MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	GAAGG	2	10	1878	1887	40 %	0 %	60 %	0 %	545631678
2	NC_022440	CAGGG	2	10	5223	5232	20 %	0 %	60 %	20 %	545631680
3	NC_022440	TTTAA	2	10	6532	6541	40 %	60 %	0 %	0 %	545631681
4	NC_022440	TTTTA	2	10	7537	7546	20 %	80 %	0 %	0 %	545631682
5	NC_022440	CTTTT	2	10	7755	7764	0 %	80 %	0 %	20 %	545631683
6	NC_022440	AAAGA	2	10	7910	7919	80 %	0 %	20 %	0 %	545631683
7	NC_022440	GAAAA	2	10	7988	7997	80 %	0 %	20 %	0 %	545631683
8	NC_022440	AAGAT	2	10	8764	8773	60 %	20 %	20 %	0 %	545631683
9	NC_022440	TTGAG	2	10	8805	8814	20 %	40 %	40 %	0 %	545631683
10	NC_022440	AAGGA	2	10	8866	8875	60 %	0 %	40 %	0 %	545631683
11	NC_022440	GAGAG	2	10	9264	9273	40 %	0 %	60 %	0 %	545631683
12	NC_022440	AAGAT	2	10	9727	9736	60 %	20 %	20 %	0 %	545631683
13	NC_022440	GGGAT	2	10	10542	10551	20 %	20 %	60 %	0 %	545631683
14	NC_022440	GAGAA	2	10	12523	12532	60 %	0 %	40 %	0 %	545631684
15	NC_022440	GAAGA	2	10	13137	13146	60 %	0 %	40 %	0 %	545631684
16	NC_022440	GGAAT	2	10	15329	15338	40 %	20 %	40 %	0 %	545631685
17	NC_022440	AGGGG	2	10	17785	17794	20 %	0 %	80 %	0 %	545631688
18	NC_022440	TCGGG	2	10	17966	17975	0 %	20 %	60 %	20 %	545631688
19	NC_022440	GTTGG	2	10	18770	18779	0 %	40 %	60 %	0 %	545631689
20	NC_022440	GATTG	2	10	18853	18862	20 %	40 %	40 %	0 %	545631689
21	NC_022440	TTGCT	2	10	22469	22478	0 %	60 %	20 %	20 %	545631691
22	NC_022440	AATCC	2	10	23738	23747	40 %	20 %	0 %	40 %	545631692
23	NC_022440	CTTTT	2	10	24994	25003	0 %	80 %	0 %	20 %	545631692
24	NC_022440	GCAGA	2	10	26543	26552	40 %	0 %	40 %	20 %	545631693
25	NC_022440	GAGCA	2	10	30151	30160	40 %	0 %	40 %	20 %	545631696
26	NC_022440	AGACG	2	10	32182	32191	40 %	0 %	40 %	20 %	545631699
27	NC_022440	AAAGA	2	10	35602	35611	80 %	0 %	20 %	0 %	545631703
28	NC_022440	GGAGC	2	10	39462	39471	20 %	0 %	60 %	20 %	545631706
29	NC_022440	CAAGC	2	10	39672	39681	40 %	0 %	20 %	40 %	545631706
30	NC_022440	GGTGA	2	10	41060	41069	20 %	20 %	60 %	0 %	545631706
31	NC_022440	AGAGC	2	10	42309	42318	40 %	0 %	40 %	20 %	545631709
32	NC_022440	CCTAT	2	10	43528	43537	20 %	40 %	0 %	40 %	545631711
33	NC_022440	GCGAT	2	10	44693	44702	20 %	20 %	40 %	20 %	545631712
34	NC_022440	AGATG	2	10	44928	44937	40 %	20 %	40 %	0 %	545631712
35	NC_022440	CCTTG	2	10	46945	46954	0 %	40 %	20 %	40 %	545631714
36	NC_022440	TTTGG	2	10	47474	47483	0 %	60 %	40 %	0 %	545631715
37	NC_022440	AGACA	2	10	50844	50853	60 %	0 %	20 %	20 %	545631716
38	NC_022440	GCAAG	2	10	51595	51604	40 %	0 %	40 %	20 %	545631717
39	NC_022440	AAGAT	2	10	51862	51871	60 %	20 %	20 %	0 %	545631717
40	NC_022440	TTTTG	2	10	53468	53477	0 %	80 %	20 %	0 %	545631719
41	NC_022440	AAACA	2	10	54683	54692	80 %	0 %	0 %	20 %	545631720
42	NC_022440	TGAAG	2	10	66357	66366	40 %	20 %	40 %	0 %	545631728
43	NC_022440	AAGGC	2	10	71663	71672	40 %	0 %	40 %	20 %	545631734
44	NC_022440	CATTA	2	10	74454	74463	40 %	40 %	0 %	20 %	545631736
45	NC_022440	AACGT	2	10	75342	75351	40 %	20 %	20 %	20 %	545631737
46	NC_022440	TCTTT	2	10	77520	77529	0 %	80 %	0 %	20 %	545631739
