MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	GGTAAA	2	12	2009	2020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631678
2	NC_022440	TGAAGA	2	12	12806	12817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631684
3	NC_022440	TATGGA	2	12	14916	14927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631685
4	NC_022440	AAAAGA	2	12	18952	18963	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631689
5	NC_022440	GAAAGC	2	12	22492	22503	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631691
6	NC_022440	CAGAAG	2	12	22592	22603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631691
7	NC_022440	CACCTA	2	12	24472	24483	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545631692
8	NC_022440	CATAAG	2	12	24826	24837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631692
9	NC_022440	ATTAAG	2	12	25028	25039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545631692
10	NC_022440	CAGGGA	2	12	26643	26654	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545631693
11	NC_022440	CTGGGT	2	12	28254	28265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545631693
12	NC_022440	TTTTTC	2	12	33713	33724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545631702
13	NC_022440	CATCTG	2	12	35480	35491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631703
14	NC_022440	AAAAAG	2	12	39537	39548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631706
15	NC_022440	AGAAAA	2	12	42204	42215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631709
16	NC_022440	CTTTCT	2	12	46517	46528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631714
17	NC_022440	TAAGAA	2	12	48543	48554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631716
18	NC_022440	AGATGC	2	12	49083	49094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631716
19	NC_022440	GCGTTT	2	12	50004	50015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631716
20	NC_022440	TCGTCA	2	12	50473	50484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631716
21	NC_022440	CCTCTT	2	12	60557	60568	0 %	50 %	0 %	50 %	545631724
22	NC_022440	GATGCT	2	12	62498	62509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631725
23	NC_022440	AGCTGC	2	12	76057	76068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631738
24	NC_022440	TCTTTA	2	12	81100	81111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545631742
25	NC_022440	TTTCTT	2	12	83701	83712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545631746
26	NC_022440	CGATAT	2	12	87949	87960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631748
27	NC_022440	TCCATT	2	12	88179	88190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545631748
28	NC_022440	AAGCAA	2	12	89866	89877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631749
29	NC_022440	CAGAAT	2	12	94498	94509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631752
30	NC_022440	CAAAAT	2	12	96673	96684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545631755
31	NC_022440	TTCTAA	2	12	101443	101454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545631761
32	NC_022440	TGAGGT	2	12	105432	105443	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631766
33	NC_022440	TCAAGC	2	12	115009	115020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631785
34	NC_022440	GAAGTT	2	12	115250	115261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631785
35	NC_022440	TTCTGA	2	12	122908	122919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631795
36	NC_022440	ATATGA	2	12	123994	124005	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545631795
37	NC_022440	TTTGTA	2	12	126770	126781	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631797
38	NC_022440	AAAGGA	2	12	133778	133789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631802
39	NC_022440	TTATCG	2	12	135889	135900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631805
40	NC_022440	AGATTT	2	12	136234	136245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631805
41	NC_022440	CTGTAG	2	12	141777	141788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631811
42	NC_022440	TGTTTC	2	12	143139	143150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545631812
43	NC_022440	TTTGTA	2	12	144303	144314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631812
44	NC_022440	TTTGAT	2	12	144527	144538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631813
45	NC_022440	CTTAGG	2	12	147546	147557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631814
46	NC_022440	AGGAGA	2	12	150908	150919	50 %	0 %	50 %	0 %	545631817
47	NC_022440	ATAAGG	2	12	151585	151596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631817
48	NC_022440	ATGGAT	2	12	154380	154391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545631821
49	NC_022440	GTTGCT	2	12	158367	158378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631826
50	NC_022440	CAGAAG	2	12	159144	159155	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631826
51	NC_022440	GGAAAA	2	12	159860	159871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631826
52	NC_022440	AGAAAA	2	12	160025	160036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631826
53	NC_022440	GGAGAG	2	12	161320	161331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631827
54	NC_022440	GTTGCC	2	12	164669	164680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631831
55	NC_022440	CAAGAG	2	12	164926	164937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631832
56	NC_022440	GATTTG	2	12	168428	168439	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631836
57	NC_022440	ATGGTG	2	12	171370	171381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631839
58	NC_022440	AGCTCC	2	12	172172	172183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545631839
59	NC_022440	TTTTCC	2	12	177309	177320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545631844
60	NC_022440	AATAAA	2	12	177637	177648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545631844
61	NC_022440	GCTAGA	2	12	191228	191239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631852
