MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	CCGG	2	8	501	508	0 %	0 %	50 %	50 %	544579033
2	NC_022371	GGCT	2	8	596	603	0 %	25 %	50 %	25 %	544579033
3	NC_022371	CAGC	2	8	986	993	25 %	0 %	25 %	50 %	544579033
4	NC_022371	GCTG	2	8	1152	1159	0 %	25 %	50 %	25 %	544579033
5	NC_022371	CAAA	2	8	1360	1367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022371	ATCA	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022371	GGGA	2	8	4096	4103	25 %	0 %	75 %	0 %	544579038
8	NC_022371	CTGG	2	8	4137	4144	0 %	25 %	50 %	25 %	544579038
9	NC_022371	GGCT	2	8	4337	4344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022371	ATAA	2	8	4543	4550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022371	TACT	2	8	4641	4648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022371	AAAG	2	8	5714	5721	75 %	0 %	25 %	0 %	544579039
13	NC_022371	AACA	2	8	7028	7035	75 %	0 %	0 %	25 %	544579041
14	NC_022371	TACC	2	8	7432	7439	25 %	25 %	0 %	50 %	544579041
15	NC_022371	ATTA	2	8	7589	7596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022371	CAGC	2	8	7907	7914	25 %	0 %	25 %	50 %	544579042
17	NC_022371	GTGA	2	8	8984	8991	25 %	25 %	50 %	0 %	544579043
18	NC_022371	AGAA	2	8	9219	9226	75 %	0 %	25 %	0 %	544579043
19	NC_022371	CAGC	2	8	9400	9407	25 %	0 %	25 %	50 %	544579044
20	NC_022371	GTAT	2	8	10053	10060	25 %	50 %	25 %	0 %	544579045
21	NC_022371	GCTG	2	8	10278	10285	0 %	25 %	50 %	25 %	544579045
22	NC_022371	TTCA	2	8	10681	10688	25 %	50 %	0 %	25 %	544579046
23	NC_022371	TGGC	2	8	10803	10810	0 %	25 %	50 %	25 %	544579046
24	NC_022371	CGGG	2	8	10961	10968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022371	CCGG	2	8	11074	11081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022371	AGCC	2	8	11130	11137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022371	GCAG	2	8	11825	11832	25 %	0 %	50 %	25 %	544579047
28	NC_022371	CAGT	2	8	12940	12947	25 %	25 %	25 %	25 %	544579049
29	NC_022371	CTGC	2	8	13320	13327	0 %	25 %	25 %	50 %	544579049
30	NC_022371	GCGG	2	8	13625	13632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022371	GTCT	2	8	13898	13905	0 %	50 %	25 %	25 %	544579050
32	NC_022371	ACGG	2	8	14281	14288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022371	TCAG	2	8	15662	15669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022371	TAAG	2	8	16479	16486	50 %	25 %	25 %	0 %	544579053
35	NC_022371	AAGC	2	8	16579	16586	50 %	0 %	25 %	25 %	544579054
36	NC_022371	CCTG	2	8	16781	16788	0 %	25 %	25 %	50 %	544579054
37	NC_022371	GAAC	2	8	17552	17559	50 %	0 %	25 %	25 %	544579054
38	NC_022371	GAAG	2	8	18017	18024	50 %	0 %	50 %	0 %	544579054
39	NC_022371	CTGG	2	8	18427	18434	0 %	25 %	50 %	25 %	544579054
40	NC_022371	TCAC	2	8	18649	18656	25 %	25 %	0 %	50 %	544579055
41	NC_022371	CTTT	2	8	19113	19120	0 %	75 %	0 %	25 %	544579056
42	NC_022371	TGGC	2	8	19217	19224	0 %	25 %	50 %	25 %	544579056
43	NC_022371	CCGT	2	8	19304	19311	0 %	25 %	25 %	50 %	544579056
44	NC_022371	GCGA	2	8	20000	20007	25 %	0 %	50 %	25 %	544579057
45	NC_022371	GCGG	2	8	20523	20530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022371	GCCT	2	8	21324	21331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022371	CCTG	2	8	21368	21375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022371	ACTA	2	8	22499	22506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022371	TTCA	2	8	22930	22937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022371	CTGG	2	8	23762	23769	0 %	25 %	50 %	25 %	544579062
