MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 2707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022439	TGCA	2	8	620	627	25 %	25 %	25 %	25 %	545630755
2	NC_022439	GAAG	2	8	873	880	50 %	0 %	50 %	0 %	545630755
3	NC_022439	TTTA	2	8	914	921	25 %	75 %	0 %	0 %	545630755
4	NC_022439	AGTC	2	8	943	950	25 %	25 %	25 %	25 %	545630755
5	NC_022439	GGGT	2	8	1018	1025	0 %	25 %	75 %	0 %	545630755
6	NC_022439	AGAA	2	8	1669	1676	75 %	0 %	25 %	0 %	545630756
7	NC_022439	TTTG	2	8	3272	3279	0 %	75 %	25 %	0 %	545630758
8	NC_022439	TTTC	2	8	3589	3596	0 %	75 %	0 %	25 %	545630758
9	NC_022439	TTTC	2	8	3649	3656	0 %	75 %	0 %	25 %	545630758
10	NC_022439	TCTT	2	8	4272	4279	0 %	75 %	0 %	25 %	545630758
11	NC_022439	ATAA	2	8	5013	5020	75 %	25 %	0 %	0 %	545630758
12	NC_022439	GTTG	2	8	5067	5074	0 %	50 %	50 %	0 %	545630758
13	NC_022439	AATC	2	8	5383	5390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022439	CTGC	2	8	5635	5642	0 %	25 %	25 %	50 %	545630759
15	NC_022439	ACAT	2	8	6414	6421	50 %	25 %	0 %	25 %	545630759
16	NC_022439	TTAT	2	8	6918	6925	25 %	75 %	0 %	0 %	545630760
17	NC_022439	AGAA	2	8	8240	8247	75 %	0 %	25 %	0 %	545630761
18	NC_022439	TTCG	2	8	8957	8964	0 %	50 %	25 %	25 %	545630761
19	NC_022439	TGAT	2	8	9331	9338	25 %	50 %	25 %	0 %	545630761
20	NC_022439	GCAT	2	8	9340	9347	25 %	25 %	25 %	25 %	545630761
21	NC_022439	AAGC	2	8	10158	10165	50 %	0 %	25 %	25 %	545630761
22	NC_022439	TTTC	2	8	10824	10831	0 %	75 %	0 %	25 %	545630762
23	NC_022439	GGGA	2	8	11004	11011	25 %	0 %	75 %	0 %	545630762
24	NC_022439	GAAG	2	8	11240	11247	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
25	NC_022439	CTTT	2	8	11390	11397	0 %	75 %	0 %	25 %	545630762
26	NC_022439	GTTG	2	8	11681	11688	0 %	50 %	50 %	0 %	545630762
27	NC_022439	GGAA	2	8	11731	11738	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
28	NC_022439	TTTG	2	8	11947	11954	0 %	75 %	25 %	0 %	545630762
29	NC_022439	GAAA	2	8	12059	12066	75 %	0 %	25 %	0 %	545630762
30	NC_022439	GAGG	2	8	12468	12475	25 %	0 %	75 %	0 %	545630762
31	NC_022439	GGAT	2	8	12479	12486	25 %	25 %	50 %	0 %	545630762
32	NC_022439	GATT	2	8	13166	13173	25 %	50 %	25 %	0 %	545630762
33	NC_022439	TTTA	2	8	13396	13403	25 %	75 %	0 %	0 %	545630762
34	NC_022439	AAAT	2	8	13477	13484	75 %	25 %	0 %	0 %	545630762
35	NC_022439	GGAT	2	8	14558	14565	25 %	25 %	50 %	0 %	545630763
36	NC_022439	AAAG	2	8	15462	15469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022439	GTTT	2	8	15547	15554	0 %	75 %	25 %	0 %	545630764
38	NC_022439	TAAA	2	8	16573	16580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022439	GCTT	2	8	16837	16844	0 %	50 %	25 %	25 %	545630765
40	NC_022439	TAAA	2	8	16892	16899	75 %	25 %	0 %	0 %	545630765
41	NC_022439	TCTT	2	8	17050	17057	0 %	75 %	0 %	25 %	545630765
42	NC_022439	GAAA	2	8	17085	17092	75 %	0 %	25 %	0 %	545630765
43	NC_022439	TTTC	2	8	18570	18577	0 %	75 %	0 %	25 %	545630767
44	NC_022439	CGAG	2	8	19191	19198	25 %	0 %	50 %	25 %	545630767
45	NC_022439	TCCC	2	8	19317	19324	0 %	25 %	0 %	75 %	545630767
46	NC_022439	TTTA	2	8	19577	19584	25 %	75 %	0 %	0 %	545630767