62	NC_022440	AAAGAA	2	12	198137	198148	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545631859
63	NC_022440	TTGTGC	2	12	198709	198720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631860
64	NC_022440	TGCTGT	2	12	199697	199708	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631862
65	NC_022440	CCATTT	3	18	210316	210333	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545631872
66	NC_022440	TTGAGT	2	12	210735	210746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631872
67	NC_022440	TGCAGC	4	24	211920	211943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631872
68	NC_022440	TCATGG	2	12	213561	213572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631873
69	NC_022440	GAGAGG	2	12	220977	220988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545631881
70	NC_022440	CTCTTC	2	12	221476	221487	0 %	50 %	0 %	50 %	545631881
71	NC_022440	GGAGTG	2	12	222064	222075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545631882
72	NC_022440	ATGTGT	2	12	226892	226903	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631886
73	NC_022440	TAAAGA	2	12	229577	229588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631888
74	NC_022440	GGATTT	2	12	234289	234300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631894
75	NC_022440	AAGCTG	2	12	236784	236795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631895
76	NC_022440	ACGCTA	2	12	243871	243882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631904
77	NC_022440	GGAGCA	2	12	243919	243930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545631904
78	NC_022440	CAAATC	2	12	247348	247359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545631907
79	NC_022440	CTGTAG	2	12	248301	248312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631908
80	NC_022440	AGATAG	2	12	251707	251718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545631911
81	NC_022440	CGAAAA	2	12	254487	254498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631912
82	NC_022440	TTATTG	2	12	258460	258471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631917
83	NC_022440	GAAAAT	2	12	262795	262806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545631920
84	NC_022440	TTCTGT	2	12	267493	267504	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545631925
85	NC_022440	CCCTCC	2	12	267706	267717	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	545631925
86	NC_022440	TTCATT	2	12	267918	267929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545631926
87	NC_022440	GGAGAA	2	12	273819	273830	50 %	0 %	50 %	0 %	545631930
88	NC_022440	TTCGTA	2	12	275116	275127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631931
89	NC_022440	GGCGTA	2	12	280764	280775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545631934
90	NC_022440	AGCTAT	2	12	284764	284775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631936
91	NC_022440	GTAATT	2	12	286348	286359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631937
92	NC_022440	GTAGAG	2	12	287923	287934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631938
93	NC_022440	GTATGC	2	12	288408	288419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631938
94	NC_022440	TTTGGG	2	12	288506	288517	0 %	50 %	50 %	0 %	545631938
95	NC_022440	TTGATT	2	12	290280	290291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631938
96	NC_022440	GGTGTG	2	12	293433	293444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545631939
97	NC_022440	GGTTGA	2	12	296033	296044	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545631940
98	NC_022440	GTTCCT	2	12	296220	296231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545631940
99	NC_022440	GCTACA	2	12	298226	298237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631941
100	NC_022440	GGTTAT	2	12	304755	304766	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631944
101	NC_022440	TTTAGC	2	12	305609	305620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631945
102	NC_022440	AGAAAG	2	12	307993	308004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545631945
103	NC_022440	GATAGG	2	12	308177	308188	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545631945
104	NC_022440	TGTTTG	2	12	309995	310006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545631946
105	NC_022440	GCAATC	2	12	310800	310811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545631946
106	NC_022440	GCCATT	2	12	311351	311362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545631946
107	NC_022440	GCTTGT	2	12	313297	313308	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631947
108	NC_022440	GCAAAC	2	12	318373	318384	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545631949
109	NC_022440	CAATAG	2	12	319517	319528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631949
110	NC_022440	TAGCTT	2	12	319943	319954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545631949
111	NC_022440	GTCGTT	2	12	321163	321174	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545631949
112	NC_022440	GTCGTA	2	12	321232	321243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545631949
113	NC_022440	CTGCGA	3	18	321576	321593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545631949
114	NC_022440	CTCTGG	2	12	321594	321605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545631949
115	NC_022440	GCCCTT	2	12	326980	326991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545631954
116	NC_022440	CAAGAA	2	12	327593	327604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545631955
117	NC_022440	CTTGAA	2	12	328791	328802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545631956
118	NC_022440	TTTGTA	2	12	331070	331081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545631959
119	NC_022440	CCTCAG	2	12	338220	338231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545631964
120	NC_022440	TAATTC	2	12	344516	344527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545631970
121	NC_022440	TCAGGA	2	12	348625	348636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545631973
122	NC_022440	AGGAGA	2	12	353758	353769	50 %	0 %	50 %	0 %	545631978
