MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022444	CGCAGG	2	12	2743	2754	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022444	GGCCAG	2	12	13576	13587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022444	TGCGAC	2	12	18532	18543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022444	AGAGGA	2	12	30182	30193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022444	GCGTCC	2	12	30273	30284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022444	TCCAGC	2	12	60925	60936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022444	CGGGCT	2	12	60980	60991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022444	TCTCCA	2	12	85955	85966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022444	TGCAGG	2	12	86151	86162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022444	TGATTT	2	12	92690	92701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022444	TCGCCG	2	12	92800	92811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022444	CTGGCC	2	12	103871	103882	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022444	GAAAAT	2	12	130693	130704	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022444	TTTATC	2	12	150079	150090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022444	GTCCAG	2	12	218069	218080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022444	CGCCCC	2	12	245585	245596	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
17	NC_022444	GCCTCG	2	12	252186	252197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022444	GCGCAG	2	12	292967	292978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022444	GGCGCA	2	12	292998	293009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022444	TGAACG	2	12	315309	315320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022444	CAAAAT	2	12	438024	438035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022444	TTGTCA	2	12	474052	474063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022444	CTACCC	2	12	495217	495228	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_022444	AGCATC	2	12	502235	502246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022444	GCCACC	2	12	513294	513305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022444	CATGCA	2	12	591794	591805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022444	ATGGAA	2	12	607757	607768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022444	CAAAAA	2	12	635815	635826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022444	TCTCAT	2	12	675594	675605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022444	TGGAGG	2	12	716159	716170	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022444	CCTGTC	2	12	716216	716227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022444	TCCGCA	2	12	722470	722481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022444	TCGGCG	2	12	745275	745286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022444	GGCCCT	2	12	750217	750228	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022444	GCCTGG	2	12	774843	774854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022444	ACCGGC	2	12	812367	812378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022444	GGGGCG	2	12	842998	843009	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022444	CTTTTG	2	12	861340	861351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022444	AGCGCC	2	12	865437	865448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022444	TGCCGG	2	12	890965	890976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022444	CAAAAT	2	12	896792	896803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022444	CGCCTG	2	12	919421	919432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022444	GCGCAG	2	12	963515	963526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022444	GGCCTG	2	12	1009532	1009543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022444	GCAGGT	2	12	1010439	1010450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022444	GCAGGT	2	12	1012889	1012900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022444	CAGTTC	2	12	1020298	1020309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022444	CTGGCC	2	12	1021499	1021510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022444	GGCCAC	2	12	1021627	1021638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022444	CCGGGG	2	12	1021737	1021748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022444	CCACGG	2	12	1022169	1022180	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022444	GGCCAC	2	12	1026403	1026414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022444	CATGCC	2	12	1029279	1029290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022444	GCGGGG	2	12	1029296	1029307	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022444	TGGCCG	2	12	1031787	1031798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022444	AGCCCC	2	12	1033755	1033766	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_022444	CGGGGG	2	12	1078127	1078138	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022444	CCCTGG	2	12	1134786	1134797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022444	ATGACA	2	12	1136663	1136674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022444	TCTTCG	2	12	1189242	1189253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022444	CCTGGC	2	12	1189585	1189596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022444	GCCCGA	2	12	1213734	1213745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022444	CCCCGG	2	12	1250252	1250263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022444	TAAGCG	2	12	1255268	1255279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022444	CAGTTG	2	12	1303220	1303231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022444	GGCCAG	2	12	1310021	1310032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022444	AAGCGA	2	12	1319305	1319316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022444	CCCCTG	2	12	1340095	1340106	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022444	TGCGTC	2	12	1371847	1371858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022444	TGGGCC	2	12	1381289	1381300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022444	TCGCCC	2	12	1450784	1450795	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_022444	GCCCCG	2	12	1475160	1475171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022444	AGGCCG	2	12	1477002	1477013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022444	GTGAAT	2	12	1548305	1548316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022444	CCCGCA	2	12	1663220	