MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 2457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	545636472
2	NC_022443	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	545636473
3	NC_022443	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	545636473
4	NC_022443	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	545636473
5	NC_022443	GAAAA	2	10	3349	3358	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022443	CAAAT	2	10	5968	5977	60 %	20 %	0 %	20 %	545636477
7	NC_022443	TGAAT	2	10	7478	7487	40 %	40 %	20 %	0 %	545636477
8	NC_022443	TGAAC	2	10	7719	7728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022443	TTCAA	2	10	8465	8474	40 %	40 %	0 %	20 %	545636478
10	NC_022443	ATCGC	2	10	10927	10936	20 %	20 %	20 %	40 %	545636479
11	NC_022443	CGTTG	2	10	12470	12479	0 %	40 %	40 %	20 %	545636480
12	NC_022443	GTAGG	2	10	15141	15150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022443	TTATT	2	10	16180	16189	20 %	80 %	0 %	0 %	545636483
14	NC_022443	TTTGA	2	10	17513	17522	20 %	60 %	20 %	0 %	545636484
15	NC_022443	TCAAT	2	10	19650	19659	40 %	40 %	0 %	20 %	545636486
16	NC_022443	AGTTA	2	10	22828	22837	40 %	40 %	20 %	0 %	545636488
17	NC_022443	ATGTA	2	10	24387	24396	40 %	40 %	20 %	0 %	545636489
18	NC_022443	TCGAT	2	10	24551	24560	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022443	ATATT	2	10	25089	25098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022443	ACCAA	2	10	26991	27000	60 %	0 %	0 %	40 %	545636491
21	NC_022443	ATCAA	2	10	27703	27712	60 %	20 %	0 %	20 %	545636491
22	NC_022443	GAAAC	2	10	28324	28333	60 %	0 %	20 %	20 %	545636492
23	NC_022443	GAAGT	2	10	28474	28483	40 %	20 %	40 %	0 %	545636492
24	NC_022443	ATTAT	2	10	30117	30126	40 %	60 %	0 %	0 %	545636493
25	NC_022443	AACGA	2	10	30190	30199	60 %	0 %	20 %	20 %	545636493
26	NC_022443	AAACG	2	10	32023	32032	60 %	0 %	20 %	20 %	545636495
27	NC_022443	AAGGT	2	10	33195	33204	40 %	20 %	40 %	0 %	545636495
28	NC_022443	TATGA	2	10	33392	33401	40 %	40 %	20 %	0 %	545636495
29	NC_022443	GTTGT	2	10	33785	33794	0 %	60 %	40 %	0 %	545636495
30	NC_022443	CATTA	2	10	34622	34631	40 %	40 %	0 %	20 %	545636497
31	NC_022443	TTTCA	2	10	35025	35034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022443	AAATG	2	10	36266	36275	60 %	20 %	20 %	0 %	545636498
33	NC_022443	ATTTT	2	10	36347	36356	20 %	80 %	0 %	0 %	545636498
34	NC_022443	TAAAA	2	10	36478	36487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022443	AGATA	2	10	36636	36645	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022443	ATGAG	2	10	38930	38939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022443	TGAAT	2	10	39277	39286	40 %	40 %	20 %	0 %	545636502
38	NC_022443	TTGGT	2	10	39319	39328	0 %	60 %	40 %	0 %	545636502
39	NC_022443	AATAT	2	10	39387	39396	60 %	40 %	0 %	0 %	545636502
40	NC_022443	TTCGT	2	10	39598	39607	0 %	60 %	20 %	20 %	545636502
41	NC_022443	CAAAA	2	10	39958	39967	80 %	0 %	0 %	20 %	545636503
42	NC_022443	AAATT	2	10	42057	42066	60 %	40 %	0 %	0 %	545636504
43	NC_022443	TTGAA	2	10	44086	44095	40 %	40 %	20 %	0 %	545636507
44	NC_022443	TTGAA	2	10	44432	44441	40 %	40 %	20 %	0 %	545636507
45	NC_022443	TTTGT	2	10	45336	45345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022443	TTGAT	2	10	47466	47475	20 %	60 %	20 %	0 %	545636511
