MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	TTTAAA	2	12	4213	4224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022443	TAAATC	2	12	17902	17913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022443	AAAAAT	2	12	39056	39067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022443	GAAATA	2	12	61099	61110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022443	AATATA	2	12	82179	82190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022443	TTAAAT	2	12	93951	93962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022443	TTAACA	2	12	95307	95318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022443	AATTAT	2	12	113660	113671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022443	GTTTTT	2	12	133605	133616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022443	GATTTT	2	12	150578	150589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022443	ATTAAT	2	12	159017	159028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022443	TTTATA	2	12	180442	180453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022443	ATTAAT	2	12	180465	180476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022443	ATATGA	2	12	225971	225982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022443	AGTGGA	2	12	240912	240923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022443	ATATAG	2	12	262142	262153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022443	ATTTTC	2	12	267459	267470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022443	ATAATT	2	12	268409	268420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022443	AACGAT	2	12	275749	275760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022443	TAACTT	3	18	284127	284144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022443	GAAAAA	2	12	333992	334003	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022443	TTGTAA	2	12	342449	342460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022443	TAATAT	2	12	350694	350705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022443	TAAAGA	2	12	384665	384676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022443	ATTAAT	2	12	401106	401117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022443	GATTTT	2	12	402859	402870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022443	ATTGTT	2	12	405488	405499	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022443	TATAAT	2	12	409031	409042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022443	TAAAAT	2	12	410810	410821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022443	TTGAAA	2	12	413463	413474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022443	TGTATA	2	12	427780	427791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022443	TTTTTA	2	12	441450	441461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022443	AAAATG	2	12	446881	446892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022443	ACGTTG	2	12	467300	467311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022443	AAAATA	2	12	468024	468035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022443	TTATAA	2	12	487098	487109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022443	AAATTT	2	12	493857	493868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022443	TTATAA	2	12	550054	550065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022443	GTTATA	2	12	550725	550736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022443	CTTAAA	2	12	559157	559168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022443	ACATGT	2	12	569123	569134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022443	ATTGCG	2	12	600641	600652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022443	TAAAAT	2	12	620718	620729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022443	TTTTAA	2	12	627984	627995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022443	CATTAT	2	12	644108	644119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022443	TTATTT	2	12	652615	652626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022443	CATCAA	2	12	654559	654570	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022443	TAATTT	2	12	658799	658810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022443	TGAATA	2	12	675277	675288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022443	GGATTC	2	12	686629	686640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022443	TTAAAA	2	12	701774	701785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022443	TAGTTA	2	12	706196	706207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022443	TAATTA	2	12	717002	717013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022443	TTTTTA	2	12	724401	724412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022443	TGAAAA	2	12	732644	732655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022443	TAGAAT	2	12	820152	820163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022443	TAAAAA	2	12	822282	822293	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022443	TATCAA	2	12	828839	828850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022443	AATATA	2	12	830214	830225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022443	TCATTT	2	12	838609	838620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022443	AAATTA	2	12	865030	865041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022443	AATGAT	2	12	874080	874091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022443	TAAAAT	2	12	881651	881662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022443	ATTTAT	2	12	895841	895852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022443	AATTAT	2	12	936875	936886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022443	TTTAAT	2	12	956946	956957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022443	AACGGA	2	12	991153	991164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022443	CATTTA	2	12	1021359	1021370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022443	ATCATA	2	12	1023263	1023274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022443	TATGTA	2	12	1043399	1043410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022443	TTTTCT	2	12	1043494	1043505	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022443	TTTATA	2	12	1079275	1079286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022443	CTTAGG	2	12	1084821	1084832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022443	GAATTA	2	12	1085792	1085803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022443	ATTTTT	2	12	1103183	1103194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022443	ATAATT	2	12	1103980	1103991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022443	TCATTA	2	12	1109064	1109075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022443	TAATGA	2	12	1117155	1117166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022443	ATTTAT	2	12	1136398	1136409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022443	AAATTT	2	12	1141128	1141139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022443	AAGTAA	2	12	1162823	1162834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022443	TCGTTT	2	12	1167322	1167333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022443	TTAATT	2	12	1178039	1178050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022443	TCAAAA	2	12	1178883	1178894	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022443	AATTAA	2	12	1180976	1180987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022443	TGATTT	2	12	1185942	1185953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022443	GAAATT	2	12	1224944	1224955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022443	AATGAT	2	12	1237718	1237729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022443	TTTCAT	2	12	1268004	1268015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022443	