MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 2387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022439	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022439	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022439	AG	3	6	855	860	50 %	0 %	50 %	0 %	545630755
4	NC_022439	CG	3	6	1069	1074	0 %	0 %	50 %	50 %	545630755
5	NC_022439	AC	3	6	1758	1763	50 %	0 %	0 %	50 %	545630756
6	NC_022439	GT	3	6	1899	1904	0 %	50 %	50 %	0 %	545630756
7	NC_022439	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	545630756
8	NC_022439	TG	3	6	2121	2126	0 %	50 %	50 %	0 %	545630756
9	NC_022439	TG	3	6	3056	3061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022439	TA	3	6	3936	3941	50 %	50 %	0 %	0 %	545630758
11	NC_022439	CT	3	6	4155	4160	0 %	50 %	0 %	50 %	545630758
12	NC_022439	TA	3	6	4369	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	545630758
13	NC_022439	TC	3	6	4840	4845	0 %	50 %	0 %	50 %	545630758
14	NC_022439	GA	4	8	4934	4941	50 %	0 %	50 %	0 %	545630758
15	NC_022439	GC	3	6	4974	4979	0 %	0 %	50 %	50 %	545630758
16	NC_022439	TC	3	6	5822	5827	0 %	50 %	0 %	50 %	545630759
17	NC_022439	GT	3	6	5879	5884	0 %	50 %	50 %	0 %	545630759
18	NC_022439	AT	3	6	6508	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	545630759
19	NC_022439	AG	3	6	7229	7234	50 %	0 %	50 %	0 %	545630760
20	NC_022439	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	545630761
21	NC_022439	GA	3	6	7904	7909	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
22	NC_022439	GA	3	6	8086	8091	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
23	NC_022439	AG	4	8	8175	8182	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
24	NC_022439	GA	3	6	8315	8320	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
25	NC_022439	AG	3	6	8457	8462	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
26	NC_022439	GA	3	6	8903	8908	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
27	NC_022439	AG	3	6	9064	9069	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
28	NC_022439	AG	3	6	9912	9917	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
29	NC_022439	AG	3	6	10072	10077	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
30	NC_022439	GA	3	6	10116	10121	50 %	0 %	50 %	0 %	545630761
31	NC_022439	TG	3	6	10125	10130	0 %	50 %	50 %	0 %	545630761
32	NC_022439	AG	4	8	10776	10783	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
33	NC_022439	GA	3	6	11048	11053	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
34	NC_022439	AC	3	6	11160	11165	50 %	0 %	0 %	50 %	545630762
35	NC_022439	GA	3	6	11367	11372	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
36	NC_022439	GA	3	6	11445	11450	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
37	NC_022439	GA	3	6	11664	11669	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
38	NC_022439	AG	3	6	11800	11805	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
39	NC_022439	GA	3	6	11932	11937	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
40	NC_022439	AG	3	6	12226	12231	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
41	NC_022439	AG	3	6	12762	12767	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
42	NC_022439	GA	3	6	12795	12800	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
43	NC_022439	GA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
44	NC_022439	GA	4	8	13353	13360	50 %	0 %	50 %	0 %	545630762
45	NC_022439	TA	3	6	13791	13796	50 %	50 %	0 %	0 %	545630763
46	NC_022439	CT	3	6	14190	14195	0 %	50 %	0 %	50 %	545630763
47	NC_022439	TG	3	6	14336	14341	0 %	50 %	50 %	0 %	545630763
48	NC_022439	TC	3	6	14618	14623	0 %	50 %	0 %	50 %	545630763
49	NC_022439	AT	3	6	15229	15234	50 %	50 %	0 %	0 %	545630763
50	NC_022439	TG	3	6	15266	15271	0 %	50 %	50 %	0 %	545630763
51	NC_022439	TA	3	6	15477	15482	50 %	50 %	0 %	0 %	545630764
52	NC_022439	CT	3	6	16275	16280	0 %	50 %	0 %	50 %	545630764
53	NC_022439	GT	3	6	17260	17265	0 %	50 %	50 %	0 %	545630765
54	NC_022439	TC	4	8	17271	17278	0 %	50 %	0 %	50 %	545630765
55	NC_022439	AG	3	6	18845	18850	50 %	0 %	50 %	0 %	545630767
56	NC_022439	GC	3	6	19051	19056	0 %	0 %	50 %	50 %	545630767
57	NC_022439	AT	3	6	20036	20041	50 %	50 %	0 %	0 %	545630768
58	NC_022439	CT	3	6	20735	20740	0 %	50 %	0 %	50 %	545630768
59	NC_022439	TG	4	8	20780	20787	0 %	50 %	50 %	0 %	545630768
60	NC_022439	CA	3	6	23279	23284	50 %	0 %	0 %	50 %	545630769
61	NC_022439	AG	3	6	23435	23440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022439	GC	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	545630770
63	NC_022439	AG	3	6	26523	26528	50 %	0 %	50 %	0 %	545630771
