MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 2393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022441	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022441	AG	3	6	855	860	50 %	0 %	50 %	0 %	545632603
4	NC_022441	CG	3	6	1069	1074	0 %	0 %	50 %	50 %	545632603
5	NC_022441	AC	3	6	1758	1763	50 %	0 %	0 %	50 %	545632604
6	NC_022441	GT	3	6	1899	1904	0 %	50 %	50 %	0 %	545632604
7	NC_022441	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	545632604
8	NC_022441	TG	3	6	2121	2126	0 %	50 %	50 %	0 %	545632604
9	NC_022441	TA	3	6	3937	3942	50 %	50 %	0 %	0 %	545632606
10	NC_022441	CT	3	6	4156	4161	0 %	50 %	0 %	50 %	545632606
11	NC_022441	TA	3	6	4370	4375	50 %	50 %	0 %	0 %	545632606
12	NC_022441	TG	3	6	4432	4437	0 %	50 %	50 %	0 %	545632606
13	NC_022441	TC	3	6	4841	4846	0 %	50 %	0 %	50 %	545632606
14	NC_022441	GA	4	8	4935	4942	50 %	0 %	50 %	0 %	545632606
15	NC_022441	GC	3	6	4975	4980	0 %	0 %	50 %	50 %	545632606
16	NC_022441	TC	3	6	5824	5829	0 %	50 %	0 %	50 %	545632607
17	NC_022441	GT	3	6	5881	5886	0 %	50 %	50 %	0 %	545632607
18	NC_022441	AT	3	6	6510	6515	50 %	50 %	0 %	0 %	545632607
19	NC_022441	AG	3	6	7231	7236	50 %	0 %	50 %	0 %	545632608
20	NC_022441	TA	3	6	7730	7735	50 %	50 %	0 %	0 %	545632609
21	NC_022441	GA	3	6	7906	7911	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
22	NC_022441	GA	3	6	8088	8093	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
23	NC_022441	AG	4	8	8177	8184	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
24	NC_022441	GA	3	6	8317	8322	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
25	NC_022441	AG	3	6	8459	8464	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
26	NC_022441	GA	3	6	8905	8910	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
27	NC_022441	AG	3	6	9066	9071	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
28	NC_022441	AG	3	6	9914	9919	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
29	NC_022441	AG	3	6	10074	10079	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
30	NC_022441	GA	3	6	10118	10123	50 %	0 %	50 %	0 %	545632609
31	NC_022441	TG	3	6	10127	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	545632609
32	NC_022441	AG	4	8	10778	10785	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
33	NC_022441	GA	3	6	11050	11055	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
34	NC_022441	AC	3	6	11162	11167	50 %	0 %	0 %	50 %	545632610
35	NC_022441	GA	3	6	11369	11374	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
36	NC_022441	GA	3	6	11447	11452	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
37	NC_022441	GA	3	6	11666	11671	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
38	NC_022441	AG	3	6	11802	11807	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
39	NC_022441	GA	3	6	11934	11939	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
40	NC_022441	AG	3	6	12156	12161	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
41	NC_022441	AG	3	6	12228	12233	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
42	NC_022441	AG	3	6	12764	12769	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
43	NC_022441	GA	3	6	12797	12802	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
