MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 plasmid sequence

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022436	TG	3	6	1637	1642	0 %	50 %	50 %	0 %	545625503
2	NC_022436	GC	4	8	2053	2060	0 %	0 %	50 %	50 %	545625503
3	NC_022436	GC	3	6	4023	4028	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
4	NC_022436	GC	4	8	4509	4516	0 %	0 %	50 %	50 %	545625504
5	NC_022436	GC	3	6	5308	5313	0 %	0 %	50 %	50 %	545625505
6	NC_022436	GA	3	6	5777	5782	50 %	0 %	50 %	0 %	545625505
7	NC_022436	GC	4	8	6032	6039	0 %	0 %	50 %	50 %	545625505
8	NC_022436	GC	4	8	8670	8677	0 %	0 %	50 %	50 %	545625507
9	NC_022436	GC	3	6	8984	8989	0 %	0 %	50 %	50 %	545625508
10	NC_022436	GC	3	6	11562	11567	0 %	0 %	50 %	50 %	545625510
11	NC_022436	AC	3	6	12780	12785	50 %	0 %	0 %	50 %	545625511
12	NC_022436	GC	3	6	12789	12794	0 %	0 %	50 %	50 %	545625511
13	NC_022436	AC	3	6	14320	14325	50 %	0 %	0 %	50 %	545625513
14	NC_022436	GC	3	6	14435	14440	0 %	0 %	50 %	50 %	545625513
15	NC_022436	GC	4	8	16285	16292	0 %	0 %	50 %	50 %	545625515
16	NC_022436	GC	3	6	16439	16444	0 %	0 %	50 %	50 %	545625515
17	NC_022436	GC	3	6	16563	16568	0 %	0 %	50 %	50 %	545625515
18	NC_022436	CG	3	6	17093	17098	0 %	0 %	50 %	50 %	545625516
19	NC_022436	GC	4	8	17960	17967	0 %	0 %	50 %	50 %	545625517
20	NC_022436	GC	3	6	18049	18054	0 %	0 %	50 %	50 %	545625517
21	NC_022436	CG	3	6	20770	20775	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
22	NC_022436	GC	3	6	20804	20809	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
23	NC_022436	GC	3	6	22385	22390	0 %	0 %	50 %	50 %	545625520
24	NC_022436	CA	3	6	22629	22634	50 %	0 %	0 %	50 %	545625520
25	NC_022436	GC	3	6	26267	26272	0 %	0 %	50 %	50 %	545625524
26	NC_022436	CG	3	6	26297	26302	0 %	0 %	50 %	50 %	545625524
27	NC_022436	CA	3	6	26608	26613	50 %	0 %	0 %	50 %	545625524
28	NC_022436	TC	3	6	30183	30188	0 %	50 %	0 %	50 %	545625528
29	NC_022436	CA	3	6	31070	31075	50 %	0 %	0 %	50 %	545625529
30	NC_022436	CA	3	6	31684	31689	50 %	0 %	0 %	50 %	545625530
31	NC_022436	CT	3	6	33182	33187	0 %	50 %	0 %	50 %	545625530
32	NC_022436	CG	3	6	38735	38740	0 %	0 %	50 %	50 %	545625532
33	NC_022436	GC	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	545625532
34	NC_022436	CG	3	6	42744	42749	0 %	0 %	50 %	50 %	545625535
35	NC_022436	GT	3	6	45174	45179	0 %	50 %	50 %	0 %	545625536
36	NC_022436	CG	3	6	45601	45606	0 %	0 %	50 %	50 %	545625536
37	NC_022436	TG	3	6	47109	47114	0 %	50 %	50 %	0 %	545625537
38	NC_022436	TG	3	6	47406	47411	0 %	50 %	50 %	0 %	545625537
39	NC_022436	GA	3	6	50462	50467	50 %	0 %	50 %	0 %	545625539
40	NC_022436	GC	3	6	51764	51769	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
41	NC_022436	CA	3	6	52190	52195	50 %	0 %	0 %	50 %	545625540
42	NC_022436	GC	3	6	52198	52203	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
43	NC_022436	GC	3	6	52864	52869	0 %	0 %	50 %	50 %	545625540
44	NC_022436	CG	3	6	53179	53184	0 %	0 %	50 %	50 %	545625541
45	NC_022436	GC	3	6	53214	53219	0 %	0 %	50 %	50 %	545625541
46	NC_022436	GC	3	6	53566	53571	0 %	0 %	50 %	50 %	545625541