47	NC_022440	GATAC	2	10	78464	78473	40 %	20 %	20 %	20 %	545631740
48	NC_022440	GTTGT	2	10	80995	81004	0 %	60 %	40 %	0 %	545631742
49	NC_022440	TGTAG	2	10	81491	81500	20 %	40 %	40 %	0 %	545631742
50	NC_022440	CCTAA	2	10	83552	83561	40 %	20 %	0 %	40 %	545631745
51	NC_022440	CAGAG	2	10	85228	85237	40 %	0 %	40 %	20 %	545631747
52	NC_022440	CTTTT	2	10	86333	86342	0 %	80 %	0 %	20 %	545631748
53	NC_022440	AAAGA	2	10	86424	86433	80 %	0 %	20 %	0 %	545631748
54	NC_022440	TCTTT	2	10	86461	86470	0 %	80 %	0 %	20 %	545631748
55	NC_022440	TAAAA	2	10	88489	88498	80 %	20 %	0 %	0 %	545631748
56	NC_022440	TTTGC	2	10	88546	88555	0 %	60 %	20 %	20 %	545631748
57	NC_022440	GAAAA	2	10	89582	89591	80 %	0 %	20 %	0 %	545631749
58	NC_022440	AAGAG	2	10	89908	89917	60 %	0 %	40 %	0 %	545631749
59	NC_022440	CTGCT	2	10	89939	89948	0 %	40 %	20 %	40 %	545631749
60	NC_022440	CTGCA	2	10	92292	92301	20 %	20 %	20 %	40 %	545631750
61	NC_022440	CTTTT	2	10	93362	93371	0 %	80 %	0 %	20 %	545631751
62	NC_022440	CAATG	2	10	93572	93581	40 %	20 %	20 %	20 %	545631751
63	NC_022440	GCAAA	2	10	93923	93932	60 %	0 %	20 %	20 %	545631751
64	NC_022440	TACAA	2	10	94642	94651	60 %	20 %	0 %	20 %	545631752
65	NC_022440	GATTT	2	10	97552	97561	20 %	60 %	20 %	0 %	545631757
66	NC_022440	CTTTG	2	10	98951	98960	0 %	60 %	20 %	20 %	545631759
67	NC_022440	GGGCA	2	10	99095	99104	20 %	0 %	60 %	20 %	545631759
68	NC_022440	TCCTT	2	10	103995	104004	0 %	60 %	0 %	40 %	545631764
69	NC_022440	CAAAG	2	10	104905	104914	60 %	0 %	20 %	20 %	545631765
70	NC_022440	AAGGG	2	10	105069	105078	40 %	0 %	60 %	0 %	545631765
71	NC_022440	TGTTA	2	10	108633	108642	20 %	60 %	20 %	0 %	545631772
72	NC_022440	TGCTT	2	10	113239	113248	0 %	60 %	20 %	20 %	545631783
73	NC_022440	GTAGG	2	10	113256	113265	20 %	20 %	60 %	0 %	545631783
74	NC_022440	TGAAA	2	10	114241	114250	60 %	20 %	20 %	0 %	545631783
75	NC_022440	TTTAC	2	10	115440	115449	20 %	60 %	0 %	20 %	545631786
76	NC_022440	AAAAG	2	10	116487	116496	80 %	0 %	20 %	0 %	545631786
77	NC_022440	AAGAG	2	10	119781	119790	60 %	0 %	40 %	0 %	545631790
78	NC_022440	AAGAG	2	10	119865	119874	60 %	0 %	40 %	0 %	545631790
79	NC_022440	CTTGT	2	10	125847	125856	0 %	60 %	20 %	20 %	545631796
80	NC_022440	TATGT	2	10	127771	127780	20 %	60 %	20 %	0 %	545631798
81	NC_022440	TTTGA	2	10	133731	133740	20 %	60 %	20 %	0 %	545631802
82	NC_022440	TACAG	2	10	134282	134291	40 %	20 %	20 %	20 %	545631802
83	NC_022440	GATGC	2	10	134637	134646	20 %	20 %	40 %	20 %	545631802
84	NC_022440	TTGAT	2	10	138320	138329	20 %	60 %	20 %	0 %	545631807
85	NC_022440	AAGGA	2	10	139462	139471	60 %	0 %	40 %	0 %	545631809
86	NC_022440	AAAGA	2	10	141425	141434	80 %	0 %	20 %	0 %	545631810
87	NC_022440	GAATA	2	10	141472	141481	60 %	20 %	20 %	0 %	545631810
88	NC_022440	TTGTT	2	10	143277	143286	0 %	80 %	20 %	0 %	545631812
89	NC_022440	TCTCT	2	10	144360	144369	0 %	60 %	0 %	40 %	545631812
90	NC_022440	TGTTT	2	10	151769	151778	0 %	80 %	20 %	0 %	545631818
91	NC_022440	TTATT	2	10	151785	151794	20 %	80 %	0 %	0 %	545631818