44	NC_022441	GA	3	6	12911	12916	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
45	NC_022441	GA	4	8	13355	13362	50 %	0 %	50 %	0 %	545632610
46	NC_022441	TA	3	6	13793	13798	50 %	50 %	0 %	0 %	545632611
47	NC_022441	CT	3	6	14192	14197	0 %	50 %	0 %	50 %	545632611
48	NC_022441	TG	3	6	14338	14343	0 %	50 %	50 %	0 %	545632611
49	NC_022441	TC	3	6	14620	14625	0 %	50 %	0 %	50 %	545632611
50	NC_022441	AT	3	6	15231	15236	50 %	50 %	0 %	0 %	545632611
51	NC_022441	TG	3	6	15268	15273	0 %	50 %	50 %	0 %	545632611
52	NC_022441	TA	3	6	15479	15484	50 %	50 %	0 %	0 %	545632612
53	NC_022441	GT	3	6	17262	17267	0 %	50 %	50 %	0 %	545632613
54	NC_022441	TC	4	8	17273	17280	0 %	50 %	0 %	50 %	545632613
55	NC_022441	AG	3	6	18847	18852	50 %	0 %	50 %	0 %	545632615
56	NC_022441	GC	3	6	19053	19058	0 %	0 %	50 %	50 %	545632615
57	NC_022441	AT	3	6	20038	20043	50 %	50 %	0 %	0 %	545632616
58	NC_022441	CT	3	6	20737	20742	0 %	50 %	0 %	50 %	545632616
59	NC_022441	TG	4	8	20782	20789	0 %	50 %	50 %	0 %	545632616
60	NC_022441	AG	3	6	21502	21507	50 %	0 %	50 %	0 %	545632617
61	NC_022441	GA	3	6	21819	21824	50 %	0 %	50 %	0 %	545632617
62	NC_022441	CA	3	6	23218	23223	50 %	0 %	0 %	50 %	545632617
63	NC_022441	AG	3	6	23902	23907	50 %	0 %	50 %	0 %	545632618
64	NC_022441	GT	3	6	25442	25447	0 %	50 %	50 %	0 %	545632618
65	NC_022441	AG	3	6	26460	26465	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
66	NC_022441	GA	3	6	27101	27106	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
67	NC_022441	GC	3	6	27975	27980	0 %	0 %	50 %	50 %	545632619
68	NC_022441	AG	3	6	28236	28241	50 %	0 %	50 %	0 %	545632619
69	NC_022441	CA	3	6	28880	28885	50 %	0 %	0 %	50 %	545632620
70	NC_022441	AG	3	6	29189	29194	50 %	0 %	50 %	0 %	545632621
71	NC_022441	AG	3	6	29816	29821	50 %	0 %	50 %	0 %	545632622
72	NC_022441	CA	4	8	30258	30265	50 %	0 %	0 %	50 %	545632622
73	NC_022441	TG	3	6	30487	30492	0 %	50 %	50 %	0 %	545632623
74	NC_022441	GA	3	6	30686	30691	50 %	0 %	50 %	0 %	545632623
75	NC_022441	GA	3	6	32051	32056	50 %	0 %	50 %	0 %	545632625
76	NC_022441	GT	3	6	32098	32103	0 %	50 %	50 %	0 %	545632625
77	NC_022441	AG	3	6	32569	32574	50 %	0 %	50 %	0 %	545632625
78	NC_022441	AT	3	6	32762	32767	50 %	50 %	0 %	0 %	545632625
79	NC_022441	GA	3	6	32853	32858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022441	AT	3	6	33020	33025	50 %	50 %	0 %	0 %	545632626
81	NC_022441	GT	3	6	33070	33075	0 %	50 %	50 %	0 %	545632626
82	NC_022441	GT	3	6	33136	33141	0 %	50 %	50 %	0 %	545632626
83	NC_022441	TA	3	6	33211	33216	50 %	50 %	0 %	0 %	545632627
84	NC_022441	AT	3	6	33475	33480	50 %	50 %	0 %	0 %	545632627
85	NC_022441	AG	3	6	33942	33947	50 %	0 %	50 %	0 %	545632628
86	NC_022441	AG	3	6	35571	35576	50 %	0 %	50 %	0 %	545632629
87	NC_022441	CG	3	6	36770	36775	0 %	0 %	50 %	50 %	545632629
88	NC_022441	TA	3	6	37074	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022441	AG	3	6	37412	37417	50 %	0 %	50 %	0 %	545632630
90	NC_022441	CT	3	6	37637	37642	0 %	50 %	0 %	50 %	545632630
91	NC_022441	AT	3	6	38055	38060	50 %	50 %	0 %	0 %	545632630
92	NC_022441	AT	3	6	42393	42398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022441	CT	3	6	42545	42550	0 %	50 %	0 %	50 %	545632636
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95	NC_022441	CA	3	6	42817	42822	50 %	0 %	0 %	50 %	545632636
