MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	GCTG	2	8	321	328	0 %	25 %	50 %	25 %	545625501
2	NC_022436	CAGG	2	8	359	366	25 %	0 %	50 %	25 %	545625501
3	NC_022436	CTGG	2	8	521	528	0 %	25 %	50 %	25 %	545625501
4	NC_022436	CCGC	2	8	1077	1084	0 %	0 %	25 %	75 %	545625502
5	NC_022436	ATCC	2	8	1108	1115	25 %	25 %	0 %	50 %	545625502
6	NC_022436	GCCC	2	8	1371	1378	0 %	0 %	25 %	75 %	545625502
7	NC_022436	CCTG	2	8	1570	1577	0 %	25 %	25 %	50 %	545625503
8	NC_022436	CGCC	2	8	2586	2593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_022436	GGCC	2	8	3028	3035	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
10	NC_022436	GGGC	2	8	3046	3053	0 %	0 %	75 %	25 %	545625504
11	NC_022436	CGGC	2	8	3111	3118	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
12	NC_022436	CCTC	2	8	3312	3319	0 %	25 %	0 %	75 %	545625504
13	NC_022436	GCCG	2	8	3703	3710	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
14	NC_022436	GCCG	2	8	3952	3959	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
15	NC_022436	GCTG	2	8	4449	4456	0 %	25 %	50 %	25 %	545625504
16	NC_022436	GCCG	2	8	4645	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
17	NC_022436	TTCC	2	8	4857	4864	0 %	50 %	0 %	50 %	545625505
18	NC_022436	GCCG	2	8	6094	6101	0 %	0 %	50 %	50 %	545625505
19	NC_022436	CCGG	2	8	6579	6586	0 %	0 %	50 %	50 %	545625506
20	NC_022436	TGGC	2	8	6602	6609	0 %	25 %	50 %	25 %	545625506
21	NC_022436	CGGC	2	8	7164	7171	0 %	0 %	50 %	50 %	545625506
22	NC_022436	GGCC	2	8	7228	7235	0 %	0 %	50 %	50 %	545625506
23	NC_022436	CAGA	2	8	7258	7265	50 %	0 %	25 %	25 %	545625506
24	NC_022436	GCTG	2	8	7386	7393	0 %	25 %	50 %	25 %	545625506
25	NC_022436	GCCG	2	8	7878	7885	0 %	0 %	50 %	50 %	545625507
26	NC_022436	CAGC	2	8	8107	8114	25 %	0 %	25 %	50 %	545625507
27	NC_022436	AAGA	2	8	8461	8468	75 %	0 %	25 %	0 %	545625507
28	NC_022436	GCTG	2	8	8553	8560	0 %	25 %	50 %	25 %	545625507
29	NC_022436	TGCA	2	8	8777	8784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022436	CACG	2	8	9209	9216	25 %	0 %	25 %	50 %	545625508
31	NC_022436	GGCC	2	8	9347	9354	0 %	0 %	50 %	50 %	545625508
32	NC_022436	CAGG	2	8	9710	9717	25 %	0 %	50 %	25 %	545625508
33	NC_022436	CGGC	2	8	10116	10123	0 %	0 %	50 %	50 %	545625509
34	NC_022436	CTGC	4	16	10747	10762	0 %	25 %	25 %	50 %	545625509
35	NC_022436	CCGG	2	8	10864	10871	0 %	0 %	50 %	50 %	545625509
36	NC_022436	TTGC	2	8	11176	11183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022436	GACG	2	8	11588	11595	25 %	0 %	50 %	25 %	545625510
38	NC_022436	GCAG	2	8	11710	11717	25 %	0 %	50 %	25 %	545625510
39	NC_022436	GGGC	2	8	11726	11733	0 %	0 %	75 %	25 %	545625510
40	NC_022436	GCCG	2	8	11855	11862	0 %	0 %	50 %	50 %	545625510
41	NC_022436	CCGG	2	8	12442	12449	0 %	0 %	50 %	50 %	545625511
42	NC_022436	CCGG	2	8	12539	12546	0 %	0 %	50 %	50 %	545625511
43	NC_022436	TGCC	2	8	12599	12606	0 %	25 %	25 %	50 %	545625511
44	NC_022436	CGGG	2	8	12768	12775	0 %	0 %	75 %	25 %	545625511
45	NC_022436	CAGG	2	8	14130	14137	25 %	0 %	50 %	25 %	545625513
46	NC_022436	GGCG	2	8	15367	15374	0 %	0 %	75 %	25 %	545625514
47	NC_022436	CAGC	2	8	15494	15501	25 %	0 %	25 %	50 %	545625514
48	NC_022436	ATCC	2	8	15795	15802	25 %	25 %	0 %	50 %	545625514
49	NC_022436	TTGC	2	8	16222	16229	0 %	50 %	25 %	25 %	545625515
50	NC_022436	GATA	2	8	16916	16923	50 %	25 %	25 %	0 %	545625516
51	NC_022436	GCGG	2	8	17642	17649	0 %	0 %	75 %	25 %	545625517