92	NC_022440	GTTTT	2	10	151948	151957	0 %	80 %	20 %	0 %	545631818
93	NC_022440	TAAAT	2	10	154172	154181	60 %	40 %	0 %	0 %	545631821
94	NC_022440	GCTTT	2	10	155094	155103	0 %	60 %	20 %	20 %	545631822
95	NC_022440	TGTGT	2	10	160556	160565	0 %	60 %	40 %	0 %	545631826
96	NC_022440	AAGTT	2	10	160702	160711	40 %	40 %	20 %	0 %	545631826
97	NC_022440	AAGAG	3	15	161384	161398	60 %	0 %	40 %	0 %	545631827
98	NC_022440	GATTT	2	10	162012	162021	20 %	60 %	20 %	0 %	545631827
99	NC_022440	GGTTG	2	10	165654	165663	0 %	40 %	60 %	0 %	545631833
100	NC_022440	GTTCG	2	10	166248	166257	0 %	40 %	40 %	20 %	545631833
101	NC_022440	TTTAC	2	10	166413	166422	20 %	60 %	0 %	20 %	545631834
102	NC_022440	CAGAA	2	10	169325	169334	60 %	0 %	20 %	20 %	545631838
103	NC_022440	TGCTT	2	10	171929	171938	0 %	60 %	20 %	20 %	545631839
104	NC_022440	GGAGA	2	10	175303	175312	40 %	0 %	60 %	0 %	545631841
105	NC_022440	GAGAG	2	10	175657	175666	40 %	0 %	60 %	0 %	545631841
106	NC_022440	AATTA	2	10	179002	179011	60 %	40 %	0 %	0 %	545631846
107	NC_022440	TTCTT	2	10	179343	179352	0 %	80 %	0 %	20 %	545631846
108	NC_022440	TCTTT	2	10	180269	180278	0 %	80 %	0 %	20 %	545631847
109	NC_022440	GCTGC	2	10	183079	183088	0 %	20 %	40 %	40 %	545631847
110	NC_022440	TACAG	2	10	183603	183612	40 %	20 %	20 %	20 %	545631847
111	NC_022440	TAGCT	2	10	185414	185423	20 %	40 %	20 %	20 %	545631848
112	NC_022440	TATTG	2	10	185603	185612	20 %	60 %	20 %	0 %	545631848
113	NC_022440	AGAGG	2	10	190472	190481	40 %	0 %	60 %	0 %	545631852
114	NC_022440	TGGAT	2	10	190788	190797	20 %	40 %	40 %	0 %	545631852
115	NC_022440	AAGAA	2	10	191527	191536	80 %	0 %	20 %	0 %	545631853
116	NC_022440	GAAGA	2	10	192621	192630	60 %	0 %	40 %	0 %	545631855
117	NC_022440	AAAGT	2	10	193222	193231	60 %	20 %	20 %	0 %	545631855
118	NC_022440	TAAGA	2	10	196587	196596	60 %	20 %	20 %	0 %	545631857
119	NC_022440	GTTGG	2	10	199239	199248	0 %	40 %	60 %	0 %	545631861
120	NC_022440	GTATT	2	10	201100	201109	20 %	60 %	20 %	0 %	545631862
121	NC_022440	AACGA	2	10	201618	201627	60 %	0 %	20 %	20 %	545631863
122	NC_022440	ATTGC	2	10	203203	203212	20 %	40 %	20 %	20 %	545631865
123	NC_022440	TGGGT	2	10	205300	205309	0 %	40 %	60 %	0 %	545631868
124	NC_022440	AAAAG	2	10	208665	208674	80 %	0 %	20 %	0 %	545631872
125	NC_022440	TAAAA	2	10	208947	208956	80 %	20 %	0 %	0 %	545631872
126	NC_022440	TGCTG	2	10	210601	210610	0 %	40 %	40 %	20 %	545631872
127	NC_022440	CTTTG	2	10	210949	210958	0 %	60 %	20 %	20 %	545631872
128	NC_022440	CCTTT	2	10	214364	214373	0 %	60 %	0 %	40 %	545631873
129	NC_022440	TTTCT	2	10	214948	214957	0 %	80 %	0 %	20 %	545631873
130	NC_022440	TGTTT	2	10	216506	216515	0 %	80 %	20 %	0 %	545631874
131	NC_022440	ATAAA	2	10	217100	217109	80 %	20 %	0 %	0 %	545631875
132	NC_022440	TTTCT	2	10	217325	217334	0 %	80 %	0 %	20 %	545631876
133	NC_022440	AGCAA	2	10	218867	218876	60 %	0 %	20 %	20 %	545631877
134	NC_022440	TTATG	2	10	220840	220849	20 %	60 %	20 %	0 %	545631881
135	NC_022440	AGGAA	2	10	221356	221365	60 %	0 %	40 %	0 %	545631881
136	NC_022440	TGCCT	2	10	221623	221632	0 %	40 %	20 %	40 %	545631881
