MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	GCCGC	2	10	1522	1531	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_022371	TTTGT	2	10	6421	6430	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022371	GTTAA	2	10	7491	7500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022371	TGTTA	2	10	7544	7553	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022371	CGCGG	2	10	11033	11042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022371	ACGGG	2	10	11084	11093	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022371	AAGGT	2	10	13638	13647	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022371	GGCAC	2	10	13800	13809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022371	CCGGC	2	10	15017	15026	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_022371	CCGCC	2	10	16213	16222	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_022371	CCGCC	2	10	18513	18522	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_022371	TCGTT	2	10	20340	20349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022371	GGCAC	2	10	20709	20718	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022371	CCGTG	2	10	21849	21858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022371	GAGCA	2	10	24322	24331	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022371	TTTAT	2	10	24835	24844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022371	GGGAG	2	10	34811	34820	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022371	CCTGC	2	10	35180	35189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_022371	CGGGC	2	10	38559	38568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022371	GAAAA	2	10	58086	58095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.