47	NC_022443	TTTGA	2	10	48686	48695	20 %	60 %	20 %	0 %	545636511
48	NC_022443	GTTTT	2	10	48769	48778	0 %	80 %	20 %	0 %	545636511
49	NC_022443	GTTTG	2	10	49399	49408	0 %	60 %	40 %	0 %	545636512
50	NC_022443	TTGCT	2	10	49727	49736	0 %	60 %	20 %	20 %	545636512
51	NC_022443	TGAAA	2	10	52760	52769	60 %	20 %	20 %	0 %	545636515
52	NC_022443	AAAAC	2	10	53124	53133	80 %	0 %	0 %	20 %	545636516
53	NC_022443	AAATC	2	10	53533	53542	60 %	20 %	0 %	20 %	545636516
54	NC_022443	ATATT	2	10	54064	54073	40 %	60 %	0 %	0 %	545636517
55	NC_022443	TCTAT	2	10	54928	54937	20 %	60 %	0 %	20 %	545636517
56	NC_022443	TATTG	2	10	54978	54987	20 %	60 %	20 %	0 %	545636517
57	NC_022443	ATCAA	2	10	55691	55700	60 %	20 %	0 %	20 %	545636518
58	NC_022443	AATAC	2	10	56107	56116	60 %	20 %	0 %	20 %	545636518
59	NC_022443	CGATA	2	10	56599	56608	40 %	20 %	20 %	20 %	545636519
60	NC_022443	TACAG	2	10	58193	58202	40 %	20 %	20 %	20 %	545636520
61	NC_022443	ATAAA	2	10	58897	58906	80 %	20 %	0 %	0 %	545636520
62	NC_022443	TTTAA	2	10	59191	59200	40 %	60 %	0 %	0 %	545636521
63	NC_022443	AAAAT	2	10	59639	59648	80 %	20 %	0 %	0 %	545636521
64	NC_022443	ATTCC	2	10	60428	60437	20 %	40 %	0 %	40 %	545636521
65	NC_022443	GTATT	2	10	61822	61831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022443	TGTTT	2	10	62233	62242	0 %	80 %	20 %	0 %	545636523
67	NC_022443	TTTGC	2	10	62319	62328	0 %	60 %	20 %	20 %	545636523
68	NC_022443	ATTTT	2	10	65593	65602	20 %	80 %	0 %	0 %	545636529
69	NC_022443	TATGG	2	10	67606	67615	20 %	40 %	40 %	0 %	545636531
70	NC_022443	TAACT	2	10	67911	67920	40 %	40 %	0 %	20 %	545636531
71	NC_022443	ATTTA	2	10	68605	68614	40 %	60 %	0 %	0 %	545636532
72	NC_022443	CAGAA	2	10	68695	68704	60 %	0 %	20 %	20 %	545636532
73	NC_022443	TAAAT	2	10	69190	69199	60 %	40 %	0 %	0 %	545636532
74	NC_022443	AATTA	2	10	69443	69452	60 %	40 %	0 %	0 %	545636533
75	NC_022443	GGATA	2	10	69983	69992	40 %	20 %	40 %	0 %	545636533
76	NC_022443	CAAAA	2	10	72121	72130	80 %	0 %	0 %	20 %	545636535
77	NC_022443	ATTGC	2	10	77785	77794	20 %	40 %	20 %	20 %	545636539
78	NC_022443	TCATT	2	10	77973	77982	20 %	60 %	0 %	20 %	545636539
79	NC_022443	TGAAA	2	10	79857	79866	60 %	20 %	20 %	0 %	545636540
80	NC_022443	TCAAT	2	10	80229	80238	40 %	40 %	0 %	20 %	545636540
81	NC_022443	GTATT	2	10	80718	80727	20 %	60 %	20 %	0 %	545636541
82	NC_022443	AGATA	2	10	86584	86593	60 %	20 %	20 %	0 %	545636544
83	NC_022443	TAAAA	2	10	87144	87153	80 %	20 %	0 %	0 %	545636544
84	NC_022443	ATACA	2	10	87575	87584	60 %	20 %	0 %	20 %	545636545
85	NC_022443	AAAGA	2	10	88778	88787	80 %	0 %	20 %	0 %	545636545
86	NC_022443	GTAAT	2	10	88997	89006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022443	CAATT	2	10	89429	89438	40 %	40 %	0 %	20 %	545636546
88	NC_022443	TTGCG	2	10	90834	90843	0 %	40 %	40 %	20 %	545636547
89	NC_022443	TTTTC	2	10	92305	92314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022443	AGTTA	2	10	92994	93003	40 %	40 %	20 %	0 %	545636549
91	NC_022443	TTGCG	2	10	93502	93511	0 %	40 %	40 %	20 %	545636549
92	NC_022443	AGATG	2	10	96367	96376	40 %	20 %	40 %	0 %	545636551
93	NC_022443	GAAAA	2	10	100400	100409	80 %	0 %	20 %	0 %	545636555
94	NC_022443	AATCA	2	10	103589	103598	60 %	20 %	0 %	20 %	545636557
95	NC_022443	ATTTT	2	10	104287	104296	20 %	80 %	0 %	0 %	545636558
96	NC_022443	ATCAC	2	10	105547	105556	40 %	20 %	0 %	40 %	545636559