137	NC_022440	GTCAT	2	10	221921	221930	20 %	40 %	20 %	20 %	545631882
138	NC_022440	AGGGA	2	10	222719	222728	40 %	0 %	60 %	0 %	545631883
139	NC_022440	ACGGC	2	10	224628	224637	20 %	0 %	40 %	40 %	545631884
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142	NC_022440	TCTCA	2	10	233268	233277	20 %	40 %	0 %	40 %	545631893
143	NC_022440	TTTAG	2	10	235013	235022	20 %	60 %	20 %	0 %	545631895
144	NC_022440	AAGCT	2	10	236526	236535	40 %	20 %	20 %	20 %	545631895
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147	NC_022440	TAGCA	2	10	239993	240002	40 %	20 %	20 %	20 %	545631899
148	NC_022440	TAACA	2	10	241481	241490	60 %	20 %	0 %	20 %	545631899
149	NC_022440	CGCTG	2	10	243349	243358	0 %	20 %	40 %	40 %	545631902
150	NC_022440	GCGTA	2	10	245005	245014	20 %	20 %	40 %	20 %	545631906
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157	NC_022440	TAATG	2	10	256696	256705	40 %	40 %	20 %	0 %	545631915
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208	NC_022440	AGTGT	2	10	348133	348142	20 %	40 %	40 %	0 %	545631973
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248	NC_022440	AAAGA	2	10	399656	399665	80 %	0 %	20 %	0 %	545632021
249	NC_022440	ATTAT	2	10	401650	401659	40 %	60 %	0 %	0 %	545632024
250	NC_022440	GTGAT	2	10	401941	401950	20 %	40 %	40 %	0 %	545632025
251	NC_022440	ATTGC	2	10	402633	402642	20 %	40 %	20 %	20 %	545632025
252	NC_022440	AGGAG	2	10	403124	403133	40 %	0 %	60 %	0 %	545632025
253	NC_022440	CATGC	2	10	403194	403203	20 %	20 %	20 %	40 %	545632025
254	NC_022440	GGGTT	2	10	406938	406947	0 %	40 %	60 %	0 %	545632029
255	NC_022440	CATTA	2	10	409571	409580	40 %	40 %	0 %	20 %	545632031
256	NC_022440	AAATT	2	10	409684	409693	60 %	40 %	0 %	0 %	545632031
257	NC_022440	TGCAA	2	10	411782	411791	40 %	20 %	20 %	20 %	545632033
258	NC_022440	CAGGA	2	10	412220	412229	40 %	0 %	40 %	20 %	545632033
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260	NC_022440	GTTGC	2	10	418621	418630	0 %	40 %	40 %	20 %	545632040
261	NC_022440	GATCA	2	10	420987	420996	40 %	20 %	20 %	20 %	545632041
262	NC_022440	AATTG	2	10	423192	423201	40 %	40 %	20 %	0 %	545632043
263	NC_022440	GGAAG	2	10	423273	423282	40 %	0 %	60 %	0 %	545632043
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265	NC_022440	CTTCA	2	10	428210	428219	20 %	40 %	0 %	40 %	545632049
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384	NC_022440	AAGAT	2	10	606116	606125	60 %	20 %	20 %	0 %	545632203
385	NC_022440	CGAAG	2	10	606645	606654	40 %	0 %	40 %	20 %	545632203
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388	NC_022440	CGGAT	2	10	608912	608921	20 %	20 %	40 %	20 %	545632203
389	NC_022440	GAAGT	2	10	610411	610420	40 %	20 %	40 %	0 %	545632203
390	NC_022440	CCAGT	2	10	612973	612982	20 %	20 %	20 %	40 %	545632204
391	NC_022440	TCTCT	2	10	613494	613503	0 %	60 %	0 %	40 %	545632204
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393	NC_022440	AATAC	2	10	615160	615169	60 %	20 %	0 %	20 %	545632205
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