51	NC_022371	GCTG	2	8	24041	24048	0 %	25 %	50 %	25 %	544579062
52	NC_022371	TCAC	2	8	24265	24272	25 %	25 %	0 %	50 %	544579062
53	NC_022371	TACA	2	8	25135	25142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022371	CAGC	2	8	25730	25737	25 %	0 %	25 %	50 %	544579065
55	NC_022371	TGAT	2	8	25834	25841	25 %	50 %	25 %	0 %	544579065
56	NC_022371	CCTG	2	8	26347	26354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022371	GTCT	2	8	26356	26363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022371	TGAG	2	8	26887	26894	25 %	25 %	50 %	0 %	544579067
59	NC_022371	TGAT	2	8	27073	27080	25 %	50 %	25 %	0 %	544579067
60	NC_022371	TGAT	2	8	27432	27439	25 %	50 %	25 %	0 %	544579068
61	NC_022371	CAGT	2	8	27454	27461	25 %	25 %	25 %	25 %	544579068
62	NC_022371	TGCA	2	8	27861	27868	25 %	25 %	25 %	25 %	544579068
63	NC_022371	GTTC	2	8	28119	28126	0 %	50 %	25 %	25 %	544579068
64	NC_022371	TCAG	2	8	28197	28204	25 %	25 %	25 %	25 %	544579068
65	NC_022371	CCGG	2	8	28252	28259	0 %	0 %	50 %	50 %	544579068
66	NC_022371	ATGG	2	8	28393	28400	25 %	25 %	50 %	0 %	544579068
67	NC_022371	TTGA	2	8	28721	28728	25 %	50 %	25 %	0 %	544579068
68	NC_022371	CGGG	2	8	28740	28747	0 %	0 %	75 %	25 %	544579068
69	NC_022371	GCAG	2	8	28909	28916	25 %	0 %	50 %	25 %	544579068
70	NC_022371	GAAG	2	8	29284	29291	50 %	0 %	50 %	0 %	544579068
71	NC_022371	GTGG	2	8	29344	29351	0 %	25 %	75 %	0 %	544579068
72	NC_022371	AGCA	2	8	30190	30197	50 %	0 %	25 %	25 %	544579069
73	NC_022371	TTCT	2	8	30620	30627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022371	TGAT	2	8	30844	30851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022371	GCTG	2	8	31423	31430	0 %	25 %	50 %	25 %	544579070
76	NC_022371	CAGC	2	8	32001	32008	25 %	0 %	25 %	50 %	544579070
77	NC_022371	TGAT	2	8	32148	32155	25 %	50 %	25 %	0 %	544579070
78	NC_022371	CTGC	2	8	32766	32773	0 %	25 %	25 %	50 %	544579072
79	NC_022371	AGCC	2	8	33771	33778	25 %	0 %	25 %	50 %	544579073
80	NC_022371	GACG	2	8	33864	33871	25 %	0 %	50 %	25 %	544579073
81	NC_022371	ATCC	2	8	34337	34344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022371	TTCG	2	8	34652	34659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022371	GTTT	2	8	35028	35035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022371	TATC	2	8	35131	35138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022371	GCCG	2	8	36026	36033	0 %	0 %	50 %	50 %	544579075
86	NC_022371	GCCA	2	8	36225	36232	25 %	0 %	25 %	50 %	544579075
87	NC_022371	TGAA	2	8	36526	36533	50 %	25 %	25 %	0 %	544579076
88	NC_022371	GAAA	2	8	36659	36666	75 %	0 %	25 %	0 %	544579077
89	NC_022371	GCTG	2	8	36705	36712	0 %	25 %	50 %	25 %	544579077
90	NC_022371	ATGA	2	8	36751	36758	50 %	25 %	25 %	0 %	544579077
91	NC_022371	GTTC	2	8	36915	36922	0 %	50 %	25 %	25 %	544579077
92	NC_022371	GGCT	2	8	37809	37816	0 %	25 %	50 %	25 %	544579077
93	NC_022371	AAGC	2	8	38003	38010	50 %	0 %	25 %	25 %	544579077
94	NC_022371	ACAT	2	8	38099	38106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022371	TATT	2	8	38157	38164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022371	TCAA	2	8	38370	38377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022371	TTCT	2	8	38454	38461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022371	CATC	2	8	38701	38708	25 %	25 %	0 %	50 %	544579078
