MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022441	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022441	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022441	GA	3	6	32853	32858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022441	TA	3	6	37074	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022441	AT	3	6	42393	42398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022441	AT	3	6	56389	56394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022441	AG	3	6	56622	56627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022441	GC	3	6	56733	56738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022441	AC	3	6	58073	58078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022441	TG	3	6	58138	58143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022441	TG	3	6	58385	58390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022441	GA	3	6	61698	61703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022441	AT	3	6	62748	62753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022441	AG	3	6	68646	68651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022441	TG	4	8	75809	75816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022441	AG	3	6	78205	78210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022441	CA	3	6	80612	80617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022441	TA	3	6	90753	90758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022441	GT	3	6	90883	90888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022441	CT	3	6	95898	95903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022441	TA	3	6	95975	95980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022441	GC	3	6	98075	98080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022441	TA	4	8	103400	103407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022441	GT	3	6	108586	108591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022441	AG	3	6	124544	124549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022441	TA	3	6	126067	126072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022441	CT	3	6	126345	126350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022441	AG	3	6	126461	126466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022441	GA	3	6	135796	135801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022441	TC	3	6	137201	137206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022441	AG	3	6	148226	148231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022441	GA	3	6	151606	151611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022441	AG	3	6	156703	156708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022441	AC	3	6	158041	158046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022441	AT	3	6	178848	178853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022441	AT	3	6	189576	189581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022441	TC	3	6	198351	198356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022441	GA	3	6	198438	198443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022441	AC	3	6	203855	203860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022441	AG	3	6	203880	203885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022441	AG	3	6	204229	204234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022441	GA	3	6	208097	208102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022441	GT	3	6	208137	208142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022441	CT	3	6	208174	208179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022441	AT	3	6	216296	216301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022441	TG	3	6	217098	217103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022441	TC	3	6	219517	219522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022441	AG	4	8	227151	227158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022441	CT	3	6	227492	227497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022441	TA	3	6	230779	230784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022441	CT	3	6	233752	233757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022441	TC	3	6	258151	258156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022441	AG	3	6	264688	264693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022441	GA	3	6	271735	271740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022441	GA	3	6	282734	282739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022441	CA	3	6	282903	282908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022441	AT	3	6	297073	297078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022441	GC	3	6	298633	298638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022441	AG	3	6	298796	298801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022441	CT	3	6	299249	299254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022441	AG	3	6	302726	302731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022441	AT	3	6	314629	314634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022441	AG	3	6	325986	325991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022441	TA	4	8	330222	330229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022441	AG	3	6	332233	332238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022441	CT	3	6	333216	333221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022441	TG	3	6	344535	344540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022441	AG	3	6	344547	344552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022441	AG	3	6	353805	353810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022441	AG	3	6	358224	358229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022441	AG	3	6	363170	363175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022441	AG	3	6	369072	369077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022441	AG	3	6	369675	369680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022441	TG	3	6	376758	376763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022441	TA	3	6	382294	382299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022441	TA	3	6	388920	388925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022441	CA	3	6	396176	396181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022441	GT	3	6	398861	398866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022441	GA	3	6	398902	398907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022441	AG	3	6	403293	403298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022441	AT	3	6	403319	403324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022441	GC	3	6	403365	403370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022441	GT	3	6	405655	405660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022441	TC	4	8	405714	405721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022441	TG	3	6	405740	405745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022441	GA	3	6	413707	413712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022441	AG	4	8	417550	417557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022441	AG	3	6	425802	425807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022441	CA	3	6	431128	431133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022441	AT	3	6	451430	451435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022441	AG	4	8	462073	462080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022441	TA	3	6	464428	464433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022441	AG	3	6	464542	464547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022441	TA	3	6	464733	464738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022441	CT	3	6	475257	475262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022441	AG	3	6	478904	478909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022441	TC	3	6	478914	478919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022441	AT	3	6	484600	484605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022441	AC	3	6	498424	498429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022441	AG	4	8	498449	498456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022441	GA	3	6	503141	503146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022441	TA	3	6	507473	507478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022441	TA	3	6	522702	522707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022441	CT	3	6	526631	526636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022441	AG	3	6	544031	544036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022441	AT	3	6	544708	544713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022441	TA	3	6	555975	555980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022441	GA	3	6	556060	556065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022441	GA	3	6	558669	558674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022441	TG	3	6	558776	558781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022441	TA	3	6	559768	559773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022441	CT	3	6	568001	568006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022441	CT	3	6	570508	570513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022441	CT	3	6	571246	