123	NC_022440	TCAGAA	2	12	353933	353944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545631978
124	NC_022440	GCAGAA	2	12	358561	358572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545631982
125	NC_022440	GCTGGA	2	12	358666	358677	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545631982
126	NC_022440	TTTAGG	2	12	359893	359904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545631983
127	NC_022440	TTTAGA	2	12	360448	360459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545631983
128	NC_022440	TCAATC	2	12	368595	368606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545631990
129	NC_022440	GCTCTT	2	12	371449	371460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545631993
130	NC_022440	ATGGGG	2	12	373181	373192	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545631996
131	NC_022440	ATTTTA	2	12	376018	376029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545631998
132	NC_022440	GACAGC	2	12	377001	377012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545631999
133	NC_022440	AGAAAA	2	12	380655	380666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545632003
134	NC_022440	AAGGAA	2	12	385282	385293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632007
135	NC_022440	CAGCTC	2	12	386046	386057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632007
136	NC_022440	ATGAAA	2	12	390973	390984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632010
137	NC_022440	AGCTTG	2	12	391342	391353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632010
138	NC_022440	AACTTT	2	12	392702	392713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632014
139	NC_022440	ATTCCC	2	12	392894	392905	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632014
140	NC_022440	CAATCA	2	12	393853	393864	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545632015
141	NC_022440	CCTTAT	2	12	396903	396914	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632018
142	NC_022440	AGCCTT	2	12	399777	399788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632022
143	NC_022440	TGTCGG	2	12	403914	403925	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632026
144	NC_022440	GATCGC	2	12	404953	404964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632026
145	NC_022440	ATTTTA	2	12	410610	410621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632031
146	NC_022440	AAGAGG	2	12	411794	411805	50 %	0 %	50 %	0 %	545632033
147	NC_022440	GTAATT	2	12	412203	412214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632033
148	NC_022440	AATATC	2	12	413233	413244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632035
149	NC_022440	TTTTGG	2	12	413610	413621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632036
150	NC_022440	TGTGGC	2	12	423694	423705	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632043
151	NC_022440	ATTGAC	2	12	423924	423935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632044
152	NC_022440	AAAGAA	2	12	424102	424113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545632044
153	NC_022440	CTTGGA	2	12	427951	427962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632048
154	NC_022440	TTCATT	2	12	449825	449836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632069
155	NC_022440	AATAAA	2	12	456004	456015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632074
156	NC_022440	GGAGTA	2	12	457503	457514	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545632075
157	NC_022440	AAACCC	2	12	458486	458497	50 %	0 %	0 %	50 %	545632076
158	NC_022440	CTCCTA	2	12	458788	458799	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632076
159	NC_022440	CTCGCT	2	12	459352	459363	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545632076
160	NC_022440	CAATTA	2	12	460666	460677	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632077
161	NC_022440	TCTTTA	2	12	462686	462697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632079
162	NC_022440	CATTAG	2	12	463230	463241	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632079
163	NC_022440	TTCTTT	2	12	465351	465362	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632081
164	NC_022440	CGCTTT	2	12	467931	467942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545632083
165	NC_022440	TTGAAA	2	12	471959	471970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632086
166	NC_022440	TTTTCT	2	12	473127	473138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632087
167	NC_022440	CTTTAG	2	12	475466	475477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632089
168	NC_022440	AGGAAG	2	12	477789	477800	50 %	0 %	50 %	0 %	545632092
169	NC_022440	GAGAAA	2	12	478517	478528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632093
170	NC_022440	AAAGAG	2	12	478828	478839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632094
171	NC_022440	CTTTTT	2	12	484876	484887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632099
172	NC_022440	CCCATA	2	12	485734	485745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632100
173	NC_022440	ATTACC	2	12	494381	494392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632107
174	NC_022440	TTTCAG	2	12	497554	497565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632109
175	NC_022440	CTGGAG	2	12	501203	501214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545632112
176	NC_022440	GAAGTA	2	12	504760	504771	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632116
177	NC_022440	ATAAGC	2	12	513139	513150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632122
178	NC_022440	CTACAT	2	12	518127	518138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632126
179	NC_022440	ATAGCC	2	12	521483	521494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632129
180	NC_022440	AAAATA	2	12	527997	528008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632136
181	NC_022440	TATTTT	2	12	533221	533232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632139
182	NC_022440	TTTTAC	2	12	533605	533616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632139
183	NC_022440	CAAAAA	2	12	541828	541839	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545632145
