MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 1028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022439	CCA	2	6	63	68	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022439	AGA	3	9	76	84	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022439	TAT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022439	CAA	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022439	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022439	CTA	2	6	16460	16465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022439	AAT	2	6	16476	16481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022439	TCG	2	6	16528	16533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022439	AGA	2	6	16534	16539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022439	AAT	2	6	16582	16587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022439	TTA	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022439	TAA	2	6	21352	21357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022439	TGT	2	6	21369	21374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022439	GTT	2	6	26216	26221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022439	TAA	2	6	26286	26291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022439	TGT	2	6	26299	26304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022439	TGG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022439	CTT	2	6	28896	28901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022439	GAG	2	6	28921	28926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022439	GAA	2	6	31468	31473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022439	TTA	2	6	32867	32872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022439	CTA	2	6	37018	37023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022439	GAA	2	6	37049	37054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022439	TTA	2	6	37073	37078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022439	TCA	2	6	38253	38258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022439	ATG	2	6	38395	38400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022439	AGG	2	6	38470	38475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022439	ACA	2	6	38517	38522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022439	TTA	2	6	41411	41416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022439	TAT	2	6	51283	51288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022439	GAA	2	6	51305	51310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022439	GTC	2	6	51424	51429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022439	AAT	2	6	53133	53138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022439	AAC	2	6	53164	53169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022439	ATA	2	6	53354	53359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022439	ATA	2	6	53433	53438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022439	GAA	2	6	56507	56512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022439	ATT	2	6	56670	56675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022439	AGA	2	6	56716	56721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022439	AAC	2	6	56770	56775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022439	GGC	2	6	58031	58036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022439	AGG	2	6	58091	58096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022439	AGG	2	6	58242	58247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022439	TCT	2	6	58335	58340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022439	TGT	2	6	58379	58384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022439	TGA	2	6	58431	58436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022439	TTA	2	6	62844	62849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022439	GAA	2	6	62908	62913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022439	CTT	3	9	62923	62931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022439	CTT	2	6	62976	62981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022439	TTG	2	6	62998	63003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022439	GGA	2	6	63027	63032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022439	AGG	2	6	68614	68619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022439	CTT	2	6	68634	68639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022439	GAA	2	6	68642	68647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022439	GAG	2	6	68657	68662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022439	TAA	2	6	69525	69530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022439	CTT	2	6	70470	70475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022439	AAC	2	6	70507	70512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022439	GAA	2	6	70554	70559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022439	TAT	2	6	72548	72553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022439	GTT	2	6	75877	75882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022439	TAA	2	6	75919	75924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022439	GTG	2	6	80696	80701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022439	TGC	2	6	80730	80735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022439	TAT	2	6	90704	90709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022439	TGA	2	6	90792	90797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022439	TCT	3	9	90877	90885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022439	TGC	2	6	90948	90953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022439	ATT	2	6	91052	91057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022439	AAG	2	6	95806	95811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022439	AGG	2	6	95955	95960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022439	AGA	2	6	101109	101114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022439	TAT	2	6	103427	103432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022439	GCT	2	6	104655	104660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022439	GTC	2	6	104674	104679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022439	TTA	2	6	104680	104685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022439	GTA	2	6	104690	104695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022439	AGA	2	6	105374	105379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022439	AAT	2	6	111242	111247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022439	GAT	2	6	118877	118882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022439	AGA	2	6	118958	118963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022439	TGG	2	6	119016	119021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022439	AGG	2	6	119937	119942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022439	AGA	2	6	119979	119984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022439	GTG	2	6	119996	120001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022439	TGT	2	6	120094	120099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022439	ATC	2	6	124466	124471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022439	GCA	2	6	124529	124534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022439	CTA	2	6	124540	124545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022439	CTA	2	6	124563	124568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022439	GTA	2	6	124621	124626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022439	AGG	2	6	126131	126136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022439	CCT	2	6	126149	126154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022439	TGA	2	6	126172	126177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022439	GTA	2	6	126190	126195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022439	AGC	2	6	126454	126459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022439	TAA	2	6	126460	126465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022439	ATA	2	6	127298	127303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022439	TCT	2	6	129047	129052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022439	AAC	2	6	137183	137188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022439	AGA	2	6	138573	138578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022439	GTA	2	6	138618	138623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022439	ATG	2	6	138647	138652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022439	CAT	2	6	138674	138679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022439	GTT	2	6	141935	141940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022439	CTT	2	6	142043	142048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022439	TTG	2	6	142056	142061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022439	CTT	2	6	142077	142082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022439	GAA	2	6	142133	142138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022439	ATT	2	6	142308	142313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022439	GAG	2	6	151647	151652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022439	GAA	2	6	153873	153878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022439	GGT	2	6	153945	153950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022439	CTT	2	6	154008	154013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022439	TCT	2	6	154016	154021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022439	GAA	2	6	156591	156596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022439	TAT	2	6	156616	156621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022439	ACC	2	6	156681	156686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022439	ATT	2	6	158057	158062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022439	TGT	2	6	162401	162406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022439	TAG	2	6	163265	163270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022439	GAT	2	6	163283	163288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022439	GGT	2	6	166693	166698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022439	AAG	2	6	166699	166704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022439	AAG	2	6	166741	166746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022439	CTC	2	6	168548	168553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_022439	TCT	2	6	169818	169823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022439	TAA	2	6	172533	172538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022439	ATT	2	6	172551	172556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022439	TAT	2	6	178652	178657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022439	TAA	2	6	178713	178718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022439	ATT	2	6	178726	178731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022439	TTG	2	6	178758	178763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022439	TAG	2	6	178782	178787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022439	TGT	2	6	178878	178883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022439	TAA	2	6	180196	180201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022439	GAA	2	6	180208	180213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022439	TTA	2	6	184457	184462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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