MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum W73

Total Repeats: 2702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022440	TGCA	2	8	620	627	25 %	25 %	25 %	25 %	545631677
2	NC_022440	GAAG	2	8	873	880	50 %	0 %	50 %	0 %	545631677
3	NC_022440	TTTA	2	8	914	921	25 %	75 %	0 %	0 %	545631677
4	NC_022440	AGTC	2	8	943	950	25 %	25 %	25 %	25 %	545631677
5	NC_022440	GGGT	2	8	1018	1025	0 %	25 %	75 %	0 %	545631677
6	NC_022440	AGAA	2	8	1669	1676	75 %	0 %	25 %	0 %	545631678
7	NC_022440	TTTG	2	8	3272	3279	0 %	75 %	25 %	0 %	545631680
8	NC_022440	TTTC	2	8	3589	3596	0 %	75 %	0 %	25 %	545631680
9	NC_022440	TTTC	2	8	3649	3656	0 %	75 %	0 %	25 %	545631680
10	NC_022440	TCTT	2	8	4272	4279	0 %	75 %	0 %	25 %	545631680
11	NC_022440	ATAA	2	8	5013	5020	75 %	25 %	0 %	0 %	545631680
12	NC_022440	GTTG	2	8	5067	5074	0 %	50 %	50 %	0 %	545631680
13	NC_022440	AATC	2	8	5383	5390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022440	CTGC	2	8	5635	5642	0 %	25 %	25 %	50 %	545631681
15	NC_022440	ACAT	2	8	6414	6421	50 %	25 %	0 %	25 %	545631681
16	NC_022440	TTAT	2	8	6918	6925	25 %	75 %	0 %	0 %	545631682
17	NC_022440	AGAA	2	8	8240	8247	75 %	0 %	25 %	0 %	545631683
18	NC_022440	TTCG	2	8	8957	8964	0 %	50 %	25 %	25 %	545631683
19	NC_022440	TGAT	2	8	9331	9338	25 %	50 %	25 %	0 %	545631683
20	NC_022440	GCAT	2	8	9340	9347	25 %	25 %	25 %	25 %	545631683
21	NC_022440	AAGC	2	8	10158	10165	50 %	0 %	25 %	25 %	545631683
22	NC_022440	TTTC	2	8	10824	10831	0 %	75 %	0 %	25 %	545631684
23	NC_022440	GGGA	2	8	11004	11011	25 %	0 %	75 %	0 %	545631684
24	NC_022440	GAAG	2	8	11240	11247	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
25	NC_022440	CTTT	2	8	11390	11397	0 %	75 %	0 %	25 %	545631684
26	NC_022440	GTTG	2	8	11681	11688	0 %	50 %	50 %	0 %	545631684
27	NC_022440	GGAA	2	8	11731	11738	50 %	0 %	50 %	0 %	545631684
28	NC_022440	TTTG	2	8	11947	11954	0 %	75 %	25 %	0 %	545631684
29	NC_022440	GAAA	2	8	12059	12066	75 %	0 %	25 %	0 %	545631684
30	NC_022440	GAGG	2	8	12468	12475	25 %	0 %	75 %	0 %	545631684
31	NC_022440	GGAT	2	8	12479	12486	25 %	25 %	50 %	0 %	545631684
32	NC_022440	GATT	2	8	13166	13173	25 %	50 %	25 %	0 %	545631684
33	NC_022440	TTTA	2	8	13396	13403	25 %	75 %	0 %	0 %	545631684
34	NC_022440	AAAT	2	8	13477	13484	75 %	25 %	0 %	0 %	545631684
35	NC_022440	GGAT	2	8	14558	14565	25 %	25 %	50 %	0 %	545631685
36	NC_022440	AAAG	2	8	15462	15469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022440	GTTT	2	8	15547	15554	0 %	75 %	25 %	0 %	545631686
38	NC_022440	TAAA	2	8	16573	16580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022440	GCTT	2	8	16837	16844	0 %	50 %	25 %	25 %	545631687
40	NC_022440	TCTT	2	8	17050	17057	0 %	75 %	0 %	25 %	545631687
41	NC_022440	GAAA	2	8	17085	17092	75 %	0 %	25 %	0 %	545631687
42	NC_022440	TTTC	2	8	18571	18578	0 %	75 %	0 %	25 %	545631689
43	NC_022440	CGAG	2	8	19192	19199	25 %	0 %	50 %	25 %	545631689
44	NC_022440	TCCC	2	8	19318	19325	0 %	25 %	0 %	75 %	545631689
45	NC_022440	TTTA	2	8	19578	19585	25 %	75 %	0 %	0 %	545631689
46	NC_022440	GCAT	2	8	19667	19674	25 %	25 %	25 %	25 %	545631689
47	NC_022440	AGAA	2	8	20339	20346	75 %	0 %	25 %	0 %	545631690
