MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 1486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
2	NC_022443	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022443	TTTAAA	2	12	4213	4224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022443	TGGCGG	2	12	6113	6124	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	545636477
5	NC_022443	GTTATC	2	12	8041	8052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636478
6	NC_022443	CAGATA	2	12	8950	8961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636478
7	NC_022443	CAAGCT	2	12	9009	9020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636478
8	NC_022443	GTAATG	2	12	9997	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636478
9	NC_022443	AGATGA	2	12	10391	10402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636478
10	NC_022443	ACAATT	2	12	11994	12005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545636480
11	NC_022443	TTAGCA	2	12	12088	12099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636480
12	NC_022443	TAAATC	2	12	17902	17913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022443	GCTTTA	2	12	18180	18191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636485
14	NC_022443	TTTGAA	2	12	19001	19012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636485
15	NC_022443	TAAAGG	2	12	21048	21059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636487
16	NC_022443	TTGAAG	2	12	21245	21256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636487
17	NC_022443	TGATTG	2	12	22449	22460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636488
18	NC_022443	TGAAAT	2	12	22780	22791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636488
19	NC_022443	AAGGAA	2	12	23219	23230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
20	NC_022443	TGAATT	2	12	26141	26152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636490
21	NC_022443	ATTTCA	2	12	28625	28636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636492
22	NC_022443	GTTCTG	2	12	29924	29935	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545636493
23	NC_022443	ATCAGC	2	12	31939	31950	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636495
24	NC_022443	AAAAGA	2	12	34568	34579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545636497
25	NC_022443	ACATCT	2	12	36222	36233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636498
26	NC_022443	GTTTAA	2	12	37365	37376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636500
27	NC_022443	AAAAAT	2	12	39056	39067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022443	AATGAA	2	12	40292	40303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636503
29	NC_022443	ACAACT	2	12	42357	42368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545636504
30	NC_022443	GCTAAA	2	12	43596	43607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636506
31	NC_022443	ACAAGA	2	12	57883	57894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545636520
32	NC_022443	AAATGG	2	12	59249	59260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636521
33	NC_022443	TAGAAA	2	12	60524	60535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636521
34	NC_022443	GAAATA	2	12	61099	61110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022443	ACCCTT	2	12	64308	64319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545636526
36	NC_022443	TTTTAA	2	12	68752	68763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636532
37	NC_022443	AGAAAA	2	12	68956	68967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545636532
38	NC_022443	GAATGT	2	12	68989	69000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636532
39	NC_022443	CGAAAT	2	12	69461	69472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636533
40	NC_022443	GATGTC	2	12	70416	70427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545636534
41	NC_022443	GTTAGA	2	12	72910	72921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636535
42	NC_022443	AAAAGA	2	12	72964	72975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545636535
43	NC_022443	TACAAG	2	12	75719	75730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636537
44	NC_022443	GTAGAA	2	12	79642	79653	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636540
45	NC_022443	AACCAC	2	12	80477	80488	50 %	0 %	0 %	50 %	545636540
46	NC_022443	AATATA	2	12	82179	82190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022443	AACCGA	2	12	83793	83804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545636542
48	NC_022443	AGCAAA	2	12	88254	88265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545636545
49	NC_022443	ATAGAT	2	12	88694	88705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636545
50	NC_022443	TATCAT	2	12	89461	89472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636546
51	NC_022443	TAAATA	2	12	91388	91399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636547
52	NC_022443	TTTTTC	2	12	93856	93867	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545636549
53	NC_022443	TTAAAT	2	12	93951	93962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022443	TTAACA	2	12	95307	95318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022443	TAAGCC	2	12	95717	95728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636551
56	NC_022443	ATCGCA	2	12	96932	96943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545636552
57	NC_022443	TTTGAA	2	12	97963	97974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636553
58	NC_022443	TGAAGA	2	12	107755	107766	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636560
59	NC_022443	TTTCAT	2	12	108436	108447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545636561
60	NC_022443	AGAATG	2	12	110405	110416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636563
61	NC_022443	ATTTTT	2	12	110650	110661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545636564