52	NC_022436	CGCC	2	8	18003	18010	0 %	0 %	25 %	75 %	545625517
53	NC_022436	GCCC	2	8	18543	18550	0 %	0 %	25 %	75 %	545625518
54	NC_022436	CCCG	2	8	18918	18925	0 %	0 %	25 %	75 %	545625518
55	NC_022436	GCCT	2	8	19018	19025	0 %	25 %	25 %	50 %	545625518
56	NC_022436	GGCC	2	8	19119	19126	0 %	0 %	50 %	50 %	545625518
57	NC_022436	CCGG	2	8	19170	19177	0 %	0 %	50 %	50 %	545625518
58	NC_022436	GACG	2	8	19598	19605	25 %	0 %	50 %	25 %	545625519
59	NC_022436	CGGG	2	8	20311	20318	0 %	0 %	75 %	25 %	545625519
60	NC_022436	GCCA	2	8	20604	20611	25 %	0 %	25 %	50 %	545625519
61	NC_022436	CGGC	2	8	21345	21352	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
62	NC_022436	GCGG	2	8	21355	21362	0 %	0 %	75 %	25 %	545625520
63	NC_022436	CAGC	2	8	21366	21373	25 %	0 %	25 %	50 %	545625520
64	NC_022436	GGCC	3	12	21721	21732	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
65	NC_022436	GGGC	2	8	21933	21940	0 %	0 %	75 %	25 %	545625520
66	NC_022436	GCGG	2	8	22913	22920	0 %	0 %	75 %	25 %	545625521
67	NC_022436	GATG	2	8	22985	22992	25 %	25 %	50 %	0 %	545625521
68	NC_022436	GGCC	2	8	22993	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	545625521
69	NC_022436	GGCC	2	8	23947	23954	0 %	0 %	50 %	50 %	545625522
70	NC_022436	TGAT	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	545625523
71	NC_022436	CATG	2	8	24864	24871	25 %	25 %	25 %	25 %	545625523
72	NC_022436	CCCG	2	8	25470	25477	0 %	0 %	25 %	75 %	545625523
73	NC_022436	GACG	2	8	25719	25726	25 %	0 %	50 %	25 %	545625523
74	NC_022436	CAGG	2	8	25872	25879	25 %	0 %	50 %	25 %	545625524
75	NC_022436	GCAG	2	8	26363	26370	25 %	0 %	50 %	25 %	545625524
76	NC_022436	CGTT	2	8	26626	26633	0 %	50 %	25 %	25 %	545625524
77	NC_022436	ACCG	2	8	26698	26705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022436	GGCA	2	8	26938	26945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022436	CCGG	2	8	27631	27638	0 %	0 %	50 %	50 %	545625526
80	NC_022436	GGGC	2	8	27947	27954	0 %	0 %	75 %	25 %	545625526
81	NC_022436	CGGC	2	8	28504	28511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022436	GCTG	2	8	28953	28960	0 %	25 %	50 %	25 %	545625527
83	NC_022436	CAAC	2	8	29862	29869	50 %	0 %	0 %	50 %	545625528
84	NC_022436	CATT	2	8	30632	30639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022436	GGGC	2	8	30750	30757	0 %	0 %	75 %	25 %	545625529
86	NC_022436	GGCA	2	8	30856	30863	25 %	0 %	50 %	25 %	545625529
87	NC_022436	TCCA	2	8	31507	31514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022436	GCAT	2	8	31713	31720	25 %	25 %	25 %	25 %	545625530
89	NC_022436	GGCT	3	12	31903	31914	0 %	25 %	50 %	25 %	545625530
90	NC_022436	TGGC	2	8	32159	32166	0 %	25 %	50 %	25 %	545625530
91	NC_022436	GACC	2	8	32338	32345	25 %	0 %	25 %	50 %	545625530
92	NC_022436	GCCA	2	8	32663	32670	25 %	0 %	25 %	50 %	545625530
93	NC_022436	CGCC	2	8	34794	34801	0 %	0 %	25 %	75 %	545625531
94	NC_022436	TGGC	2	8	35198	35205	0 %	25 %	50 %	25 %	545625531
95	NC_022436	CCCT	2	8	35665	35672	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_022436	GCAC	2	8	35737	35744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022436	GCCC	2	8	35746	35753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_022436	CAGG	2	8	36292	36299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022436	GACG	2	8	36705	36712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022436	CTTC	2	8	36714	36721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022436	AGCC	2	8	36871	36878	25 %	0 %	25 %	50 %	545625532
