MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 25446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022521	CCT	2	6	27	32	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454645
2	NC_022521	CTG	3	9	49	57	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454645
3	NC_022521	GTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454645
4	NC_022521	AGG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
5	NC_022521	GGA	2	6	162	167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
6	NC_022521	TGG	2	6	174	179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454645
7	NC_022521	GGT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454645
8	NC_022521	CGG	2	6	261	266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454645
9	NC_022521	AGC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454645
10	NC_022521	GCA	2	6	353	358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454645
11	NC_022521	GGA	3	9	360	368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
12	NC_022521	CGT	2	6	375	380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454645
13	NC_022521	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454645
14	NC_022521	GGT	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454645
15	NC_022521	CCT	2	6	578	583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454645
16	NC_022521	CGC	2	6	588	593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454645
17	NC_022521	CGG	2	6	638	643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454645
18	NC_022521	ACC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454645
19	NC_022521	CTC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454645
20	NC_022521	TAG	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454645
21	NC_022521	GGA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
22	NC_022521	CCT	2	6	957	962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454645
23	NC_022521	ACT	2	6	1073	1078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454645
24	NC_022521	GGA	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
25	NC_022521	GAG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454645
26	NC_022521	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454645
27	NC_022521	CTG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454645
28	NC_022521	CTG	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454645
29	NC_022521	ACA	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454645
30	NC_022521	GTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454646
31	NC_022521	TCG	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454646
32	NC_022521	CAT	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454646
33	NC_022521	CGA	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454646
34	NC_022521	GCT	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454646
35	NC_022521	CTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454646
36	NC_022521	GCC	2	6	2281	2286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454646
37	NC_022521	AAC	2	6	2369	2374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022521	GAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022521	TAT	2	6	2543	2548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454647
40	NC_022521	TCA	2	6	2578	2583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454647
41	NC_022521	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022521	TGG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022521	ATT	2	6	2790	2795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022521	TTA	2	6	2838	2843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022521	TCT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022521	GCC	2	6	2948	2953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022521	GCG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022521	AGA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022521	AGC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022521	CAA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022521	GAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454648
52	NC_022521	CAT	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454648
53	NC_022521	GAG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454648
54	NC_022521	CAT	2	6	3348	3353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454648
55	NC_022521	TAT	3	9	3686	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022521	TTG	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022521	TTA	2	6	3728	3733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022521	TAA	2	6	3836	3841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022521	AGA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022521	CCT	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454649
61	NC_022521	TGA	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454649
62	NC_022521	CTG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454649
63	NC_022521	CTC	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454649
64	NC_022521	TAT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454649
65	NC_022521	CCT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454649
66	NC_022521	CGC	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454649
67	NC_022521	CTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454649
68	NC_022521	CTA	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454649
69	NC_022521	TGA	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454649
70	NC_022521	GTG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454649
71	NC_022521	CCA	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454649
72	NC_022521	ATC	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454649
73	NC_022521	CCA	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454649
74	NC_022521	AGG	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454649
75	NC_022521	GAC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454649
76	NC_022521	CTC	2	6	5184	5189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454649
77	NC_022521	GCA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454649
78	NC_022521	CCG	2	6	5288	5293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454649
79	NC_022521	AAC	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454649
80	NC_022521	GCG	3	9	5429	5437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454649
81	NC_022521	GAG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022521	ATA	2	6	5737	5742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022521	ACC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454650
84	NC_022521	ATT	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454650
85	NC_022521	CTC	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454650
86	NC_022521	CAT	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454650
87	NC_022521	GCG	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454650
88	NC_022521	AGA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454650
89	NC_022521	TAG	2	6	6273	6278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454650
90	NC_022521	GGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454650
91	NC_022521	CTA	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454650
92	NC_022521	GCG	2	6	6399	6404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454650
93	NC_022521	GTT	2	6	6479	6484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454650
94	NC_022521	GGA	2	6	6486	6491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454650
95	NC_022521	AGC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454650
96	NC_022521	ATA	2	6	6605	6610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022521	GGA	2	6	6616	6621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
98	NC_022521	GAG	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
99	NC_022521	GAG	2	6	6766	6771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
100	NC_022521	GAC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454651
101	NC_022521	GGA	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
102	NC_022521	GTG	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454651
103	NC_022521	CGG	2	6	6978	6983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454651
104	NC_022521	ATA	2	6	6998	7003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454651
105	NC_022521	AAG	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454651
106	NC_022521	CCA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454651
107	NC_022521	GAG	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
108	NC_022521	GGT	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454651
109	NC_022521	CGC	2	6	7378	7383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454651
110	NC_022521	CCT	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454651
111	NC_022521	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454651
