MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 1991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022443	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022443	AATA	2	8	3428	3435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022443	CCAA	2	8	3444	3451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022443	AAGG	2	8	4034	4041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022443	AAAT	2	8	4118	4125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022443	AATT	2	8	4317	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022443	CTAC	2	8	13312	13319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022443	ATAA	2	8	15096	15103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022443	TAAA	2	8	15275	15282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022443	GTAT	2	8	15337	15344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022443	AATA	2	8	24761	24768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022443	ATCT	2	8	24871	24878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022443	GCCT	2	8	24999	25006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022443	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022443	CATT	2	8	30523	30530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022443	ATCA	2	8	31664	31671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022443	TTCT	2	8	35104	35111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022443	ATAA	2	8	35142	35149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022443	TAAA	2	8	36519	36526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022443	AAAT	2	8	38296	38303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022443	TTAA	2	8	39048	39055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022443	AAGA	2	8	39906	39913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022443	TCCC	2	8	46210	46217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_022443	GATA	2	8	46436	46443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022443	ACAA	2	8	46814	46821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022443	TTAT	3	12	46880	46891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022443	TGAT	2	8	50262	50269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022443	TCGT	2	8	57409	57416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022443	ATAC	2	8	57429	57436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022443	AAAT	2	8	60668	60675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022443	ATTA	2	8	61013	61020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022443	ATTA	2	8	61777	61784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022443	AGTG	2	8	70809	70816	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022443	TATT	2	8	70844	70851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022443	ATTT	2	8	71054	71061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022443	AGCT	2	8	74856	74863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022443	TAAT	2	8	75001	75008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022443	AGAA	2	8	75020	75027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022443	TTGT	2	8	76139	76146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022443	ATAA	2	8	77005	77012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022443	ATAA	2	8	79451	79458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022443	ATCA	2	8	79461	79468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022443	ATGA	2	8	79489	79496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022443	TTAT	2	8	82236	82243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022443	ATAA	2	8	82536	82543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022443	CAAT	2	8	84408	84415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022443	TTTC	2	8	84484	84491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022443	AAAG	2	8	89045	89052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022443	ATAA	2	8	89586	89593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022443	TATT	2	8	89624	89631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022443	AGTA	2	8	91566	91573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022443	CCTT	2	8	91622	91629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022443	TTGG	2	8	92212	92219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022443	ATAA	2	8	92315	92322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022443	TTGT	2	8	92453	92460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022443	TGTA	2	8	93882	93889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022443	AAAT	2	8	93982	93989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022443	ATTG	2	8	95228	95235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022443	GTTA	2	8	95350	95357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022443	TCAG	2	8	102441	102448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022443	TTAT	2	8	105419	105426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022443	TAAA	2	8	109995	110002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022443	TAAA	2	8	110033	110040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022443	TAAA	2	8	110511	110518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022443	ATAA	2	8	112329	112336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022443	TAAA	2	8	112576	112583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022443	ATAA	2	8	113651	113658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022443	AAAT	2	8	118488	118495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022443	ATTA	2	8	118522	118529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022443	ATAA	2	8	119399	119406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022443	TATT	2	8	121148	121155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022443	TGAA	2	8	121426	121433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022443	ATAG	2	8	122337	122344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022443	TAAA	2	8	124614	124621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022443	CTTT	2	8	129047	129054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022443	CTTT	2	8	130323	130330	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022443	ATTT	2	8	130410	130417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022443	AAGA	2	8	131996	132003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022443	GAGT	2	8	132019	132026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022443	ACTT	2	8	133581	133588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022443	ATTT	2	8	135921	135928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022443	TATT	2	8	138766	138773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022443	ATAA	2	8	138892	138899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022443	TAAT	2	8	138927	138934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022443	ATTT	2	8	141345	141352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022443	TAAA	2	8	153234	153241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022443	AATA	2	8	158458	158465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022443	ATTA	2	8	158690	158697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022443	GTTT	2	8	158738	158745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022443	TAAC	2	8	158838	158845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022443	ATTG	2	8	160086	160093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022443	TTTA	2	8	160349	160356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022443	GAGT	2	8	162100	162107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022443	ATTT	2	8	166778	166785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022443	ATGT	2	8	167009	167016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022443	TTAA	2	8	167130	167137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022443	AAGT	2	8	175177	175184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022443	ATCA	2	8	175316	175323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022443	TGTA	2	8	180537	180544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022443	TTAA	2	8	182075	182082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022443	AATA	2	8	182155	182162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022443	TATT	2	8	186911	186918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022443	CTTA	2	8	186998	187005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022443	TAAT	2	8	187024	187031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022443	TTTG	2	8	187114	187121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022443	AAAG	2	8	187295	187302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022443	AGTT	2	8	191794	191801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022443	ATGT	2	8	195995	196002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022443	TAGT	2	8	196996	197003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022443	TGAA	2	8	205167	205174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022443	TAGT	2	8	205300	205307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022443	ATCA	2	8	207077	207084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022443	GGAT	2	8	207204	207211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022443	TTGA	2	8	212786	212793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022443	TTGT	2	8	216128	216135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022443	TATT	2	8	216960	216967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022443	GAAA	2	8	218758	218765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022443	TTTG	2	8	222248	222255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022443	ACAT	2	8	222574	222581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022443	AAAG	2	8	225745	225752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022443	GAAG	2	8	225855	225862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022443	ATTA	2	8	234719	234726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022443	AATT	2	8	242745	242752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022443	AAAT	2	8	242773	242780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022443	AAAT	2	8	243255	243262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022443	AATT	2	8	244747	244754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022443	ATAA	2	8	244768	244775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022443	ATTT	2	8	244875	244882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022443	AAAT	2	8	245041	245048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022443	AAAT	2	8	245099	245106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022443	ATGT	2	8	245225	245232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022443	ATAA	2	8	248374	248381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022443	TTAA	2	8	249370	249377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022443	AGGG	2	8	252762	252769	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022443	TCAA	2	8	260448	260455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022443	AATC	2	8	260500	260507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022443	CATA	2	8	260686	260693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022443	ATTA	2	8	261926	261933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022443	ATAA	2	8	261944	261951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022443	TACA	2	8	268382	268389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022443	GTAA	2	8	273095	273102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022443	ATAA	2	8	275582	275589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022443	ACTA	2	8	275678	275685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022443	ATGC	2	8	279169	279176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022443	TAAT	2	8	280353	280360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022443	TTAA	2	8	280669	280676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022443	TCAC	2	8	282679	282686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022443	GAAT	2	8	282730	282737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022443	AATT	2	8	282741	282748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022443	TGAT	2	8	282756	282763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022443	GATG	2	8	283866	283873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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