MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	CGCC	2	8	2586	2593	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022436	TGCA	2	8	8777	8784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022436	TTGC	2	8	11176	11183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022436	ACCG	2	8	26698	26705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022436	GGCA	2	8	26938	26945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022436	CGGC	2	8	28504	28511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022436	CATT	2	8	30632	30639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022436	TCCA	2	8	31507	31514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022436	CCCT	2	8	35665	35672	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_022436	GCAC	2	8	35737	35744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022436	GCCC	2	8	35746	35753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_022436	CAGG	2	8	36292	36299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022436	GACG	2	8	36705	36712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022436	CTTC	2	8	36714	36721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022436	TTTC	2	8	43253	43260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022436	CCAG	2	8	43575	43582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022436	GCTC	2	8	43948	43955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022436	CCTG	2	8	44000	44007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022436	ACAG	2	8	48220	48227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022436	CTGT	2	8	48493	48500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022436	TTCC	2	8	48515	48522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022436	CTTT	2	8	49326	49333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022436	CGGG	3	12	56722	56733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022436	CCAT	2	8	63400	63407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022436	CTGG	2	8	68363	68370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022436	CGTG	2	8	70399	70406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022436	GCTT	2	8	70515	70522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022436	ATGT	2	8	70666	70673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022436	CCCG	2	8	76285	76292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_022436	CGGC	2	8	79428	79435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022436	CCGC	2	8	79780	79787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_022436	CTGG	2	8	79866	79873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022436	TCCA	2	8	80244	80251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022436	GTCT	2	8	80253	80260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022436	TGCC	2	8	80366	80373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022436	GCGT	2	8	81148	81155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022436	GCCC	2	8	81545	81552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_022436	GCCT	2	8	81590	81597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022436	CGGC	2	8	81641	81648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022436	CCGG	2	8	81787	81794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022436	AAGC	2	8	81851	81858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022436	GGCC	2	8	82033	82040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022436	CGGC	2	8	83716	83723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022436	GCCG	2	8	83754	83761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022436	CAGC	2	8	83765	83772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022436	GCCG	2	8	84161	84168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022436	GCCC	2	8	84851	84858	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_022436	GCCG	2	8	84872	84879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022436	ATCC	2	8	85265	85272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022436	GCCG	2	8	85397	85404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022436	GAGC	2	8	85805	85812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022436	GACG	2	8	85952	85959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022436	CCAT	2	8	86093	86100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022436	TTAA	2	8	98977	98984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.