47	NC_022439	GCAT	2	8	19666	19673	25 %	25 %	25 %	25 %	545630767
48	NC_022439	AGAA	2	8	20338	20345	75 %	0 %	25 %	0 %	545630768
49	NC_022439	GCAT	2	8	20361	20368	25 %	25 %	25 %	25 %	545630768
50	NC_022439	TGAG	2	8	20568	20575	25 %	25 %	50 %	0 %	545630768
51	NC_022439	CAGC	2	8	20809	20816	25 %	0 %	25 %	50 %	545630768
52	NC_022439	GAAA	2	8	20832	20839	75 %	0 %	25 %	0 %	545630768
53	NC_022439	AACA	2	8	20869	20876	75 %	0 %	0 %	25 %	545630768
54	NC_022439	TGAA	2	8	20904	20911	50 %	25 %	25 %	0 %	545630768
55	NC_022439	ACTA	2	8	21119	21126	50 %	25 %	0 %	25 %	545630768
56	NC_022439	GCTT	2	8	21141	21148	0 %	50 %	25 %	25 %	545630768
57	NC_022439	TCTT	2	8	21291	21298	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022439	ATGA	2	8	21816	21823	50 %	25 %	25 %	0 %	545630769
59	NC_022439	ACAG	2	8	22328	22335	50 %	0 %	25 %	25 %	545630769
60	NC_022439	AAGA	2	8	22523	22530	75 %	0 %	25 %	0 %	545630769
61	NC_022439	TTAA	2	8	22698	22705	50 %	50 %	0 %	0 %	545630769
62	NC_022439	TCAG	2	8	22984	22991	25 %	25 %	25 %	25 %	545630769
63	NC_022439	TGGA	2	8	23227	23234	25 %	25 %	50 %	0 %	545630769
64	NC_022439	CTTT	2	8	23262	23269	0 %	75 %	0 %	25 %	545630769
65	NC_022439	ATAC	2	8	23348	23355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022439	GTAT	2	8	23364	23371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022439	GATA	2	8	23813	23820	50 %	25 %	25 %	0 %	545630770
68	NC_022439	GATA	2	8	24143	24150	50 %	25 %	25 %	0 %	545630770
69	NC_022439	AATT	2	8	24187	24194	50 %	50 %	0 %	0 %	545630770
70	NC_022439	TTAA	2	8	24198	24205	50 %	50 %	0 %	0 %	545630770
71	NC_022439	TGCT	2	8	24221	24228	0 %	50 %	25 %	25 %	545630770
72	NC_022439	TAAA	2	8	24255	24262	75 %	25 %	0 %	0 %	545630770
73	NC_022439	ATTT	2	8	24499	24506	25 %	75 %	0 %	0 %	545630770
74	NC_022439	CCAA	2	8	24725	24732	50 %	0 %	0 %	50 %	545630770
75	NC_022439	GTAT	2	8	24782	24789	25 %	50 %	25 %	0 %	545630770
76	NC_022439	TCCA	2	8	24930	24937	25 %	25 %	0 %	50 %	545630770
77	NC_022439	TCTG	2	8	25530	25537	0 %	50 %	25 %	25 %	545630770
78	NC_022439	TCTT	2	8	26152	26159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022439	TCTT	2	8	26376	26383	0 %	75 %	0 %	25 %	545630771
80	NC_022439	GAAT	2	8	26946	26953	50 %	25 %	25 %	0 %	545630771
81	NC_022439	ATAC	2	8	27752	27759	50 %	25 %	0 %	25 %	545630771
82	NC_022439	CAAG	2	8	28024	28031	50 %	0 %	25 %	25 %	545630771
83	NC_022439	CTTC	2	8	28051	28058	0 %	50 %	0 %	50 %	545630771
84	NC_022439	GAAA	2	8	29783	29790	75 %	0 %	25 %	0 %	545630773
85	NC_022439	TCTA	2	8	30025	30032	25 %	50 %	0 %	25 %	545630774
86	NC_022439	GAAA	2	8	30065	30072	75 %	0 %	25 %	0 %	545630774
87	NC_022439	AATA	2	8	30474	30481	75 %	25 %	0 %	0 %	545630775
88	NC_022439	CTGT	2	8	30533	30540	0 %	50 %	25 %	25 %	545630775
89	NC_022439	AACG	2	8	30631	30638	50 %	0 %	25 %	25 %	545630775
90	NC_022439	TAGG	2	8	31335	31342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022439	GCTA	2	8	31526	31533	25 %	25 %	25 %	25 %	545630776
92	NC_022439	TAAA	2	8	31840	31847	75 %	25 %	0 %	0 %	545630777
93	NC_022439	ATAG	2	8	32034	32041	50 %	25 %	25 %	0 %	545630777
94	NC_022439	CTTT	2	8	32202	32209	0 %	75 %	0 %	25 %	545630777