64	NC_022439	GA	3	6	27164	27169	50 %	0 %	50 %	0 %	545630771
65	NC_022439	GC	3	6	28038	28043	0 %	0 %	50 %	50 %	545630771
66	NC_022439	AG	3	6	28299	28304	50 %	0 %	50 %	0 %	545630771
67	NC_022439	CA	3	6	28943	28948	50 %	0 %	0 %	50 %	545630772
68	NC_022439	TG	3	6	29115	29120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022439	AG	3	6	29252	29257	50 %	0 %	50 %	0 %	545630773
70	NC_022439	AG	3	6	29879	29884	50 %	0 %	50 %	0 %	545630774
71	NC_022439	CA	4	8	30321	30328	50 %	0 %	0 %	50 %	545630774
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73	NC_022439	GA	3	6	30749	30754	50 %	0 %	50 %	0 %	545630775
74	NC_022439	GA	3	6	32113	32118	50 %	0 %	50 %	0 %	545630777
75	NC_022439	GT	3	6	32160	32165	0 %	50 %	50 %	0 %	545630777
76	NC_022439	AG	3	6	32631	32636	50 %	0 %	50 %	0 %	545630777
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78	NC_022439	GA	3	6	32915	32920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022439	AT	3	6	33082	33087	50 %	50 %	0 %	0 %	545630778
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82	NC_022439	TA	3	6	33273	33278	50 %	50 %	0 %	0 %	545630779
83	NC_022439	AT	3	6	33537	33542	50 %	50 %	0 %	0 %	545630779
84	NC_022439	AG	3	6	34004	34009	50 %	0 %	50 %	0 %	545630780
85	NC_022439	AG	3	6	35633	35638	50 %	0 %	50 %	0 %	545630781
86	NC_022439	CG	3	6	36832	36837	0 %	0 %	50 %	50 %	545630781
87	NC_022439	TA	3	6	37136	37141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022439	AG	3	6	37474	37479	50 %	0 %	50 %	0 %	545630782
89	NC_022439	CT	3	6	37699	37704	0 %	50 %	0 %	50 %	545630782
90	NC_022439	AT	3	6	38117	38122	50 %	50 %	0 %	0 %	545630782
91	NC_022439	AT	3	6	42454	42459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022439	CT	3	6	42606	42611	0 %	50 %	0 %	50 %	545630788
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97	NC_022439	GT	3	6	43463	43468	0 %	50 %	50 %	0 %	545630789
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99	NC_022439	TA	3	6	44723	44728	50 %	50 %	0 %	0 %	545630790
100	NC_022439	GT	3	6	46102	46107	0 %	50 %	50 %	0 %	545630792
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102	NC_022439	AG	3	6	46637	46642	50 %	0 %	50 %	0 %	545630792
103	NC_022439	AG	4	8	48074	48081	50 %	0 %	50 %	0 %	545630793
104	NC_022439	AT	3	6	49485	49490	50 %	50 %	0 %	0 %	545630794
105	NC_022439	TA	4	8	50250	50257	50 %	50 %	0 %	0 %	545630794
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108	NC_022439	GA	3	6	54628	54633	50 %	0 %	50 %	0 %	545630798
109	NC_022439	TC	3	6	55164	55169	0 %	50 %	0 %	50 %	545630799
110	NC_022439	TC	3	6	55568	55573	0 %	50 %	0 %	50 %	545630799
111	NC_022439	GA	3	6	55712	55717	50 %	0 %	50 %	0 %	545630800
112	NC_022439	TC	3	6	56127	56132	0 %	50 %	0 %	50 %	545630800
113	NC_022439	GA	3	6	56250	56255	50 %	0 %	50 %	0 %	545630800
114	NC_022439	AT	3	6	56450	56455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022439	GA	3	6	56687	56692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022439	TA	3	6	57425	57430	50 %	50 %	0 %	0 %	545630801
117	NC_022439	TC	3	6	57659	57664	0 %	50 %	0 %	50 %	545630801
118	NC_022439	AC	3	6	58128	58133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022439	TG	3	6	58193	58198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022439	TG	3	6	58440	58445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022439	GT	3	6	59100	59105	0 %	50 %	50 %	0 %	545630802
122	NC_022439	GA	3	6	59351	59356	50 %	0 %	50 %	0 %	545630802
123	NC_022439	AG	3	6	59692	59697	50 %	0 %	50 %	0 %	545630802
124	NC_022439	CT	3	6	60145	60150	0 %	50 %	0 %	50 %	545630802
125	NC_022439	CT	3	6	60912	60917	0 %	50 %	0 %	50 %	545630802
126	NC_022439	TG	3	6	61530	61535	0 %	50 %	50 %	0 %	545630802
127	NC_022439	AG	3	6	61691	61696	50 %	0 %	50 %	0 %	545630802
128	NC_022439	GA	3	6	61753	61758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022439	TA	3	6	62205	62210	50 %	50 %	0 %	0 %	545630803
130	NC_022439	GA	3	6	63053	63058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022439	TG	3	6	63946	63951	0 %	50 %	50 %	0 %	545630804
132	NC_022439	AG	3	6	64040	64045	50 %	0 %	50 %	0 %	545630804
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135	NC_022439	CT	3	6	64891	64896	0 %	50 %	0 %	50 %	545630805
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139	NC_022439	AG	3	6	65679	65684	50 %	0 %	50 %	0 %	545630806
140	NC_022439	GA	3	6	65882	65887	50 %	0 %	50 %	0 %	545630806
141	NC_022439	TA	3	6	66622	66627	50 %	50 %	0 %	0 %	545630807
142	NC_022439	TA	3	6	66721	66726	50 %	50 %	0 %	0 %	545630807
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