MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 1792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	545636472
2	NC_022443	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	545636473
3	NC_022443	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	545636473
4	NC_022443	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	545636473
5	NC_022443	CAAAT	2	10	5968	5977	60 %	20 %	0 %	20 %	545636477
6	NC_022443	TGAAT	2	10	7478	7487	40 %	40 %	20 %	0 %	545636477
7	NC_022443	TTCAA	2	10	8465	8474	40 %	40 %	0 %	20 %	545636478
8	NC_022443	ATCGC	2	10	10927	10936	20 %	20 %	20 %	40 %	545636479
9	NC_022443	CGTTG	2	10	12470	12479	0 %	40 %	40 %	20 %	545636480
10	NC_022443	TTATT	2	10	16180	16189	20 %	80 %	0 %	0 %	545636483
11	NC_022443	TTTGA	2	10	17513	17522	20 %	60 %	20 %	0 %	545636484
12	NC_022443	TCAAT	2	10	19650	19659	40 %	40 %	0 %	20 %	545636486
13	NC_022443	AGTTA	2	10	22828	22837	40 %	40 %	20 %	0 %	545636488
14	NC_022443	ATGTA	2	10	24387	24396	40 %	40 %	20 %	0 %	545636489
15	NC_022443	ACCAA	2	10	26991	27000	60 %	0 %	0 %	40 %	545636491
16	NC_022443	ATCAA	2	10	27703	27712	60 %	20 %	0 %	20 %	545636491
17	NC_022443	GAAAC	2	10	28324	28333	60 %	0 %	20 %	20 %	545636492
18	NC_022443	GAAGT	2	10	28474	28483	40 %	20 %	40 %	0 %	545636492
19	NC_022443	ATTAT	2	10	30117	30126	40 %	60 %	0 %	0 %	545636493
20	NC_022443	AACGA	2	10	30190	30199	60 %	0 %	20 %	20 %	545636493
21	NC_022443	AAACG	2	10	32023	32032	60 %	0 %	20 %	20 %	545636495
22	NC_022443	AAGGT	2	10	33195	33204	40 %	20 %	40 %	0 %	545636495
23	NC_022443	TATGA	2	10	33392	33401	40 %	40 %	20 %	0 %	545636495
24	NC_022443	GTTGT	2	10	33785	33794	0 %	60 %	40 %	0 %	545636495
25	NC_022443	CATTA	2	10	34622	34631	40 %	40 %	0 %	20 %	545636497
26	NC_022443	AAATG	2	10	36266	36275	60 %	20 %	20 %	0 %	545636498
27	NC_022443	ATTTT	2	10	36347	36356	20 %	80 %	0 %	0 %	545636498
28	NC_022443	TGAAT	2	10	39277	39286	40 %	40 %	20 %	0 %	545636502
29	NC_022443	TTGGT	2	10	39319	39328	0 %	60 %	40 %	0 %	545636502
30	NC_022443	AATAT	2	10	39387	39396	60 %	40 %	0 %	0 %	545636502
31	NC_022443	TTCGT	2	10	39598	39607	0 %	60 %	20 %	20 %	545636502
32	NC_022443	CAAAA	2	10	39958	39967	80 %	0 %	0 %	20 %	545636503
33	NC_022443	AAATT	2	10	42057	42066	60 %	40 %	0 %	0 %	545636504
34	NC_022443	TTGAA	2	10	44086	44095	40 %	40 %	20 %	0 %	545636507
35	NC_022443	TTGAA	2	10	44432	44441	40 %	40 %	20 %	0 %	545636507
36	NC_022443	TTGAT	2	10	47466	47475	20 %	60 %	20 %	0 %	545636511
37	NC_022443	TTTGA	2	10	48686	48695	20 %	60 %	20 %	0 %	545636511
38	NC_022443	GTTTT	2	10	48769	48778	0 %	80 %	20 %	0 %	545636511
39	NC_022443	GTTTG	2	10	49399	49408	0 %	60 %	40 %	0 %	545636512
40	NC_022443	TTGCT	2	10	49727	49736	0 %	60 %	20 %	20 %	545636512
41	NC_022443	TGAAA	2	10	52760	52769	60 %	20 %	20 %	0 %	545636515
42	NC_022443	AAAAC	2	10	53124	53133	80 %	0 %	0 %	20 %	545636516
43	NC_022443	AAATC	2	10	53533	53542	60 %	20 %	0 %	20 %	545636516
44	NC_022443	ATATT	2	10	54064	54073	40 %	60 %	0 %	0 %	545636517
45	NC_022443	TCTAT	2	10	54928	54937	20 %	60 %	0 %	20 %	545636517
46	NC_022443	TATTG	2	10	54978	54987	20 %	60 %	20 %	0 %	545636517