62	NC_022443	TGTATA	2	12	113301	113312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636566
63	NC_022443	AATTAT	2	12	113660	113671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022443	TCGAAA	2	12	114802	114813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636568
65	NC_022443	CTATTG	2	12	117388	117399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636570
66	NC_022443	CATATG	2	12	118591	118602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636571
67	NC_022443	CAGATT	2	12	125297	125308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636576
68	NC_022443	GTTTTT	2	12	133605	133616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022443	TGAAAG	2	12	134475	134486	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636584
70	NC_022443	GATATG	2	12	141979	141990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636590
71	NC_022443	ATTTGA	2	12	145885	145896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636593
72	NC_022443	TATAAA	2	12	146416	146427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636594
73	NC_022443	GATTTT	2	12	150578	150589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022443	ACAAAG	2	12	155098	155109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545636602
75	NC_022443	TGTAAT	2	12	156122	156133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636603
76	NC_022443	AAAGAT	2	12	157111	157122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636605
77	NC_022443	ATTAAT	2	12	159017	159028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022443	CAATAT	2	12	159581	159592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545636606
79	NC_022443	TTGGTA	2	12	163435	163446	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636611
80	NC_022443	AATTTA	2	12	163554	163565	50 %	50 %	0 %	0 %	545636611
81	NC_022443	CTATTA	2	12	169853	169864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636614
82	NC_022443	TATGAT	2	12	171387	171398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636614
83	NC_022443	ATTGAA	2	12	171838	171849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636614
84	NC_022443	AGCAAC	2	12	177789	177800	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545636618
85	NC_022443	CACCTT	2	12	179841	179852	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545636620
86	NC_022443	ACCTTT	2	12	180346	180357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545636620
87	NC_022443	TTTATA	2	12	180442	180453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022443	ATTAAT	2	12	180465	180476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022443	GTAAAT	2	12	184078	184089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636623
90	NC_022443	ATTTTA	2	12	185672	185683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636625
91	NC_022443	TATCTT	2	12	190286	190297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545636628
92	NC_022443	GAGTTT	2	12	195211	195222	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636631
93	NC_022443	CCCTGA	2	12	197726	197737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545636633
94	NC_022443	TCCTGA	2	12	198545	198556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545636633
95	NC_022443	AAATAT	2	12	198963	198974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636634
96	NC_022443	TCAATT	2	12	200696	200707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636635
97	NC_022443	AATATG	2	12	201996	202007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636636
98	NC_022443	AGATCA	2	12	202946	202957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636636
99	NC_022443	AAAAAT	2	12	205488	205499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545636638
100	NC_022443	AAAGGA	2	12	207347	207358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636640
101	NC_022443	ACATTT	2	12	207685	207696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636640
102	NC_022443	TTCTTG	2	12	212614	212625	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545636644
103	NC_022443	GGACGT	2	12	223220	223231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545636653
104	NC_022443	ATATGA	2	12	225971	225982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022443	CATAAA	2	12	229344	229355	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545636657
106	NC_022443	AAAACT	2	12	229419	229430	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545636657
107	NC_022443	AGTGGA	2	12	240912	240923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022443	TGGTAT	2	12	252496	252507	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636675
109	NC_022443	TATAGA	2	12	255850	255861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636679
110	NC_022443	ATATAG	2	12	262142	262153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022443	ACGATG	2	12	262478	262489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545636684
112	NC_022443	ATTTTC	2	12	267459	267470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022443	ATAATT	2	12	268409	268420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022443	AGAATC	2	12	270037	270048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636689
115	NC_022443	AAGTAA	2	12	273460	273471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636694
116	NC_022443	ATAAAG	2	12	274441	274452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636695
117	NC_022443	AACGAT	2	12	275749	275760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022443	GACATT	2	12	276102	276113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636696
119	NC_022443	GATTTC	2	12	277921	277932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636698
120	NC_022443	TTCATA	2	12	278491	278502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636699
121	NC_022443	GATTAT	2	12	282901	282912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636703
