MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leifsonia xyli subsp. cynodontis DSM 46306

Total Repeats: 52167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022438	GCA	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022438	AAT	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022438	GGC	2	6	233	238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022438	CAT	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628284
5	NC_022438	GAT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628284
6	NC_022438	AGC	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
7	NC_022438	CTC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628284
8	NC_022438	ACA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628284
9	NC_022438	ACG	2	6	467	472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
10	NC_022438	TCG	2	6	480	485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628284
11	NC_022438	CAG	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
12	NC_022438	CAC	2	6	579	584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628284
13	NC_022438	CGC	3	9	679	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628284
14	NC_022438	CCT	2	6	766	771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628284
15	NC_022438	TCA	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628284
16	NC_022438	CAA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628284
17	NC_022438	TTC	2	6	974	979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628284
18	NC_022438	CAA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628284
19	NC_022438	GAC	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
20	NC_022438	CGA	3	9	1333	1341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
21	NC_022438	CAT	2	6	1363	1368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628284
22	NC_022438	GGA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628284
23	NC_022438	AAG	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628284
24	NC_022438	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628284
25	NC_022438	TTA	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022438	GTC	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022438	GAG	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022438	TTG	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022438	CAG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022438	GGA	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628285
31	NC_022438	GCT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628285
32	NC_022438	GGA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628285
33	NC_022438	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628285
34	NC_022438	CAG	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628285
35	NC_022438	GAC	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628285
36	NC_022438	ACA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628285
37	NC_022438	ACG	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628285
38	NC_022438	CGA	2	6	2739	2744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628285
39	NC_022438	CTC	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628285
40	NC_022438	CCG	2	6	2820	2825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628285
41	NC_022438	TGA	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628285
42	NC_022438	CCG	2	6	2867	2872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628285
43	NC_022438	CCG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628285
44	NC_022438	CAA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628285
45	NC_022438	TCA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628285
46	NC_022438	CAA	2	6	3298	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628286
47	NC_022438	GAA	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628286
48	NC_022438	CGC	2	6	3397	3402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628286
49	NC_022438	CTG	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628286
50	NC_022438	CGG	2	6	3511	3516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628286
51	NC_022438	CGC	2	6	3547	3552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628286
52	NC_022438	GCT	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628286
53	NC_022438	CGG	2	6	3640	3645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628286
54	NC_022438	GCT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628286
55	NC_022438	CAT	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628286
56	NC_022438	CTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628286
57	NC_022438	CTG	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628286
58	NC_022438	AAC	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628286
59	NC_022438	CGC	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628286
60	NC_022438	CGG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628286
61	NC_022438	CCT	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628287
62	NC_022438	TCG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628287
63	NC_022438	ACG	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628287
64	NC_022438	GGC	2	6	4426	4431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628287
65	NC_022438	GTT	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545628287
66	NC_022438	GGA	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628287
67	NC_022438	CCG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628287
68	NC_022438	CTC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628287
69	NC_022438	CTG	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628287
70	NC_022438	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628287
71	NC_022438	GAC	2	6	4811	4816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628287
72	NC_022438	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628287
73	NC_022438	GCT	2	6	4828	4833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628287
74	NC_022438	GAG	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628287
75	NC_022438	GAC	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628287
76	NC_022438	CGA	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628287
77	NC_022438	CCG	2	6	5110	5115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628287
78	NC_022438	CCG	2	6	5199	5204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628287
79	NC_022438	TCA	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628287
80	NC_022438	CGG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628287
81	NC_022438	CGC	2	6	5266	5271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628287
82	NC_022438	CGC	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628288
83	NC_022438	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628288
84	NC_022438	GAC	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628288
85	NC_022438	TGC	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628288
86	NC_022438	GTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022438	GAA	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022438	TCG	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
89	NC_022438	ACA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628289
90	NC_022438	AGA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628289
91	NC_022438	CGG	2	6	6249	6254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628289
92	NC_022438	GGC	2	6	6256	6261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628289