47	NC_022443	ATCAA	2	10	55691	55700	60 %	20 %	0 %	20 %	545636518
48	NC_022443	AATAC	2	10	56107	56116	60 %	20 %	0 %	20 %	545636518
49	NC_022443	CGATA	2	10	56599	56608	40 %	20 %	20 %	20 %	545636519
50	NC_022443	TACAG	2	10	58193	58202	40 %	20 %	20 %	20 %	545636520
51	NC_022443	ATAAA	2	10	58897	58906	80 %	20 %	0 %	0 %	545636520
52	NC_022443	TTTAA	2	10	59191	59200	40 %	60 %	0 %	0 %	545636521
53	NC_022443	AAAAT	2	10	59639	59648	80 %	20 %	0 %	0 %	545636521
54	NC_022443	ATTCC	2	10	60428	60437	20 %	40 %	0 %	40 %	545636521
55	NC_022443	TGTTT	2	10	62233	62242	0 %	80 %	20 %	0 %	545636523
56	NC_022443	TTTGC	2	10	62319	62328	0 %	60 %	20 %	20 %	545636523
57	NC_022443	ATTTT	2	10	65593	65602	20 %	80 %	0 %	0 %	545636529
58	NC_022443	TATGG	2	10	67606	67615	20 %	40 %	40 %	0 %	545636531
59	NC_022443	TAACT	2	10	67911	67920	40 %	40 %	0 %	20 %	545636531
60	NC_022443	ATTTA	2	10	68605	68614	40 %	60 %	0 %	0 %	545636532
61	NC_022443	CAGAA	2	10	68695	68704	60 %	0 %	20 %	20 %	545636532
62	NC_022443	TAAAT	2	10	69190	69199	60 %	40 %	0 %	0 %	545636532
63	NC_022443	AATTA	2	10	69443	69452	60 %	40 %	0 %	0 %	545636533
64	NC_022443	GGATA	2	10	69983	69992	40 %	20 %	40 %	0 %	545636533
65	NC_022443	CAAAA	2	10	72121	72130	80 %	0 %	0 %	20 %	545636535
66	NC_022443	ATTGC	2	10	77785	77794	20 %	40 %	20 %	20 %	545636539
67	NC_022443	TCATT	2	10	77973	77982	20 %	60 %	0 %	20 %	545636539
68	NC_022443	TGAAA	2	10	79857	79866	60 %	20 %	20 %	0 %	545636540
69	NC_022443	TCAAT	2	10	80229	80238	40 %	40 %	0 %	20 %	545636540
70	NC_022443	GTATT	2	10	80718	80727	20 %	60 %	20 %	0 %	545636541
71	NC_022443	AGATA	2	10	86584	86593	60 %	20 %	20 %	0 %	545636544
72	NC_022443	TAAAA	2	10	87144	87153	80 %	20 %	0 %	0 %	545636544
73	NC_022443	ATACA	2	10	87575	87584	60 %	20 %	0 %	20 %	545636545
74	NC_022443	AAAGA	2	10	88778	88787	80 %	0 %	20 %	0 %	545636545
75	NC_022443	CAATT	2	10	89429	89438	40 %	40 %	0 %	20 %	545636546
76	NC_022443	TTGCG	2	10	90834	90843	0 %	40 %	40 %	20 %	545636547
77	NC_022443	AGTTA	2	10	92994	93003	40 %	40 %	20 %	0 %	545636549
78	NC_022443	TTGCG	2	10	93502	93511	0 %	40 %	40 %	20 %	545636549
79	NC_022443	AGATG	2	10	96367	96376	40 %	20 %	40 %	0 %	545636551
80	NC_022443	GAAAA	2	10	100400	100409	80 %	0 %	20 %	0 %	545636555
81	NC_022443	AATCA	2	10	103589	103598	60 %	20 %	0 %	20 %	545636557
82	NC_022443	ATTTT	2	10	104287	104296	20 %	80 %	0 %	0 %	545636558
83	NC_022443	ATCAC	2	10	105547	105556	40 %	20 %	0 %	40 %	545636559
84	NC_022443	AACGA	2	10	106224	106233	60 %	0 %	20 %	20 %	545636559
85	NC_022443	ACACA	2	10	108280	108289	60 %	0 %	0 %	40 %	545636561
86	NC_022443	GACAA	2	10	109431	109440	60 %	0 %	20 %	20 %	545636562
87	NC_022443	TCTTA	2	10	110214	110223	20 %	60 %	0 %	20 %	545636563
88	NC_022443	ATTAC	2	10	112260	112269	40 %	40 %	0 %	20 %	545636565
89	NC_022443	TATCT	2	10	112920	112929	20 %	60 %	0 %	20 %	545636566
90	NC_022443	ATACG	2	10	115353	115362	40 %	20 %	20 %	20 %	545636568
91	NC_022443	TTATA	2	10	116011	116020	40 %	60 %	0 %	0 %	545636569
92	NC_022443	TATAA	2	10	116381	116390	60 %	40 %	0 %	0 %	545636569