99	NC_022371	AGCA	2	8	38875	38882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022371	CGGC	2	8	38927	38934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022371	TCGT	2	8	38984	38991	0 %	50 %	25 %	25 %	544579079
102	NC_022371	CCCG	2	8	39183	39190	0 %	0 %	25 %	75 %	544579079
103	NC_022371	CTTG	2	8	39385	39392	0 %	50 %	25 %	25 %	544579079
104	NC_022371	CGGC	2	8	39673	39680	0 %	0 %	50 %	50 %	544579079
105	NC_022371	CCAC	2	8	39961	39968	25 %	0 %	0 %	75 %	544579079
106	NC_022371	TCGG	2	8	40361	40368	0 %	25 %	50 %	25 %	544579080
107	NC_022371	GATG	2	8	40587	40594	25 %	25 %	50 %	0 %	544579081
108	NC_022371	GGCC	2	8	40622	40629	0 %	0 %	50 %	50 %	544579081
109	NC_022371	GCCG	2	8	41513	41520	0 %	0 %	50 %	50 %	544579082
110	NC_022371	GGCC	2	8	41554	41561	0 %	0 %	50 %	50 %	544579082
111	NC_022371	CTGG	2	8	42853	42860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022371	GGCA	2	8	42875	42882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022371	TGTA	2	8	42924	42931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022371	GCGG	2	8	43148	43155	0 %	0 %	75 %	25 %	544579085
115	NC_022371	GGGT	2	8	43384	43391	0 %	25 %	75 %	0 %	544579085
116	NC_022371	GGGT	2	8	43643	43650	0 %	25 %	75 %	0 %	544579085
117	NC_022371	TGAC	2	8	44445	44452	25 %	25 %	25 %	25 %	544579085
118	NC_022371	TTTC	2	8	45033	45040	0 %	75 %	0 %	25 %	544579087
119	NC_022371	ACAG	2	8	45203	45210	50 %	0 %	25 %	25 %	544579087
120	NC_022371	CTGC	2	8	45423	45430	0 %	25 %	25 %	50 %	544579087
121	NC_022371	CGAG	2	8	45579	45586	25 %	0 %	50 %	25 %	544579087
122	NC_022371	TTTA	2	8	46312	46319	25 %	75 %	0 %	0 %	544579088
123	NC_022371	ATAA	2	8	46537	46544	75 %	25 %	0 %	0 %	544579088
124	NC_022371	GTTT	2	8	46555	46562	0 %	75 %	25 %	0 %	544579088
125	NC_022371	CGGG	2	8	48667	48674	0 %	0 %	75 %	25 %	544579089
126	NC_022371	ATGC	2	8	49400	49407	25 %	25 %	25 %	25 %	544579090
127	NC_022371	AAGG	2	8	49414	49421	50 %	0 %	50 %	0 %	544579090
128	NC_022371	GCGT	2	8	49428	49435	0 %	25 %	50 %	25 %	544579090
129	NC_022371	CGGG	2	8	49594	49601	0 %	0 %	75 %	25 %	544579090
130	NC_022371	GGGA	2	8	49806	49813	25 %	0 %	75 %	0 %	544579090
131	NC_022371	CAGG	2	8	49843	49850	25 %	0 %	50 %	25 %	544579090
132	NC_022371	GTGA	2	8	50236	50243	25 %	25 %	50 %	0 %	544579091
133	NC_022371	GGCT	2	8	50381	50388	0 %	25 %	50 %	25 %	544579091
134	NC_022371	CAGG	2	8	51270	51277	25 %	0 %	50 %	25 %	544579091
135	NC_022371	GTGG	2	8	51589	51596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022371	TTCT	2	8	52593	52600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022371	CCAC	2	8	52881	52888	25 %	0 %	0 %	75 %	544579093
138	NC_022371	ATTT	2	8	53058	53065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022371	CTGT	2	8	53317	53324	0 %	50 %	25 %	25 %	544579094
140	NC_022371	GTGA	2	8	53545	53552	25 %	25 %	50 %	0 %	544579094
141	NC_022371	TTTA	2	8	53585	53592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022371	CTTA	2	8	53873	53880	25 %	50 %	0 %	25 %	544579095
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144	NC_022371	ATCA	2	8	55918	55925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.