95	NC_022439	TAGA	2	8	33122	33129	50 %	25 %	25 %	0 %	545630778
96	NC_022439	GTTT	2	8	33653	33660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022439	TCTT	2	8	33795	33802	0 %	75 %	0 %	25 %	545630780
98	NC_022439	AGCT	2	8	33890	33897	25 %	25 %	25 %	25 %	545630780
99	NC_022439	AGAA	2	8	33956	33963	75 %	0 %	25 %	0 %	545630780
100	NC_022439	GAAT	2	8	34371	34378	50 %	25 %	25 %	0 %	545630780
101	NC_022439	GAAG	2	8	34662	34669	50 %	0 %	50 %	0 %	545630780
102	NC_022439	TGCA	2	8	34707	34714	25 %	25 %	25 %	25 %	545630780
103	NC_022439	TTTG	2	8	34844	34851	0 %	75 %	25 %	0 %	545630780
104	NC_022439	CATG	2	8	35083	35090	25 %	25 %	25 %	25 %	545630780
105	NC_022439	AATA	2	8	35346	35353	75 %	25 %	0 %	0 %	545630781
106	NC_022439	AAAT	2	8	35394	35401	75 %	25 %	0 %	0 %	545630781
107	NC_022439	AAAG	3	12	35420	35431	75 %	0 %	25 %	0 %	545630781
108	NC_022439	CTTG	2	8	35919	35926	0 %	50 %	25 %	25 %	545630781
109	NC_022439	TTAA	2	8	35933	35940	50 %	50 %	0 %	0 %	545630781
110	NC_022439	GTTT	2	8	35967	35974	0 %	75 %	25 %	0 %	545630781
111	NC_022439	CAAT	2	8	36635	36642	50 %	25 %	0 %	25 %	545630781
112	NC_022439	GAGT	2	8	36900	36907	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022439	TTGT	2	8	37109	37116	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022439	TATT	2	8	38336	38343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022439	GTTA	2	8	38960	38967	25 %	50 %	25 %	0 %	545630784
116	NC_022439	GTTG	2	8	39019	39026	0 %	50 %	50 %	0 %	545630784
117	NC_022439	AGCA	2	8	39724	39731	50 %	0 %	25 %	25 %	545630784
118	NC_022439	ATTT	2	8	39970	39977	25 %	75 %	0 %	0 %	545630784
119	NC_022439	CTCC	2	8	40360	40367	0 %	25 %	0 %	75 %	545630784
120	NC_022439	AGAA	2	8	40619	40626	75 %	0 %	25 %	0 %	545630784
121	NC_022439	CATT	2	8	40937	40944	25 %	50 %	0 %	25 %	545630784
122	NC_022439	TCTT	2	8	40952	40959	0 %	75 %	0 %	25 %	545630784
123	NC_022439	GCGT	2	8	41146	41153	0 %	25 %	50 %	25 %	545630784
124	NC_022439	GAAG	2	8	41363	41370	50 %	0 %	50 %	0 %	545630784
125	NC_022439	AATA	2	8	41394	41401	75 %	25 %	0 %	0 %	545630784
126	NC_022439	TTTC	2	8	42242	42249	0 %	75 %	0 %	25 %	545630787
127	NC_022439	TTTC	2	8	43360	43367	0 %	75 %	0 %	25 %	545630789
128	NC_022439	ACGA	2	8	43581	43588	50 %	0 %	25 %	25 %	545630789
129	NC_022439	CGAT	2	8	44207	44214	25 %	25 %	25 %	25 %	545630789
130	NC_022439	TAGA	2	8	44541	44548	50 %	25 %	25 %	0 %	545630790
131	NC_022439	CTTT	2	8	45932	45939	0 %	75 %	0 %	25 %	545630792
132	NC_022439	GCTC	2	8	46859	46866	0 %	25 %	25 %	50 %	545630792
133	NC_022439	CTTT	2	8	47643	47650	0 %	75 %	0 %	25 %	545630793
134	NC_022439	AAGA	2	8	47808	47815	75 %	0 %	25 %	0 %	545630793
135	NC_022439	CAAT	2	8	47821	47828	50 %	25 %	0 %	25 %	545630793
136	NC_022439	AATT	2	8	48272	48279	50 %	50 %	0 %	0 %	545630793
137	NC_022439	GTAA	2	8	49301	49308	50 %	25 %	25 %	0 %	545630794
138	NC_022439	TAGC	2	8	49998	50005	25 %	25 %	25 %	25 %	545630794
139	NC_022439	CTTA	2	8	50560	50567	25 %	50 %	0 %	25 %	545630794
140	NC_022439	ACAA	2	8	51083	51090	75 %	0 %	0 %	25 %	545630794
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