MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	GCAGC	2	10	942	951	20 %	0 %	40 %	40 %	544579033
2	NC_022371	GCCGC	2	10	1522	1531	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_022371	TCTTT	2	10	4118	4127	0 %	80 %	0 %	20 %	544579038
4	NC_022371	TTTGT	2	10	6421	6430	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022371	TGCTT	2	10	6732	6741	0 %	60 %	20 %	20 %	544579040
6	NC_022371	GTTAA	2	10	7491	7500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022371	TGTTA	2	10	7544	7553	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022371	GTTCA	2	10	7809	7818	20 %	40 %	20 %	20 %	544579042
9	NC_022371	CGTAC	2	10	8272	8281	20 %	20 %	20 %	40 %	544579042
10	NC_022371	CGCGG	2	10	11033	11042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022371	ACGGG	2	10	11084	11093	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022371	GCTGG	2	10	11710	11719	0 %	20 %	60 %	20 %	544579047
13	NC_022371	CCGTC	2	10	13352	13361	0 %	20 %	20 %	60 %	544579049
14	NC_022371	AAGGT	2	10	13638	13647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022371	GGCAC	2	10	13800	13809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022371	ACCGT	2	10	14090	14099	20 %	20 %	20 %	40 %	544579050
17	NC_022371	CCGGC	2	10	15017	15026	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_022371	CCGCC	2	10	16213	16222	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_022371	CTGTC	2	10	16612	16621	0 %	40 %	20 %	40 %	544579054
20	NC_022371	CCGCC	2	10	18513	18522	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_022371	ACTGA	2	10	18561	18570	40 %	20 %	20 %	20 %	544579055
22	NC_022371	CTGGT	2	10	19489	19498	0 %	40 %	40 %	20 %	544579056
23	NC_022371	TCGTT	2	10	20340	20349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022371	GGCAC	2	10	20709	20718	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_022371	CCGTG	2	10	21849	21858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022371	GAGCA	2	10	24322	24331	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022371	TTTAT	2	10	24835	24844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022371	TTACG	2	10	29126	29135	20 %	40 %	20 %	20 %	544579068
29	NC_022371	CAGCG	2	10	32828	32837	20 %	0 %	40 %	40 %	544579072
30	NC_022371	TGACC	2	10	33390	33399	20 %	20 %	20 %	40 %	544579073
31	NC_022371	TGGGT	2	10	34145	34154	0 %	40 %	60 %	0 %	544579073
32	NC_022371	GGGAG	2	10	34811	34820	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022371	CCTGC	2	10	35180	35189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_022371	AGCGA	2	10	36540	36549	40 %	0 %	40 %	20 %	544579076
35	NC_022371	AGCCC	2	10	36619	36628	20 %	0 %	20 %	60 %	544579076
36	NC_022371	TGTTT	2	10	37176	37185	0 %	80 %	20 %	0 %	544579077
37	NC_022371	CGGGC	2	10	38559	38568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_022371	GGCGT	2	10	40322	40331	0 %	20 %	60 %	20 %	544579080
39	NC_022371	GCGCC	2	10	42310	42319	0 %	0 %	40 %	60 %	544579083
40	NC_022371	CGAAG	2	10	42427	42436	40 %	0 %	40 %	20 %	544579083
41	NC_022371	CACGA	2	10	44792	44801	40 %	0 %	20 %	40 %	544579086
42	NC_022371	CATAT	2	10	46436	46445	40 %	40 %	0 %	20 %	544579088
43	NC_022371	TGCGT	2	10	49477	49486	0 %	40 %	40 %	20 %	544579090
44	NC_022371	CGGGG	2	10	49555	49564	0 %	0 %	80 %	20 %	544579090
45	NC_022371	GATGT	2	10	49876	49885	20 %	40 %	40 %	0 %	544579090
46	NC_022371	CCAGA	2	10	50541	50550	40 %	0 %	20 %	40 %	544579091
47	NC_022371	TCCTG	2	10	54484	54493	0 %	40 %	20 %	40 %	544579096
48	NC_022371	GTTGT	2	10	55119	55128	0 %	60 %	40 %	0 %	544579098
49	NC_022371	ATGGA	2	10	55517	55526	40 %	20 %	40 %	0 %	544579099
50	NC_022371	TTCAG	2	10	56481	56490	20 %	40 %	20 %	20 %	544579100
51	NC_022371	AACTC	2	10	56979	56988	40 %	20 %	0 %	40 %	544579100
52	NC_022371	GAAAA	2	10	58086	58095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022371	AAAAT	2	10	58638	58647	80 %	20 %	0 %	0 %	544579101
54	NC_022371	CGTCC	2	10	60730	60739	0 %	20 %	20 %	60 %	544579102
55	NC_022371	CGGTC	2	10	61988	61997	0 %	20 %	40 %	40 %	544579104
56	NC_022371	GGCAG	2	10	62340	62349	20 %	0 %	60 %	20 %	544579104
57	NC_022371	AGGAG	2	10	63661	63670	40 %	0 %	60 %	0 %	544579106
58	NC_022371	ACATC	2	10	64782	64791	40 %	20 %	0 %	40 %	544579106
59	NC_022371	AAAAC	2	10	66176	66185	80 %	0 %	0 %	20 %	544579106
60	NC_022371	CATGG	2	10	66511	66520	20 %	20 %	40 %	20 %	544579106
61	NC_022371	TGGTC	2	10	67791	67800	0 %	40 %	40 %	20 %	544579108
62	NC_022371	CTGCC	2	10	68923	68932	0 %	20 %	20 %	60 %	544579111
63	NC_022371	TCAGT	2	10	75011	75020	20 %	40 %	20 %	20 %	544579116
64	NC_022371	GTCCC	2	10	75900	75909	0 %	20 %	20 %	60 %	544579116
65	NC_022371	TTCCG	2	10	77058	77067	0 %	40 %	20 %	40 %	544579117
66	NC_022371	AACTG	2	10	79468	79477	40 %	20 %	20 %	20 %	544579120
67	NC_022371	GTCAG	2	10	81807	81816	20 %	20 %	40 %	20 %	544579122
68	NC_022371	TTTCA	2	10	81989	81998	20 %	60 %	0 %	20 %	544579122
69	NC_022371	CTGCA	2	10	84121	84130	20 %	20 %	20 %	40 %	544579124
70	NC_022371	TTCAG	2	10	91217	91226	20 %	40 %	20 %	20 %	544579131
71	NC_022371	GTGTC	2	10	91260	91269	0 %	40 %	40 %	20 %	544579131
72	NC_022371	CCCAT	2	10	92167	92176	20 %	20 %	0 %	60 %	544579132
73	NC_022371	CTGGC	2	10	94960	94969	0 %	20 %	40 %	40 %	544579135
74	NC_022371	CTCTG	2	10	95155	95164	0 %	40 %	20 %	40 %	544579135
75	NC_022371	CGGTG	2	10	96247	96256	0 %	20 %	60 %	20 %	544579136
76	NC_022371	GCCTG	2	10	98276	98285	0 %	20 %	40 %	40 %	544579138

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.