112	NC_022521	ACT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022521	GTT	3	9	7586	7594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022521	TGG	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022521	GAG	2	6	7699	7704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454652
116	NC_022521	CGA	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454652
117	NC_022521	GTG	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454652
118	NC_022521	AGG	2	6	7878	7883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454652
119	NC_022521	ACG	2	6	7935	7940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454652
120	NC_022521	ATG	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454652
121	NC_022521	TGC	2	6	8251	8256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454652
122	NC_022521	TGG	2	6	8409	8414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454652
123	NC_022521	TTG	2	6	8418	8423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454652
124	NC_022521	CCT	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454652
125	NC_022521	CGA	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454652
126	NC_022521	CGA	2	6	8575	8580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454652
127	NC_022521	CAG	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454652
128	NC_022521	TGG	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454652
129	NC_022521	TGA	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454652
130	NC_022521	GAG	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454652
131	NC_022521	GAG	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454652
132	NC_022521	TGT	3	9	8977	8985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454652
133	NC_022521	GCG	2	6	9105	9110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454652
134	NC_022521	TGG	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454652
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140	NC_022521	AAT	2	6	9779	9784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454653
141	NC_022521	TCC	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454653
142	NC_022521	TCA	2	6	9809	9814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454653
143	NC_022521	TGC	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454653
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243	NC_022521	TGA	2	6	17448	17453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454662
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249	NC_022521	ACC	2	6	17675	17680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_022521	CAT	2	6	17722	17727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454663
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253	NC_022521	TAT	2	6	17887	17892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454663
254	NC_022521	GCT	3	9	17915	17923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454663
255	NC_022521	TCC	2	6	17983	17988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_022521	AAG	2	6	18039	18044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454664
257	NC_022521	TAG	2	6	18116	18121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454664
258	NC_022521	AGA	2	6	18124	18129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454664
259	NC_022521	AGG	2	6	18147	18152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454664
260	NC_022521	ATA	2	6	18166	18171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454664
261	NC_022521	TAG	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454664
262	NC_022521	GGC	2	6	18326	18331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454664
263	NC_022521	GCT	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454664
264	NC_022521	TCA	2	6	18445	18450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454664
265	NC_022521	AGA	2	6	18478	18483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454664
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267	NC_022521	GGT	2	6	18564	18569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454664
268	NC_022521	TTA	2	6	18724	18729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454664
269	NC_022521	TGG	2	6	18759	18764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454664
270	NC_022521	TAC	2	6	18797	18802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454664
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272	NC_022521	GGC	2	6	18855	18860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454664
273	NC_022521	TTC	2	6	18900	18905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454664
274	NC_022521	CGG	2	6	18907	18912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454664
275	NC_022521	CCG	2	6	18981	18986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454664
276	NC_022521	TTC	2	6	19144	19149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454664
277	NC_022521	GCT	2	6	19200	19205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454664
278	NC_022521	CGA	2	6	19231	19236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454664
279	NC_022521	CGC	2	6	19288	19293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454664
280	NC_022521	TCC	2	6	19298	19303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454664
281	NC_022521	ATG	2	6	19305	19310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454664
282	NC_022521	AAC	2	6	19335	19340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454664
283	NC_022521	TAG	2	6	19370	19375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454664
284	NC_022521	TTA	2	6	19396	19401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454664
285	NC_022521	GCA	2	6	19512	19517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454664
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287	NC_022521	GTC	2	6	19558	19563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454664
288	NC_022521	TAT	2	6	19574	19579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454664
289	NC_022521	GGT	2	6	19651	19656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454664
290	NC_022521	ATA	2	6	19660	19665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454664
291	NC_022521	TGC	2	6	19694	19699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454664
292	NC_022521	AGA	2	6	19722	19727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454664
293	NC_022521	CAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454664
294	NC_022521	TTC	2	6	19824	19829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454664
295	NC_022521	CCA	2	6	19885	19890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454664
296	NC_022521	CTC	2	6	19987	19992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454664
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299	NC_022521	AGG	2	6	20157	20162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454664
300	NC_022521	AGT	2	6	20241	20246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454664
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330	NC_022521	TAA	2	6	22279	22284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_022521	AAG	2	6	22457	22462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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360	NC_022521	ATT	2	6	24515	24520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_022521	ATG	2	6	24525	24530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_022521	TTG	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454668
372	NC_022521	AAG	2	6	25163	25168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454668
373	NC_022521	TTC	2	6	25172	25177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454668
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379	NC_022521	GCT	2	6	25648	25653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454668
380	NC_022521	CGA	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454668
381	NC_022521	GCT	2	6	25864	25869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454668
382	NC_022521	CGG	3	9	25933	25941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454668
383	NC_022521	GTT	2	6	26113	26118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454669
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385	NC_022521	CTA	2	6	26236	26241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454669
386	NC_022521	CTA	2	6	26248	26253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454669
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391	NC_022521	GCC	2	6	26515	26520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454669
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433	NC_022521	CTG	2	6	28572	28577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454671
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498	NC_022521	GCG	2	6	33057	33062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454676
499	NC_022521	AGG	2	6	33163	33168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454676
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