10	514384	514393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022521	CTAAC	2	10	514409	514418	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022521	GTGTA	2	10	524075	524084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022521	TAGTT	2	10	543045	543054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022521	AAAAT	2	10	543140	543149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022521	ATTAT	2	10	553103	553112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022521	ACACC	2	10	594557	594566	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_022521	TTTCT	2	10	595985	595994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022521	GGGCT	2	10	641802	641811	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022521	GCCCC	2	10	650518	650527	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
65	NC_022521	CGGGG	2	10	653055	653064	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022521	GCCCC	2	10	670488	670497	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_022521	ACTAG	2	10	673593	673602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022521	TGGAG	2	10	679850	679859	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022521	GCTGT	2	10	680511	680520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022521	AGGGG	2	10	684534	684543	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022521	TCTCA	2	10	693425	693434	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022521	GCCGG	2	10	697570	697579	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022521	AACCC	2	10	697643	697652	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_022521	AGCTC	2	10	721058	721067	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022521	GAAAA	2	10	737652	737661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022521	GAGTG	2	10	742682	742691	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022521	TAGAC	2	10	742702	742711	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022521	TACAT	2	10	754742	754751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022521	GGTGA	2	10	815589	815598	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022521	GGACC	2	10	819505	819514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022521	CTAGG	2	10	827638	827647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022521	TAAAA	2	10	835888	835897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022521	GCCGG	2	10	888902	888911	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022521	GCCGG	2	10	892317	892326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_022521	GCCGG	2	10	892348	892357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_022521	CACCC	2	10	910705	910714	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
87	NC_022521	CCCCG	2	10	913859	913868	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_022521	GCTGT	2	10	928141	928150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022521	TAGGT	2	10	933538	933547	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022521	AGTGG	2	10	935114	935123	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022521	CCAGC	2	10	938853	938862	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_022521	CAGGA	2	10	946279	946288	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022521	GGGGT	2	10	946463	946472	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022521	CACTC	2	10	957675	957684	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_022521	GCCTC	2	10	960493	960502	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_022521	GGGTA	2	10	975107	975116	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022521	AGTAT	2	10	994876	994885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022521	GAGGT	2	10	1002577	1002586	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022521	ACTGC	2	10	1033378	1033387	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_022521	TAGTT	2	10	1034106	1034115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022521	GAAAA	2	10	1068049	1068058	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022521	CCCAC	2	10	1071045	1071054	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
103	NC_022521	CCCCG	2	10	1091037	1091046	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_022521	TACCA	2	10	1103216	1103225	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_022521	TCTAA	2	10	1111278	1111287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022521	AGTGT	2	10	1114047	1114056	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022521	GTGTA	2	10	1125852	1125861	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022521	ATACA	2	10	1145172	1145181	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022521	CCACA	2	10	1158063	1158072	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_022521	GTGTT	2	10	1158073	1158082	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022521	CACAA	2	10	1160776	1160785	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022521	CTACG	2	10	1161765	1161774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_022521	ACTCG	2	10	1162092	1162101	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_022521	CACCC	2	10	1163398	1163407	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
115	NC_022521	CGGCC	2	10	1163809	1163818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_022521	CGAGC	2	10	1164776	1164785	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022521	CCCAG	2	10	1165586	1165595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_022521	TATTT	2	10	1165673	1165682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022521	CGTGC	2	10	1165695	1165704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022521	CAGCG	2	10	1167174	1167183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_022521	CGCTC	2	10	1182593	1182602	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_022521	CCACA	2	10	1205838	1205847	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_022521	GGCCG	2	10	1205889	1205898	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_022521	CTAGT	2	10	1221561	1221570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022521	CCCCG	2	10	1223522	1223531	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_022521	CCCTA	2	10	1242510	1242519	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_022521	GGCGG	2	10	1261771	1261780	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022521	CCCGC	2	10	1276505	1276514	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
129	NC_022521	TAGAT	2	10	1292669	1292678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022521	GAGAA	2	10	1295552	1295561	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022521	GCTCC	2	10	1296057	1296066	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_022521	CAGAG	2	10	1357758	1357767	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022521	TTTCA	2	10	1358169	1358178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022521	CCGGG	2	10	1358369	1358378	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_022521	GTGGG	2	10	1361927	1361936	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022521	GAGGG	2	10	1387812	1387821	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022521	TATAT	2	10	1388619	1388628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022521	CTGCA	2	10	1391417	1391426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_022521	CCTGC	2	10	1429481	1429490	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_022521	CCGGA	2	10	1434551	1434560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_022521	GCCGG	2	10	1453620	1453629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_022521	ATTTT	2	10	1463511	1463520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022521	ATTTG	2	10	1466946	1466955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022521	TTTGA	2	10	1473177	1473186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022521	CATAA	2	10	1489883	1489892	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022521	CTGGT	2	10	1491994	1492003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022521	ACTAT	2	10	1504509	1504518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022521	GGCGG	2	10	1524585	1524594	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022521	ATCTT	2	10	1529214	1529223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_022521	TACAT	2	10	1531901	1531910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022521	CCCTC	2	10	1534721	1534730	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
152	NC_022521	TGTAG	2	10	1553374	1553383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022521	GGTGG	2	10	1555269	1555278	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022521	CAGCA	2	10	1592743	1592752	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_022521	CTCAT	2	10	1594103	1594112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_022521	TGAGG	2	10	1594517	1594526	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022521	GCTAG	2	10	1595769	1595778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.