MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	AAT	2	6	31	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022371	CAT	2	6	1181	1186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022371	ATC	2	6	1201	1206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022371	TAG	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022371	TCA	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022371	GTT	2	6	1333	1338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022371	AAG	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022371	CAT	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022371	CGC	2	6	1448	1453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_022371	CAA	2	6	1595	1600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022371	GCA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022371	GCC	2	6	1670	1675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022371	AAC	2	6	1693	1698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022371	TGT	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022371	TCT	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022371	TCG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022371	CGG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022371	ACC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022371	GCC	2	6	1995	2000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022371	ATT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022371	AAC	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022371	ATT	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022371	AAT	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022371	TAC	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022371	GTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022371	ACT	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022371	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022371	CTG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022371	TCT	2	6	3645	3650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022371	TAA	2	6	4357	4362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022371	TAA	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022371	GTA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022371	TGT	2	6	4531	4536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022371	AGA	3	9	4575	4583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022371	TGT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022371	TGC	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022371	CAG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022371	TAA	2	6	6224	6229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022371	ATT	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022371	GTT	2	6	7566	7571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022371	TAA	2	6	9682	9687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022371	TTG	2	6	9714	9719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022371	CTG	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022371	GCT	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022371	CCT	2	6	9895	9900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_022371	TCG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022371	TCC	3	9	9922	9930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022371	GAG	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022371	CTC	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_022371	TGA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022371	GAC	2	6	11199	11204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022371	CAC	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_022371	CCG	2	6	11403	11408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_022371	GCA	2	6	12264	12269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022371	CGC	2	6	12286	12291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_022371	GGA	2	6	12387	12392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022371	TTC	2	6	12424	12429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022371	GCG	2	6	12434	12439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022371	ATC	2	6	12446	12451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022371	CTG	2	6	12485	12490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022371	CTG	2	6	12493	12498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022371	CCG	2	6	12515	12520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022371	GCC	2	6	12547	12552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022371	GCA	2	6	13414	13419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022371	CGC	2	6	13513	13518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022371	CCT	2	6	13670	13675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_022371	AAC	2	6	13833	13838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022371	GGA	2	6	13839	13844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022371	GGC	2	6	14289	14294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022371	GCC	2	6	14298	14303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022371	ATC	2	6	14344	14349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022371	GGA	2	6	14676	14681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022371	GCG	2	6	14787	14792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022371	CAC	2	6	14816	14821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_022371	TTG	2	6	14830	14835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022371	CAG	2	6	14862	14867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022371	GCA	2	6	14902	14907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022371	GCC	2	6	14939	14944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022371	GCG	2	6	15008	15013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022371	GGC	2	6	15141	15146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022371	ACA	2	6	15694	15699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022371	TCG	2	6	15709	15714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022371	ACG	2	6	15804	15809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022371	GTG	2	6	15842	15847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022371	CAC	2	6	16010	16015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_022371	CAG	2	6	16045	16050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022371	CGA	2	6	16076	16081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022371	CCG	2	6	16147	16152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022371	GGA	2	6	16158	16163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022371	GAC	2	6	16177	16182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022371	GCA	2	6	18535	18540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022371	GGT	2	6	20355	20360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022371	CGC	2	6	20408	20413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_022371	GCC	2	6	20471	20476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022371	CCT	2	6	20568	20573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_022371	GGA	2	6	20747	20752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022371	CGG	2	6	21275	21280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022371	AGG	2	6	21339	21344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022371	GCG	2	6	21354	21359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022371	TGT	2	6	21411	21416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022371	GGC	2	6	21461	21466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022371	GTC	2	6	21472	21477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022371	GCT	2	6	21498	21503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022371	CCG	2	6	21521	21526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022371	CGC	2	6	21604	21609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022371	CCG	2	6	21693	21698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022371	GAA	2	6	21904	21909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022371	CAG	2	6	21973	21978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022371	AGG	2	6	22841	22846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022371	ACG	2	6	22872	22877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022371	CAG	2	6	24316	24321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022371	GAA	2	6	24889	24894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022371	GTG	2	6	24955	24960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022371	ACC	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_022371	TTG	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022371	CGT	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022371	TTC	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022371	GCG	2	6	25019	25024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022371	GCC	2	6	25090	25095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022371	GTC	2	6	25161	25166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022371	GTG	2	6	25252	25257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022371	CTC	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_022371	GAG	2	6	25369	25374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022371	ATC	2	6	26279	26284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022371	TTG	2	6	26321	26326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022371	ATC	2	6	26692	26697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022371	ATG	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022371	CTG	2	6	27224	27229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022371	GAG	2	6	29946	29951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022371	GAG	2	6	30033	30038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022371	AGA	2	6	30467	30472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022371	TAC	2	6	30490	30495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022371	TAA	2	6	30639	30644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022371	GGA	2	6	30780	30785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022371	TAT	2	6	30823	30828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022371	TGC	2	6	30862	30867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022371	GAA	2	6	30966	30971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022371	GCC	2	6	32240	32245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_022371	GCT	2	6	32276	32281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022371	CGT	2	6	34269	34274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022371	GCT	2	6	34313	34318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022371	CAT	2	6	34365	34370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_022371	AAC	2	6	34518	34523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_022371	AAG	2	6	34671	34676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022371	ATT	3	9	34677	34685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022371	TTA	3	9	34687	34695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_022371	TGG	2	6	38535	38540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_022371	AAT	2	6	41647	41652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_022371	GTC	2	6	44945	44950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_022371	CTG	2	6	44975	44980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_022371	TAA	4	12	45843	45854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022371	GGT	2	6	51524	51529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022371	GGA	2	6	51606	51611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_022371	ACG	2	6	98790	98795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_022371	AGA	2	6	98832	98837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.