MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	GCAGTT	2	12	473	484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545625501
2	NC_022436	GTGCTG	2	12	2675	2686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	545625504
3	NC_022436	TGCGCA	2	12	2707	2718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545625504
4	NC_022436	GGCAAG	2	12	3827	3838	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545625504
5	NC_022436	CGAATC	2	12	4588	4599	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545625504
6	NC_022436	GAGCAG	2	12	5047	5058	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	545625505
7	NC_022436	TGCCCC	2	12	5990	6001	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545625505
8	NC_022436	GATCCC	2	12	8622	8633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545625507
9	NC_022436	GCCTGG	2	12	10029	10040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625509
10	NC_022436	CCCTGG	2	12	10815	10826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625509
11	NC_022436	CCGGGT	2	12	12900	12911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625512
12	NC_022436	GCAGGG	2	12	16371	16382	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	545625515
13	NC_022436	GCGTCG	2	12	17518	17529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625516
14	NC_022436	TGCCGG	2	12	17847	17858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625517
15	NC_022436	CCCAGC	2	12	18738	18749	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	545625518
16	NC_022436	CGGGCG	2	12	19857	19868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545625519
17	NC_022436	GTGCCC	2	12	20621	20632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625519
18	NC_022436	GTCAGG	2	12	22001	22012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545625520
19	NC_022436	CACGGC	2	12	25306	25317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	545625523
20	NC_022436	GCCTGC	2	12	26320	26331	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625524
21	NC_022436	GCCCGT	2	12	28876	28887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625527
22	NC_022436	GTGGCG	2	12	31021	31032	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	545625529
23	NC_022436	CAAGGC	2	12	36912	36923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545625532
24	NC_022436	TGCCCG	2	12	55415	55426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625542
25	NC_022436	ATCTGG	2	12	56446	56457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545625543
26	NC_022436	ATGCCA	2	12	57132	57143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545625544
27	NC_022436	GGCAGG	2	12	59462	59473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	545625545
28	NC_022436	CAGCTC	2	12	60899	60910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545625546
29	NC_022436	TGCAGG	2	12	61230	61241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545625546
30	NC_022436	GCACCA	2	12	61578	61589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	545625547
31	NC_022436	GGCCAG	2	12	62541	62552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	545625548
32	NC_022436	TGCAAC	2	12	62998	63009	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545625548
33	NC_022436	CTGCCC	2	12	65214	65225	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545625550
34	NC_022436	GATGCC	2	12	66417	66428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545625550
35	NC_022436	CATGGA	2	12	67004	67015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545625550
36	NC_022436	ACGGTG	2	12	71280	71291	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545625553
37	NC_022436	CAAGGA	2	12	71795	71806	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545625553
38	NC_022436	GACCTT	2	12	72887	72898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545625554
39	NC_022436	TGCGCG	2	12	75066	75077	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625555
40	NC_022436	ACCCTG	2	12	75724	75735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545625556
41	NC_022436	CCCGCT	2	12	76305	76316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545625557
42	NC_022436	CCGGCC	2	12	86201	86212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545625558
43	NC_022436	CTGCGG	2	12	86998	87009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625558
44	NC_022436	GGCCCT	2	12	88517	88528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625559
45	NC_022436	GCTGGC	2	12	90598	90609	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625562
46	NC_022436	GCCCTG	2	12	92376	92387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625563
47	NC_022436	CGTGGC	2	12	93106	93117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625564
48	NC_022436	GAGGCC	2	12	93407	93418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	545625564
49	NC_022436	CTGGCC	2	12	93686	93697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545625564
50	NC_022436	TTCCAC	2	12	94078	94089	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	545625565
51	NC_022436	GTGGCC	2	12	97785	97796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545625567
52	NC_022436	CCACCC	2	12	100222	100233	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	545625570

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.