MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	GCCGG	2	10	1315	1324	0 %	0 %	60 %	40 %	545625502
2	NC_022436	CATGC	2	10	1361	1370	20 %	20 %	20 %	40 %	545625502
3	NC_022436	GTCCC	2	10	1758	1767	0 %	20 %	20 %	60 %	545625503
4	NC_022436	CGCGG	2	10	2550	2559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_022436	CTGCC	2	10	5967	5976	0 %	20 %	20 %	60 %	545625505
6	NC_022436	GCCCT	2	10	6905	6914	0 %	20 %	20 %	60 %	545625506
7	NC_022436	ATGGA	2	10	8336	8345	40 %	20 %	40 %	0 %	545625507
8	NC_022436	GGGCG	2	10	9572	9581	0 %	0 %	80 %	20 %	545625508
9	NC_022436	CGCGG	2	10	9788	9797	0 %	0 %	60 %	40 %	545625509
10	NC_022436	CCTTG	2	10	11360	11369	0 %	40 %	20 %	40 %	545625510
11	NC_022436	GGCCG	2	10	12125	12134	0 %	0 %	60 %	40 %	545625511
12	NC_022436	CCGGC	2	10	12324	12333	0 %	0 %	40 %	60 %	545625511
13	NC_022436	TGCCC	2	10	12999	13008	0 %	20 %	20 %	60 %	545625512
14	NC_022436	ACGGC	2	10	15664	15673	20 %	0 %	40 %	40 %	545625514
15	NC_022436	CGCGG	2	10	18237	18246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022436	GGGCC	2	10	21210	21219	0 %	0 %	60 %	40 %	545625520
17	NC_022436	GGTCC	2	10	22240	22249	0 %	20 %	40 %	40 %	545625520
18	NC_022436	GGGCA	2	10	23035	23044	20 %	0 %	60 %	20 %	545625521
19	NC_022436	CCTGC	2	10	23445	23454	0 %	20 %	20 %	60 %	545625521
20	NC_022436	GAACG	2	10	23765	23774	40 %	0 %	40 %	20 %	545625522
21	NC_022436	TCCAC	2	10	25979	25988	20 %	20 %	0 %	60 %	545625524
22	NC_022436	ATGCC	2	10	26197	26206	20 %	20 %	20 %	40 %	545625524
23	NC_022436	GATCA	2	10	26310	26319	40 %	20 %	20 %	20 %	545625524
24	NC_022436	CAAAA	2	10	27161	27170	80 %	0 %	0 %	20 %	545625525
25	NC_022436	CCCGG	2	10	28229	28238	0 %	0 %	40 %	60 %	545625526
26	NC_022436	CAGGG	2	10	29608	29617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022436	GAAAG	2	10	29961	29970	60 %	0 %	40 %	0 %	545625528
28	NC_022436	GCCGC	2	10	32603	32612	0 %	0 %	40 %	60 %	545625530
29	NC_022436	ATCCT	2	10	35184	35193	20 %	40 %	0 %	40 %	545625531
30	NC_022436	ACAGC	2	10	35481	35490	40 %	0 %	20 %	40 %	545625531
31	NC_022436	GGCAG	2	10	35600	35609	20 %	0 %	60 %	20 %	545625531
32	NC_022436	TGCGG	2	10	41571	41580	0 %	20 %	60 %	20 %	545625534
33	NC_022436	CAGGG	2	10	43642	43651	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022436	GTCAG	2	10	44711	44720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022436	AGGCT	2	10	47508	47517	20 %	20 %	40 %	20 %	545625537
36	NC_022436	TCTAT	2	10	48262	48271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022436	CCGTG	2	10	50176	50185	0 %	20 %	40 %	40 %	545625538
38	NC_022436	ACCAT	2	10	50507	50516	40 %	20 %	0 %	40 %	545625539
39	NC_022436	GGCGT	2	10	51877	51886	0 %	20 %	60 %	20 %	545625540
40	NC_022436	GATGG	2	10	52698	52707	20 %	20 %	60 %	0 %	545625540
41	NC_022436	GCCAG	2	10	53497	53506	20 %	0 %	40 %	40 %	545625541
42	NC_022436	CCGGG	2	10	53510	53519	0 %	0 %	60 %	40 %	545625541
43	NC_022436	GCAGG	2	10	53908	53917	20 %	0 %	60 %	20 %	545625541
44	NC_022436	CAGGG	2	10	54857	54866	20 %	0 %	60 %	20 %	545625542
45	NC_022436	GACTG	2	10	55591	55600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022436	ATGAT	2	10	57219	57228	40 %	40 %	20 %	0 %	545625544
47	NC_022436	GGGCA	2	10	60621	60630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022436	CCCGG	2	10	60738	60747	0 %	0 %	40 %	60 %	545625546
49	NC_022436	GGCCG	2	10	61746	61755	0 %	0 %	60 %	40 %	545625547
50	NC_022436	GCATG	2	10	62177	62186	20 %	20 %	40 %	20 %	545625548
51	NC_022436	CTGGC	2	10	64938	64947	0 %	20 %	40 %	40 %	545625550
52	NC_022436	CCGGC	2	10	65338	65347	0 %	0 %	40 %	60 %	545625550
53	NC_022436	CTCCC	2	10	67102	67111	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_022436	TGTTC	2	10	67254	67263	0 %	60 %	20 %	20 %	545625551
55	NC_022436	TGCTT	2	10	73150	73159	0 %	60 %	20 %	20 %	545625555
56	NC_022436	CGGGC	2	10	73625	73634	0 %	0 %	60 %	40 %	545625555
57	NC_022436	ATCGC	2	10	73674	73683	20 %	20 %	20 %	40 %	545625555
58	NC_022436	GGCCT	2	10	81576	81585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_022436	GCACC	2	10	82502	82511	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_022436	CGGCG	2	10	82661	82670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022436	GCCCG	2	10	83556	83565	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_022436	CCGGG	2	10	84137	84146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022436	CGGCC	2	10	85073	85082	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_022436	CCGCG	2	10	88621	88630	0 %	0 %	40 %	60 %	545625559
65	NC_022436	AGGCC	2	10	89430	89439	20 %	0 %	40 %	40 %	545625561
66	NC_022436	CGGCC	2	10	89574	89583	0 %	0 %	40 %	60 %	545625561
67	NC_022436	GGCCT	2	10	90555	90564	0 %	20 %	40 %	40 %	545625562
68	NC_022436	CCTGG	2	10	91154	91163	0 %	20 %	40 %	40 %	545625562
69	NC_022436	TCCCC	2	10	95498	95507	0 %	20 %	0 %	80 %	545625566
70	NC_022436	CCAGG	2	10	97958	97967	20 %	0 %	40 %	40 %	545625567
71	NC_022436	ATGGA	2	10	98174	98183	40 %	20 %	40 %	0 %	545625568
72	NC_022436	GGCCA	2	10	98402	98411	20 %	0 %	40 %	40 %	545625568
73	NC_022436	GCCCC	2	10	99918	99927	0 %	0 %	20 %	80 %	545625570
74	NC_022436	GGGCC	2	10	100303	100312	0 %	0 %	60 %	40 %	545625570
75	NC_022436	CCGGG	2	10	101406	101415	0 %	0 %	60 %	40 %	545625571
76	NC_022436	GACGG	2	10	101893	101902	20 %	0 %	60 %	20 %	545625572

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.