TATATT	2	12	1273198	1273209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022443	ATGTAT	2	12	1298898	1298909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022443	AAAGAA	2	12	1299132	1299143	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022443	TTAAAG	2	12	1302710	1302721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022443	CTATAA	2	12	1304102	1304113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022443	TTAAAG	2	12	1304514	1304525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022443	TTAAAG	2	12	1305448	1305459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022443	ATTAAA	2	12	1331236	1331247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022443	ATATAA	2	12	1339059	1339070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022443	GTTTTA	2	12	1368862	1368873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022443	TAAAAT	2	12	1384440	1384451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022443	TATCTT	2	12	1406278	1406289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022443	TTGATT	2	12	1406341	1406352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022443	ATTCTA	2	12	1414043	1414054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022443	AATAAA	2	12	1416893	1416904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022443	TTTCTT	2	12	1427105	1427116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022443	CTTGTT	2	12	1428370	1428381	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022443	GCTTTT	2	12	1428975	1428986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022443	GCATCA	2	12	1434828	1434839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022443	TATCAG	2	12	1435579	1435590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022443	CATTTG	2	12	1435765	1435776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022443	CATTAG	2	12	1440055	1440066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022443	GTTGGT	2	12	1441935	1441946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022443	TTTTTG	2	12	1443680	1443691	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022443	TTTTTG	2	12	1446704	1446715	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022443	TTAGCA	2	12	1452612	1452623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022443	ACTGTT	2	12	1452864	1452875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022443	CTGCTT	2	12	1454665	1454676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022443	CCTGCT	2	12	1457541	1457552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022443	TATTCT	2	12	1464406	1464417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022443	TACTTG	2	12	1474654	1474665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022443	CATTCA	2	12	1477872	1477883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022443	TTAATC	2	12	1488145	1488156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022443	TGAAAA	2	12	1507561	1507572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022443	AATAAA	2	12	1531843	1531854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022443	ATAAAA	2	12	1535631	1535642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022443	ACAAGA	2	12	1541208	1541219	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022443	TTATAG	2	12	1563241	1563252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022443	AATTTA	2	12	1571276	1571287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022443	AGCCAA	2	12	1599162	1599173	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022443	TTGACT	2	12	1599181	1599192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022443	TTTAAC	2	12	1604065	1604076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_022443	TTATAA	2	12	1606734	1606745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022443	ACCTTT	2	12	1616691	1616702	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022443	AGTTTT	2	12	1646133	1646144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022443	AATTAA	2	12	1647379	1647390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022443	TAAAAC	2	12	1650519	1650530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_022443	AATTTA	2	12	1660327	1660338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022443	ATTTTC	2	12	1666362	1666373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_022443	TTTTAG	2	12	1672834	1672845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022443	TAAAAA	2	12	1699515	1699526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022443	TTTCAT	2	12	1719389	1719400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_022443	GTAAAA	2	12	1748078	1748089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022443	TAATTA	2	12	1754943	1754954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022443	TATCAA	2	12	1758856	1758867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_022443	TAAAAA	2	12	1761057	1761068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022443	CACTAT	2	12	1768173	1768184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022443	TCAAAA	2	12	1780116	1780127	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_022443	CATACA	2	12	1788242	1788253	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022443	ATTATA	2	12	1831329	1831340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022443	TTTAAA	2	12	1843061	1843072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022443	AGTGAA	2	12	1843394	1843405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022443	TTTCAA	2	12	1847806	1847817	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_022443	TAGTAA	2	12	1849409	1849420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022443	TTCTAC	2	12	1860067	1860078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_022443	TATTTT	2	12	1869671	1869682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022443	TTTAAC	2	12	1877335	1877346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_022443	TCTAAC	2	12	1907233	1907244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_022443	TTTTAA	2	12	1912147	1912158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022443	TAATTT	2	12	1922264	1922275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022443	ATTCTT	2	12	1925679	1925690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_022443	ATTATG	2	12	1932419	1932430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022443	AATTTA	2	12	1971808	1971819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022443	AATATT	2	12	1983610	1983621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022443	TTTTAT	2	12	1987735	1987746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022443	CCTATT	2	12	1989373	1989384	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_022443	TATTTA	2	12	2041798	2041809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022443	AAAAAG	2	12	2043886	2043897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022443	TAAAAA	2	12	2074490	2074501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022443	TCAAAA	2	12	2095532	2095543	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_022443	ATTTTG	2	12	2104173	2104184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022443	CACACC	2	12	2109143	2109154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_022443	TTTAAT	2	12	2113376	2113387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_022443	AAATTT	2	12	2176869	2176880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_022443	TTTATA	2	12	2672148	2672159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_022443	ATTCGA	2	12	2702113	2702124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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231	NC_022443	ATATAA	2	12	2722307	2722318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.