184	NC_022440	GGACAG	2	12	550276	550287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545632152
185	NC_022440	AGAAAA	2	12	550431	550442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	545632152
186	NC_022440	CCTATG	2	12	558044	558055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632161
187	NC_022440	CCTTTT	2	12	559728	559739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632163
188	NC_022440	TAAGCA	2	12	560799	560810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632164
189	NC_022440	GCAAAA	2	12	561375	561386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545632165
190	NC_022440	TTACAG	2	12	562957	562968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632167
191	NC_022440	TCGAAT	2	12	571203	571214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632177
192	NC_022440	GCTCCT	2	12	574176	574187	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545632180
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194	NC_022440	CAGAGA	2	12	581749	581760	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632187
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196	NC_022440	TTGCCA	2	12	585101	585112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632191
197	NC_022440	GATAAA	2	12	589020	589031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632195
198	NC_022440	CTATCC	2	12	591978	591989	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632199
199	NC_022440	TATCTT	2	12	594092	594103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632200
200	NC_022440	TTTTTG	2	12	596791	596802	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545632202
201	NC_022440	CCTCTC	2	12	602873	602884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632203
202	NC_022440	TCCTAT	2	12	603084	603095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632203
203	NC_022440	AAAACT	2	12	603417	603428	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632203
204	NC_022440	TTTAAG	2	12	603495	603506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632203
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206	NC_022440	GAGATG	2	12	604321	604332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545632203
207	NC_022440	GATATC	2	12	604576	604587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632203
208	NC_022440	TAAAGC	2	12	604788	604799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632203
209	NC_022440	CAAAAA	2	12	608306	608317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545632203
210	NC_022440	ACACAG	2	12	611171	611182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632203
211	NC_022440	GGTGAT	2	12	615623	615634	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545632205
212	NC_022440	CTTCCC	2	12	615667	615678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632205
213	NC_022440	AAGGAA	2	12	619517	619528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632206
214	NC_022440	GCAACA	2	12	621851	621862	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632206
215	NC_022440	TAAAGG	2	12	628275	628286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632207
216	NC_022440	CGCATA	2	12	629587	629598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632208
217	NC_022440	AAAATA	2	12	631547	631558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632210
218	NC_022440	ACCTCC	2	12	632969	632980	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	545632211
219	NC_022440	TTCGCT	2	12	633035	633046	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545632211
220	NC_022440	CAAAAA	2	12	634222	634233	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	545632213
221	NC_022440	GCTCCA	2	12	636387	636398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
222	NC_022440	GCTCCA	2	12	636402	636413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
223	NC_022440	GCTCCA	3	18	636417	636434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
224	NC_022440	GCTCCA	2	12	636438	636449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
225	NC_022440	GCTCCA	2	12	636453	636464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632215
226	NC_022440	TCTTGT	2	12	637829	637840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545632217
227	NC_022440	AGCAAC	2	12	638757	638768	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632217
228	NC_022440	CGCAAC	2	12	639493	639504	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	545632218
229	NC_022440	CTCTCC	2	12	639788	639799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632218
230	NC_022440	CAAGCC	2	12	640103	640114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	545632218
231	NC_022440	GTTCCA	2	12	644780	644791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632221
232	NC_022440	TTGCAG	2	12	644874	644885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632221
233	NC_022440	ATTAGC	2	12	648413	648424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632225
234	NC_022440	CTCAAC	2	12	651493	651504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632227
235	NC_022440	CTTGCG	2	12	653653	653664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632228
236	NC_022440	CTTGCC	2	12	656002	656013	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545632231
237	NC_022440	ACTACA	2	12	660809	660820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545632234
238	NC_022440	AACCAC	2	12	660873	660884	50 %	0 %	0 %	50 %	545632234
239	NC_022440	CAGCCC	2	12	664586	664597	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	545632237
240	NC_022440	TAAAGA	2	12	667089	667100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632238
241	NC_022440	TCCTCT	2	12	668404	668415	0 %	50 %	0 %	50 %	545632239
242	NC_022440	GTTTAA	2	12	669049	669060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632240
243	NC_022440	ATATGC	2	12	670853	670864	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632241
244	NC_022440	CCATAG	2	12	671980	671991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632241