1663231	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_022444	ATGCCG	2	12	1696752	1696763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022444	AATGGT	2	12	1697231	1697242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022444	TTCACC	2	12	1762085	1762096	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022444	GGACAG	2	12	1785646	1785657	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022444	TGGTGT	2	12	1845737	1845748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022444	GGTTGG	2	12	1922569	1922580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022444	CCAACC	2	12	2001326	2001337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022444	CTGCGG	2	12	2026242	2026253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022444	GCATCC	2	12	2036689	2036700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022444	CAGAAC	2	12	2071160	2071171	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022444	CGGCAA	2	12	2081060	2081071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022444	AAGACA	2	12	2114727	2114738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022444	GGCCTG	2	12	2115603	2115614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022444	GAGGAA	2	12	2116536	2116547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022444	CCACGG	2	12	2141043	2141054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022444	CACGGC	2	12	2141590	2141601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022444	ACCGTC	2	12	2143333	2143344	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022444	ATAAAC	2	12	2172442	2172453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022444	TGCAGA	2	12	2174385	2174396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022444	CAGCAC	2	12	2179791	2179802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022444	ATTAAT	2	12	2180347	2180358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022444	GACCTG	2	12	2262241	2262252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022444	GGGCAG	2	12	2279182	2279193	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022444	GCAAGG	2	12	2281575	2281586	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022444	GGCCAG	2	12	2281964	2281975	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022444	TGATGG	2	12	2296255	2296266	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022444	CCGAGG	2	12	2442044	2442055	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022444	ATGCCG	2	12	2442650	2442661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022444	CATCCA	2	12	2464164	2464175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022444	GCGACG	3	18	2507601	2507618	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022444	GCCATC	2	12	2525907	2525918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022444	ACGGCA	2	12	2546067	2546078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022444	ATTTTT	2	12	2560220	2560231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022444	TCGCCC	2	12	2574812	2574823	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022444	GCGCCA	2	12	2576921	2576932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022444	GCCAGG	2	12	2713261	2713272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022444	TGCAGG	2	12	2713273	2713284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022444	GGGAGA	2	12	2847035	2847046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022444	CCACGC	2	12	2867241	2867252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_022444	CGGTGA	2	12	2878873	2878884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022444	TTCATT	2	12	2878984	2878995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022444	ATGTTT	2	12	2885508	2885519	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022444	CTAGCC	2	12	2982872	2982883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022444	CCAGGG	2	12	3076901	3076912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022444	CTTGCG	2	12	3091658	3091669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022444	TCAAGG	2	12	3112156	3112167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022444	GTTGAC	2	12	3118234	3118245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022444	GGGCGG	2	12	3191831	3191842	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022444	GAGAAT	2	12	3212561	3212572	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022444	CCTTGC	2	12	3219102	3219113	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022444	CTGCGC	2	12	3253070	3253081	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022444	CAGCGG	2	12	3255039	3255050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022444	CCCCTT	2	12	3291571	3291582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022444	CCTGTG	2	12	3295467	3295478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022444	CGGCCG	2	12	3314712	3314723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022444	CGGCAG	2	12	3319128	3319139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022444	CGCGGG	2	12	3362094	3362105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022444	CGCGGC	2	12	3365199	3365210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022444	GTGCTG	2	12	3365888	3365899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022444	CCCCTG	2	12	3384790	3384801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_022444	TTGCGG	2	12	3388228	3388239	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022444	TGGCCC	2	12	3392733	3392744	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022444	TGCGCT	2	12	3431813	3431824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022444	TCCCTC	2	12	3454886	3454897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_022444	GGACGG	2	12	3464831	3464842	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022444	GGGAGA	2	12	3474546	3474557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022444	AGGGAG	2	12	3498805	3498816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022444	TGTATT	2	12	3522051	3522062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022444	AATATG	2	12	3526346	3526357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022444	TATTAA	2	12	3535040	3535051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022444	GTGCTG	2	12	3535597	3535608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_022444	GCGTTC	2	12	3587552	3587563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022444	CTTTTG	2	12	3670942	3670953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.