MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022521	CCTT	2	8	1581	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022521	GTAG	2	8	2864	2871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022521	ATTT	2	8	3757	3764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022521	TAAA	2	8	21969	21976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022521	AGAA	2	8	21980	21987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022521	GAAC	2	8	22014	22021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022521	CTTT	2	8	22514	22521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022521	GCTT	2	8	22556	22563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022521	TGTT	2	8	22602	22609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022521	TTCT	2	8	22679	22686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022521	GCTG	2	8	22829	22836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022521	TAGG	2	8	32405	32412	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022521	CCTC	2	8	32585	32592	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_022521	TTAT	2	8	35773	35780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022521	TAGT	2	8	40825	40832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022521	ACCC	2	8	42609	42616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_022521	TACA	2	8	50202	50209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022521	TCCC	2	8	56735	56742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_022521	AGCC	2	8	62075	62082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022521	GCCG	2	8	62165	62172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022521	TGGG	2	8	62244	62251	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022521	TACT	2	8	68801	68808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022521	GTGG	2	8	72926	72933	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022521	AGCC	2	8	75472	75479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022521	TACC	2	8	76728	76735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022521	GGGC	2	8	78140	78147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022521	CGGT	2	8	81496	81503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022521	CTAC	2	8	93810	93817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022521	TAAT	2	8	93831	93838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022521	CAGC	2	8	93849	93856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022521	TAAA	2	8	115709	115716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022521	TTTA	2	8	117304	117311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022521	ACCT	2	8	123061	123068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022521	TTTA	2	8	128820	128827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022521	CGGC	2	8	152716	152723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022521	GTTC	2	8	152844	152851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022521	TCCG	2	8	155450	155457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022521	AAAT	2	8	164241	164248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022521	ATGT	2	8	167440	167447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022521	TGGT	2	8	171367	171374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022521	ATTA	2	8	176042	176049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022521	ATTA	2	8	176056	176063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022521	GCCC	2	8	185813	185820	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_022521	AGTG	2	8	185823	185830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022521	GTGC	2	8	185987	185994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022521	GGGA	2	8	191202	191209	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022521	TAAA	2	8	199949	199956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022521	CGGG	2	8	200187	200194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022521	CTTC	2	8	200340	200347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022521	GCCC	2	8	200413	200420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_022521	GCCG	2	8	200448	200455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022521	GGGC	2	8	200752	200759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022521	GGGT	2	8	200800	200807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022521	AGGG	2	8	201067	201074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022521	TGAA	2	8	203234	203241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022521	GCAT	2	8	203978	203985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022521	TTGA	2	8	204703	204710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022521	AATT	2	8	205624	205631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022521	CCAG	2	8	213278	213285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022521	ATTA	2	8	213949	213956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022521	CAAT	2	8	214588	214595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022521	ATGG	2	8	216777	216784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022521	TCCC	2	8	225482	225489	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_022521	TTGG	2	8	228729	228736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022521	CCGG	2	8	234584	234591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022521	GGAG	2	8	234697	234704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022521	AGGG	2	8	236308	236315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022521	CCAC	2	8	245826	245833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_022521	GAAC	2	8	248082	248089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022521	GCGG	2	8	256477	256484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022521	GATA	2	8	268840	268847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022521	ACCC	2	8	276725	276732	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_022521	CCCT	2	8	279661	279668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_022521	CAAA	2	8	282383	282390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022521	GTTT	2	8	282392	282399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022521	CTGC	2	8	282474	282481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022521	TTTG	2	8	282507	282514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022521	AGGG	2	8	282995	283002	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022521	GGCT	2	8	286046	286053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022521	AGTT	2	8	290348	290355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022521	TACC	2	8	292293	292300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022521	GCCT	2	8	293188	293195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022521	CCTC	2	8	295314	295321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_022521	AACA	2	8	312196	312203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022521	CCTC	2	8	312729	312736	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_022521	TTGT	2	8	312738	312745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022521	CTTA	2	8	313054	313061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022521	GATA	2	8	314257	314264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022521	GGAT	2	8	318188	318195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022521	CATA	2	8	319267	319274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022521	AGAT	2	8	321558	321565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022521	CCAA	2	8	329050	329057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022521	CTAA	2	8	329680	329687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022521	GTAT	2	8	329690	329697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022521	AAAT	2	8	330079	330086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022521	AAGA	2	8	330118	330125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022521	TAAA	2	8	336337	336344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022521	ACCA	2	8	338083	338090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022521	GGCT	2	8	341497	341504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022521	GAGG	2	8	356122	356129	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022521	AGGG	2	8	357825	357832	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022521	GGAG	2	8	365016	365023	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022521	CCCT	2	8	365747	365754	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_022521	TCCC	2	8	365768	365775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_022521	GATA	2	8	372499	372506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022521	GATA	2	8	372509	372516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022521	CAAC	2	8	372582	372589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022521	GCTG	2	8	372887	372894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022521	GCCC	2	8	379895	379902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_022521	CCTG	2	8	401729	401736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022521	CAAA	2	8	406344	406351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022521	CTCA	2	8	406808	406815	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022521	TGAG	2	8	406822	406829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022521	GGAA	2	8	407013	407020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022521	GCCC	2	8	410263	410270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_022521	GGGC	2	8	410293	410300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022521	GTTT	2	8	413126	413133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022521	ACCC	2	8	421389	421396	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_022521	TGCA	2	8	439387	439394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022521	AGCC	2	8	441816	441823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022521	AGCC	2	8	455443	455450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022521	AAAC	2	8	455579	455586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022521	GGGC	2	8	457280	457287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022521	GGGA	2	8	464152	464159	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022521	GTGG	2	8	466044	466051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022521	CCGG	2	8	466056	466063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022521	AATT	2	8	468034	468041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022521	TGGC	2	8	472260	472267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022521	CTGG	2	8	477443	477450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022521	GCCC	2	8	487613	487620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_022521	TTTA	2	8	489532	489539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022521	TATT	2	8	489956	489963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022521	CAGG	2	8	490114	490121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022521	TAAC	2	8	502793	502800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022521	TTGG	2	8	506908	506915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022521	GGGA	2	8	509230	509237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022521	TTCT	2	8	513004	513011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022521	TCCA	2	8	513170	513177	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022521	GAGG	2	8	516677	516684	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022521	TGGT	2	8	522262	522269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022521	TTTA	2	8	537659	537666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022521	TGTA	2	8	540392	540399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022521	TCTT	3	12	540420	540431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022521	TTCT	2	8	541640	541647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022521	ATGA	2	8	542756	542763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022521	TAAT	2	8	543192	543199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022521	GGGT	2	8	553114	553121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022521	CCTC	2	8	554295	554302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_022521	CCCT	2	8	557548	557555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_022521	TCCA	2	8	557604	557611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022521	GCCT	2	8	572024	572031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022521	TAGA	2	8	572175	572182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_022521	TAGT	2	8	1143165	1143172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.