97	NC_022443	AACGA	2	10	106224	106233	60 %	0 %	20 %	20 %	545636559
98	NC_022443	ACACA	2	10	108280	108289	60 %	0 %	0 %	40 %	545636561
99	NC_022443	GACAA	2	10	109431	109440	60 %	0 %	20 %	20 %	545636562
100	NC_022443	TCTTA	2	10	110214	110223	20 %	60 %	0 %	20 %	545636563
101	NC_022443	ATTAC	2	10	112260	112269	40 %	40 %	0 %	20 %	545636565
102	NC_022443	ATTTT	2	10	112564	112573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022443	TATCT	2	10	112920	112929	20 %	60 %	0 %	20 %	545636566
104	NC_022443	ATACG	2	10	115353	115362	40 %	20 %	20 %	20 %	545636568
105	NC_022443	TTATA	2	10	116011	116020	40 %	60 %	0 %	0 %	545636569
106	NC_022443	TATAA	2	10	116381	116390	60 %	40 %	0 %	0 %	545636569
107	NC_022443	TTTTA	2	10	116809	116818	20 %	80 %	0 %	0 %	545636569
108	NC_022443	AATAA	2	10	117915	117924	80 %	20 %	0 %	0 %	545636570
109	NC_022443	TACGC	2	10	118182	118191	20 %	20 %	20 %	40 %	545636570
110	NC_022443	TACTT	2	10	119309	119318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022443	TTTAG	2	10	121135	121144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022443	TCCCT	2	10	122053	122062	0 %	40 %	0 %	60 %	545636573
113	NC_022443	GCTTT	2	10	124287	124296	0 %	60 %	20 %	20 %	545636575
114	NC_022443	TAATT	2	10	124372	124381	40 %	60 %	0 %	0 %	545636575
115	NC_022443	ATACT	2	10	125553	125562	40 %	40 %	0 %	20 %	545636577
116	NC_022443	TAATA	2	10	126719	126728	60 %	40 %	0 %	0 %	545636578
117	NC_022443	ATTTT	2	10	127710	127719	20 %	80 %	0 %	0 %	545636579
118	NC_022443	TAAAA	2	10	127909	127918	80 %	20 %	0 %	0 %	545636579
119	NC_022443	TTGTA	2	10	129934	129943	20 %	60 %	20 %	0 %	545636581
120	NC_022443	TGCAA	2	10	130939	130948	40 %	20 %	20 %	20 %	545636582
121	NC_022443	ATATG	2	10	132957	132966	40 %	40 %	20 %	0 %	545636583
122	NC_022443	TATGA	2	10	134637	134646	40 %	40 %	20 %	0 %	545636585
123	NC_022443	AATAT	2	10	135643	135652	60 %	40 %	0 %	0 %	545636585
124	NC_022443	TTCAA	2	10	139659	139668	40 %	40 %	0 %	20 %	545636587
125	NC_022443	ACATC	2	10	140502	140511	40 %	20 %	0 %	40 %	545636589
126	NC_022443	TAATT	2	10	142725	142734	40 %	60 %	0 %	0 %	545636590
127	NC_022443	AGAGA	2	10	145751	145760	60 %	0 %	40 %	0 %	545636593
128	NC_022443	AATCC	2	10	146107	146116	40 %	20 %	0 %	40 %	545636593
129	NC_022443	TTGGA	2	10	149136	149145	20 %	40 %	40 %	0 %	545636596
130	NC_022443	TTATT	2	10	149551	149560	20 %	80 %	0 %	0 %	545636597
131	NC_022443	ATTTT	2	10	149617	149626	20 %	80 %	0 %	0 %	545636597
132	NC_022443	TATGG	2	10	150018	150027	20 %	40 %	40 %	0 %	545636597
133	NC_022443	ATCGT	2	10	150459	150468	20 %	40 %	20 %	20 %	545636597
134	NC_022443	TGAAT	2	10	155045	155054	40 %	40 %	20 %	0 %	545636602
135	NC_022443	CAAAA	2	10	156429	156438	80 %	0 %	0 %	20 %	545636604
136	NC_022443	TTCAT	2	10	159281	159290	20 %	60 %	0 %	20 %	545636606
137	NC_022443	TTTAC	2	10	159664	159673	20 %	60 %	0 %	20 %	545636606
138	NC_022443	CGTTT	2	10	160108	160117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022443	TTATT	2	10	160644	160653	20 %	80 %	0 %	0 %	545636608
140	NC_022443	GGATT	2	10	161632	161641	20 %	40 %	40 %	0 %	545636609
141	NC_022443	CACAA	2	10	162284	162293	60 %	0 %	0 %	40 %	545636610
142	NC_022443	TAACT	2	10	164672	164681	40 %	40 %	0 %	20 %	545636612
143	NC_022443	CCCCA	2	10	165294	165303	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