96	NC_022441	GA	5	10	42948	42957	50 %	0 %	50 %	0 %	545632636
97	NC_022441	CA	3	6	43003	43008	50 %	0 %	0 %	50 %	545632636
98	NC_022441	GT	3	6	43402	43407	0 %	50 %	50 %	0 %	545632637
99	NC_022441	CT	3	6	43624	43629	0 %	50 %	0 %	50 %	545632637
100	NC_022441	TA	3	6	44662	44667	50 %	50 %	0 %	0 %	545632638
101	NC_022441	GT	3	6	46038	46043	0 %	50 %	50 %	0 %	545632640
102	NC_022441	GA	3	6	46080	46085	50 %	0 %	50 %	0 %	545632640
103	NC_022441	AG	3	6	46573	46578	50 %	0 %	50 %	0 %	545632640
104	NC_022441	AG	4	8	48010	48017	50 %	0 %	50 %	0 %	545632641
105	NC_022441	AT	3	6	49424	49429	50 %	50 %	0 %	0 %	545632642
106	NC_022441	TA	3	6	50191	50196	50 %	50 %	0 %	0 %	545632642
107	NC_022441	CT	3	6	52639	52644	0 %	50 %	0 %	50 %	545632644
108	NC_022441	AC	3	6	52916	52921	50 %	0 %	0 %	50 %	545632644
109	NC_022441	GA	3	6	54567	54572	50 %	0 %	50 %	0 %	545632646
110	NC_022441	TC	3	6	55103	55108	0 %	50 %	0 %	50 %	545632647
111	NC_022441	TC	3	6	55507	55512	0 %	50 %	0 %	50 %	545632647
112	NC_022441	GA	3	6	55651	55656	50 %	0 %	50 %	0 %	545632648
113	NC_022441	TC	3	6	56066	56071	0 %	50 %	0 %	50 %	545632648
114	NC_022441	AT	3	6	56389	56394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022441	AG	3	6	56622	56627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022441	GC	3	6	56733	56738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022441	TA	3	6	57367	57372	50 %	50 %	0 %	0 %	545632649
118	NC_022441	TC	3	6	57605	57610	0 %	50 %	0 %	50 %	545632649
119	NC_022441	AC	3	6	58073	58078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022441	TG	3	6	58138	58143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022441	TG	3	6	58385	58390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022441	GA	3	6	58705	58710	50 %	0 %	50 %	0 %	545632650
123	NC_022441	GT	3	6	59045	59050	0 %	50 %	50 %	0 %	545632650
124	NC_022441	GA	3	6	59296	59301	50 %	0 %	50 %	0 %	545632650
125	NC_022441	AG	3	6	59637	59642	50 %	0 %	50 %	0 %	545632650
126	NC_022441	CT	3	6	60090	60095	0 %	50 %	0 %	50 %	545632650
127	NC_022441	CT	3	6	60857	60862	0 %	50 %	0 %	50 %	545632650
128	NC_022441	TG	3	6	61475	61480	0 %	50 %	50 %	0 %	545632650
129	NC_022441	AG	3	6	61636	61641	50 %	0 %	50 %	0 %	545632650
130	NC_022441	GA	3	6	61698	61703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022441	TA	3	6	62150	62155	50 %	50 %	0 %	0 %	545632651
132	NC_022441	AT	3	6	62748	62753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022441	TG	3	6	63891	63896	0 %	50 %	50 %	0 %	545632652
134	NC_022441	AG	3	6	63985	63990	50 %	0 %	50 %	0 %	545632652
135	NC_022441	GA	3	6	64154	64159	50 %	0 %	50 %	0 %	545632652
136	NC_022441	TA	3	6	64431	64436	50 %	50 %	0 %	0 %	545632652
137	NC_022441	CT	3	6	64836	64841	0 %	50 %	0 %	50 %	545632653
138	NC_022441	GA	3	6	65047	65052	50 %	0 %	50 %	0 %	545632653
139	NC_022441	GT	3	6	65474	65479	0 %	50 %	50 %	0 %	545632654
140	NC_022441	AG	3	6	65558	65563	50 %	0 %	50 %	0 %	545632654
141	NC_022441	AG	3	6	65624	65629	50 %	0 %	50 %	0 %	545632654
142	NC_022441	GA	3	6	65827	65832	50 %	0 %	50 %	0 %	545632654
143	NC_022441	TA	3	6	66666	66671	50 %	50 %	0 %	0 %	545632655
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