MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	CAAA	2	8	1360	1367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022371	ATCA	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022371	GGCT	2	8	4337	4344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022371	ATAA	2	8	4543	4550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022371	TACT	2	8	4641	4648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022371	ATTA	2	8	7589	7596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022371	CGGG	2	8	10961	10968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022371	CCGG	2	8	11074	11081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022371	AGCC	2	8	11130	11137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022371	GCGG	2	8	13625	13632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022371	ACGG	2	8	14281	14288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022371	TCAG	2	8	15662	15669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022371	GCGG	2	8	20523	20530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022371	GCCT	2	8	21324	21331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022371	CCTG	2	8	21368	21375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022371	ACTA	2	8	22499	22506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022371	TTCA	2	8	22930	22937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022371	TACA	2	8	25135	25142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022371	CCTG	2	8	26347	26354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022371	GTCT	2	8	26356	26363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022371	TTCT	2	8	30620	30627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022371	TGAT	2	8	30844	30851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022371	ATCC	2	8	34337	34344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022371	TTCG	2	8	34652	34659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022371	GTTT	2	8	35028	35035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022371	TATC	2	8	35131	35138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022371	ACAT	2	8	38099	38106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022371	TATT	2	8	38157	38164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022371	TCAA	2	8	38370	38377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022371	TTCT	2	8	38454	38461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022371	AGCA	2	8	38875	38882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022371	CGGC	2	8	38927	38934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022371	CTGG	2	8	42853	42860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022371	GGCA	2	8	42875	42882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022371	TGTA	2	8	42924	42931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022371	GTGG	2	8	51589	51596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022371	TTCT	2	8	52593	52600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022371	ATTT	2	8	53058	53065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022371	TTTA	2	8	53585	53592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022371	ATCA	2	8	55918	55925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022371	AACG	2	8	56008	56015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022371	TTGT	2	8	56216	56223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022371	ATAA	2	8	66657	66664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022371	GTCA	2	8	66723	66730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022371	GGTG	2	8	67469	67476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022371	GATT	2	8	68266	68273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022371	ATTT	2	8	82351	82358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022371	TAAA	2	8	84984	84991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022371	CGGG	2	8	84997	85004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022371	GTAT	2	8	93263	93270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022371	ACAG	2	8	93609	93616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022371	ATTA	2	8	93774	93781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022371	GTCA	2	8	96610	96617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022371	GTCA	2	8	96672	96679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022371	GGCG	2	8	98342	98349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.