144	NC_022443	TAAAT	2	10	165381	165390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022443	TGCAT	2	10	165818	165827	20 %	40 %	20 %	20 %	545636613
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147	NC_022443	TATTT	2	10	166367	166376	20 %	80 %	0 %	0 %	545636613
148	NC_022443	TATCA	2	10	167150	167159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022443	ATGCA	2	10	167649	167658	40 %	20 %	20 %	20 %	545636614
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151	NC_022443	GTGAA	2	10	174929	174938	40 %	20 %	40 %	0 %	545636615
152	NC_022443	ATCAT	2	10	175282	175291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_022443	ATATA	2	10	178223	178232	60 %	40 %	0 %	0 %	545636619
154	NC_022443	AAGAT	2	10	181948	181957	60 %	20 %	20 %	0 %	545636621
155	NC_022443	CGTTT	2	10	182394	182403	0 %	60 %	20 %	20 %	545636622
156	NC_022443	AAATG	2	10	184872	184881	60 %	20 %	20 %	0 %	545636625
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158	NC_022443	TTTAA	2	10	185056	185065	40 %	60 %	0 %	0 %	545636625
159	NC_022443	TTTGC	2	10	185572	185581	0 %	60 %	20 %	20 %	545636625
160	NC_022443	TTGTT	2	10	186578	186587	0 %	80 %	20 %	0 %	545636625
161	NC_022443	CAACT	2	10	187427	187436	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_022443	CAAAA	2	10	189790	189799	80 %	0 %	0 %	20 %	545636628
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165	NC_022443	AAAAT	2	10	191184	191193	80 %	20 %	0 %	0 %	545636629
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167	NC_022443	GCTTT	2	10	191939	191948	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_022443	ATTAT	2	10	195392	195401	40 %	60 %	0 %	0 %	545636631
169	NC_022443	TAGAT	2	10	196374	196383	40 %	40 %	20 %	0 %	545636632
170	NC_022443	TAACA	2	10	197018	197027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_022443	CATGT	2	10	197237	197246	20 %	40 %	20 %	20 %	545636633
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173	NC_022443	AATTG	2	10	198637	198646	40 %	40 %	20 %	0 %	545636633
174	NC_022443	TTTTC	2	10	198886	198895	0 %	80 %	0 %	20 %	545636634
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176	NC_022443	TTATT	2	10	199358	199367	20 %	80 %	0 %	0 %	545636634
177	NC_022443	CTATG	2	10	201614	201623	20 %	40 %	20 %	20 %	545636636
178	NC_022443	GATTG	2	10	203677	203686	20 %	40 %	40 %	0 %	545636637
179	NC_022443	TTATT	2	10	205431	205440	20 %	80 %	0 %	0 %	545636638
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182	NC_022443	ATCGT	2	10	209264	209273	20 %	40 %	20 %	20 %	545636641
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184	NC_022443	ATGTG	2	10	213128	213137	20 %	40 %	40 %	0 %	545636645
185	NC_022443	TAAAT	2	10	213471	213480	60 %	40 %	0 %	0 %	545636645
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187	NC_022443	TGGAT	2	10	215121	215130	20 %	40 %	40 %	0 %	545636647
188	NC_022443	AATAT	2	10	216303	216312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022443	TCGCA	2	10	219045	219054	20 %	20 %	20 %	40 %	545636650
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200	NC_022443	CAAGC	2	10	230264	230273	40 %	0 %	20 %	40 %	545636657
201	NC_022443	CAAGC	2	10	230345	230354	40 %	0 %	20 %	40 %	545636657
202	NC_022443	AACAT	2	10	230738	230747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_022443	ATCAA	2	10	231418	231427	60 %	20 %	0 %	20 %	545636658
