MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 41955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022443	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022443	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022443	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022443	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
7	NC_022443	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
8	NC_022443	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
9	NC_022443	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
10	NC_022443	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
11	NC_022443	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
12	NC_022443	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
13	NC_022443	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
14	NC_022443	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
15	NC_022443	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
16	NC_022443	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
17	NC_022443	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
18	NC_022443	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
19	NC_022443	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636472
20	NC_022443	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
21	NC_022443	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
22	NC_022443	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
23	NC_022443	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
24	NC_022443	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
25	NC_022443	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
26	NC_022443	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
27	NC_022443	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
28	NC_022443	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636472
29	NC_022443	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
30	NC_022443	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636472
31	NC_022443	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
32	NC_022443	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
33	NC_022443	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022443	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022443	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022443	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
37	NC_022443	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
38	NC_022443	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
39	NC_022443	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
40	NC_022443	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
41	NC_022443	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
42	NC_022443	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
43	NC_022443	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636473
44	NC_022443	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
45	NC_022443	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
46	NC_022443	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
47	NC_022443	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
48	NC_022443	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
49	NC_022443	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
50	NC_022443	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
51	NC_022443	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
52	NC_022443	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
53	NC_022443	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
54	NC_022443	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
55	NC_022443	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
56	NC_022443	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
57	NC_022443	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636473
58	NC_022443	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022443	GAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022443	AGA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
61	NC_022443	ACC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636474
62	NC_022443	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636474
63	NC_022443	TTG	2	6	3712	3717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636474
64	NC_022443	AGT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636474
65	NC_022443	GAA	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
66	NC_022443	TAG	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022443	ACC	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_022443	GGT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022443	AAT	2	6	4096	4101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022443	TAA	2	6	4191	4196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022443	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022443	AAG	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636475
73	NC_022443	GTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636475
74	NC_022443	ATT	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636475
75	NC_022443	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636475
76	NC_022443	ATG	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
77	NC_022443	AGA	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636476
78	NC_022443	CTC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636476
79	NC_022443	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
80	NC_022443	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636476
81	NC_022443	AAT	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636476
82	NC_022443	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
83	NC_022443	AAG	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636476
84	NC_022443	ATT	2	6	5326	5331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
85	NC_022443	ATA	2	6	5404	5409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636476
86	NC_022443	GAT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
87	NC_022443	TTA	3	9	5592	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
88	NC_022443	GAT	2	6	5622	5627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
89	NC_022443	TTA	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
90	NC_022443	ACA	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636477
91	NC_022443	ATA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636477
92	NC_022443	GTT	2	6	5982	5987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636477
93	NC_022443	TGG	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
94	NC_022443	TGG	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
95	NC_022443	TCA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
96	NC_022443	TCA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
97	NC_022443	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
98	NC_022443	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
99	NC_022443	AGA	2	6	6446	6451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
100	NC_022443	ATG	2	6	6520	6525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
101	NC_022443	TCA	2	6	6539	6544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
102	NC_022443	GAT	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
103	NC_022443	GGT	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
104	NC_022443	AGA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
105	NC_022443	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636477
106	NC_022443	TAT	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636477
107	NC_022443	GGC	2	6	6941	6946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545636477
108	NC_022443	TGC	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636477
109	NC_022443	CGT	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636477
110	NC_022443	GAA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
111	NC_022443	TTA	2	6	7335	7340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636477
112	NC_022443	TTC	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636477
113	NC_022443	TAT	2	6	7437	7442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636477
114	NC_022443	ACA	2	6	7557	7562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636477
115	NC_022443	AGA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
116	NC_022443	AGG	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022443	TCG	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636478
118	NC_022443	TTG	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636478
119	NC_022443	GCA	3	9	8100	8108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636478
120	NC_022443	TAA	2	6	8165	8170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636478
121	NC_022443	ATG	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636478
122	NC_022443	TTA	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636478
123	NC_022443	CCA	2	6	8298	8303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636478
124	NC_022443	CTG	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636478
125	NC_022443	GAA	2	6	8496	8501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
126	NC_022443	TTG	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636478
127	NC_022443	TGA	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636478
128	NC_022443	CAT	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636478
129	NC_022443	TTA	2	6	8782	8787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636478
130	NC_022443	AAG	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
131	NC_022443	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636478
132	NC_022443	GTT	2	6	8832	8837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636478
133	NC_022443	AGA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
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253	NC_022443	ATG	2	6	15155	15160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_022443	TCA	2	6	15198	15203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_022443	AAC	2	6	15238	15243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_022443	TGT	2	6	15369	15374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_022443	TAT	2	6	15408	15413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_022443	AGG	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_022443	ATT	2	6	15510	15515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
261	NC_022443	TGC	2	6	15615	15620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636482
262	NC_022443	TAT	2	6	15627	15632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
263	NC_022443	ATT	2	6	16042	16047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
264	NC_022443	ATG	2	6	16060	16065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636482
265	NC_022443	CAG	2	6	16124	16129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636482
266	NC_022443	TGA	2	6	16139	16144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636482
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269	NC_022443	CAG	2	6	16329	16334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636483
270	NC_022443	ATT	2	6	16434	16439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636483
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273	NC_022443	TCA	2	6	16647	16652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_022443	TAA	2	6	17494	17499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636484
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293	NC_022443	TAA	2	6	17810	17815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636484
294	NC_022443	AAT	2	6	17941	17946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022443	TTA	2	6	18015	18020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022443	ATA	2	6	18084	18089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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370	NC_022443	GAT	2	6	22730	22735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
371	NC_022443	GAT	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
372	NC_022443	GGT	2	6	22745	22750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636488
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374	NC_022443	CAT	2	6	22792	22797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636488
375	NC_022443	ATA	2	6	22854	22859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636488
376	NC_022443	ATG	2	6	22892	22897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636488
377	NC_022443	AAT	3	9	22918	22926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_022443	TGA	2	6	23000	23005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
379	NC_022443	TCA	2	6	23182	23187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636489
380	NC_022443	GTA	2	6	23191	23196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636489
381	NC_022443	GGT	2	6	23281	23286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636489
382	NC_022443	AAT	2	6	23287	23292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636489
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384	NC_022443	GAA	2	6	23524	23529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
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