MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia pecorum PV3056/3

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022439	TC	3	6	32	37	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022439	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022439	TG	3	6	3056	3061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022439	AG	3	6	23435	23440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022439	TG	3	6	29115	29120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022439	GA	3	6	32915	32920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022439	TA	3	6	37136	37141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022439	AT	3	6	42454	42459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022439	AT	3	6	56450	56455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022439	GA	3	6	56687	56692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022439	AC	3	6	58128	58133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022439	TG	3	6	58193	58198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022439	TG	3	6	58440	58445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022439	GA	3	6	61753	61758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022439	GA	3	6	63053	63058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022439	AG	3	6	68701	68706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022439	TG	4	8	75864	75871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022439	AG	3	6	78254	78259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022439	CA	3	6	80661	80666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022439	TA	3	6	90801	90806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022439	GT	3	6	90931	90936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022439	CT	3	6	95944	95949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022439	TA	3	6	96021	96026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022439	GC	3	6	98121	98126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022439	TA	4	8	103446	103453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022439	GT	3	6	108629	108634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022439	TG	3	6	119926	119931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022439	AG	3	6	124584	124589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022439	TA	3	6	126107	126112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022439	CT	3	6	126385	126390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022439	AG	3	6	126502	126507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022439	GA	3	6	135831	135836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022439	TC	3	6	137234	137239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022439	AG	3	6	148256	148261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022439	GA	3	6	151635	151640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022439	AG	3	6	156732	156737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022439	AC	3	6	158069	158074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022439	AT	3	6	178871	178876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022439	AT	3	6	189609	189614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022439	TC	3	6	198392	198397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022439	GA	3	6	198479	198484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022439	CA	3	6	203890	203895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022439	AG	3	6	203914	203919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022439	AG	3	6	204263	204268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022439	GA	3	6	208130	208135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022439	GT	3	6	208170	208175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022439	CT	3	6	208207	208212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022439	AT	3	6	216392	216397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022439	TG	3	6	217194	217199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022439	TC	3	6	219612	219617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022439	AG	4	8	227246	227253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022439	CT	3	6	227587	227592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022439	TA	3	6	230910	230915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022439	CT	3	6	233886	233891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022439	TC	3	6	258291	258296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022439	AG	3	6	264828	264833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022439	GA	3	6	271874	271879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022439	GA	3	6	282904	282909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022439	CA	3	6	283073	283078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022439	AT	4	8	297148	297155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022439	GC	3	6	298766	298771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022439	AG	3	6	298930	298935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022439	CT	3	6	299375	299380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022439	AG	3	6	302873	302878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022439	AT	3	6	314736	314741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022439	AG	3	6	325882	325887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022439	TA	4	8	330117	330124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022439	TC	3	6	331983	331988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022439	AG	3	6	332156	332161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022439	CT	3	6	333138	333143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022439	TG	3	6	344448	344453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022439	AG	3	6	344460	344465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022439	AG	3	6	353718	353723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022439	TA	3	6	357330	357335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022439	AG	3	6	358136	358141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022439	AG	3	6	368967	368972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022439	AG	3	6	369578	369583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022439	TG	3	6	376660	376665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022439	TA	3	6	382379	382384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022439	TA	3	6	388995	389000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022439	CA	3	6	396251	396256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022439	GA	3	6	398977	398982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022439	AG	3	6	403368	403373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022439	AT	3	6	403394	403399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022439	GC	3	6	403440	403445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022439	GT	3	6	405730	405735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022439	TC	4	8	405789	405796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022439	TG	3	6	405815	405820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022439	GA	3	6	413783	413788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022439	AG	3	6	425880	425885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022439	CA	3	6	431206	431211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022439	AT	3	6	451507	451512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022439	GT	3	6	454444	454449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022439	TG	3	6	454603	454608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022439	CT	3	6	460698	460703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022439	AG	4	8	462118	462125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022439	TA	3	6	464476	464481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022439	AG	3	6	464590	464595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022439	TA	3	6	464785	464790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022439	AG	3	6	478955	478960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022439	TC	3	6	478965	478970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022439	AT	3	6	484644	484649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022439	AC	3	6	498465	498470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022439	AG	4	8	498490	498497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022439	GA	3	6	503181	503186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022439	TA	3	6	507519	507524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022439	TA	3	6	522748	522753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022439	AG	3	6	544073	544078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022439	AT	3	6	544750	544755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022439	TA	3	6	556014	556019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022439	GA	3	6	556099	556104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022439	GA	3	6	558698	558703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022439	TG	3	6	558805	558810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022439	TA	3	6	559797	559802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022439	CT	3	6	568028	568033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022439	CT	3	6	570535	570540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022439	AC	3	6	570601	570606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022439	CT	3	6	571274	571279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022439	TG	3	6	579782	579787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022439	CT	3	6	581682	581687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022439	TC	3	6	589036	589041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022439	AG	3	6	589742	589747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022439	CT	3	6	590607	590612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022439	TA	3	6	590680	590685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022439	TA	3	6	591520	591525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022439	GT	3	6	595643	595648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022439	AG	3	6	598538	598543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022439	CT	3	6	598641	598646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022439	AT	4	8	600391	600398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022439	TC	3	6	600592	600597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022439	TC	3	6	601057	601062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022439	AT	3	6	601145	601150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022439	AT	3	6	601999	602004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022439	AG	3	6	602282	602287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022439	TC	3	6	602332	602337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022439	AT	3	6	612765	612770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022439	TA	3	6	613012	613017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022439	TA	3	6	613076	613081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022439	TC	3	6	613686	613691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022439	CT	3	6	613698	613703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022439	TC	3	6	613745	613750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022439	TC	3	6	613823	613828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022439	TC	3	6	614110	614115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022439	CT	3	6	626622	626627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022439	TC	3	6	633462	633467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022439	CA	3	6	633497	633502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022439	GA	3	6	634593	634598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022439	TC	3	6	634658	634663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022439	TC	5	10	646213	646222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022439	CT	3	6	649363	649368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022439	AG	3	6	651150	651155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022439	TA	3	6	651369	651374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022439	CA	3	6	652134	652139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022439	CT	3	6	654892	654897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.