48	NC_022440	GCAT	2	8	20362	20369	25 %	25 %	25 %	25 %	545631690
49	NC_022440	TGAG	2	8	20569	20576	25 %	25 %	50 %	0 %	545631690
50	NC_022440	CAGC	2	8	20810	20817	25 %	0 %	25 %	50 %	545631690
51	NC_022440	GAAA	2	8	20833	20840	75 %	0 %	25 %	0 %	545631690
52	NC_022440	AACA	2	8	20870	20877	75 %	0 %	0 %	25 %	545631690
53	NC_022440	TGAA	2	8	20905	20912	50 %	25 %	25 %	0 %	545631690
54	NC_022440	ACTA	2	8	21120	21127	50 %	25 %	0 %	25 %	545631690
55	NC_022440	TCTT	2	8	21292	21299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022440	ATGA	2	8	21820	21827	50 %	25 %	25 %	0 %	545631691
57	NC_022440	ACAG	2	8	22332	22339	50 %	0 %	25 %	25 %	545631691
58	NC_022440	AAGA	2	8	22527	22534	75 %	0 %	25 %	0 %	545631691
59	NC_022440	TTAA	2	8	22696	22703	50 %	50 %	0 %	0 %	545631691
60	NC_022440	TCAG	2	8	22982	22989	25 %	25 %	25 %	25 %	545631691
61	NC_022440	TGGA	2	8	23225	23232	25 %	25 %	50 %	0 %	545631691
62	NC_022440	CTTT	2	8	23260	23267	0 %	75 %	0 %	25 %	545631691
63	NC_022440	ATAC	2	8	23346	23353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022440	GTAT	2	8	23362	23369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022440	GATA	2	8	24146	24153	50 %	25 %	25 %	0 %	545631692
66	NC_022440	AATT	2	8	24190	24197	50 %	50 %	0 %	0 %	545631692
67	NC_022440	TTAA	2	8	24201	24208	50 %	50 %	0 %	0 %	545631692
68	NC_022440	TGCT	2	8	24224	24231	0 %	50 %	25 %	25 %	545631692
69	NC_022440	TAAA	2	8	24258	24265	75 %	25 %	0 %	0 %	545631692
70	NC_022440	ATTT	2	8	24502	24509	25 %	75 %	0 %	0 %	545631692
71	NC_022440	TATG	2	8	24679	24686	25 %	50 %	25 %	0 %	545631692
72	NC_022440	CCAA	2	8	24728	24735	50 %	0 %	0 %	50 %	545631692
73	NC_022440	GTAT	2	8	24785	24792	25 %	50 %	25 %	0 %	545631692
74	NC_022440	TCCA	2	8	24933	24940	25 %	25 %	0 %	50 %	545631692
75	NC_022440	TCTG	2	8	25533	25540	0 %	50 %	25 %	25 %	545631692
76	NC_022440	TCTT	2	8	26149	26156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022440	TGTT	3	12	26216	26227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022440	TCTT	2	8	26374	26381	0 %	75 %	0 %	25 %	545631693
79	NC_022440	GAAT	2	8	26944	26951	50 %	25 %	25 %	0 %	545631693
80	NC_022440	ATAC	2	8	27750	27757	50 %	25 %	0 %	25 %	545631693
81	NC_022440	CAAG	2	8	28022	28029	50 %	0 %	25 %	25 %	545631693
82	NC_022440	CTTC	2	8	28049	28056	0 %	50 %	0 %	50 %	545631693
83	NC_022440	GAAA	2	8	29781	29788	75 %	0 %	25 %	0 %	545631695
84	NC_022440	TCTA	2	8	30023	30030	25 %	50 %	0 %	25 %	545631696
85	NC_022440	GAAA	2	8	30063	30070	75 %	0 %	25 %	0 %	545631696
86	NC_022440	AATA	2	8	30472	30479	75 %	25 %	0 %	0 %	545631697
87	NC_022440	CTGT	2	8	30531	30538	0 %	50 %	25 %	25 %	545631697
88	NC_022440	AACG	2	8	30629	30636	50 %	0 %	25 %	25 %	545631697
89	NC_022440	TAGG	2	8	31333	31340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022440	GCTA	2	8	31524	31531	25 %	25 %	25 %	25 %	545631698
91	NC_022440	TAAA	2	8	31838	31845	75 %	25 %	0 %	0 %	545631699
92	NC_022440	ATAG	2	8	32032	32039	50 %	25 %	25 %	0 %	545631699
93	NC_022440	CTTT	2	8	32200	32207	0 %	75 %	0 %	25 %	545631699
94	NC_022440	TAGA	2	8	33120	33127	50 %	25 %	25 %	0 %	545631700