47	NC_022436	GC	3	6	54583	54588	0 %	0 %	50 %	50 %	545625542
48	NC_022436	GC	3	6	54871	54876	0 %	0 %	50 %	50 %	545625542
49	NC_022436	GC	3	6	55318	55323	0 %	0 %	50 %	50 %	545625542
50	NC_022436	CG	4	8	55451	55458	0 %	0 %	50 %	50 %	545625542
51	NC_022436	GC	3	6	55459	55464	0 %	0 %	50 %	50 %	545625542
52	NC_022436	CG	3	6	55732	55737	0 %	0 %	50 %	50 %	545625543
53	NC_022436	GC	3	6	55886	55891	0 %	0 %	50 %	50 %	545625543
54	NC_022436	GC	3	6	56253	56258	0 %	0 %	50 %	50 %	545625543
55	NC_022436	GC	3	6	58099	58104	0 %	0 %	50 %	50 %	545625545
56	NC_022436	CG	3	6	58448	58453	0 %	0 %	50 %	50 %	545625545
57	NC_022436	AG	3	6	58478	58483	50 %	0 %	50 %	0 %	545625545
58	NC_022436	CG	3	6	59474	59479	0 %	0 %	50 %	50 %	545625545
59	NC_022436	GC	3	6	60105	60110	0 %	0 %	50 %	50 %	545625545
60	NC_022436	CG	4	8	61561	61568	0 %	0 %	50 %	50 %	545625546
61	NC_022436	TG	3	6	62449	62454	0 %	50 %	50 %	0 %	545625548
62	NC_022436	GC	3	6	62573	62578	0 %	0 %	50 %	50 %	545625548
63	NC_022436	GC	3	6	62709	62714	0 %	0 %	50 %	50 %	545625548
64	NC_022436	GC	3	6	63475	63480	0 %	0 %	50 %	50 %	545625549
65	NC_022436	GC	3	6	64111	64116	0 %	0 %	50 %	50 %	545625549
66	NC_022436	GC	3	6	64273	64278	0 %	0 %	50 %	50 %	545625549
67	NC_022436	TG	3	6	64461	64466	0 %	50 %	50 %	0 %	545625549
68	NC_022436	CG	3	6	64496	64501	0 %	0 %	50 %	50 %	545625549
69	NC_022436	CG	3	6	66959	66964	0 %	0 %	50 %	50 %	545625550
70	NC_022436	GC	3	6	68906	68911	0 %	0 %	50 %	50 %	545625552
71	NC_022436	CG	3	6	69332	69337	0 %	0 %	50 %	50 %	545625552
72	NC_022436	GC	3	6	72354	72359	0 %	0 %	50 %	50 %	545625554
73	NC_022436	CA	3	6	72419	72424	50 %	0 %	0 %	50 %	545625554
74	NC_022436	TA	3	6	72984	72989	50 %	50 %	0 %	0 %	545625554
75	NC_022436	CA	3	6	73840	73845	50 %	0 %	0 %	50 %	545625555
76	NC_022436	GC	3	6	75464	75469	0 %	0 %	50 %	50 %	545625556
77	NC_022436	GC	3	6	76438	76443	0 %	0 %	50 %	50 %	545625557
78	NC_022436	GC	3	6	77132	77137	0 %	0 %	50 %	50 %	545625557
79	NC_022436	GC	3	6	77332	77337	0 %	0 %	50 %	50 %	545625557
80	NC_022436	GC	3	6	77422	77427	0 %	0 %	50 %	50 %	545625557
81	NC_022436	GC	3	6	78093	78098	0 %	0 %	50 %	50 %	545625557
82	NC_022436	GC	3	6	86173	86178	0 %	0 %	50 %	50 %	545625558
83	NC_022436	GC	3	6	87154	87159	0 %	0 %	50 %	50 %	545625558
84	NC_022436	TC	3	6	88899	88904	0 %	50 %	0 %	50 %	545625560
85	NC_022436	GC	3	6	89886	89891	0 %	0 %	50 %	50 %	545625561
86	NC_022436	CA	3	6	91092	91097	50 %	0 %	0 %	50 %	545625562
87	NC_022436	CG	4	8	91595	91602	0 %	0 %	50 %	50 %	545625562
88	NC_022436	GC	3	6	92655	92660	0 %	0 %	50 %	50 %	545625564
89	NC_022436	GC	4	8	94283	94290	0 %	0 %	50 %	50 %	545625565
90	NC_022436	GC	3	6	94725	94730	0 %	0 %	50 %	50 %	545625565
91	NC_022436	GC	3	6	94988	94993	0 %	0 %	50 %	50 %	545625566
92	NC_022436	CA	3	6	97817	97822	50 %	0 %	0 %	50 %	545625567
93	NC_022436	CT	3	6	99854	99859	0 %	50 %	0 %	50 %	545625570
94	NC_022436	TC	3	6	99956	99961	0 %	50 %	0 %	50 %	545625570
95	NC_022436	CG	4	8	100103	100110	0 %	0 %	50 %	50 %	545625570
96	NC_022436	TC	3	6	100381	100386	0 %	50 %	0 %	50 %	545625570

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.