MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 1459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	AAT	2	6	31	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022371	GAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579033
3	NC_022371	CCA	2	6	305	310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544579033
4	NC_022371	TCG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579033
5	NC_022371	AAC	2	6	512	517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579033
6	NC_022371	GAA	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579033
7	NC_022371	CTG	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579033
8	NC_022371	CAG	3	9	829	837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579033
9	NC_022371	CAG	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579033
10	NC_022371	GAA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579033
11	NC_022371	GAA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579033
12	NC_022371	CAG	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579033
13	NC_022371	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579033
14	NC_022371	CAT	2	6	1181	1186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022371	ATC	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022371	TAG	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022371	TCA	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022371	GTT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022371	AAG	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022371	CAT	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022371	CGC	2	6	1448	1453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_022371	CAA	2	6	1595	1600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022371	GCA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022371	GCC	2	6	1670	1675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022371	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022371	TGT	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022371	TCT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022371	TCG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022371	CGG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022371	ACC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_022371	GCC	2	6	1995	2000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_022371	ATT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022371	AAC	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022371	CAA	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579034
35	NC_022371	GCC	2	6	2171	2176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579034
36	NC_022371	AGG	3	9	2235	2243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544579034
37	NC_022371	GCC	2	6	2449	2454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579035
38	NC_022371	GTT	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579035
39	NC_022371	ATT	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022371	AAT	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022371	GCA	2	6	2964	2969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579036
42	NC_022371	AAT	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579036
43	NC_022371	TAC	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022371	GTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022371	ACT	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022371	TTA	2	6	3351	3356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	544579037
47	NC_022371	ATC	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579037
48	NC_022371	ATC	3	9	3483	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579037
49	NC_022371	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022371	CTG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022371	TCT	2	6	3645	3650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022371	CTG	2	6	3746	3751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579038
53	NC_022371	CGG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544579038
54	NC_022371	CCA	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544579038
55	NC_022371	TTC	3	9	4128	4136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544579038
56	NC_022371	CGG	2	6	4186	4191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544579038
57	NC_022371	ATA	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579038
58	NC_022371	ACG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579038
59	NC_022371	CAC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544579038
60	NC_022371	TTC	2	6	4307	4312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544579038
61	NC_022371	TAA	2	6	4357	4362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022371	TAA	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022371	GTA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022371	TGT	2	6	4531	4536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022371	AGA	3	9	4575	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022371	AGA	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579039
67	NC_022371	ATG	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579039
68	NC_022371	TGC	2	6	4896	4901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579039
69	NC_022371	ACC	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544579039
70	NC_022371	TGA	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579039
71	NC_022371	CTC	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	544579039
72	NC_022371	GCA	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579039
73	NC_022371	AGA	2	6	5401	5406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579039
74	NC_022371	GCA	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579039
75	NC_022371	TCA	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579039
76	NC_022371	ATC	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579039
77	NC_022371	GCA	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579039
78	NC_022371	ATC	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579039
79	NC_022371	TGT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022371	TGC	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022371	CAG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022371	TAA	2	6	6224	6229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022371	CCG	2	6	6614	6619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579040
84	NC_022371	ACA	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579040
85	NC_022371	GAT	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579040
86	NC_022371	TGA	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579040
87	NC_022371	TAT	2	6	6773	6778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	544579040
88	NC_022371	TAA	2	6	6800	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579040
89	NC_022371	TGC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579040
90	NC_022371	TGC	2	6	7094	7099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579041
91	NC_022371	TTG	2	6	7326	7331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579041
92	NC_022371	AAT	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579041
93	NC_022371	TAT	2	6	7463	7468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	544579041
94	NC_022371	ATT	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022371	GTT	2	6	7566	7571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022371	TGG	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579042
97	NC_022371	TCA	2	6	7864	7869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579042
98	NC_022371	AAT	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579042
99	NC_022371	TGC	2	6	7974	7979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579042
100	NC_022371	AAT	2	6	7983	7988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544579042
101	NC_022371	GTC	2	6	8083	8088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579042
102	NC_022371	AAC	2	6	8148	8153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579042
103	NC_022371	CTG	2	6	8214	8219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579042
104	NC_022371	CGG	2	6	8226	8231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544579042
105	NC_022371	CTT	2	6	8234	8239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544579042
106	NC_022371	TTG	2	6	8495	8500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579042
107	NC_022371	TGA	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579042
108	NC_022371	TCA	2	6	8650	8655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579042
109	NC_022371	TCT	2	6	8759	8764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	544579042
110	NC_022371	CAG	2	6	9080	9085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579043
