MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	GCCGG	2	10	1315	1324	0 %	0 %	60 %	40 %	545625502
2	NC_022436	CATGC	2	10	1361	1370	20 %	20 %	20 %	40 %	545625502
3	NC_022436	GTCCC	2	10	1758	1767	0 %	20 %	20 %	60 %	545625503
4	NC_022436	CTGCC	2	10	5967	5976	0 %	20 %	20 %	60 %	545625505
5	NC_022436	GCCCT	2	10	6905	6914	0 %	20 %	20 %	60 %	545625506
6	NC_022436	ATGGA	2	10	8336	8345	40 %	20 %	40 %	0 %	545625507
7	NC_022436	GGGCG	2	10	9572	9581	0 %	0 %	80 %	20 %	545625508
8	NC_022436	CGCGG	2	10	9788	9797	0 %	0 %	60 %	40 %	545625509
9	NC_022436	CCTTG	2	10	11360	11369	0 %	40 %	20 %	40 %	545625510
10	NC_022436	GGCCG	2	10	12125	12134	0 %	0 %	60 %	40 %	545625511
11	NC_022436	CCGGC	2	10	12324	12333	0 %	0 %	40 %	60 %	545625511
12	NC_022436	TGCCC	2	10	12999	13008	0 %	20 %	20 %	60 %	545625512
13	NC_022436	ACGGC	2	10	15664	15673	20 %	0 %	40 %	40 %	545625514
14	NC_022436	GGGCC	2	10	21210	21219	0 %	0 %	60 %	40 %	545625520
15	NC_022436	GGTCC	2	10	22240	22249	0 %	20 %	40 %	40 %	545625520
16	NC_022436	GGGCA	2	10	23035	23044	20 %	0 %	60 %	20 %	545625521
17	NC_022436	CCTGC	2	10	23445	23454	0 %	20 %	20 %	60 %	545625521
18	NC_022436	GAACG	2	10	23765	23774	40 %	0 %	40 %	20 %	545625522
19	NC_022436	TCCAC	2	10	25979	25988	20 %	20 %	0 %	60 %	545625524
20	NC_022436	ATGCC	2	10	26197	26206	20 %	20 %	20 %	40 %	545625524
21	NC_022436	GATCA	2	10	26310	26319	40 %	20 %	20 %	20 %	545625524
22	NC_022436	CAAAA	2	10	27161	27170	80 %	0 %	0 %	20 %	545625525
23	NC_022436	CCCGG	2	10	28229	28238	0 %	0 %	40 %	60 %	545625526
24	NC_022436	GAAAG	2	10	29961	29970	60 %	0 %	40 %	0 %	545625528
25	NC_022436	GCCGC	2	10	32603	32612	0 %	0 %	40 %	60 %	545625530
26	NC_022436	ATCCT	2	10	35184	35193	20 %	40 %	0 %	40 %	545625531
27	NC_022436	ACAGC	2	10	35481	35490	40 %	0 %	20 %	40 %	545625531
28	NC_022436	GGCAG	2	10	35600	35609	20 %	0 %	60 %	20 %	545625531
29	NC_022436	TGCGG	2	10	41571	41580	0 %	20 %	60 %	20 %	545625534
30	NC_022436	AGGCT	2	10	47508	47517	20 %	20 %	40 %	20 %	545625537
31	NC_022436	CCGTG	2	10	50176	50185	0 %	20 %	40 %	40 %	545625538
32	NC_022436	ACCAT	2	10	50507	50516	40 %	20 %	0 %	40 %	545625539
33	NC_022436	GGCGT	2	10	51877	51886	0 %	20 %	60 %	20 %	545625540
34	NC_022436	GATGG	2	10	52698	52707	20 %	20 %	60 %	0 %	545625540
35	NC_022436	GCCAG	2	10	53497	53506	20 %	0 %	40 %	40 %	545625541
36	NC_022436	CCGGG	2	10	53510	53519	0 %	0 %	60 %	40 %	545625541
37	NC_022436	GCAGG	2	10	53908	53917	20 %	0 %	60 %	20 %	545625541
38	NC_022436	CAGGG	2	10	54857	54866	20 %	0 %	60 %	20 %	545625542
39	NC_022436	ATGAT	2	10	57219	57228	40 %	40 %	20 %	0 %	545625544
40	NC_022436	CCCGG	2	10	60738	60747	0 %	0 %	40 %	60 %	545625546
41	NC_022436	GGCCG	2	10	61746	61755	0 %	0 %	60 %	40 %	545625547
42	NC_022436	GCATG	2	10	62177	62186	20 %	20 %	40 %	20 %	545625548
43	NC_022436	CTGGC	2	10	64938	64947	0 %	20 %	40 %	40 %	545625550
44	NC_022436	CCGGC	2	10	65338	65347	0 %	0 %	40 %	60 %	545625550
45	NC_022436	TGTTC	2	10	67254	67263	0 %	60 %	20 %	20 %	545625551
46	NC_022436	TGCTT	2	10	73150	73159	0 %	60 %	20 %	20 %	545625555
47	NC_022436	CGGGC	2	10	73625	73634	0 %	0 %	60 %	40 %	545625555
48	NC_022436	ATCGC	2	10	73674	73683	20 %	20 %	20 %	40 %	545625555
49	NC_022436	CCGCG	2	10	88621	88630	0 %	0 %	40 %	60 %	545625559
50	NC_022436	AGGCC	2	10	89430	89439	20 %	0 %	40 %	40 %	545625561
51	NC_022436	CGGCC	2	10	89574	89583	0 %	0 %	40 %	60 %	545625561
52	NC_022436	GGCCT	2	10	90555	90564	0 %	20 %	40 %	40 %	545625562
53	NC_022436	CCTGG	2	10	91154	91163	0 %	20 %	40 %	40 %	545625562
54	NC_022436	TCCCC	2	10	95498	95507	0 %	20 %	0 %	80 %	545625566
55	NC_022436	CCAGG	2	10	97958	97967	20 %	0 %	40 %	40 %	545625567
56	NC_022436	ATGGA	2	10	98174	98183	40 %	20 %	40 %	0 %	545625568
57	NC_022436	GGCCA	2	10	98402	98411	20 %	0 %	40 %	40 %	545625568
58	NC_022436	GCCCC	2	10	99918	99927	0 %	0 %	20 %	80 %	545625570
59	NC_022436	GGGCC	2	10	100303	100312	0 %	0 %	60 %	40 %	545625570
60	NC_022436	CCGGG	2	10	101406	101415	0 %	0 %	60 %	40 %	545625571
61	NC_022436	GACGG	2	10	101893	101902	20 %	0 %	60 %	20 %	545625572

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.