122	NC_022443	ATGGTG	2	12	283034	283045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545636703
123	NC_022443	CAGCAA	2	12	283421	283432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545636703
124	NC_022443	TAACTT	3	18	284127	284144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022443	AAATGC	2	12	284455	284466	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636704
126	NC_022443	TAATGG	2	12	284635	284646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636704
127	NC_022443	TCTTCA	2	12	289007	289018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545636708
128	NC_022443	TTATCT	2	12	289103	289114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545636708
129	NC_022443	ATTTTA	2	12	289208	289219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636708
130	NC_022443	ATAAGT	2	12	290569	290580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636709
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132	NC_022443	GATACA	2	12	292530	292541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636711
133	NC_022443	AATCAA	2	12	293536	293547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545636711
134	NC_022443	TAATTA	2	12	294857	294868	50 %	50 %	0 %	0 %	545636713
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138	NC_022443	TGAAGA	2	12	299186	299197	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636715
139	NC_022443	GATCAA	2	12	299893	299904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636715
140	NC_022443	AATATA	2	12	304089	304100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636720
141	NC_022443	TTTTTA	2	12	305289	305300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545636722
142	NC_022443	TGTTTT	2	12	305792	305803	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545636723
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145	NC_022443	CTGAAT	2	12	312724	312735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636734
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148	NC_022443	ACGAAT	2	12	317982	317993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636738
149	NC_022443	GAAACA	2	12	319587	319598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545636739
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151	NC_022443	AAAATT	2	12	320152	320163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636740
152	NC_022443	AAGGTA	2	12	331468	331479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636748
153	NC_022443	AATGCA	2	12	332522	332533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636749
154	NC_022443	GAAAAA	2	12	333992	334003	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022443	AATGAC	2	12	335570	335581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636753
156	NC_022443	AAAATG	2	12	337051	337062	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545636754
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159	NC_022443	TTGTAA	2	12	342449	342460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022443	AATTTT	2	12	343720	343731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636761
161	NC_022443	TAATAT	2	12	350694	350705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022443	GATGCT	2	12	354383	354394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545636771
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189	NC_022443	TAAAAT	2	12	410810	410821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_022443	TGATAT	2	12	454606	454617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636872
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226	NC_022443	TTGATA	2	12	466493	466504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636881
227	NC_022443	ACGTTG	2	12	467300	467311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
228	NC_022443	AAAATA	2	12	468024	468035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_022443	GTTGGT	2	12	469378	469389	0 %	50 %	50 %	0 %	545636882
230	NC_022443	GCTATT	2	12	469450	469461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636882
231	NC_022443	GATCAT	2	12	471046	471057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636883
232	NC_022443	AATTTA	2	12	471953	471964	50 %	50 %	0 %	0 %	545636884
233	NC_022443	CAAGAA	2	12	475079	475090	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545636887
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235	NC_022443	CAAGAT	2	12	484464	484475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545636891
236	NC_022443	AGTTGA	2	12	484703	484714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636891
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238	NC_022443	TTATAA	2	12	487098	487109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_022443	TTTATA	2	12	488015	488026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636895
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271	NC_022443	GTTATA	2	12	550725	550736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_022443	ATTGCG	2	12	600641	600652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
350	NC_022443	TATTTA	2	12	601882	601893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636985
351	NC_022443	GCAATT	2	12	608445	608456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636994
352	NC_022443	GAAAAA	2	12	609006	609017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545636994
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458	NC_022443	ATCAAT	2	12	806098	806109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545637179
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460	NC_022443	GAAGTA	2	12	813309	813320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545637185
461	NC_022443	AAACAA	2	12	815543	815554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545637187
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