MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	TAAAAA	2	12	26196	26207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022441	TTTTTA	2	12	38363	38374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022441	TCATAT	2	12	58307	58318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022441	TTTCTG	2	12	68627	68638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022441	TTTTGT	2	12	75849	75860	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022441	TTAAAA	2	12	75899	75910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022441	TGTTTA	2	12	84566	84577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022441	GGAATC	2	12	90716	90727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022441	TTAATA	2	12	135696	135707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022441	TTCTTT	2	12	135716	135727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022441	ATTTCT	2	12	220155	220166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022441	TGAGTT	2	12	226114	226125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022441	CTCCTA	2	12	227354	227365	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022441	AGAGAA	2	12	258299	258310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022441	GGAATG	2	12	290827	290838	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022441	GAATAA	2	12	308938	308949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022441	ACAAAA	2	12	314573	314584	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022441	TTTATG	2	12	373095	373106	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022441	TTTTTC	2	12	398867	398878	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022441	TAGAGA	2	12	403299	403310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022441	AAAAAT	2	12	442083	442094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022441	TTTGTT	2	12	478285	478296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022441	GTTTTT	2	12	478960	478971	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022441	AAATTA	2	12	519530	519541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022441	TTAATA	2	12	555931	555942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022441	ATTTTT	2	12	578763	578774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022441	TCTATG	2	12	589148	589159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022441	GGAAGT	2	12	598542	598553	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022441	GGATTA	2	12	598554	598565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022441	AGAAAA	2	12	598762	598773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022441	AAATGT	2	12	600369	600380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022441	TAAAGG	2	12	627919	627930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022441	AGAATA	2	12	658954	658965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022441	AATAAA	2	12	667337	667348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022441	AAAATT	2	12	678959	678970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022441	AAAAGA	2	12	681023	681034	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022441	AACTCT	2	12	761216	761227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022441	TAACTT	2	12	802066	802077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022441	TAAAAA	2	12	844567	844578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022441	GATTTA	2	12	888861	888872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022441	ATTTGG	2	12	891177	891188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022441	AAAAAT	2	12	909338	909349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022441	ATAAAA	2	12	925675	925686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022441	TTTTTC	2	12	927304	927315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022441	TCGCTT	2	12	961736	961747	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022441	TCCTTA	2	12	962647	962658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022441	ACTATA	2	12	1004304	1004315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022441	ATTTTT	2	12	1042457	1042468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022441	TTCCTT	2	12	1067609	1067620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022441	CTTTCT	2	12	1102650	1102661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022441	AAATAA	2	12	1104605	1104616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.