571251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022441	TG	3	6	579753	579758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022441	CT	3	6	581653	581658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022441	TC	3	6	589001	589006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022441	AG	3	6	589710	589715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022441	CT	3	6	590575	590580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022441	TA	3	6	590648	590653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022441	GT	3	6	595466	595471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022441	GC	3	6	600176	600181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022441	CT	5	10	600394	600403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022441	AG	3	6	600498	600503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022441	AT	3	6	600582	600587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022441	TC	3	6	600737	600742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022441	CT	3	6	600945	600950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022441	TA	3	6	600999	601004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022441	CT	3	6	601175	601180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022441	CT	3	6	601471	601476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022441	AT	3	6	601757	601762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022441	AT	3	6	601962	601967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022441	AG	3	6	602018	602023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022441	TC	3	6	602069	602074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022441	TA	3	6	613729	613734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022441	CA	3	6	626045	626050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022441	TC	3	6	627445	627450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022441	TC	3	6	628180	628185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022441	CT	3	6	631470	631475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022441	TC	3	6	635055	635060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022441	CA	3	6	635090	635095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022441	GA	3	6	636264	636269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022441	TC	3	6	636329	636334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022441	CA	3	6	647824	647829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022441	TC	4	8	647889	647896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022441	CT	3	6	651037	651042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022441	AG	3	6	652824	652829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022441	CT	3	6	656553	656558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022441	TC	3	6	656691	656696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022441	CA	3	6	688578	688583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022441	AG	3	6	701928	701933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022441	TC	3	6	717291	717296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022441	TC	3	6	717437	717442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022441	TA	3	6	724160	724165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022441	TA	3	6	726764	726769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022441	TA	3	6	726809	726814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022441	CA	3	6	759453	759458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_022441	CA	3	6	759466	759471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022441	AC	3	6	762664	762669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_022441	AG	3	6	762673	762678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022441	CT	4	8	778928	778935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_022441	CT	3	6	782216	782221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_022441	CT	3	6	805512	805517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_022441	TC	3	6	821206	821211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_022441	CT	3	6	828170	828175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_022441	TC	3	6	840657	840662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_022441	TC	3	6	844674	844679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_022441	AT	3	6	849087	849092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022441	AT	3	6	849223	849228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022441	AG	3	6	877114	877119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022441	CT	3	6	891036	891041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_022441	GA	3	6	895109	895114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022441	TC	3	6	897292	897297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_022441	TC	4	8	902340	902347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_022441	TC	3	6	903455	903460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_022441	TC	3	6	903511	903516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_022441	AG	3	6	903548	903553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022441	CT	3	6	905240	905245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_022441	AT	3	6	909291	909296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_022441	AG	3	6	918032	918037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022441	TC	3	6	921028	921033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_022441	AG	4	8	921319	921326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022441	AC	3	6	921368	921373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_022441	AG	3	6	923174	923179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022441	CG	3	6	931917	931922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
186	NC_022441	GT	3	6	943062	943067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022441	AG	3	6	943094	943099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022441	CT	3	6	957206	957211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_022441	TA	3	6	959247	959252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022441	GT	3	6	959344	959349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022441	AC	3	6	959682	959687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_022441	CG	3	6	960726	960731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_022441	GA	3	6	961557	961562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022441	GT	3	6	962806	962811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022441	GT	3	6	962975	962980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022441	TC	3	6	963746	963751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_022441	CA	3	6	963794	963799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_022441	TC	3	6	963902	963907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
199	NC_022441	AC	3	6	964030	964035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
200	NC_022441	TC	3	6	964468	964473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
201	NC_022441	TA	4	8	971343	971350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_022441	AT	3	6	977221	977226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_022441	CT	3	6	983098	983103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
204	NC_022441	AG	3	6	985763	985768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
205	NC_022441	TA	3	6	1012657	1012662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_022441	TC	3	6	1014150	1014155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
207	NC_022441	TC	3	6	1015099	1015104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
208	NC_022441	CT	3	6	1017213	1017218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
209	NC_022441	AG	4	8	1017272	1017279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
210	NC_022441	TA	3	6	1042341	1042346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_022441	TA	3	6	1056009	1056014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_022441	GA	3	6	1067680	1067685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
213	NC_022441	TC	3	6	1067704	1067709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
214	NC_022441	AG	3	6	1075388	1075393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
215	NC_022441	TC	3	6	1084609	1084614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
216	NC_022441	AC	3	6	1088620	1088625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
217	NC_022441	CT	3	6	1092697	1092702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
218	NC_022441	TC	3	6	1092730	1092735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
219	NC_022441	AT	3	6	1093901	1093906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_022441	GA	3	6	1097193	1097198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
221	NC_022441	TA	4	8	1101847	1101854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_022441	CT	3	6	1102660	1102665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
223	NC_022441	AT	3	6	1102724	1102729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_022441	AG	3	6	1104621	1104626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.