102	NC_022436	AAAT	2	8	37041	37048	75 %	25 %	0 %	0 %	545625532
103	NC_022436	AAGG	2	8	37168	37175	50 %	0 %	50 %	0 %	545625532
104	NC_022436	TGTT	2	8	37448	37455	0 %	75 %	25 %	0 %	545625532
105	NC_022436	CATT	2	8	37571	37578	25 %	50 %	0 %	25 %	545625532
106	NC_022436	CCGG	2	8	38613	38620	0 %	0 %	50 %	50 %	545625532
107	NC_022436	GGCA	2	8	39320	39327	25 %	0 %	50 %	25 %	545625532
108	NC_022436	CGGC	2	8	39457	39464	0 %	0 %	50 %	50 %	545625532
109	NC_022436	CGTG	2	8	39806	39813	0 %	25 %	50 %	25 %	545625532
110	NC_022436	GATT	2	8	40233	40240	25 %	50 %	25 %	0 %	545625532
111	NC_022436	AATC	2	8	41076	41083	50 %	25 %	0 %	25 %	545625533
112	NC_022436	CTCA	2	8	41489	41496	25 %	25 %	0 %	50 %	545625533
113	NC_022436	GTCC	2	8	41748	41755	0 %	25 %	25 %	50 %	545625534
114	NC_022436	CCTG	2	8	42209	42216	0 %	25 %	25 %	50 %	545625534
115	NC_022436	CGGC	2	8	42477	42484	0 %	0 %	50 %	50 %	545625535
116	NC_022436	GCCT	2	8	42514	42521	0 %	25 %	25 %	50 %	545625535
117	NC_022436	CTTC	2	8	42604	42611	0 %	50 %	0 %	50 %	545625535
118	NC_022436	TTTC	2	8	43253	43260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022436	CCAG	2	8	43575	43582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022436	GCTC	2	8	43948	43955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022436	CCTG	2	8	44000	44007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022436	ACGG	2	8	46772	46779	25 %	0 %	50 %	25 %	545625537
123	NC_022436	AAAT	2	8	46969	46976	75 %	25 %	0 %	0 %	545625537
124	NC_022436	TTTC	2	8	47056	47063	0 %	75 %	0 %	25 %	545625537
125	NC_022436	CCGC	2	8	47221	47228	0 %	0 %	25 %	75 %	545625537
126	NC_022436	TGGA	2	8	47664	47671	25 %	25 %	50 %	0 %	545625537
127	NC_022436	CACC	2	8	47956	47963	25 %	0 %	0 %	75 %	545625537
128	NC_022436	ATGC	2	8	48131	48138	25 %	25 %	25 %	25 %	545625537
129	NC_022436	ACAG	2	8	48220	48227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022436	CTGT	2	8	48493	48500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022436	TTCC	2	8	48515	48522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022436	CTTT	2	8	49326	49333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022436	GGCA	2	8	49656	49663	25 %	0 %	50 %	25 %	545625538
134	NC_022436	CAGC	2	8	49821	49828	25 %	0 %	25 %	50 %	545625538
135	NC_022436	ACGC	2	8	50577	50584	25 %	0 %	25 %	50 %	545625539
136	NC_022436	CGGC	2	8	51689	51696	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
137	NC_022436	GGCC	2	8	51974	51981	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
138	NC_022436	CCGG	2	8	52017	52024	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
139	NC_022436	GCCG	2	8	52265	52272	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
140	NC_022436	AGGG	2	8	52435	52442	25 %	0 %	75 %	0 %	545625540
141	NC_022436	GGCC	2	8	52758	52765	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
142	NC_022436	CGGC	2	8	52847	52854	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
143	NC_022436	CGGG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	75 %	25 %	545625541
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285	NC_022436	AAGG	2	8	101457	101464	50 %	0 %	50 %	0 %	545625571
286	NC_022436	GCGG	2	8	101801	101808	0 %	0 %	75 %	25 %	545625572

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.