93	NC_022443	TTTTA	2	10	116809	116818	20 %	80 %	0 %	0 %	545636569
94	NC_022443	AATAA	2	10	117915	117924	80 %	20 %	0 %	0 %	545636570
95	NC_022443	TACGC	2	10	118182	118191	20 %	20 %	20 %	40 %	545636570
96	NC_022443	TCCCT	2	10	122053	122062	0 %	40 %	0 %	60 %	545636573
97	NC_022443	GCTTT	2	10	124287	124296	0 %	60 %	20 %	20 %	545636575
98	NC_022443	TAATT	2	10	124372	124381	40 %	60 %	0 %	0 %	545636575
99	NC_022443	ATACT	2	10	125553	125562	40 %	40 %	0 %	20 %	545636577
100	NC_022443	TAATA	2	10	126719	126728	60 %	40 %	0 %	0 %	545636578
101	NC_022443	ATTTT	2	10	127710	127719	20 %	80 %	0 %	0 %	545636579
102	NC_022443	TAAAA	2	10	127909	127918	80 %	20 %	0 %	0 %	545636579
103	NC_022443	TTGTA	2	10	129934	129943	20 %	60 %	20 %	0 %	545636581
104	NC_022443	TGCAA	2	10	130939	130948	40 %	20 %	20 %	20 %	545636582
105	NC_022443	ATATG	2	10	132957	132966	40 %	40 %	20 %	0 %	545636583
106	NC_022443	TATGA	2	10	134637	134646	40 %	40 %	20 %	0 %	545636585
107	NC_022443	AATAT	2	10	135643	135652	60 %	40 %	0 %	0 %	545636585
108	NC_022443	TTCAA	2	10	139659	139668	40 %	40 %	0 %	20 %	545636587
109	NC_022443	ACATC	2	10	140502	140511	40 %	20 %	0 %	40 %	545636589
110	NC_022443	TAATT	2	10	142725	142734	40 %	60 %	0 %	0 %	545636590
111	NC_022443	AGAGA	2	10	145751	145760	60 %	0 %	40 %	0 %	545636593
112	NC_022443	AATCC	2	10	146107	146116	40 %	20 %	0 %	40 %	545636593
113	NC_022443	TTGGA	2	10	149136	149145	20 %	40 %	40 %	0 %	545636596
114	NC_022443	TTATT	2	10	149551	149560	20 %	80 %	0 %	0 %	545636597
115	NC_022443	ATTTT	2	10	149617	149626	20 %	80 %	0 %	0 %	545636597
116	NC_022443	TATGG	2	10	150018	150027	20 %	40 %	40 %	0 %	545636597
117	NC_022443	ATCGT	2	10	150459	150468	20 %	40 %	20 %	20 %	545636597
118	NC_022443	TGAAT	2	10	155045	155054	40 %	40 %	20 %	0 %	545636602
119	NC_022443	CAAAA	2	10	156429	156438	80 %	0 %	0 %	20 %	545636604
120	NC_022443	TTCAT	2	10	159281	159290	20 %	60 %	0 %	20 %	545636606
121	NC_022443	TTTAC	2	10	159664	159673	20 %	60 %	0 %	20 %	545636606
122	NC_022443	TTATT	2	10	160644	160653	20 %	80 %	0 %	0 %	545636608
123	NC_022443	GGATT	2	10	161632	161641	20 %	40 %	40 %	0 %	545636609
124	NC_022443	CACAA	2	10	162284	162293	60 %	0 %	0 %	40 %	545636610
125	NC_022443	TAACT	2	10	164672	164681	40 %	40 %	0 %	20 %	545636612
126	NC_022443	TGCAT	2	10	165818	165827	20 %	40 %	20 %	20 %	545636613
127	NC_022443	ACATT	2	10	165910	165919	40 %	40 %	0 %	20 %	545636613
128	NC_022443	TATTT	2	10	166367	166376	20 %	80 %	0 %	0 %	545636613
129	NC_022443	ATGCA	2	10	167649	167658	40 %	20 %	20 %	20 %	545636614
130	NC_022443	TATGA	2	10	174895	174904	40 %	40 %	20 %	0 %	545636615
131	NC_022443	GTGAA	2	10	174929	174938	40 %	20 %	40 %	0 %	545636615
132	NC_022443	ATATA	2	10	178223	178232	60 %	40 %	0 %	0 %	545636619
133	NC_022443	AAGAT	2	10	181948	181957	60 %	20 %	20 %	0 %	545636621
134	NC_022443	CGTTT	2	10	182394	182403	0 %	60 %	20 %	20 %	545636622
135	NC_022443	AAATG	2	10	184872	184881	60 %	20 %	20 %	0 %	545636625
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263	NC_022443	TAAAA	2	10	356506	356515	80 %	20 %	0 %	0 %	545636773
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