111	NC_022371	CAG	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579043
112	NC_022371	CTG	2	6	9240	9245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579043
113	NC_022371	AAC	2	6	9327	9332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579043
114	NC_022371	TGC	2	6	9391	9396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579043
115	NC_022371	GTC	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579044
116	NC_022371	CAG	2	6	9430	9435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579044
117	NC_022371	GTT	2	6	9546	9551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579044
118	NC_022371	TAA	2	6	9682	9687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022371	TTG	2	6	9714	9719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022371	CTG	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022371	GCT	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022371	CCT	2	6	9895	9900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022371	TCG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022371	TCC	3	9	9922	9930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_022371	GAG	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022371	CGC	2	6	10130	10135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579045
127	NC_022371	GTG	2	6	10242	10247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579045
128	NC_022371	CTG	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579045
129	NC_022371	TGC	2	6	10332	10337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579045
130	NC_022371	GAT	2	6	10391	10396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579045
131	NC_022371	TCA	2	6	10414	10419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579045
132	NC_022371	GTG	2	6	10469	10474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579045
133	NC_022371	CTG	2	6	10522	10527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579045
134	NC_022371	CGG	2	6	10572	10577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544579046
135	NC_022371	CAG	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579046
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141	NC_022371	TGA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022371	GAC	2	6	11199	11204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022371	CAC	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_022371	TTC	2	6	12424	12429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_022371	CTG	2	6	12493	12498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_022371	GAC	2	6	18101	18106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579054
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255	NC_022371	GCC	2	6	18492	18497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579054
256	NC_022371	TGA	2	6	18498	18503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579054
257	NC_022371	GCA	2	6	18535	18540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_022371	TGA	2	6	18553	18558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579055
259	NC_022371	TGC	2	6	18620	18625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579055
260	NC_022371	TGA	2	6	18694	18699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579055
261	NC_022371	TGG	3	9	18833	18841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579055
262	NC_022371	CGT	2	6	18854	18859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579055
263	NC_022371	CAT	2	6	18950	18955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579055
264	NC_022371	AGG	2	6	18974	18979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544579055
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266	NC_022371	GCC	2	6	19034	19039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579056
267	NC_022371	AAC	2	6	19062	19067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544579056
268	NC_022371	GTC	3	9	19068	19076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579056
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274	NC_022371	GTT	2	6	19499	19504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579056
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280	NC_022371	GTG	2	6	19635	19640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579056
281	NC_022371	GAT	2	6	19672	19677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579056
282	NC_022371	ATG	2	6	19702	19707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579056
283	NC_022371	GAA	2	6	19789	19794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579057
284	NC_022371	CTG	2	6	19795	19800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579057
285	NC_022371	TGT	2	6	19830	19835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579057
286	NC_022371	CTG	2	6	19876	19881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544579057
287	NC_022371	GAA	2	6	19939	19944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579057
288	NC_022371	GCC	2	6	20065	20070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579057
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290	NC_022371	CAT	2	6	20195	20200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544579057
291	NC_022371	GGT	2	6	20355	20360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022371	CGC	2	6	20408	20413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_022371	GCC	2	6	20471	20476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_022371	CCT	2	6	20568	20573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_022371	GGA	2	6	20747	20752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_022371	TGT	2	6	20765	20770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544579058
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301	NC_022371	TGG	2	6	21087	21092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544579058
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304	NC_022371	CGG	2	6	21275	21280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_022371	AGG	2	6	21339	21344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_022371	TGT	2	6	21411	21416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
308	NC_022371	GGC	2	6	21461	21466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
309	NC_022371	GTC	2	6	21472	21477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_022371	GCT	2	6	21498	21503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_022371	CGC	2	6	21604	21609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
313	NC_022371	CCG	2	6	21693	21698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
314	NC_022371	GAA	2	6	21904	21909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
315	NC_022371	CAG	2	6	21973	21978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
316	NC_022371	CAG	2	6	22001	22006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579059
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321	NC_022371	AGG	2	6	22841	22846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_022371	ACG	2	6	22872	22877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_022371	TGA	2	6	23007	23012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579061
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341	NC_022371	GGC	2	6	23660	23665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544579062
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362	NC_022371	ACC	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
363	NC_022371	TTG	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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366	NC_022371	GCG	2	6	25019	25024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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369	NC_022371	GTG	2	6	25252	25257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
370	NC_022371	CTC	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
371	NC_022371	GAG	2	6	25369	25374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
372	NC_022371	TGA	2	6	25381	25386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544579065
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385	NC_022371	GCC	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544579065
386	NC_022371	ATC	2	6	26279	26284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_022371	TTG	2	6	26321	26326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_022371	GAA	2	6	26385	26390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544579066
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393	NC_022371	AGC	2	6	26600	26605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544579066
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396	NC_022371	ATG	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
397	NC_022371	GGA	2	6	26957	26962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544579067
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