245	NC_022440	TTCCCT	2	12	672557	672568	0 %	50 %	0 %	50 %	545632241
246	NC_022440	TTTCCA	2	12	676282	676293	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632242
247	NC_022440	TTTTTG	2	12	680049	680060	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545632245
248	NC_022440	GACAAA	2	12	680632	680643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545632245
249	NC_022440	AAGATA	2	12	682599	682610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632247
250	NC_022440	TAAAAA	2	12	683182	683193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632247
251	NC_022440	TCGCAT	2	12	684828	684839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632247
252	NC_022440	ATGGCC	2	12	688504	688515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632251
253	NC_022440	CTGTAT	2	12	692465	692476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632256
254	NC_022440	AATATG	2	12	697764	697775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632260
255	NC_022440	TATTCT	2	12	701160	701171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632263
256	NC_022440	CGAGCA	2	12	705452	705463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632268
257	NC_022440	CCTTAT	2	12	709682	709693	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632273
258	NC_022440	ATTTCT	2	12	711087	711098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632275
259	NC_022440	TATTTT	2	12	711216	711227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632275
260	NC_022440	TATCCG	2	12	717021	717032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632277
261	NC_022440	ATTGTA	2	12	720223	720234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632280
262	NC_022440	CACTCT	2	12	721570	721581	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545632281
263	NC_022440	CAAGCA	2	12	722074	722085	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632282
264	NC_022440	TCCTAA	2	12	730217	730228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632289
265	NC_022440	ATCAGG	2	12	731885	731896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545632289
266	NC_022440	TTATCT	2	12	733461	733472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632289
267	NC_022440	ACAGCA	2	12	740332	740343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632291
268	NC_022440	TTAACC	2	12	742156	742167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632294
269	NC_022440	AGCTAA	2	12	748946	748957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632299
270	NC_022440	ATATAA	2	12	756131	756142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632304
271	NC_022440	GCAACA	2	12	760998	761009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545632307
272	NC_022440	AAACCA	2	12	762533	762544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632310
273	NC_022440	CAACTT	2	12	765472	765483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632313
274	NC_022440	TTCTTA	2	12	769248	769259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545632317
275	NC_022440	AGCTCT	2	12	771337	771348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632320
276	NC_022440	AAAATA	2	12	774063	774074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632323
277	NC_022440	GAGCAA	2	12	781782	781793	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632329
278	NC_022440	GAAGAG	2	12	786763	786774	50 %	0 %	50 %	0 %	545632334
279	NC_022440	GATCCC	2	12	786945	786956	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545632334
280	NC_022440	TGGGCA	2	12	790946	790957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545632339
281	NC_022440	CGGAAT	2	12	796857	796868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545632344
282	NC_022440	GTGCTG	2	12	797282	797293	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632345
283	NC_022440	TACCAA	2	12	797953	797964	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545632345
284	NC_022440	TCCTAT	2	12	798871	798882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632346
285	NC_022440	AAGCAG	2	12	806739	806750	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545632352
286	NC_022440	AGATCA	2	12	809175	809186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632354
287	NC_022440	TTAGGA	2	12	812823	812834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632358
288	NC_022440	ACTATT	2	12	817354	817365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632360
289	NC_022440	TTCTTT	2	12	823829	823840	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632367
290	NC_022440	TCATTA	2	12	824915	824926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632368
291	NC_022440	TGAGGT	2	12	830547	830558	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	545632376
292	NC_022440	AGGAAT	2	12	833175	833186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632377
293	NC_022440	ATTTAA	2	12	842178	842189	50 %	50 %	0 %	0 %	545632386
294	NC_022440	TAACAT	2	12	843891	843902	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632388
295	NC_022440	GCAGCT	2	12	849867	849878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632392
296	NC_022440	TTTAAA	2	12	850363	850374	50 %	50 %	0 %	0 %	545632393
297	NC_022440	CAAGTT	2	12	853204	853215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632394
298	NC_022440	CCGATA	2	12	856566	856577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632396
299	NC_022440	CTATAG	2	12	856780	856791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632396
300	NC_022440	CATACC	2	12	860187	860198	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632399
301	NC_022440	GCAATT	2	12	862743	862754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632402
302	NC_022440	TCTTCA	2	12	863823	863834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632402
303	NC_022440	ATCCCC	2	12	865020	865031	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	545632403
304	NC_022440	AAAGTA	2	12	866859	866870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632404
305	NC_022440	TGAAAA	2	12	869681	869692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632406