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215	NC_022443	TGAAT	2	10	239429	239438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
216	NC_022443	ATTAA	2	10	239570	239579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
217	NC_022443	ATGAT	2	10	241806	241815	40 %	40 %	20 %	0 %	545636664
218	NC_022443	TTCAT	2	10	242631	242640	20 %	60 %	0 %	20 %	545636664
219	NC_022443	AAAGT	2	10	243314	243323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_022443	ATTAA	2	10	245025	245034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_022443	AAGCG	2	10	245742	245751	40 %	0 %	40 %	20 %	545636668
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224	NC_022443	AAATT	2	10	246823	246832	60 %	40 %	0 %	0 %	545636670
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232	NC_022443	CATGC	2	10	260317	260326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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234	NC_022443	CATGG	2	10	261078	261087	20 %	20 %	40 %	20 %	545636683
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237	NC_022443	ATTCA	2	10	266659	266668	40 %	40 %	0 %	20 %	545636687
238	NC_022443	GTTAA	2	10	267331	267340	40 %	40 %	20 %	0 %	545636687
239	NC_022443	AGAAA	2	10	267641	267650	80 %	0 %	20 %	0 %	545636688
240	NC_022443	ATAAA	2	10	268398	268407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_022443	TATCT	2	10	268805	268814	20 %	60 %	0 %	20 %	545636689
242	NC_022443	TTCAA	2	10	269612	269621	40 %	40 %	0 %	20 %	545636689
243	NC_022443	TCATA	2	10	276830	276839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_022443	TAATA	2	10	278955	278964	60 %	40 %	0 %	0 %	545636699
245	NC_022443	ATATT	2	10	280327	280336	40 %	60 %	0 %	0 %	545636700
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247	NC_022443	GCAGT	2	10	282304	282313	20 %	20 %	40 %	20 %	545636702
248	NC_022443	ATGTC	2	10	285331	285340	20 %	40 %	20 %	20 %	545636705
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251	NC_022443	TTAAT	2	10	289841	289850	40 %	60 %	0 %	0 %	545636709
252	NC_022443	CCAAT	2	10	289913	289922	40 %	20 %	0 %	40 %	545636709
253	NC_022443	CTTTG	2	10	290239	290248	0 %	60 %	20 %	20 %	545636709
254	NC_022443	ATTTA	2	10	290763	290772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_022443	GCAAT	2	10	291708	291717	40 %	20 %	20 %	20 %	545636711
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258	NC_022443	CATTA	2	10	296645	296654	40 %	40 %	0 %	20 %	545636715
259	NC_022443	TTCAA	2	10	296696	296705	40 %	40 %	0 %	20 %	545636715
260	NC_022443	GAAAA	2	10	297270	297279	80 %	0 %	20 %	0 %	545636715
261	NC_022443	AGACA	2	10	298956	298965	60 %	0 %	20 %	20 %	545636715
262	NC_022443	ACATT	2	10	298999	299008	40 %	40 %	0 %	20 %	545636715
263	NC_022443	AATTC	2	10	299754	299763	40 %	40 %	0 %	20 %	545636715
264	NC_022443	ATTAG	2	10	300492	300501	40 %	40 %	20 %	0 %	545636715
265	NC_022443	CATTT	2	10	301762	301771	20 %	60 %	0 %	20 %	545636718
266	NC_022443	TAAAA	2	10	302504	302513	80 %	20 %	0 %	0 %	545636718
267	NC_022443	TTTTA	2	10	304858	304867	20 %	80 %	0 %	0 %	545636722
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269	NC_022443	ATTAA	2	10	306299	306308	60 %	40 %	0 %	0 %	545636724
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