MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	AATC	2	8	5385	5392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022441	AAAG	2	8	15464	15471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022441	TAAA	2	8	16575	16582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022441	TCTT	2	8	21293	21300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022441	ATAC	2	8	23287	23294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022441	GTAT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022441	TCTT	2	8	26089	26096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022441	TGTT	3	12	26155	26166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022441	TAGG	2	8	31272	31279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022441	GTTT	2	8	33591	33598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022441	GAGT	2	8	36838	36845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022441	TTGT	2	8	37047	37054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022441	TATT	2	8	38275	38282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022441	AAAT	2	8	53086	53093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022441	CTTT	2	8	67738	67745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022441	TAGA	2	8	69484	69491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022441	CTTC	2	8	75753	75760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022441	ATTT	2	8	75891	75898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022441	TTTA	2	8	90761	90768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022441	CGTG	2	8	91015	91022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022441	ATAC	2	8	94195	94202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022441	AAGA	2	8	103410	103417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022441	CGTT	2	8	119879	119886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022441	AGGA	2	8	119969	119976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022441	TTCT	2	8	124446	124453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022441	TTGT	2	8	126453	126460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022441	GTTA	2	8	126520	126527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022441	TGCA	2	8	127167	127174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022441	AGGA	2	8	138571	138578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022441	TTTC	2	8	142263	142270	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022441	AACA	2	8	151658	151665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022441	CCTT	2	8	157919	157926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022441	CTTT	2	8	157931	157938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022441	TAAA	2	8	178956	178963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022441	GAGG	2	8	187463	187470	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022441	GGGA	2	8	187591	187598	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022441	ACTT	2	8	188975	188982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022441	TCTT	2	8	189609	189616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022441	TCTA	3	12	189645	189656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022441	ACTA	2	8	192314	192321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022441	GATA	2	8	192325	192332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022441	TGAA	2	8	196821	196828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022441	AAAT	2	8	207943	207950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022441	TTTG	2	8	208187	208194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022441	AGAA	2	8	216322	216329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022441	GGGA	2	8	216358	216365	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022441	TAAG	2	8	220056	220063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022441	AAAG	2	8	222562	222569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022441	TCTG	2	8	227169	227176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022441	ATCT	2	8	227222	227229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022441	TTTA	2	8	229625	229632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022441	AGGA	2	8	233702	233709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022441	ATTT	2	8	234846	234853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022441	CCTT	2	8	243790	243797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022441	TAAT	2	8	253237	253244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022441	TTGG	2	8	253298	253305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022441	GATT	2	8	254549	254556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022441	CAAG	2	8	263158	263165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022441	TCCA	2	8	265148	265155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022441	TTTA	2	8	270844	270851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022441	GTTT	2	8	279166	279173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022441	GCAA	2	8	298514	298521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022441	TTTC	2	8	298752	298759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022441	TATC	2	8	298853	298860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022441	GTAT	2	8	299122	299129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022441	AGAA	2	8	299290	299297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022441	ACGA	2	8	308776	308783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022441	ATTT	2	8	314557	314564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022441	GAAA	2	8	314585	314592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022441	AATA	2	8	322677	322684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022441	GAAT	2	8	327416	327423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022441	GTTT	2	8	327504	327511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022441	AAAG	2	8	328049	328056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022441	GAGT	2	8	333184	333191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022441	TCTT	2	8	334282	334289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022441	TAAA	2	8	334379	334386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022441	TTTA	2	8	334394	334401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022441	TAGA	2	8	343528	343535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022441	TTCT	2	8	344442	344449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022441	TTTA	2	8	357193	357200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022441	CAAT	2	8	358356	358363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022441	AGGT	2	8	373128	373135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022441	GAAA	2	8	375032	375039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022441	TTTA	2	8	375756	375763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022441	AAGC	2	8	379601	379608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022441	TATT	2	8	382725	382732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022441	CTTT	2	8	382743	382750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022441	GTTT	2	8	399991	399998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022441	AGAA	2	8	405624	405631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022441	AATG	3	12	405770	405781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022441	TTAG	2	8	413742	413749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022441	TCTT	2	8	415669	415676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022441	CTTT	2	8	417597	417604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022441	TTTA	2	8	417648	417655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022441	TACA	2	8	417701	417708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022441	AAAG	2	8	419294	419301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022441	CTTT	2	8	423827	423834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022441	CAAG	2	8	425438	425445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022441	TAAA	2	8	425769	425776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022441	GAAG	2	8	425796	425803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022441	GTAA	2	8	438018	438025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022441	GAAA	2	8	448604	448611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022441	CATG	2	8	448660	448667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022441	AACA	2	8	449218	449225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022441	TTCT	2	8	449255	449262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022441	ATTA	2	8	450754	450761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022441	ATAA	2	8	450919	450926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022441	GAGG	2	8	450927	450934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022441	GAAG	2	8	454501	454508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022441	CATT	2	8	454550	454557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022441	ATTT	2	8	459293	459300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022441	TTTC	2	8	460655	460662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022441	GAAA	2	8	462084	462091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022441	CTTT	2	8	462121	462128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022441	ACCC	2	8	464420	464427	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_022441	AATT	2	8	464453	464460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022441	AAGA	2	8	464478	464485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022441	TAAA	2	8	478686	478693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022441	AATT	2	8	478997	479004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022441	TAAA	2	8	479023	479030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022441	TCAT	2	8	494121	494128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022441	TAAG	2	8	498436	498443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022441	TTAT	2	8	500353	500360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022441	TTTG	2	8	523151	523158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022441	TTAA	2	8	530035	530042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022441	TTAA	2	8	534965	534972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022441	TTTC	2	8	535117	535124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022441	ATTT	2	8	539191	539198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022441	AGTG	2	8	558655	558662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022441	AAGA	2	8	560558	560565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022441	AATT	2	8	561434	561441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022441	TAAA	2	8	567976	567983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022441	CTAT	2	8	570584	570591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022441	TCAA	2	8	572259	572266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022441	ATAA	2	8	578799	578806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022441	ATTA	2	8	578829	578836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022441	CTAC	2	8	579607	579614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022441	CTTT	2	8	580680	580687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022441	TTTC	2	8	580728	580735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022441	TAAA	2	8	583688	583695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022441	ACTA	2	8	587569	587576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022441	AGAA	2	8	588849	588856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022441	TCTT	2	8	588906	588913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022441	AGGA	2	8	588961	588968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022441	ACTT	2	8	589061	589068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022441	TTAT	2	8	589598	589605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022441	GGAT	2	8	590709	590716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022441	CAAA	2	8	591267	591274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022441	AAAG	2	8	598136	598143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022441	AAAT	2	8	598266	598273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022441	AAGA	2	8	598280	598287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022441	GTTC	2	8	600692	600699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_022441	AAAG	2	8	777020	777027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_022441	AATC	2	8	1066807	1066814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.