306	NC_022440	TAATAC	2	12	869765	869776	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545632406
307	NC_022440	CTGCAA	2	12	875938	875949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632408
308	NC_022440	CTTCGT	2	12	879228	879239	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	545632411
309	NC_022440	AAGTAA	2	12	886692	886703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632417
310	NC_022440	TGAAGT	2	12	889122	889133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632422
311	NC_022440	ATTTAC	2	12	890268	890279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632422
312	NC_022440	TCTATC	2	12	907008	907019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545632436
313	NC_022440	TCAAGC	2	12	910622	910633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632440
314	NC_022440	AAGAAT	2	12	919055	919066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632447
315	NC_022440	ATCACG	2	12	919865	919876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632448
316	NC_022440	TCCTCT	2	12	922265	922276	0 %	50 %	0 %	50 %	545632451
317	NC_022440	CACCAT	2	12	922902	922913	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632451
318	NC_022440	CTAAAG	2	12	935116	935127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545632464
319	NC_022440	ATGCTT	2	12	942051	942062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632470
320	NC_022440	CCAGAG	2	12	949488	949499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632473
321	NC_022440	CTTTGT	2	12	950303	950314	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545632474
322	NC_022440	GATAGA	2	12	950580	950591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632474
323	NC_022440	TTTCAG	2	12	958661	958672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632480
324	NC_022440	ATAAAA	2	12	971776	971787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	545632487
325	NC_022440	ATTTGT	2	12	972439	972450	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545632487
326	NC_022440	TATTTT	2	12	977550	977561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632492
327	NC_022440	GCCATT	2	12	978969	978980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632493
328	NC_022440	TGCCAT	2	12	978995	979006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632493
329	NC_022440	AAACAG	2	12	979468	979479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	545632493
330	NC_022440	CAGCTA	2	12	980340	980351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632494
331	NC_022440	AGGAAA	2	12	981423	981434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632495
332	NC_022440	CCCCCT	2	12	987909	987920	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	545632503
333	NC_022440	AAATGG	2	12	989835	989846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545632505
334	NC_022440	TTTTAT	2	12	996312	996323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545632510
335	NC_022440	TAATCT	2	12	998505	998516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545632511
336	NC_022440	GAATAT	2	12	999811	999822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632512
337	NC_022440	CTAAAA	2	12	1000855	1000866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632512
338	NC_022440	TCTGAT	2	12	1002528	1002539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545632512
339	NC_022440	TAAAGA	2	12	1005091	1005102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545632514
340	NC_022440	CTGCAG	2	12	1005264	1005275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545632515
341	NC_022440	ACTAAA	2	12	1007062	1007073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632516
342	NC_022440	ATCCAT	2	12	1010134	1010145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632519
343	NC_022440	ACCATC	2	12	1021749	1021760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545632525
344	NC_022440	CTTTTT	2	12	1025517	1025528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545632529
345	NC_022440	ATTGGC	2	12	1029544	1029555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632534
346	NC_022440	CAGGTA	2	12	1030072	1030083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545632534
347	NC_022440	CCCAAA	2	12	1033776	1033787	50 %	0 %	0 %	50 %	545632540
348	NC_022440	TACAGT	2	12	1039714	1039725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545632544
349	NC_022440	AATACA	2	12	1041528	1041539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545632545
350	NC_022440	CCCTCT	2	12	1042023	1042034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632545
351	NC_022440	TCCTAA	2	12	1043601	1043612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632547
352	NC_022440	AGGAGC	2	12	1044597	1044608	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545632548
353	NC_022440	TCCATG	2	12	1047033	1047044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632550
354	NC_022440	TGCGAG	2	12	1048784	1048795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545632551
355	NC_022440	AGCTAC	2	12	1057730	1057741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545632558
356	NC_022440	CTCTAG	2	12	1060804	1060815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632561
357	NC_022440	AAAGAG	2	12	1078396	1078407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632576
358	NC_022440	GCTTCA	2	12	1080162	1080173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545632579
359	NC_022440	GGTGCT	2	12	1080458	1080469	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545632580
360	NC_022440	GCCTCC	2	12	1087176	1087187	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545632583
361	NC_022440	GTTTTT	2	12	1095970	1095981	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	545632592
362	NC_022440	CTCTTT	2	12	1096578	1096589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632592
363	NC_022440	GTAAAT	2	12	1097847	1097858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545632594
364	NC_022440	CCTCTG	2	12	1102221	1102232	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545632597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.