MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	TGCGCA	2	12	431	442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544579033
2	NC_022371	GTGAAA	2	12	848	859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	544579033
3	NC_022371	ATAGAT	2	12	2899	2910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	544579036
4	NC_022371	AGTACA	2	12	3038	3049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022371	ATGCTC	2	12	5615	5626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544579039
6	NC_022371	GGCGCT	2	12	17135	17146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	544579054
7	NC_022371	CAGGTG	2	12	17166	17177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544579054
8	NC_022371	GTGGCG	2	12	17256	17267	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	544579054
9	NC_022371	GCCGGA	2	12	17507	17518	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	544579054
10	NC_022371	CCCGTA	2	12	23741	23752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	544579062
11	NC_022371	CGCGCA	2	12	26816	26827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022371	TGCATG	2	12	27720	27731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579068
13	NC_022371	TGAACT	2	12	27814	27825	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544579068
14	NC_022371	GGAAAA	2	12	30247	30258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579069
15	NC_022371	GCTGAC	2	12	31924	31935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544579070
16	NC_022371	CTGTTG	2	12	37210	37221	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544579077
17	NC_022371	GGTGCG	2	12	37552	37563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	544579077
18	NC_022371	CGGGAT	2	12	42988	42999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544579085
19	NC_022371	GGGGCA	2	12	44168	44179	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	544579085
20	NC_022371	TGATAT	2	12	46506	46517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	544579088
21	NC_022371	TTTTCC	2	12	49816	49827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544579090
22	NC_022371	CAGTGT	2	12	50186	50197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579091
23	NC_022371	CCCAGC	2	12	50305	50316	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	544579091
24	NC_022371	AGTATA	2	12	52398	52409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022371	TGAGCG	2	12	57015	57026	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544579100
26	NC_022371	TGTTCC	2	12	59705	59716	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	544579102
27	NC_022371	GACGGT	2	12	60383	60394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544579102
28	NC_022371	ACGGTT	2	12	63002	63013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579105
29	NC_022371	AGGGGC	2	12	66621	66632	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022371	CACCGG	2	12	66790	66801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022371	GCGGGA	2	12	67565	67576	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	544579108
32	NC_022371	GTGATG	2	12	68875	68886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	544579111
33	NC_022371	GTCATG	2	12	69292	69303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579111
34	NC_022371	CGGCCC	2	12	70141	70152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579112
35	NC_022371	CGGTAT	2	12	70558	70569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579112
36	NC_022371	TGTTCT	2	12	70848	70859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544579112
37	NC_022371	CAGTGT	2	12	73692	73703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544579116
38	NC_022371	ACCGAT	2	12	77771	77782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544579118
39	NC_022371	GCCAGT	2	12	85860	85871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544579127
40	NC_022371	CAGTTC	2	12	86669	86680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544579127
41	NC_022371	CAACGG	2	12	89059	89070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579130
42	NC_022371	TGAGTA	2	12	89467	89478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579130
43	NC_022371	TTCCGG	2	12	93382	93393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022371	TGCTTC	2	12	94665	94676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	544579135
45	NC_022371	GGCAAC	2	12	95658	95669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579135
46	NC_022371	CTGCCG	2	12	96947	96958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	544579137
47	NC_022371	TGCCGG	2	12	98802	98813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.