93	NC_022438	CGG	2	6	6273	6278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628289
94	NC_022438	GTG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545628289
95	NC_022438	GGC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628289
96	NC_022438	GAG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628289
97	NC_022438	TCT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628289
98	NC_022438	CAG	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
99	NC_022438	CAA	2	6	6525	6530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545628289
100	NC_022438	CGC	2	6	6666	6671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628289
101	NC_022438	GAA	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628289
102	NC_022438	ATC	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628289
103	NC_022438	GGA	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628289
104	NC_022438	GAC	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
105	NC_022438	GAA	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628289
106	NC_022438	CAC	2	6	6855	6860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628289
107	NC_022438	GAA	2	6	6885	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628289
108	NC_022438	CGA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
109	NC_022438	CCG	2	6	6947	6952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628289
110	NC_022438	ATC	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628289
111	NC_022438	TCG	2	6	7136	7141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
112	NC_022438	CTG	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
113	NC_022438	GCG	2	6	7187	7192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628289
114	NC_022438	TCG	2	6	7253	7258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
115	NC_022438	TCC	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628289
116	NC_022438	GAT	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628289
117	NC_022438	CTG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
118	NC_022438	GCC	2	6	7578	7583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628289
119	NC_022438	CGA	3	9	7611	7619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
120	NC_022438	CGC	2	6	7668	7673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628289
121	NC_022438	ACC	2	6	7753	7758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628289
122	NC_022438	GCT	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628289
123	NC_022438	CGA	2	6	7797	7802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
124	NC_022438	CGA	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628289
125	NC_022438	CAC	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628289
126	NC_022438	AGA	2	6	7874	7879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628289
127	NC_022438	TGA	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022438	CGA	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628290
129	NC_022438	ATC	2	6	8066	8071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628290
130	NC_022438	GCC	2	6	8333	8338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628290
131	NC_022438	CGA	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628290
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163	NC_022438	GCC	2	6	9815	9820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628290
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256	NC_022438	CTT	2	6	15266	15271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628297
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258	NC_022438	GCC	2	6	15324	15329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628297
259	NC_022438	GGC	2	6	15363	15368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628297
260	NC_022438	CGC	2	6	15431	15436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_022438	GCG	2	6	15522	15527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_022438	CGA	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_022438	CGG	2	6	15583	15588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_022438	AGT	2	6	15654	15659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_022438	GGC	2	6	15771	15776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628298
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272	NC_022438	CGC	2	6	16163	16168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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370	NC_022438	GCT	2	6	21952	21957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628306
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385	NC_022438	TGA	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628306
386	NC_022438	TCG	2	6	22888	22893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628306
387	NC_022438	CGC	2	6	22907	22912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628306
388	NC_022438	CCT	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628306
389	NC_022438	ACG	2	6	22945	22950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628306
390	NC_022438	GAG	2	6	22973	22978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628306
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392	NC_022438	GGC	2	6	23083	23088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_022438	CGG	2	6	23115	23120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_022438	GAC	2	6	23181	23186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
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400	NC_022438	GCG	2	6	23601	23606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
401	NC_022438	CGG	2	6	23665	23670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
402	NC_022438	CGA	2	6	23677	23682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
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412	NC_022438	GCC	2	6	23981	23986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
413	NC_022438	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
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420	NC_022438	CGA	2	6	24286	24291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
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423	NC_022438	CGC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
424	NC_022438	GCG	3	9	24522	24530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
425	NC_022438	CGA	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
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428	NC_022438	CTG	2	6	24874	24879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_022438	TTC	2	6	24914	24919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628308
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433	NC_022438	CCA	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628308
434	NC_022438	CCG	2	6	25274	25279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
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441	NC_022438	CGC	2	6	25707	25712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
442	NC_022438	TGA	2	6	25725	25730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628308
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459	NC_022438	CGA	2	6	26596	26601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
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499	NC_022438	GAC	2	6	28380	28385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628310
500	NC_022438	CCT	2	6	28520	28525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628310

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