95	NC_022440	GTTT	2	8	33651	33658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022440	TCTT	2	8	33793	33800	0 %	75 %	0 %	25 %	545631702
97	NC_022440	AGCT	2	8	33888	33895	25 %	25 %	25 %	25 %	545631702
98	NC_022440	AGAA	2	8	33954	33961	75 %	0 %	25 %	0 %	545631702
99	NC_022440	GAAT	2	8	34369	34376	50 %	25 %	25 %	0 %	545631702
100	NC_022440	GAAG	2	8	34660	34667	50 %	0 %	50 %	0 %	545631702
101	NC_022440	TGCA	2	8	34705	34712	25 %	25 %	25 %	25 %	545631702
102	NC_022440	TTTG	2	8	34842	34849	0 %	75 %	25 %	0 %	545631702
103	NC_022440	CATG	2	8	35081	35088	25 %	25 %	25 %	25 %	545631702
104	NC_022440	AATA	2	8	35345	35352	75 %	25 %	0 %	0 %	545631703
105	NC_022440	AAAT	2	8	35393	35400	75 %	25 %	0 %	0 %	545631703
106	NC_022440	AAAG	3	12	35419	35430	75 %	0 %	25 %	0 %	545631703
107	NC_022440	CTTG	2	8	35918	35925	0 %	50 %	25 %	25 %	545631703
108	NC_022440	TTAA	2	8	35932	35939	50 %	50 %	0 %	0 %	545631703
109	NC_022440	GTTT	2	8	35966	35973	0 %	75 %	25 %	0 %	545631703
110	NC_022440	CAAT	2	8	36634	36641	50 %	25 %	0 %	25 %	545631703
111	NC_022440	GAGT	2	8	36899	36906	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022440	TTGT	2	8	37108	37115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022440	TATT	2	8	38335	38342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022440	GTTA	2	8	38959	38966	25 %	50 %	25 %	0 %	545631706
115	NC_022440	AGCA	2	8	39723	39730	50 %	0 %	25 %	25 %	545631706
116	NC_022440	ATTT	2	8	39969	39976	25 %	75 %	0 %	0 %	545631706
117	NC_022440	CTCC	2	8	40359	40366	0 %	25 %	0 %	75 %	545631706
118	NC_022440	AGAA	2	8	40618	40625	75 %	0 %	25 %	0 %	545631706
119	NC_022440	CATT	2	8	40936	40943	25 %	50 %	0 %	25 %	545631706
120	NC_022440	TCTT	2	8	40951	40958	0 %	75 %	0 %	25 %	545631706
121	NC_022440	GCGT	2	8	41145	41152	0 %	25 %	50 %	25 %	545631706
122	NC_022440	GAAG	2	8	41362	41369	50 %	0 %	50 %	0 %	545631706
123	NC_022440	AATA	2	8	41393	41400	75 %	25 %	0 %	0 %	545631706
124	NC_022440	TTTC	2	8	42238	42245	0 %	75 %	0 %	25 %	545631709
125	NC_022440	TTTC	2	8	43356	43363	0 %	75 %	0 %	25 %	545631711
126	NC_022440	ACGA	2	8	43577	43584	50 %	0 %	25 %	25 %	545631711
127	NC_022440	CGAT	2	8	44203	44210	25 %	25 %	25 %	25 %	545631711
128	NC_022440	TAGA	2	8	44537	44544	50 %	25 %	25 %	0 %	545631712
129	NC_022440	CAGC	2	8	45118	45125	25 %	0 %	25 %	50 %	545631713
130	NC_022440	CTTT	2	8	45925	45932	0 %	75 %	0 %	25 %	545631714
131	NC_022440	GCTC	2	8	46852	46859	0 %	25 %	25 %	50 %	545631714
132	NC_022440	CTTT	2	8	47636	47643	0 %	75 %	0 %	25 %	545631715
133	NC_022440	AAGA	2	8	47801	47808	75 %	0 %	25 %	0 %	545631715
134	NC_022440	CAAT	2	8	47814	47821	50 %	25 %	0 %	25 %	545631715
135	NC_022440	AATT	2	8	48265	48272	50 %	50 %	0 %	0 %	545631715
136	NC_022440	GTAA	2	8	49294	49301	50 %	25 %	25 %	0 %	545631716
137	NC_022440	TAGC	2	8	49991	49998	25 %	25 %	25 %	25 %	545631716
138	NC_022440	CTTA	2	8	50553	50560	25 %	50 %	0 %	25 %	545631716
139	NC_022440	ACAA	2	8	51076	51083	75 %	0 %	0 %	25 %	545631716
140	NC_022440	AGGA	2	8	51503	51510	50 %	0 %	50 %	0 %	545631717
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142	NC_022440	TCGT	2	8	53582	53589	0 %	50 %	25 %	25 %	545631719
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